RÁMCOVÁ SMLOUVA‌

RÁMCOVÁ SMLOUVA‌

na poskytování služeb v oblasti genomického sekvenování DNA

Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.

IČO: 61389030

DIČ: CZ61389030

se sídlem: Rozvojová 263, 165 02 Praha 6 - Lysolaje

zapsaný v rejstříku veřejných výzkumných institucí vedeném MŠMT ČR

zastoupen: ředitelem

dále jen jako „Objednatel“ na straně jedné

a

Obchodní firma: GenSeq s.r.o.

IČO: 24263320

DIČ: CZ24263320

se sídlem: Wolkerova 1382, Benešov 25601 zapsaný: u Městského soudu, spis. Značka C198513 bankovní spojení: ČSOB a.s.

číslo účtu: 253638117/0300 zastoupen: jednatelkou

dále jen jako „Poskytovatel“ na straně druhé

(Objednatel a Poskytovatel dále společně též jako „Smluvní strany“ či každý samostatně jako

„Smluvní strana“) uzavřeli v souladu s ustanoveními § 1746 odst. 2 zákona č. 89/2012 Sb., občanského zákoníku, ve znění pozdějších předpisů (dále jen „Občanský zákoník“) ve spojení s ust. § 122 a násl. zákona č. 134/2016 Sb., o zadávání veřejných zakázek, ve znění pozdějších předpisů (dále jen „ZZVZ“) dle výsledků zadávacího řízení na veřejnou zakázku s názvem

„Sekvenování a syntéza oligonukleotidů, níže uvedeného dne, měsíce a roku tuto rámcovou smlouvu (dále také „Smlouva“):

1. Úvodní ustanovení

1.1. Poskytovatel je vybraným účastníkem v zadávacím řízení na veřejnou zakázku s názvem

,,Sekvenování a syntéza oligonukleotidů“, realizovanou v rámci projektu CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_019/0000738 „Centrum experimentální biologie rostlin“ (dále jen

„Projekt“) spolufinancovaného ze zdrojů Evropských strukturálních a investičních fondů, operační program Výzkum, vývoj a vzdělávání.

1.2. Tato Xxxxxxx je uzavírána za podmínek zadávacího řízení na veřejnou zakázku s názvem

„Sekvenování a syntéza oligonukleotidů“, dále upravených též v zadávací dokumentaci (dále jen „Zadávací dokumentace“), a to v rámci plnění části 3 veřejné zakázky uvedené v předchozím odstavci označené jako „Genomické sekvenování DNA“.

2. Předmět Smlouvy

2.1. Předmětem této Smlouvy je rámcová úprava vzájemných práv a povinností Smluvních stran v souvislosti s realizací jednotlivých dílčích dodávek služeb Poskytovatele v oblasti genomického sekvenování DNA (čtení pořadí nukleotidů v DNA), které jsou blíže specifikovány co do druhu a ceny v příloze č. 1 této Smlouvy – Kalkulaci nabídkové ceny a v příloze č. 2 této Smlouvy - Nároky zadavatele/Objednatele na způsob provádění zakázky, a to na základě výsledku zadávacího řízení (dále společně též jen jako „služby“).

2.2. Poskytovatel se na základě této Smlouvy zavazuje (i) poskytovat Objednateli služby uvedené v předchozím odstavci této Smlouvy v rozsahu, kvalitě a za dodacích a platebních podmínek dle objednávek Objednatele učiněných v souladu s podmínkami stanovenými v zadávacím řízení a v souladu s touto Smlouvou a (ii) předat Objednateli a převést na Objednatele vlastnické právo k výsledkům získaným v souvislosti s poskytováním služeb dle této Smlouvy (dále jen „výsledky poskytovaných služeb“ anebo také jen jako „dílo“).

2.3. Objednatel se zavazuje řádně a včas dodané výsledky poskytovaných služeb získané v souvislosti s plněním této Smlouvy dohodnutým způsobem převzít a zaplatit za ně Poskytovateli sjednanou cenu, a to vše za podmínek uvedených v Zadávací dokumentaci, této Smlouvě a v konkrétních objednávkách.

3. Rozsah plnění a dílčí objednávky

3.1. Objednávání služeb dle této Smlouvy je závislé na aktuálních potřebách Objednatele. Objednatel nicméně požaduje, aby byl Poskytovatel kdykoli v průběhu trvání této Smlouvy schopen vyhovět požadavkům Objednatele a poskytnout mu služby v jím požadovaném rozsahu.

3.2. Objednatel bude objednávat služby u Poskytovatele, a to na základě dílčích objednávek vložených Objednatelem do bezplatné internetové aplikace se zabezpečeným přístupem zpřístupněné Poskytovatelem (dále jen „internetová aplikace“). Poskytovatel poskytne Objednateli přístup do internetové aplikace bezprostředně po nabytí účinnosti této Smlouvy.

3.3. Objednávka, kterou Objednatel vloží do internetové aplikace dle předchozího odstavce této

Smlouvy, bude obsahovat zejména následující údaje:

- druh a rozsah objednávaných služeb,

- osobu oprávněnou jednat ve věci objednávky na straně Objednatele,

- výslovný odkaz na tuto Smlouvu,

- název části 3 zakázky „Genomické sekvenování DNA“

- označení Projektu: CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_019/0000738

3.4. Objednatelem řádně vystavené objednávky vložené do internetové aplikace jsou pro Poskytovatele závazné.

4. Cena služeb a platební podmínky

4.1. Cena služeb dle této Smlouvy byla stanovena dohodou Smluvních stran jako maximální, nejvýše přípustná a nepřekročitelná, a to jako jednotková cena za jednotlivé druhy služeb dle přílohy č. 1 k této Smlouvě – kalkulace nabídkové ceny. Jednotková cena je uvedena v českých korunách. Poskytovatel se zavazuje, že jednotková cena služeb nepřekročí cenu vzešlou ze zadávacího řízení (vysoutěženou cenu) po celou dobu platnosti této Smlouvy.

4.2. Cena služeb zahrnuje veškeré náklady související s plněním předmětu této Smlouvy, to však s výjimkou dopravy vzorků DNA do laboratoře Poskytovatele, kterou zajistí Objednatel.

4.3. Zvýšení ceny může Poskytovatel navrhnout pouze v souvislosti se změnou daňových právních předpisů ve smyslu změny zákona č. 235/2004 Sb., o dani z přidané hodnoty, a to nejvýše o částku odpovídající této legislativní změně. Nově sjednaná cena bude předmětem dodatku k této Smlouvě.

4.4. Objednatel nebude poskytovat zálohy na objednané služby.

4.5. Smluvní strany ujednaly celkový limit plnění dle této Smlouvy odpovídající celkové nabídkové ceně Poskytovatele ve výši 1.051.466,- Kč bez DPH (slovy: jeden milion padesát jedna tisíc čtyři sta šedesát šest korun českých). Součet jednotlivých plnění za dobu, na kterou je tato Xxxxxxx uzavírána tedy nesmí tuto částku překročit (s výjimkou uvedenou v článku 10.1 této Smlouvy).

4.6. Poskytovatel je povinen vystavit na jednotlivé objednávky daňový doklad (fakturu) do 15 dnů po uskutečnění zdanitelného plnění a nejpozději do 2 pracovních dnů po jeho vystavení jej doručit na adresu sídla Objednatele. V případě opožděného vystavení či doručení daňového dokladu (faktury) je Poskytovatel povinen Objednateli uhradit vzniklou škodu v plné výši.

4.7. Cena poskytnutých služeb je splatná ve lhůtě 14 (čtrnáct) dní ode dne doručení daňového

dokladu (faktury) Objednateli.

4.8. Platba ceny dle vystavených faktur probíhá vždy bezhotovostním převodem na účet Poskytovatele uvedený v hlavičce této Smlouvy. Veškeré platby budou probíhat výhradně v českých korunách.

4.9. Faktura za služby musí obsahovat náležitosti stanovené příslušnými právními předpisy, a to zejména zákonem č. 235/2004 Sb., o dani z přidané hodnoty, ve znění platném k datu uskutečnění zdanitelného plnění, a zákonem č. 563/1991 Sb., o účetnictví, ve znění platném k témuž datu, vždy musí obsahovat cenu předmětu plnění s DPH i bez DPH. Na faktuře budou vždy uvedeny údaje o důvodu účtování s odvoláním na objednávku nebo Smlouvu a údaj o místě předání dané části díla. Zároveň musí daňový doklad obsahovat označení Projektu: CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_019/0000738.

4.10. Nedílnou součástí daňového dokladu (faktury) musí být vždy kopie příslušné objednávky.

4.11. V případě, že zaslaná faktura nebude mít náležitosti daňového dokladu nebo na ní nebudou uvedeny údaje specifikované v této Smlouvě, nebo bude neúplná a nesprávná, je jí (nebo její kopii) Objednatel oprávněn vrátit Poskytovateli k opravě či doplnění a nedostává se do prodlení s úhradou kupní ceny. Od doručení opravené faktury začíná běžet nová lhůta splatnosti.

4.12. Poskytovatel podpisem této Smlouvy přebírá na sebe nebezpečí změny okolností ve smyslu ustanovení § 1765 občanského zákoníku.

4.13. Objednatel je povinen zaplatit cenu služeb uvedenou ve faktuře (daňovém dokladu) nejpozději poslední den její splatnosti. Zaplacením kupní ceny se pro účely této Smlouvy a jednotlivých kupních smluv uzavřených na základě této Smlouvy rozumí odepsání příslušné částky z účtu Objednatele, nebylo-li dohodnuto jinak.

5. Dodací podmínky

5.1. Objednatel zašle vzorky DNA izolované z rostlinného materiálu v laboratoři Objednatele Poskytovateli za účelem poskytování služeb dle této Smlouvy. Přibližné datum odeslání uvede při vložení objednávky do internetové aplikace. Vzorky DNA budou Objednatelem zasílány dle jeho požadavku ve formě roztoku na suchém ledu či ve formě stabilizované vysušené DNA (např. ve zkumavce GenTegra).

5.2. Poskytovatel je povinen zkontrolovat přejímané vzorky DNA ve své laboratoři a je oprávněn odmítnout požadované plnění v případě, že jsou vzorky nízké kvality anebo jsou poškozeny. O této situaci je Poskytovatel povinen bezodkladně informovat Objednatele, který je v takovém případě oprávněn zaslat Poskytovateli vzorky náhradní, aniž se dostane do prodlení s plněním svých povinností vyplývajících z této Smlouvy.

5.3. Není-li dále stanoveno jinak, Poskytovatel dodá na vlastní nebezpečí a náklady Objednateli výsledky poskytnutých služeb do místa plnění dle čl. 5.7. této Smlouvy, a to nejpozději do 6 týdnů ode dne převzetí vzorků DNA od Objednatele, nebude-li v konkrétní objednávce uvedena lhůta delší.

5.4. Poskytovatel je oprávněn dodat výsledky poskytnutých služeb ve lhůtách dle předchozího odstavce namísto fyzického předání rovněž prokazatelným zpřístupněním výsledků Objednateli v internetové aplikaci. Výsledky sekvenování DNA budou nicméně za všech okolností poskytnuty Objednateli v elektronické podobě ve formátu *fastq.

5.5. Poskytovatel se zavazuje informovat Objednatele o termínu dodání výsledků poskytnutých služeb dodávaných do místa plnění dle čl. 5.7. této Smlouvy nejméně 1 (jeden) pracovní den předem. V případě dodání výsledků poskytnutých služeb prostřednictvím internetové

aplikace bude Poskytovatel informovat o aktuálním stavu objednané služby

prostřednictvím rozhraní této internetové aplikace.

5.6. V případě prodlení Poskytovatele s dodáním výsledků poskytovaných služeb je Objednatel

oprávněn předmětnou objednávku jednostranně zrušit.

5.7. Nejsou-li výsledky poskytnutých služeb v konkrétním případě dodány Objednateli prostřednictvím internetové aplikace, je Místem plnění těchto výsledků sídlo Objednatele na adrese Xxxxxxxxx 000, 000 00 Xxxxx 0 - Xxxxxxxx. Dodání výsledků lze ve sjednaném místě provést v pracovních dnech od 9:00 do 15:00 hod.

5.8. V případě fyzického předání výsledků poskytnutých služeb v místě plnění dle předchozího odstavce, bude dodání výsledků poskytnutých služeb vždy potvrzeno podpisem dodacího listu či předávacího protokolu. Dodací list či předávací protokol musí obsahovat zejména číslo objednávky, datum uskutečnění dodávky, množství přebíraných výsledků poskytnutých služeb a další údaje stanovené relevantními právními předpisy či touto Smlouvou. Objednatel na dodací list či předávací protokol připojí podpis oprávněné osoby k převzetí dodávky a vyznačí datum jejího provedení.

5.9. Objednatel není povinen převzít výsledky poskytnutých služeb postupem dle předchozího

odstavce v případě, že dodávka (zejména její obal) vykazuje zjevné vady.

5.10. Poskytovatel je povinen předat Objednateli společně s výsledky poskytnutých služeb veškerou dokumentaci nutnou k převzetí a řádnému užívání výsledků poskytnutých služeb.

5.11. Nebude-li Poskytovatel schopen objednávku v termínu a množství splnit, je povinen to oznámit Objednateli bez zbytečného odkladu. Práva vyplývající z odpovědnosti za porušení Smlouvy tímto nejsou dotčena.

5.12. Poskytovatel je povinen dodat výsledky poskytnutých služeb na svůj náklad a na své nebezpečí ve sjednané době, za cenu dle čl. 4 této Smlouvy.

5.13. Poskytovatel se zavazuje uchovávat vzorky DNA převzaté za účelem poskytnutí služeb dle této Smlouvy po dobu nejméně 4 týdnů ode dne předání výsledků poskytnutých služeb Objednateli. Obdobně se Poskytovatel zavazuje uchovávat výsledky sekvenování po dobu nejméně 6 měsíců ode dne předání výsledků poskytnutých služeb Objednateli, Poskytovatel se nicméně zavazuje nejpozději do 24 měsíců od předání výsledků poskytnutých služeb Objednateli veškeré podklady, které od Objednatele převzal za účelem plnění konkrétní objednávky, spolu s veškerými výsledky takto poskytnutých služeb, nenávratně zničit.

5.14. Poskytovatel se zavazuje informovat Objednatele o výpadcích v poskytování služeb či distribuci výsledků poskytovaných služeb bez zbytečného odkladu poté, co se o nich dozvěděl, nejpozději však do 2 pracovních dnů.

5.15. Objednatel nepřiznává Poskytovateli statut výhradního poskytovatele služeb pro Objednatele.

6. Práva a povinnosti Smluvních stran

6.1. Dojde-li kdykoliv za trvání smluvního vztahu ke změně identifikačních údajů či jiných údajů majících vliv na plnění dle této Smlouvy či jednotlivé objednávky na kterékoli straně, povinná strana se zavazuje informovat oprávněnou stranu o této změně bez zbytečného odkladu, nejpozději však do 5 pracovních dnů ode dne, kdy ke změně došlo.

6.2. Poskytovatel je povinen řádně informovat Objednatele o obsahu a vlastnostech výsledků poskytnutých služeb. Tyto povinnosti se však nevztahují na případy, kdy se jedná o zřejmé nebo obecně známé skutečnosti.

6.3. Poskytovatel není oprávněn provádět zápočty pohledávek bez souhlasu Objednatele.

6.4. Poskytovatel se zavazuje zachovávat mlčenlivost o veškerých skutečnostech, které se dozví v souvislosti se svojí činností na základě této Smlouvy, včetně jednání před uzavřením této Smlouvy, pokud tyto skutečnosti nejsou běžně veřejně dostupné. Za důvěrné informace a předmět mlčenlivosti dle této Smlouvy se považují rovněž informace o výsledcích poskytovaných služeb i jakékoliv osobní údaje, podoba a soukromí zaměstnanců či jiných pracovníků Objednatele, o kterých se Poskytovatel v souvislosti se svou činností pro Objednatele dozví nebo dostane do kontaktu a dále veškeré informace, které jsou jako důvěrné označeny anebo jsou takového charakteru, že mohou v případě zveřejnění přivodit kterékoliv Smluvní straně újmu, bez ohledu na to, zda mají povahu osobních, obchodních či jiných informací. Ustanovení tohoto článku se vztahují, jak na období trvání této Smlouvy, tak na období po jejím ukončení.

6.5. Žádná ze Smluvních stran nepostoupí práva a povinnosti vyplývající z této Smlouvy, bez předchozího písemného souhlasu druhé Smluvní strany. Jakékoliv postoupení v rozporu s podmínkami této Smlouvy bude neplatné a neúčinné.

6.6. Poskytovatel se zavazuje, že:

a) předá Objednateli veškerá data o kvalitě, která jsou požadována (a) právními předpisy, nebo (b) byla požadována Objednatelem v rámci zadávacích podmínek, na jejichž základě byla tato Smlouva uzavřena, nebo (c) jsou požadována ustanoveními této Smlouvy, nebo (d) jsou požadována Objednatelem po uzavření této Smlouvy;

b) oznámí Objednateli veškeré odchylky od kvality a technických podmínek, které se vztahují k plnění předmětu této Smlouvy a které Poskytovatel zjistí v průběhu plnění této Smlouvy. V takovém případě Objednatel může uplatnit práva z vadného plnění ihned poté, co se o vadném plnění dozvěděl;

c) v dostatečném předstihu před plánovanými změnami výrobních metod, postupů či použitých materiálů majících potenciální vliv na kvalitu plnění předmětu Smlouvy, bude Objednatele o této skutečnosti informovat a umožní Objednateli ověření, zda Poskytovatelem deklarované změny nemohou ovlivnit výslednou kvalitu výsledků poskytovaných služeb.

6.7. Objednatel je oprávněn v případě zjištění nedostatků při plnění dodávek dle této Smlouvy zahájit s Poskytovatelem neprodleně jednání směřující k nápravě vzniklého stavu.

6.8. Poskytovatel prohlašuje, že má uzavřenou pojistnou smlouvu s pojištěním odpovědnosti za újmu způsobenou vadou díla anebo přerušením provozu podniku, a to ve výši pojistného 1.000.000,- Kč (slovy: jedenmilión korun českých). Poskytovatel se zavazuje udržovat sjednané pojištění po celou dobu trvání této Smlouvy. Poskytovatel se zavazuje předložit kdykoli po uzavření této smlouvy do pěti dnů na výzvu Objednatele kopii pojistné smlouvy či smluv, vč. dokladů o úhradě pojistného za příslušné pojistné období. V případě, že Poskytovatel poruší povinnost uvedenou v tomto odstavci, je Objednatel oprávněn od této Smlouvy odstoupit.

7. Odpovědnost za vady

7.1. Poskytovatel prohlašuje, že výsledky poskytování služeb, jejichž dodání je předmětem této Smlouvy, má vlastnosti uvedené v této Smlouvě, Zadávací dokumentaci a vyžadované právními předpisy Evropské Unie a právními předpisy České republiky, dále pak vlastnosti, které jsou pro takové dílo obvyklé.

7.2. Poskytovatel je povinen dodat výsledky poskytovaných služeb v množství, jakosti a provedení dle této Smlouvy a dle Zadávací dokumentace, bez právních či faktických vad. Vadou se rozumí zejména odchylka od druhu nebo kvalitativních podmínek výsledku poskytnutých služeb nebo jejich části, stanovených touto Smlouvou nebo specifikovaných v objednávce nebo technickými normami či obecně závaznými právními předpisy.

7.3. Poskytovatel odpovídá za veškeré vady, které mají výsledky poskytnutých služeb v době jejich předání. Objednatel je oprávněn uplatnit jakékoli vady výsledků poskytnutých služeb ve lhůtě do 2 měsíců od jejich převzetí.

7.4. Objednatel je povinen případné vady výsledků poskytnutých služeb oznámit Poskytovateli bez zbytečného odkladu po jejich zjištění a uplatnit svůj požadavek na jejich odstranění, a to písemně nebo na e-mailovou adresu Poskytovatele určenou dle čl. 13.4 této Smlouvy. Neurčí-li Objednatel jinak, je Poskytovatel povinen odstranit vadu dodaných výsledků poskytnutých služeb nejpozději do 6 týdnů ode dne oznámení vady. V případě, že vadu nelze odstranit provedením sekvenace z téhož vzorku DNA, kterého se týká vadné plnění, je Objednatel oprávněn požadovat provedení služeb na jím nově zaslaném vzorku DNA; náklady na poskytnutí služeb včetně dopravy vzorku Poskytovateli nese v takovém případě Poskytovatel.

7.5. Nároky z vad výsledků poskytnutých služeb se nedotýkají nároku na náhradu škody nebo nároku na smluvní pokutu.

8. Sankce

8.1. V případě prodlení Poskytovatele s předáním výsledků poskytnutých služeb ve lhůtě stanovené v této Smlouvě, je Poskytovatel povinen zaplatit Objednateli smluvní pokutu ve výši 0,05 % z ceny příslušné objednávky bez DPH, s jejímž dodáním je v prodlení, a to za každý i započatý den prodlení.

8.2. V případě prodlení Objednatele se zaplacením ceny služeb ve lhůtě splatnosti stanovené dle čl. 4.7. a 4.11. této Smlouvy, je Objednatel povinen zaplatit Poskytovateli smluvní pokutu ve výši 0,05 % z dlužné částky bez DPH, s jejímž zaplacením je v prodlení, a to za každý i započatý den prodlení.

8.3. V případě porušení povinnosti Poskytovatele uchovávat vzorky DNA převzaté za účelem poskytnutí služeb a/nebo povinnosti Poskytovatele uchovávat výsledky sekvenování ve lhůtě stanovené v čl. 5.13 této Smlouvy, vzniká Objednateli právo na úhradu jednorázové smluvní pokuty u každého takto neuchovaného vzorku DNA ve výši 3.000,-Kč a u každého neuchovaného výsledku ve výši 50.000,-Kč.

8.4. Smluvní pokuta dle této Smlouvy je splatná po porušení uvedené povinnosti, na něž se vztahuje, do 10 dnů od doručení písemné výzvy oprávněné Smluvní strany k její úhradě straně povinné, a to bezhotovostním převodem na bankovní účet oprávněné Smluvní strany, uvedený v hlavičce této Smlouvy.

8.5. Povinností zaplatit smluvní pokutu není dotčen nárok na náhradu škody, jež se hradí v plné výši bez ohledu na uhrazenou výši smluvní pokuty. Zaplacením smluvní pokuty dále není dotčena povinnost Poskytovatele splnit závazky vyplývající z této Smlouvy.

9. Trvání, změny a ukončení platnosti Smlouvy

9.1. Tato Xxxxxxx se sjednává na dobu určitou, a to na dobu 24 měsíců od dne nabytí účinnosti

Smlouvy nebo do okamžiku vyčerpání celkového limitu plnění dle čl. 4.5. této Smlouvy.

9.2. Tato Smlouva může být ukončena pouze písemně, a to:

a) dohodou podepsanou oběma Smluvními stranami; v tomto případě platnost a účinnost

Smlouvy končí ke sjednanému dni;

b) jednostrannou vypovědí kterékoliv ze Smluvních stran bez udání důvodu, když výpovědní doba činí 3 měsíce a počíná běžet prvním dnem měsíce následujícího po měsíci, ve kterém byla písemná výpověď druhé straně doručena;

c) odstoupením od této Smlouvy v důsledku nesplnění povinnosti vyplývající z této Smlouvy řádně a včas ani po uplynutí dodatečně poskytnuté lhůty v délce 10 pracovních dnů;

d) odstoupením od této Smlouvy v důsledku zahájení insolvenčního řízení vůči druhé

Smluvní straně.

9.3. Vedle důvodů stanovených občanským zákoníkem může oprávněná Smluvní strana odstoupit pro podstatné porušení Smlouvy druhou Smluvní stranou, kterým se rozumí zejména:

a) na straně Objednatele nezaplacení ceny za služby dodané v souladu s podmínkami Smlouvy ve lhůtě delší 60 dnů po uplynutí splatnosti,

b) na straně Poskytovatele:

i. opakované porušení povinnosti stanovené touto Smlouvou;

ii. opakované poskytnutí služby, které neodpovídá specifikaci služeb dle objednávky;

iii. opakované dodání výsledků poskytnuté služby obsahujících vady.

9.4. Odstoupení nabývá účinnosti dnem prokazatelného doručení druhé Smluvní straně. V případě, že odstoupení od Smlouvy není možné doručit druhé Smluvní straně ve lhůtě 10 dnů od odeslání, považuje se odstoupení za doručené druhé Smluvní straně uplynutím

10. dne ode dne prokazatelného odeslání takového odstoupení druhé Smluvní straně.

9.5. V důsledku ukončení Smlouvy nedochází k zániku nároků na náhradu škody vzniklých porušením této Smlouvy, nároků na uhrazení smluvních pokut, ani jiných ustanovení, která podle projevené vůle stran nebo vzhledem ke své povaze mají trvat i po ukončení této Smlouvy.

10. Změna závazku ze Smlouvy

10.1. Objednatel si vyhrazuje změny závazku ve smyslu § 222 ZZVZ, a to tak, že v případě potřeby Objednatele a dle jeho rozpočtových možností v rozsahu objednávky služeb stejného charakteru dle přílohy č. 1 smlouvy, pakliže tato objednávka či součet dílčích objednávek nepřekročí 10 % celkové nabídkové ceny Poskytovatele stanovené v rámci zadávacího řízení, je Objednatel oprávněn dále odebírat služby dle této Smlouvy, a to po dobu nejdéle tří měsíců po uplynutí lhůty stanovené v čl. 9.1. této Smlouvy.

11. Řešení sporů

11.1. Smluvní strany mají zájem vyřešit vzájemně každý spor nebo neshodu smírně, neprodleně a co nejefektivněji z hlediska nákladů za daných okolností; kromě toho se Smluvní strany dohodly, že tam, kde to bude možné, nebude spor ani neshoda překážkou v realizaci dodávek dle této Smlouvy.

11.2. Smluvní strany se dohodly na volbě místní příslušnosti soudu v souladu s § 89a zákona č. 99/1963 Sb., občanského soudního řádu, tak že případné spory z této Smlouvy budou rozhodovány Obvodním soudem pro Prahu 6 v případě, že bude v prvním stupni věcně příslušný okresní soud, a Městským soudem v Praze v případě, že v prvním stupni má věcnou příslušnost krajský soud.

12. Ostatní závazky Poskytovatele

12.1. Poskytovatel je ve smyslu ustanovení § 2 písm. e) zákona č. 320/2001 Sb., o finanční kontrole ve veřejné správě povinen spolupůsobit při výkonu finanční kontroly. Poskytovatel bere na vědomí, že je povinen obdobnou povinností smluvně zavázat také své subdodavatele, které bude využívat k zajištění služeb dle této Smlouvy.

12.2. Poskytovatel je v rámci kontroly zejména povinen:

− vytvořit podmínky pro provedení kontroly, umožnit kontrolující osobě výkon jejích oprávnění stanovených příslušnou legislativou a poskytovat k tomu potřebnou součinnost osobně se zúčastnit a zdržet se jednání a činností, které by mohly ohrozit její řádný průběh;

− navrhnout nejbližší možný termín pro provedení kontroly v případě, že si Poskytovatel vyžádá náhradní termín s tím, že Poskytovatel je povinen navrhnout náhradní termín tak, aby se kontrola uskutečnila nejpozději do 7 kalendářních dnů ode dne navrhovaného kontrolující osobou;

− seznámit členy kontrolní skupiny s bezpečnostními předpisy, které se vztahují ke kontrolovaným objektům a které jsou tyto osoby povinny v průběhu kontroly dodržovat;

− předložit kontrolní skupině na vyžádání dokumenty o kontrolách jak fyzických, tak finančních, které provedly jiné kontrolní;

− podepsat zápis o provedení kontroly;

− umožnit kontrolní skupině vstup na pozemek, do každé provozní budovy, místnosti a místa včetně dopravních prostředků a přepravních obalů, přístup k účetním písemnostem, záznamům a informacím na nosičích dat v rozsahu nezbytně nutném pro dosažení cíle kontroly; tato povinnost se rovněž týká obydlí, které kontrolovaná osoba užívá pro podnikatelskou činnost;

− předložit kontrolní skupině ve stanovených lhůtách vyžádané doklady a poskytnout informace k předmětu kontroly;

− zajistit pro účely kontroly uchování originálů dokumentů souvisejících s realizací této Smlouvy do 31. 12. 2033, pokud legislativa nestanovuje pro některé dokumenty dobu delší.

13. Závěrečná ustanovení

13.1. Jednotlivá ustanovení této Smlouvy jsou oddělitelná v tom smyslu, že neplatnost některého z nich nezpůsobí neplatnost Smlouvy jako celku. Pokud by se v důsledku vydání obecně závazného právního předpisu kterékoliv ustanovení této smlouvy dostalo do rozporu s právním řádem a tento rozpor by způsoboval neplatnost této Smlouvy jako celku, bude tato Smlouva posuzována tak, jako kdyby takové ustanovení nikdy neobsahovala, a Smluvní strany se v této věci budou řídit obecně závaznými právními předpisy.

13.2. Tato Xxxxxxx představuje úplnou dohodu Smluvních stran o předmětu této smlouvy a nahrazuje veškerá předešlá ujednání mezi Smluvními stranami ústní i písemná.

13.3. Není-li v této Smlouvě stanoveno jinak, lze tuto Smlouvu měnit nebo doplňovat pouze písemnými dodatky podepsanými oprávněnými zástupci obou Smluvních stran. Adresy, telefonní čísla a jména pracovníků oprávněných jednat za Smluvní strany ve věci plnění této Smlouvy lze měnit i jednostranným písemným oznámením; Smluvní strany se zavazují neprodleně oznamovat změny uvedených údajů druhé Smluvní straně a v případě porušení této povinnosti se zavazují uhradit veškeré škody a náklady, které druhé Smluvní straně z porušení této povinnosti vznikly.

13.4. Níže je uveden zástupce Poskytovatele oprávněný jednat v záležitosti plnění této Smlouvy:

Jméno:

tel.:

e-mail:

13.5. Tato smlouva byla vyhotovena ve dvou (2) stejnopisech s platností originálu, přičemž

Poskytovatel obdrží jedno (1) a Objednatel jedno (1) vyhotovení.

13.6. Poskytovatel poskytuje souhlas s uveřejněním smlouvy v registru smluv zřízeném zákonem č. 340/2015 Sb., o zvláštních podmínkách účinnosti některých smluv, uveřejňování těchto smluv a o registru smluv, ve znění pozdějších předpisů. Poskytovatel bere na vědomí, že uveřejnění smlouvy v registru smluv zajistí Objednatel. Do registru smluv bude vložen elektronický obraz textového obsahu smlouvy v otevřeném a strojově čitelném formátu a rovněž metadata smlouvy.

13.7. Tato smlouva nabývá platnosti okamžikem jejího podpisu oběma Smluvními stranami a

účinnosti dnem uveřejnění v registru smluv dle čl. 13.6. této Smlouvy.

13.8. Smluvní strany tímto prohlašují, že se s obsahem této smlouvy řádně seznámily, že tato smlouva je projevem jejich vážné, svobodné a určité vůle prosté omylu, není uzavřena v

tísni a/nebo za nápadně nevýhodných podmínek, na důkaz čehož připojují své níže

uvedené podpisy.

Přílohy:

- č. 1: Kalkulace nabídkové ceny

- č. 2: Nároky zadavatele/Objednatele na způsob provádění zakázky

V Benešově dne: V Praze dne:

ředitel

Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.

	Příloha č. 1 smlouvy pro část 3 veřejné zakázky - kalkulace nabídkové ceny - DNA sekvenování‌
č. položky	Balíček služeb	Nabídková cena za balíček služeb v Kč bez DPH	Požadovaný počet jednotek	M.j.	Nabídková cena - všech reakcí v Kč bez DPH
1	Příprava knihovny pro sekvenování DNA kompatibilní se sekvenační platformou Illumina, sekvenace z obou stran (paired- ends) s výnosem min. 2 milonů výstupů s požadovanou min. délkou 300 bps.	19 981,00 Kč	4	1 balíček služeb dle druhého sloupce	79 924,00 Kč
2	Příprava knihovny pro sekvenování DNA technikou vedoucí k dlouhým čtením (více než 1000 bps, např. PacBio), sekvenace s výnosem min. 500 milonů bps.	29 926,00 Kč	10	1 balíček služeb dle druhého sloupce	299 260,00 Kč
3	Sekvenace genomu jabloně (Malus domestica, velikost genomu přibližně 753 Mbps) s minimálním pokrytím genomu 50x při sekvenování párovým čtením o délce jednoho čtení min. 250 bps.	37 349,00 Kč	18	1 xxxxxxx služeb dle druhého sloupce	672 282,00 Xx
	Xxxxxxx nabídková cena za celou předpokládanou dobu plnění - 24 měsíců				1 051 466,00 Kč
	Celková nabídková cena za celou předpokládanou dobu plnění - 24 měsíců včetně DPH				1 272 273,86 Kč
Poznámka:
	Účastník vyplní své ceny ve sloupci C tabulky. Vložené ceny jsou zkusmé pro ověření počítání.
	Tato Poznámka se do nabídky neuvádí.
	Za správnost výpočtů odpovídá účastník.

Příloha č. 2 smlouvy

“Technická specifikace pro část 3 veřejné zakázky: Sekvenování DNA (genomické sekvenování)”

Účelem veřejné zakázky je poskytování služeb v oblasti sekvenování DNA (čtení pořadí nukleotidů v DNA) součástí plnění jsou činnosti související se zajištěním požadovaných služeb.

MINIMÁLNÍ (NEPODKROČITELNÉ) POŽADAVKY:

• předmětem sekvenace bude DNA izolovaná z rostlinného materiálu v laboratořích zadavatele,

• požadujeme možnost opětovného zaslání DNA vzorků ze strany zadavatele v případě zjištění jejich nízké kvality na vstupní kontrole ze strany dodavatele,

• požadujeme možnost přípravy knihoven dodaných vzorků DNA pro sekvenování technikou vedoucí k dlouhým čtením (více než 1000 bps, např. PacBio) a následnou sekvenací s výstupem min. 500 mil. bps,

• požadujeme možnost přípravy knihoven dodaných vzorků DNA umožňujících sekvenování z obou stran (paired-ends) dle požadavků zadavatele a kompatibilních se sekvenační platformou Illumina:

a) s minimálním celkovým počtem získaných výstupů sekvenace 2 milióny výstupů z každého vzorku s požadovanou délkou získaných výstupů min. 300 bps,

b) s výstupem dat poskytujícím minimální pokrytí genomu jabloně (Malus domestica, velikost genomu přibližně 753 Mbps) s požadovaným minimálním pokrytím genomu 50x při sekvenování párovým čtením o délce jednoho čtení min. 250 bps.

Další požadavky zadavatele:

• požadujeme možnost příjmu vzorků dodavatelem ve formě roztoku zaslaném na suchém ledu nebo ve formě stabilizované vysušené DNA (např. ve zkumavce GenTegra),

• doprava DNA vzorků ze sídla zadavatele do laboratoře dodavatele není zahrnuta do ceny služby,

• požadujeme max. dobu předání výsledků sekvenování nebo jejich zveřejnění na webových stránkách dodavatele do 6 týdnů od data převzetí vzorků dodavatelem,

• výsledky sekvenování budou poskytnuty zadavateli elektronicky ve formátu *fastq,

• požadujeme uchování vzorků dodavatelem minimálně 4 týdny od předání výsledků zadavateli,

• požadujeme uchování výsledků sekvenování dodavatelem minimálně 6 měsíců, max. 24

měsíců od předání výsledků zadavateli,

• požadujeme přístup do bezplatné internetové aplikace se zabezpečeným přístupem, se zajištěním správy objednávek a přístupu do databáze výsledků pro pověřené osoby zadavatele.