Договор № 37/2010 Влияние на генетичните варианти в ABCА4 гена върху развитие на свързаната с възрастта дегенерация на макулата (ARMD) ЧЛЕНОВЕ НА ИЗСЛЕДОВАТЕЛСКИЯ ЕКИП: ХХХ1, AAA2, BBB3, CCC4
Област: МЕДИКО-БИОЛОГИЧНА
Договор № 37/2010 Влияние на генетичните варианти в ABCА4 гена върху развитие на свързаната с възрастта дегенерация на макулата (ARMD)
РЪКОВОДИТЕЛ НА ПРОЕКТА: Проф. д-р ХХХ, дм
ВОДЕЩ ИЗСЛЕДОВАТЕЛ: д-р ХХХ, докторант, Катедра по офталмология
ЧЛЕНОВЕ НА ИЗСЛЕДОВАТЕЛСКИЯ ЕКИП: ХХХ1, AAA2, BBB3, CCC4
1-биолог, Катедра по клинична лаборатория; 2-Гл.ас.,дм, Катедра по Медицинска Химия и Биохимия; 3-Доц. д-р, дм, Xxxxxxx по неврология, УМБАЛ “Св. Xxxxxx”; 4-Ас. Д-р, Тракийски университет, Ст. Загора
БАЗОВА ОРГАНИЗАЦИЯ: МУ-Пловдив, Медицински факултет, Катедра по офталмология
ЦЕЛ: Да се изясни влиянието на генетичните варианти в ABCА4 гена върху развитие на свързаната с възрастта дегенерация на макулата.
РЕЗУЛТАТИ: Изследвани са 12 пациенти с AMD (7 от български, 5 от еврейски произход). След изолиране на ДНК, всички 50 екзона., включително и екзон-интронните граници на ABCA4 гена бяха изследвани чрез директно секвениране. Открити са 26 полиморфизми и редки варианти, 11 в кодиращата последователност и 15 в интрони. Намерени са два нови, неописани до сега полиморфизма, водещи до синонимни замени в екзон 13 (Asp644Asp) и екзон 31 (Th1537Thr). Някои от вариантите се срещат само при българските пациенти (rs4147830). Други варианти се срещат само при еврейски пациенти (като rs4147887). Шест от синонимните нуклеотидни замени в екзоните (Leu1894Leu, Leu1938Leu, Pro1948Pro, Ile2023Ile, Ile2083Ile, Asp2095Asp) са определени като полиморфизми, не са патогенни т.е нямат отношение към развитието на заболяването. Те се срещат с честота между 4.17 и 87.5% в настоящото проучване. Една от намерените несинонимни замени His423Arg също се смята за полиморфизъм, тъй като е доста честа и се открива в различни популации, както при болни така и при здрави контроли. Другата missense мутация – Ser2255IIe също е наблюдавана и преди при болни от различни популации с различни очни заболявания като AMD, STGD и arCRD. Независимо от малкия размер на изследваната група резултатите са в подкрепа на намереното при проучване на ABCA4 гена при болни с AMD от други популации.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ : мутации в ABCA4 гена нямат основна роля в предразположението към заболяването.
ПРИЛОЖЕНИЕ В ПРАКТИКАТА: Предлага се използването на генетичния анализ на полиморфизмите на ABCA4 гена като скрининг за оценка риска от макулна дегенерация.
НАУЧНИ ПУБЛИКАЦИИ:
ХХХ. Анализ на компютърно-периметрична находка при пациенти със съдови лезии на ретрохиазмалните зрителни пътища. Невросонография и мозъчна хемодинамика. 1: 35-39, 2012.
ХХХ, ХХХ, ХХХ. Анализ на клиничния профил на пациенти с акутна форма на оптичен неврит. Българска Неврология. 2010; 2: 68-71.
MEDICO-BIOLOGICAL AREA
Contract Nr.17/2008 Role of the genetic variants of ABCA4 gene for the development of age related macular degeneration (ARMD)
PROJECT DIRECTOR: Prof. ХХХХ, MD, PhD
LEADING SCIENTIST: Dr. ХХХ, PhD student, medical doctor, Deptartment of Ophtalmology
RESEARCH TEAM: ХХХ1, AAA2, BBB3, CCC4
1- biologist, Department of clinical laboratory; 2-Senior Assist Prof., PhD, Dept. of Medical Chemistry and Biochemistry; 3-Assoc. Prof., MD, PhD, DSc, Deptartemnt of Neurology; 4-Assist. Prof., MD, Trakia University, Stara Zagora
ORGANIZATION UNIT: Medical University – Plovdiv, Medical Faculty, Department of Ophtalmology
AIM: to investigate the effect of genetic variants of ABCA4 gene on the development of age related macular degeneration
RESULTS:
The current investigation included 12 patients with AMD (7 of Bulgarian, 5 with Jewish Origin). After DNA isolation, all 50 exons, including exon-intron boundaries of the ABCA4 gene have been analyzed with direct sequencing. In total 26 different polymorphisms and rare variants have been discovered, 11 in the coding region and 15 in the introns. Two new variants, not previously described have been found, both synonymous changes in exon 13 (Asp644Asp) and exon 31 (Thr1537Thr). Some of the variants have been found only in the Bulgarian patients (rs4147830), while others only in the Jewish sample (rs4147887). Six of the synonymous nucleotide changes (Leu1894Leu, Leu1938Leu, Pro1948Pro, Ile2023Ile, Ile2083Ile, Asp2095Asp) are polymorphisms that have no influence on the AMD. They are found with frequencies between 4.17 and 87.5% in the current sample. One of the non-synonymous changes His423Arg is also considered polymorphism, as it is quite frequent in different populations, as well as healthy controls. The other missense mutation Ser2255IIe has also been previously described and found in affected with AMD, STGD and arCRD from different populations. Despite the small sample size, the results of the current study support the findings in investigation of ABCA4 gene in patients with AMD.
CONCLUSION: mutations in ABCA4 do not have major impact on the predisposition of AMD in the studied sample.
PRACTICAL APPLICATIONS: the application of genetic testing for polymorphisms of the ABCA4 gene for AMD screening.
SCIENTIFIC PUBLICATIONS:
XXXX. Analysis of computer perimetrical findings in patients with lesions of optical vessels. Neurosonographia and brain hemodynamics. 2014; 1: 35-39.
XXX, AAA, XXX. Analysis of clinical characteristic in patients with acute optical neuritis. Bulgarian Neurology. 2010; 2: 68-71.