RÁMCOVÁ DOHODA dle ust. § 1746 odst. 2 a násl. zákona č. 89/2012 Sb., občanský zákoník
RÁMCOVÁ DOHODA
dle ust. § 1746 odst. 2 a násl. zákona č. 89/2012 Sb., občanský zákoník
(dále jen „občanský zákoník“), uzavřená mezi následujícími smluvními stranami
Mendelova univerzita v Brně
Bc. Xxxx
Digitálně podepsal Xx. Xxxx Xxxxxxxx
se sídlem: Xxxxxxxxxx 0000/0, 000 00 Xxxx IČO: 62156489, DIČ:CZ62156489
Datum: 2019.02.13
14:54:13 +01'00'
Mikušová
bankovní spojení: XXXXXXXXXX, číslo účtu: XXXXXXXXXX zastoupena: xxxx. Xxx. Xxxxxx Xxxxxxxxx, Ph.X., rektorkou
koordinátor projektu: prof. Xx. Xxx. Xxxxx Xxxxxxxxx správce rozpočtu: Xxx. Xxxxx Xxxxxxxxxx
kontaktní osoba v technických záležitostech: XXXXXXXXXX e-mail: XXXXXXXXXX, tel: +420 XXXXXXXXXX
dále jen „objednatel“ na straně jedné
Název: SEQme s.r.o.
se sídlem: Dlouhá 176, 263 01, Xxxxxx XXX: 24312819, DIČ: CZ24312819
Poskytovatel: JE plátcem DPH
bankovní spojení: XXXXXXXXXX; XXXXXXXXXX, číslo účtu: XXXXXXXXXX za niž jedná: Xxxxxxx Xxxxxxxxx, jednatel
kontaktní osoba: XXXXXXXXXX
e-mail: XXXXXXXXXX, tel. XXXXXXXXXX
dále jen „poskytovatel“ na straně jedné
Objednatel a poskytovatel dále společně rovněž „smluvní strany“
I.
Preambule
Tato dohoda je uzavírána na základě výsledku zadávacího řízení s názvem „Rámcová dohoda na zajištění sekvenování DNA na platformě Illumina“ (dále jen „zadávací řízení“ nebo rovněž „veřejná zakázka“), v rámci kterého byl poskytovatel vybrán pro zajištění níže uvedených služeb, jež jsou předmětem veřejné zakázky. Smluvní strany jsou v pochybnostech povinny vykládat tuto dohodu v souladu se zadávacími podmínkami zadávacího řízení a obsahem nabídky, která byla do zadávacího řízení poskytovatelem podána.
II.
Předmět dohody
Předmětem plnění dle této dohody je vymezení podmínek týkajících se dílčích služeb prováděných poskytovatelem na základě objednávek objednatele, přičemž službou se rozumí: provedení sekvenování DNA (čtení pořadí nukleotidů) a souvisejících služeb. Předmět plnění je podrobně specifikován v příloze č. 1, která je nedílnou součástí této dohody. Jednotlivá dílčí plnění budou poskytovatelem uskutečňována po předchozí písemné výzvě objednatele k poskytnutí plnění (dále rovněž jen „objednávky“) prostřednictvím systému SAP objednatele. Poskytovatel je povinen písemně akceptovat výzvu k plnění, do druhého pracovního dne ode dne řádného odeslání objednávky. Jestliže poskytovatel nevznese připomínky, je povinen nejpozději druhý pracovní den po odeslání objednávky potvrdit písemně přijetí objednávky. V zadávacím řízení specifikovaný počet sekvenací pro účely stanovení nabídkové ceny je pouze orientační, neboť objednatel nemůže dopředu předvídat své potřeby – maximální počet však bude 6 reakcí.
III.
Termín, způsob a místo plnění
3.1 Poskytovatel se zavazuje pro objednatele, za podmínek touto dohodou sjednaných, poskytovat na základě jednotlivých objednávek služby specifikované v čl. II dohody. Počátek plnění nastane po účinnosti rámcové dohody a to po dobu určitou – na 12 měsíců od účinnosti smlouvy (tedy od jejího vložené do registru smluv). Pokud tato dohoda nebo jednotlivé objednávky nestanoví jinak, je poskytovatel povinen objednateli odevzdat výsledek sekvenačních reakcí, specifikovaných v jednotlivých objednávkách, nejpozději do 6 týdnů od převzetí vzorků poskytovatelem.
3.2 Doprava DNA fragmentů ze sídla objednatele k poskytovateli je poskytnuta dle nabídky vybraného poskytovatele.
3.3 Systém poskytovatele pro přístup k výsledkům sekvenování, který je neomezeně přístupný na adrese xxx.xxxxx.xx
3.4 Poskytovatel zajistí uchování vzorků ve svých prostorách v délce nejméně 4 týdnů od předání výsledků objednateli.
3.5 Poskytovatel zajistí uchování výsledků sekvenace v délce nejméně 2 týdnů od předání výsledků objednateli – celkem poskytovatel garantuje uchování na: 53 týdnů – doba uchování výsledků nepřesáhne dobu, na kterou bude rámcová dohoda uzavřena – tedy dobu 12 měsíců od účinnosti rámcové dohody (od vložení do registru smluv).
3.6 Poskytovatel zajistí zpřístupnění a spuštění bezplatné internetové aplikace serveru Illumina pro pověřené osoby objednatele (administrátora služeb zadavatele) se zabezpečeným
přístupem, pro zajištění správy objednávek a databáze výsledků – případně jiným způsobem, pokud Illumina změní způsob zpřístupňování výsledků sekvenací uživatelům.
3.7 Místem plnění je Phytophtora Research Centre, Ústav ochrany lesů a myslivosti, LDF, Mendelova univerzita v Brně, Xxxxxxxxxx 0, 000 00 Xxxx.
3.8 Knihovny budou připraveny k sekvenaci zadavatelem a budou dopraveny poskytovateli buď:
3.8.1 Lyofilizované s navázanými magnetickými kuličkami (dried magnetic beads). Poskytovatel dostane všechny potřebné informace o metodě lyofilizace a přípravě knihovny. Kontrolu kvality, naředění a úpravu koncentrace vzorku provede poskytovatel.
nebo
3.8.2 V roztoku na suchém ledu. Poskytovatel dostane všechny potřebné informace o metodě přípravy knihovny. Kontrolu kvality a úpravu koncentrace vzorku provede poskytovatel.
IV.
Cena a platební podmínky
4.1 Maximální celková cena plnění za dobu trvání rámcové dohody je stanovena na 1.050.000 Kč bez DPH
4.2 Cena za jednotlivé dílčí plnění v souladu s technickou specifikací uvedenou v příloze č. 1 je: 175.000 Kč bez DPH
4.3 Cena uvedená za jednotlivé dílčí plnění v bodu 4.2 je konečná a nejvýše přípustná, přičemž v takto stanovené ceně jsou zahrnuty veškeré náklady poskytovatele související s řádným plněním této dohody (např. další náklady poskytovatele). Pokud zákon č. 235/2004 Sb., o dani z přidané hodnoty, v platném znění (dále též „zákon o DPH“) bude v době uskutečnění zdanitelného plnění poskytovatele změněn, bude poskytovatel připočítávat k dohodnuté ceně daň z přidané hodnoty v procentní sazbě, odpovídající zákonné úpravě zákona o DPH k datu uskutečnění zdanitelného plnění.
4.4 Zaplacení ceny služby bude provedeno bezhotovostně po převzetí poskytovatelem vystavených daňových dokladů (faktur), a to na bankovní účet uvedený na těchto daňových dokladech (fakturách). Objednatel neposkytuje zálohy.
V.
Platební podmínky
5.1 Poskytovatel bude vystavovat souhrnné faktury vždy za období 1 kalendářního měsíce, pokud v daném měsíci došlo k objednávce a realizaci služby (adresa pro zasílání faktury je: Mendelova univerzita v Brně, Xxxxxxxxxx 0, 000 00 Xxxx).
5.2 Daňový doklad (fakturu) doručí poskytovatel objednateli v jednom výtisku neprodleně, nejpozději však do 15 dnů ode dne vystavení. Objednatel zaplatí cenu za služby dle daňového dokladu (faktury) do 30 dnů ode dne jeho prokazatelného obdržení.
5.3 Daňový doklad (faktura) musí obsahovat zejména všechny náležitosti stanovené zákonem o DPH.
5.4 Přílohou daňového dokladu musí být seznam realizovaného plnění s jednotkovými cenami.
5.5 Objednatel je oprávněn před uplynutím lhůty splatnosti vrátit daňový doklad (fakturu), který neobsahuje požadované náležitosti, není doložen požadovanými nebo úplnými doklady, nebo obsahuje nesprávné cenové údaje.
5.6 Ve vráceném daňovém dokladu (faktuře) musí objednatel vyznačit důvod vrácení daňového dokladu (faktury). Poskytovatel je povinen vystavit nový daňový doklad (fakturu) s tím, že oprávněným vrácením daňového dokladu (faktury) přestává běžet původní lhůta splatnosti daňového dokladu (faktury) a běží nová lhůta stanovená v čl. 5.2 této dohody ode dne prokazatelného doručení opraveného a všemi náležitostmi opatřeného daňového dokladu (faktury) objednateli.
5.7 Poskytovateli bude uhrazena skutečně provedená práce podle počtu objednaných a skutečně poskytnutých služeb podle přílohy č. 1.
5.8 U zahraničních poskytovatelů bude platba prováděna v EURECH.
5.9 U Českých daňových rezidentů bude platba prováděna v Kč, kdy pro přepočet bude použit kurz ČNB ke dni vystavení faktury. Na faktuře bude uveden počet realizovaných služeb, jednotková cena v EUR, kurz pro přepočet a cena v Kč.
VI.
Odpovědnost za vady
6.1 Poskytovatel se zavazuje činit úkony a poskytovat objednanou službu v požadované kvalitě a v této dohodě dohodnutých lhůtách.
6.2 Objednatel uplatní právo z odpovědnosti poskytovatele za vady předmětu dohody a ze záruky za jakost písemným oznámením poskytovateli.
6.3 Poskytovatel je povinen odstranit vady předmětu dohody do 5 dnů ode dne doručení výše uvedeného písemného oznámení, čímž není dotčeno právo na náhradu způsobené škody, kterou může objednatel v souvislosti s uplatněnými vadami po poskytovateli požadovat.
6.4 V případě, že poskytovatel neoprávněně odmítne odstranit vadu předmětu dohody nebo vadu, na kterou se vztahuje záruka za jakost, má objednatel právo od dohody odstoupit.
VII.
Smluvní pokuta, náhrada škody
7.1 V případě prodlení poskytovatele se splněním povinnosti ve lhůtách dle této dohody má objednatel právo na úhradu smluvní pokuty ve výši 0,1 % z celkové smluvní ceny služby – v objednávce požadovaného plnění (včetně DPH) za každý i započatý den prodlení s jeho splněním, nejméně však 500 Kč za každý započatý den prodlení.
7.2 V případě neuchování vzorků v rozsahu garantovaném poskytovatelem v bodě 3.4, má objednatel právo na úhradu jednorázové smluvní pokuty u každého takto neuchovaného vzorku ve výši 10 000,- Kč.
7.3 Objednatel je povinen uplatnit nárok na smluvní pokutu a její výši písemnou výzvou. Smluvní pokuta je splatná do 10 dnů od doručení této výzvy
7.4 Jestliže dojde k poškození vzorků vinou přepravce (poškozený přepravní obal, ztráta apod.), kterého zajistil poskytovatel, je poskytovatel povinen uhradit objednateli odškodnění ve výši 100 Kč za každý jednotlivý vzorek.
7.5 Náhrada škody je vymahatelná samostatně v plné výši vedle smluvní pokuty.
VIII.
Další práva a povinnosti poskytovatele
8.1 Poskytovatel se zavazuje archivovat veškeré účetní doklady a dokumentaci spojenou se zadávacím řízením do roku 31. 12. 2033.
8.2 Poskytovatel se dále zavazuje, že umožní všem subjektům oprávněným k výkonu kontroly projektů, z jejichž prostředků může být služba hrazena, provést kontrolu dokladů souvisejících s plněním zakázky, a to po dobu stanovenou právními předpisy ČR k jejich archivaci (zákon č. 563/1991 Sb., o účetnictví, a zákon č. 235/2004 Sb., o dani z přidané hodnoty).
8.3 Poskytovatel je povinen zkontrolovat přejímané vzorky a je oprávněn odmítnout požadované plnění v případě, že vzorky jsou poškozeny. O této situaci je poskytovatel povinen bezodkladně informovat objednatele.
IX.
Zánik dohody
9.1 Smluvní strany se dohodly, že tato dohoda zaniká vedle případů stanovených občanským zákoníkem také:
a) dohodou smluvních stran spojenou se vzájemným vyrovnáním účelně vynaložených nákladů,
b) vyčerpáním předpokládané hodnoty plnění
c) jednostranným odstoupením od dohody ze strany objednatele pro její podstatné porušení poskytovatelem, kterým se rozumí zejména:
- prodlení poskytovatele s poskytováním služeb,
- neoprávněné odmítnutí poskytovatele odstranit vadu předmětu dohody,
- opakované porušení povinností poskytovatele vyplývající z této dohody, přičemž opakovaným porušením se rozumí nejméně třetí porušení jakékoliv povinnosti,
- jednostranným odstoupením od dohody ze strany objednatele pro neposkytnutí potřebné součinnosti – odmítnutí realizace některé ze služeb uvedených v příloze č. 1.
d) objednatel je oprávněn ze stejných důvodů odstoupit také pouze od dílčího plnění, jehož se podstatné porušení, definované v tomto článku, týká. Odstoupením objednatele od dílčího plnění tato dohoda nezaniká.
e) poskytovatel může tuto dohodu vypovědět, a to i bez udání důvodu, přičemž výpovědní doba činí 3 měsíce a počíná běžet prvním dnem měsíce, který následuje po měsíci, v němž byla písemná výpověď objednateli řádně doručena.
X.
Obecné nařízení o ochraně osobních údajů, důvěrnost informací
10.1 Smluvní strany jsou si vědomy toho, že v rámci plnění smlouvy mohou:
- vzájemně si poskytnout informace, které budou považovány za osobní údaje podle Nařízení Evropského parlamentu a Rady (EU) č. 2016/679 ze dne 27. dubna 2016 o ochraně fyzických osob v souvislosti se zpracováním osobních údajů a o volném pohybu těchto údajů a o zrušení směrnice 95/46/ES (obecné nařízení o ochraně osobních údajů - dále jen „směrnice“);
- získat přístup k osobním údajům zaměstnanců druhé smluvní strany;
- získat přístup k důvěrným informacím druhé smluvní strany.
10.2 Osobním údajem se rozumí jakákoliv informace týkající se určené nebo určitelné fyzické osoby, k níž se osobní údaje vztahují. Tato se považuje za určenou nebo určitelnou, jestliže lze fyzickou osobu přímo či nepřímo identifikovat zejména na základě čísla, kódu nebo jednoho či více prvků, specifických pro její fyzickou, fyziologickou, psychickou, ekonomickou, kulturní nebo sociální identitu.
10.3 Důvěrnou informací se rozumí jakákoliv informace, materiál, studie, zpráva, dokument, databáze, dokumenty, osobní údaje nebo jiné údaje poskytnuté ústně, písemně, vizuálně, elektronickou formou nebo jakýmkoliv jiným způsobem, týkající se druhé smluvní strany, její spřízněné osoby, jejich zaměstnanců nebo obchodních partnerů, které druhá smluvní strana označí jako „důvěrné“. Nedohodnou-li se smluvní strany výslovně jinak, považují se za důvěrné implicitně všechny informace, které jsou anebo by mohly být součástí obchodního tajemství, tj. například popisy nebo části popisů technologických procesů a vzorců, technických vzorců a technického know-how, informace o provozních metodách, procedurách a pracovních postupech, obchodní nebo marketingové plány, koncepce a strategie nebo jejich části, nabídky a všechny další informace, jejichž zveřejnění přijímající stranou by předávající straně mohlo způsobit škodu.
10.4 Smluvní strany si dávají vzájemný souhlas ke zpracování poskytnutých důvěrných informací a to pouze v rozsahu, který je nezbytný k plnění předmětu smlouvy. Souhlas se poskytuje na dobu určitou a jeho účinnost skončí nejdříve pět (5) let po ukončení účinnosti této smlouvy.
10.5 Smluvní strana může druhou smluvní stranu požádat o výmaz osobních údajů, které souvisí s druhou smluvní stranou i před uplynutím doby podle odst. 4. Výmaz provede smluvní strana po obdržení žádosti druhé smluvní strany bez zbytečného odkladu.
10.6 Ustanovení odst. 5 se nepoužije v případě, že právo Evropské unie nebo členského státu vyžaduje uchování příslušných poskytnutých osobních údajů.
10.7 Souhlas se zpracováním důvěrných informací může smluvní strana kdykoliv odvolat.
10.8 Smluvní strany jsou povinny zachovávat mlčenlivost o všech důvěrných informacích.
10.9 Smluvní strany se zavazují, že podle čl. 32 směrnice zajistí ochranu důvěrných informací a/nebo dokumentů před jejich krádeží, odcizením, zcizením či jiným zpřístupněním jakékoliv třetí osobě s výjimkou případných poddodavatelů, kteří jsou nezbytní ke splnění předmětu smlouvy a to pouze v nejnutnějším možném rozsahu.
10.10 S výjimkou plnění této smlouvy, se obě strany zavazují nepublikovat žádným způsobem důvěrné informace druhé strany, nepředat je třetí straně ani svým vlastním zaměstnancům a zástupcům s výjimkou těch, kteří s nimi potřebují být seznámeni, aby mohli splnit smlouvu. Obě strany se zároveň zavazují nepoužít důvěrné informace druhé strany jinak než za účelem plnění smlouvy nebo uplatnění svých práv z této smlouvy.
10.11 Pokud jsou důvěrné informace poskytovány v písemné podobě anebo ve formě textových souborů na počítačových médiích, je předávající strana povinna upozornit přijímající stranu na důvěrnost takového materiálu jejím vyznačením alespoň na titulní stránce.
10.12 Ustanovení odst. 1 až odst. 9 se vztahují jak na smluvní ujednání nová, tak v případě, že jsou součásti dodatku smlouvy původní, vztahují se rovněž na smlouvu vč. všech následných dodatků.
XI.
Závěrečná ustanovení
11.1 Právní vztahy touto dohodou neupravené se řídí příslušnými ustanoveními občanského zákoníku a předpisy souvisejícími.
11.2 V případě, že nastane zjevný rozpor mezi touto dohodou a její přílohou, budou přednostně aplikována ustanovení této dohody.
11.3 Změny a dodatky této dohody lze činit pouze písemnými, vzestupně číslovanými dodatky, podepsanými oběma smluvními stranami.
11.4 Tato dohoda je vyhotovena ve čtyřech stejnopisech, z nichž zadavatel obdrží tři stejnopisy a poskytovatel jedno.
11.5 Smluvní strany si text přečetly a prohlašují, že tato dohoda vyjadřuje jejich pravou a svobodnou vůli, což stvrzují svými podpisy.
11.6 Tato dohoda nabývá platnosti dnem podpisu oběma smluvními stranami a účinnosti vložením do registru smluv.
11.7 Dohoda nabývá účinnosti nejdříve dnem splnění všech zákonných podmínek.
11.8 Poskytovatel souhlasí s uveřejněním dohody včetně všech jejích příloh na profilu zadavatele.
11.9 Poskytovatel souhlasí, ve shodě se zněním zákona č. 340/2015 Sb., o registru smluv s uveřejněním dohody včetně všech jejích příloh v příslušném registru.
XII.
Přílohy
12.1 Nedílnou součást této dohody tvoří: Příloha č. 1_technická specifikace plnění
V Brně dne: 13. 2. 2019 V Dobříši dne 6/2/2019
podpis podpis
………………………………………… ………………………………………….. prof. Xx. Xxx. Xxxxx Xxxxxxxxx, Xxxxxxx Xxxxxxxxx, jednatel SEQme s.r.o. koordinátor projektu
podpis
………………………………………… Xxx. Xxxxx Xxxxxxxxxx,
správce rozpočtu
podepsala v zastoupení prorektorka doc. RNDr. Xxxxx Xxxxxxx, XXx. na základě plné moci ze dne 16. 7. 2018, razítko
………………………………………… xxxx. Xxx. Xxxxxx Xxxxxxxx, Ph.X., rektorka
Příloha č. 1 – Technické podmínky
Účelem veřejné zakázky je uzavření smlouvy o poskytování služeb v oblasti sekvenování DNA (čtení pořadí nukleotidů v DNA) mezi zadavatelem a jedním poskytovatelem na dobu určitou – a to na 12 měsíců od účinnosti smlouvy (vkladem do registru smluv), přičemž součástí plnění jsou činnosti související se zajištěním požadovaných služeb.
V rámci předmětu plnění rámcové dohody bude zajištěno zejména:
• Sekvenování knihoven DNA připravených zadavatelem metodou Genotyping-by-Sequencing nebo metodou odvozenou. Knihovnou se rozumí sekvenační knihovna kompatibilními se sekvenační platformou Illumina, to jest fragmenty DNA vybavené specifickými sekvencemi nezbytnými pro sekvenování na platformě Illumina.
• Cílový organizmus, který bude předmětem sekvenace DNA, je Phytophthora × cambivora a příbuzné druhy – velikost genomu cca 231 Mbp.
• Sekvenování nové generace (NGS) bude probíhat na přístroji Illumina – NovaSeq 6000 nebo HiSeq (4000 nebo 3000), PE 150 Cycle.
• Knihovny budou připraveny k sekvenaci zadavatelem a budou dopraveny poskytovateli buď:
a) Lyofilizované s navázanými magnetickými kuličkami (dried magnetic beads). Poskytovatel dostane všechny potřebné informace o metodě lyofilizace a přípravě knihovny. Kontrolu kvality, naředění a úpravu koncentrace vzorku provede poskytovatel. (Preferované)
nebo
b) V roztoku na suchém ledu. Poskytovatel dostane všechny potřebné informace o metodě přípravy knihovny. Kontrolu kvality a úpravu koncentrace vzorku provede poskytovatel. (Akceptovatelné)
Pozor: schopnost zpracovat knihovny lyofilizované s navázanými magnetickými kuličkami je výhodou při hodnocení nabídek a je jedním z hodnotících kritérií (více bod 16 Výzvy k podání nabídek)
Očekávaný počet získaných výstupů sekvenace je nejméně 600 milionů párových (z obou stran) sekvencí molekul DNA v knihovně, tj. 300 milionů fragmentů DNA osekvenovaných z každé strany, očekávaná délka sekvencí je 150 bp
• Očekávaný počet získaných výstupů sekvenace po filtraci dat (tzv. pass filter reads) je 600 milionů párově osekvenovaných (z obou stran) sekvencí molekul DNA v knihovně (paired-ends), 300 milionů výstupů sekvenace z každé strany.
• Očekávané délky získaných výstupů sekvencí jsou 2×150 bp (PE - paired-ends).
Zadavatel obecně požaduje:
• Zadavatel požaduje výsledky sekvenování do 6 týdnů od převzetí vzorků poskytovatelem.
• Zadavatel požaduje uchování výsledků sekvenace u poskytovatele v minimální délce 2 týdny (delší doba uchování, nejlépe po celou dobu trvání rámcové dohody, je výhodou při hodnocení nabídek a představuje jedno z hodnotících kritérií – viz bod. 16 Výzvy k podání nabídek)
• Zadavatel požaduje uchování vzorků u poskytovatele v minimální délce 4 týdnů od předání výsledků.
• Výsledky sekvenování budou poskytnuty zadavateli elektronicky. Zadavatel požaduje, aby poskytovatel zajistil určené osobě zadavatele přístup k databázi výsledku na uživatelském serveru Illumina nebo na jiném počítačovém serveru.
Nabídková cena musí obsahovat veškeré nutné náklady k řádnému splnění předmětu zakázky.