pro nadlimitní veřejnou zakázku

Příloha č. 2 – Obchodní podmínky

pro nadlimitní veřejnou zakázku

Rámcová dohoda na dodávku chemických látek a homogenizačních

zkumavek 2019-2021– rozděleno na části

• návrh rámcové dohody

Preambule:

Obchodní podmínky pro plnění této veřejné zakázky stanovené výzvou k podání nabídky musí být dodavatelem v nabídce respektovány. Obchodní podmínky jsou formulovány způsobem, umožňujícím převzít jejich text do nabídky (návrhu rámcové dohody).

Obchodní podmínky jsou obsaženy v přiloženém návrhu rámcové dohody (včetně příloh), který dodavatel použije pro zpracování nabídky, tj. na vyznačených místech návrh rámcové dohody doplní o požadované údaje (vyplní volná formulářová pole), přiloží všechny požadované přílohy a podepíše dokument způsobem stanoveným podle výpisu z obchodního rejstříku nebo jiné obdobné evidence, popř. jej podepíše zástupce dodavatele. Pod podpisem oprávněné osoby bude uvedeno její jméno, příjmení, funkce a obchodní firma.

Rámcová dohoda

na dodávku chemických látek a homogenizačních zkumavek – rozděleno na části

uzavřená v souladu s ustanovením § 2079 a násl. zákona č. 89/2012 Sb., občanský zákoník Smluvní strany:

Mendelova univerzita v Brně

Sídlo: Zemědělská 1665/1, 613 00 Brno

Zastoupena: xxxx. Xxx. Xxxxxx Xxxxxxxxx, Ph.D., rektorkou Ke smluvnímu

jednání oprávněni: prof. Xx. Xxx. Xxxxx Xxxxxxxxx, koordinátor projektu jako příkazce

operace

Xxx. Xxxxx Xxxxxxxxxx, manažerka projektu jako správce rozpočtu

IČO: 62156489

DIČ: CZ 00000000

Bankovní spojení: XXXXX; č.ú.: XXXXX

na straně jedné a dále v textu jen „kupující“

GeneTiCA s.r.o.

Sídlo: Služeb 3056/4, 108 00 Praha 10 Za niž jedná: RNDr. Xxxx Xxxxxx, jednatel IČO: 25609378

DIČ: CZ25609378

Bankovní spojení: XXXXX; č. ú.: XXXXX

Údaj o zápise v OR: Městský soud v Praze, oddíl C, vložka 54529 Zástupce pro věcná jednání: XXXXX

tel., email: +420 XXXXX, XXXXX

dále jen „prodávající“

I. Předmět rámcové dohody

1. Předmětem rámcové dohody je vymezení podmínek mezi kupujícím na straně jedné a prodávajícím na straně druhé, týkající se zajištění dodávek chemikálií a homogenizačních zkumavek prodávajícím kupujícímu, a to na základě jednotlivých objednávek (výzev k plnění). Jednotlivá plnění budou realizována po dobu platnosti rámcové dohody.

2. Dodávka chemikálií a homogenizačních zkumavek dle požadavků kupujícího bude vždy

specifikovaná v objednávce.

3. Dílčím plněním - dodávkou se pro účely této rámcové dohody rozumí veškerá dodávka jednotlivých plnění v rozsahu konkrétních položek uvedených v příloze č. 1, která je nedílnou součástí této rámcové dohody.

4. Cílem veřejné zakázky je zabezpečení studijních a vědecko-výzkumných prací zaměstnanců a studentů kupujícího.

5. Kupující uzavírá rámcovou dohodu s jedním dodavatelem analogicky podle ust. § 132 zákona č. 134/2016 Sb., o zadávání veřejných zakázek (dále jen ,,zákon“). Prodávající je po celou dobu účinnosti rámcové dohody vázán svojí nabídkou ze dne 8.8. 2019 (doplní prodávající), na jejímž základě je rámcová dohoda uzavřena.

6. Rámcová dohoda je uzavřena na základě výsledků zadávacího řízení na veřejnou zakázku

„Rámcová dohoda na dodávku chemických látek a homogenizačních zkumavek 2019- 2021 - rozděleno na části“.

II. Jednotlivá plnění

1. Jednotlivými plněními se rozumí zajištění a poskytnutí dodávky chemikálií a homogenizačních zkumavek prodávajícím kupujícímu na základě výzvy k plnění (za výzvu k plnění je považována objednávka). Jednotlivá plnění budou vždy blíže vymezena v objednávce (zejm. rozsah a množství položek, termín a místo plnění).

2. Za písemnou výzvu k poskytnutí plnění dle zákona je považována také objednávka vystavená kupujícím v systému SAP a odeslaná prodávajícímu, který ji potvrdí.

3. Objednávka musí obsahovat požadavky na konkrétní položky chemikálií a dále:

a) přesný termín požadovaného plnění

b) přesné místo dodání plnění

c) množství a typ požadovaných chemikálií

d) identifikační údaje kupujícího

e) odpovědnou osobu kupujícího, která zkontroluje a převezme plnění

(e-mailová adresa a mobilní telefonní číslo), se kterou mohou být řešeny případné

nejasnosti.

4. Prodávající je povinen se k objednávce vyjádřit (potvrdit, případně odmítnout) vždy do 2

pracovních dnů.

III. Termín, místo a způsob plnění

1. Prodávající se zavazuje pro kupujícího za podmínek touto rámcovou dohodou sjednaných realizovat předmět rámcové dohody v období od uzavření rámcové dohody po dobu 24 měsíců.

2. Místem plnění je Mendelova univerzita v Brně, Lesnická a dřevařská fakulta,

Ústav ochrany lesů a myslivosti, Zemědělská 1665/3, 613 00 Brno nebo laboratoř

„Phytophthora Research Centre, třída Generála Píky, 613 00 Brno, nebude-li v konkrétní objednávce uvedeno jinak.

3. Prodávající je povinen předat zboží kupujícímu do 3 týdnů (pokud není v technické specifikaci uvedeno jinak) od potvrzení objednávky na výše určené místo, pokud si je nevyzvedne zástupce kupujícího přímo na provozovně.

4. Konkrétní místo plnění bude určeno ve výzvě k dílčímu plnění (objednávce).

5. Pokud prodávající nebude schopen zajistit termíny nebo kvalitu dodávek, má kupující právo od rámcové dohody nebo od jejího dílčího plnění odstoupit.

6. Ke každé dodávce předá prodávající kupujícímu příslušné doklady (prohlášení o shodě, návod k použití, případně certifikáty apod.).

IV. Záruka za kvalitu dodávky

1. Prodávající se zavazuje zabezpečit objednané dodávky v požadované kvalitě v dohodnutých lhůtách a cenách tak, aby byly splněny veškeré související zákony, předpisy a normy.

V. Cena předmětu veřejné zakázky, platební podmínky

1. Maximální celková cena plnění za dobu trvání rámcové dohody je:

• Pro část 3: Kity a reagencie pro přípravu knihoven pro sekvenování na sekvenátorech Illumina, kity pro přímou amplifikaci DNA z rostlinného materiálu, kity pro amplifikaci cDNA konců – 600 000,- Kč bez DPH;

• Pro část 4: Reagencie pro sekvenaci na sekvenátorech Illumina – 310 000,- Kč bez

DPH

2. Cena za jednotlivá dílčí plnění bude stanovena podle skutečně realizovaných dodávek a cenové nabídky prodávajícího ze dne: 8.8. 2019, která je přílohou č. 1 rámcové dohody.

3. Ceny uvedené v nabídce prodávajícího (v příloze č. 1 této rámcové dohody) se stanovují jako nejvýše přípustné ceny bez DPH za jednotlivé položky obsažené v seznamu. DPH bude vyúčtována dle aktuálních právních předpisů.

4. V ceně za každou jednotlivou položku jsou zahrnuty veškeré související náklady prodávajícího jako např. cena dopravy, nakládka a vykládka, pojištění, kurzová rizika atd.

5. Pokud zákon č. 235/2004 Sb., o dani z přidané hodnoty, v platném znění (dále též „zákon o DPH“) bude v době uskutečnění zdanitelného plnění prodávajícího změněn, bude prodávajícímu fakturovat k dohodnuté ceně daň z přidané hodnoty v procentní sazbě odpovídající zákonné úpravě zákona o DPH ke dni uskutečnění zdanitelného plnění.

VI. Platební podmínky

1. Cenu jednotlivého plnění uhradí kupujícímu bezhotovostním převodem na bankovní účet prodávajícího na základě řádně vystavené a prokazatelně doručené faktury kupujícímu. Přílohou každé faktury je doklad o poskytnutí dílčího plnění. Faktura je splatná vždy do 30 dní ode dne uskutečnění zdanitelného plnění.

2. Dnem uskutečnění zdanitelného plnění je vždy den předání a převzetí dílčího plnění, jež je doloženo dokladem o poskytnutí dílčího plnění (dodací list potvrzený oběma stranami). Daňový doklad (faktura) musí obsahovat zejména všechny náležitosti stanovené zákonem o DPH. V případě, že faktura nebude mít odpovídající náležitosti (zejm. není doložen požadovanými nebo úplnými doklady nebo obsahuje nesprávné cenové údaje), je kupující oprávněn ve lhůtě splatnosti ji vrátit prodávajícímu s vytknutím nedostatků, aniž by se dostal do prodlení se splatností.

3. Ve vráceném daňovém dokladu (faktuře) musí kupující vyznačit důvod vrácení daňového dokladu (faktury). Prodávající je povinen vystavit nový daňový doklad (fakturu) s tím, že oprávněným vrácením daňového dokladu (faktury) přestává běžet původní lhůta splatnosti daňového dokladu (faktury) a běží nová lhůta stanovená v odst. 1 tohoto článku, a to ode dne prokazatelného doručení opraveného a všemi náležitostmi opatřeného daňového dokladu (faktury) kupujícímu.

4. Kupující neposkytuje zálohy.

5. Kupující upozorňuje dodavatele, že na jednotlivých fakturách musí být uvedeno registrační číslo projektu. Prodávající uvede na faktuře následující text: ,,OP VVV – projekt Výzkumné centrum pro studium patogenů z rodu Phytophthora", reg.č. CZ.02.1.01/0.0/0.0/ 15_003/0000453; Phytophthora Research Centre, CZ.02.1.01/0.0/0.0/ 15_003/0000453.“

VII. Práva a povinnosti smluvních stran, dodací podmínky

1. Kupující je povinen zasílat prodávajícímu objednávky na jeho kontaktní adresu uvedenou

v záhlaví této dohody.

2. Kupující se zavazuje poskytnout prodávajícímu veškerou součinnost nutnou k zajištění řádného plnění dodávek a zejména mu pro tuto činnost včas předat veškeré potřebné informace a materiály (zejména objednávky), o které prodávající kupujícího požádá.

3. Prodávající se zavazuje poskytovat dodávku a její dílčí plnění řádně a včas, při poskytování plnění postupovat s veškerou odbornou péčí a dodržovat všechny právní předpisy vztahující se k předmětu plnění. V případě jejich porušení vzniká kupujícímu nárok na náhradu škody způsobenou porušením těchto povinností.

4. Prodávající je oprávněn při realizaci plnění a při svých činnostech použít poddodavatele. V tomto případě však odpovídá kupujícímu ve stejném rozsahu jako by dodávku poskytoval on sám. Prodávající je povinen zachovávat mlčenlivost o všech skutečnostech, které získal od kupujícího v souvislosti s posykováním plnění a zavazuje se zajistit, aby dokumenty předané mu kupujícím nebyly zneužity třetími osobami. Povinnost zachovávat mlčenlivost trvá i po skončení smluvního vztahu založeného touto dohodou. Prodávající zajistí splnění této povinnosti také třetími osobami.

5. Uskutečněním dílčího plnění prodávajícím kupujícímu se rozumí dodání zboží tak, jak je uvedeno v objednávce.

VIII. Odpovědnost za škodu

1. Prodávající je povinen realizovat jednotlivá plnění na svůj náklad a nebezpečí.

2. Prodávající se zavazuje poskytnout plnění ve standardní kvalitě a v objednaném rozsahu.

3. Případná odpovědnost za škodu se řídí ustanovením § 2894 a násl. zákona č. 89/2012 Sb., občanský zákoník. Kupující uplatní svůj nárok na úhradu těchto nákladů písemnou výzvou na kontaktní adresu prodávajícího. Prodávající je povinen provést úhradu do 21 dnů od doručení této výzvy.

IX. Smluvní pokuta

1. V případě neplnění předmětu dohody z důvodů náležejících na straně prodávajícího, se prodávající zavazuje nahradit veškeré škody (zejména vrácení dotací a pokuty), které kupujícímu v této souvislosti vzniknou.

2. V případě, že prodávající nebude schopen poskytnout kupujícímu plnění dle této dohody, je povinen uhradit kupujícímu veškeré náklady, které musí navíc vynaložit k zabezpečení náhradního plnění.

3. V případě porušení některé z povinností prodávajícího, je povinen uhradit kupujícímu smluvní pokutu ve výši 1.000 Kč, slovy: tisíc korun českých, za každý jednotlivý případ porušení.

4. Kupující je povinen uhradit prodávajícímu úrok z prodlení ve výši 0,05 % z dlužné fakturační částky za každý den prodlení.

5. Zaplacením smluvní pokuty není dotčeno právo kupujícího domáhat se náhrady škody vzniklé neposkytnutím plnění řádně a včas.

6. Smluvní pokuta je splatná do 10 dnů ode dne porušení povinnosti, která zakládá její nárok.

X. Trvání rámcové dohody, ukončení smluvního vztahu

1. Rámcová dohoda se uzavírá na dobu určitou, a to od nabytí účinnosti dohody na dobu 24

měsíců.

2. Rámcová dohoda může být před uplynutím sjednané doby ukončena v těchto případech:

2.1 vyčerpáním maximální celkové ceny plnění, uvedené v čl. V dohody; to se týká každé části veřejné zakázky samostatně;

2.2 dohodou smluvních stran spojenou se vzájemným vyrovnáním účelně vynaložených nákladů;

2.3 odstoupením od rámcové dohody ze strany prodávajícího po předchozí písemné

výzvě k nápravě v případě opakovaného porušování platebních povinností kupujícího;

2.4 odstoupením od rámcové dohody ze strany kupujícího v případě, že výdaje na plnění rámcové dohody nebo její části budou řídícím orgánem, případně jiným kontrolním subjektem označeny za nezpůsobilé;

2.5 výpovědí jedné ze smluvních stran z jakéhokoliv důvodu nebo i bez udání důvodu s jednoměsíční výpovědní lhůtou, která začne běžet prvního dne měsíce následujícího po doručení. V pochybnostech se má za to, že k doručení výpovědi prodávajícího došlo třetího dne po jejím odeslání.

3. V případě zániku smluvního vztahu se smluvní strany zavazují uhradit si navzájem závazky, které si k datu zániku smluvního vztahu prokazatelně dluží.

XI. Závěrečná ujednání

1. Prodávající potvrzuje, že je účasten platného pojištění odpovědnosti za škody způsobené třetí osobě při realizaci předmětu rámcové dohody.

2. V jednotlivých dílčích objednávkách nejsou smluvní strany oprávněny sjednat podstatné změny podmínek stanovených rámcovou dohodou.

3. Rámcová dohoda může být měněna nebo doplňována pouze dohodou smluvních stran ve formě písemných vzestupně číslovaných dodatků podepsaných oprávněnými zástupci obou smluvních stran.

4. Vztahy účastníků z rámcové dohody se řídí příslušnými ustanoveními občanského zákoníku.

5. Veškeré spory mezi smluvními stranami vzniklé z této rámcové dohody nebo v souvislosti s ní budou řešeny smírnou cestou. V případě, že dohoda nebude sjednána, bude spor předložen věcně a místně příslušnému soudu kupujícího.

6. Prodávající je povinen:

- umožnit kupujícímu provést kontrolu veškerých dokladů souvisejících s plněním rámcové dohody;

- v souladu s obecně závaznými předpisy minimálně do 31. 12. 2033 archivovat

veškeré doklady související s předmětem plnění rámcové dohody;

- umožnit všem subjektům oprávněným k výkonu kontroly projektu, z jehož prostředků je poskytnutí služby hrazeno, provést kontrolu dokladů souvisejících s plněním dle této rámcové dohody, a to po dobu danou právními předpisy ČR k

jejich archivaci (dle zákona č. 563/1991 Sb., o účetnictví, a dle zákona o DPH);

- v případě potřeby a na žádost kupujícího poskytnout materiály a podklady pro zpracování monitorovací zprávy.

7. Xxxxxxx dohoda je vyhotovena ve čtyřech stejnopisech s platností originálu, kdy

kupující obdrží 3 vyhotovení a prodávající 1 vyhotovení.

8. Rámcová dohoda nabývá platnosti a účinnosti dnem uveřejnění v registru smluv.

9. Kupující i prodávající souhlasí s uveřejněním kompletní rámcové dohody včetně přílohy a jednotkových cen na profilu zadavatele a v souladu se zákonem č. 340/2015 Sb., zákon o zvláštních podmínkách účinnosti některých smluv, uveřejňování těchto smluv a o registru smluv (zákon o registru smluv) v registru smluv.

10. Uveřejnění uzavřené rámcové dohody zajistí Kupující.

Nedílnou součástí rámcové dohody je tato příloha: Příloha č. 1 – technická specifikace (cenová nabídka)

Za kupujícího: Za prodávajícího:

V Brně dne 1. 10. 2019 V Praze dne 10. 9. 2019

………………………………… ……………………………….

xxxx. Xxx. Xxxxxx Xxxxxxxx, Ph.D., RNDr. Xxxx Xxxxxx rektorka jednatel

………………………………… prof. Xx. Xxx. Xxxxx Xxxxxxxxx, koordinátor projektu

………………………………… Xxx. Xxxxx Xxxxxxxxxx,

manažer projektu

Ing. Xxxxxx

Digitálně podepsal Xxx. Xxxxxx Xxxxxxxxx

Datum: 2019.10.02

Ostrovský 10:43:32 +02'00'

Příloha č. 1 - technická specifikace

Číslo

Název

Specifikace

Splnění kritéria (VYPLNÍ DODAVATEL)

Další podmínky specifikace

Splnění kritéria (VYPLNÍ DODAVATEL)

jednotka

předpokládané množství

požadované balení

Nabídková cena za 1 kus požadovaného balení bez DPH

(VYPLNÍ DODAVATEL)

Celková cena za předpokládané množství bez DPH

CAS Number

CPV kód

Název CPV kódu

SPECIÁLNÍ CHEMIKÁLIE a SPOTŘEBNÍ MATERIÁL pro projekt

Phytophthora

část 1

Polymeráza

ano/ne

High-fidelity polymeráza

přesnost minimálně 250X Taq ; extenze větší než 5 kb/ min;

součástí balení musí být kompatibilní pufr

Dodání do 3 pracovních dnů

Units

4 000

500

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Pufr kompatibilní s high-fidelity polymerázou

koncentrace: 5X

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

nabídková cena za část

0,00 Kč

limitní cena za část

105 000,00 Kč

část 2

Reagencie a kity pro gelovou elektroforézu, pro molekulární klonování, pro

kvantifikaci a izotermální amplifikaci nukleových kyselin, kity a reagencie různé. Modifikující enzymy.

ano/ne

Master mix pro PCR pro rutinní použití vč. nanášecího pufru

přesnost cca 2X Taq ; master mix pro běžné použití s širokým rozsahem A/T a G/C bazí v templátu; možné PCR mix nanést přímo na agarózový gel

Dodání do 3 pracovních dnů

reakce (jedna reakce = 50 µl)

1 500

500

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

směs nukleotidů (dNTPs) pro PCR mix

ekvimolární roztok ultračistých dATP, dCTP, dGTP and dTTP

Dodání do 3 pracovních dnů

µmol

120

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Hot-Start polymeráza

Hot-Start polymeráza umožňuje přípravu reakce při pokojové teplotě; enzym upravuje konce templátu přidáním 3′ deoxyadenosinu na konec templátu - tato aktivita není závislá na DNA sekvenci templátu; polymeráza má 5′→3′ exonukleázovou aktivitu;

reakce (jedna reakce = 50 µl)

900

300

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Kit pro izolaci plasmidové DNA

eluční objem od 30 µl (případně méně); typický výtěžek přibližně 20 µg; downstream aplikace: PCR, sekvenace, digesce restrikčními enzymy

1 vzorek

250

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Kolonky pro purifikaci plasmidové DNA

kompatibilní s kitem pro izolaci plasmidové DNA

1 kolonka

100

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Kit pro izolaci mikrobiální DNA

kit validovaný pro izolaci DNA z mikroorganismů, vč. Bakterií, kvasinek, hub; obsahuje rozbíjecí kuličky pro homogenizaci; délka purifikovaných fragmentů od cca 200 bp až po minimálně 50 kb; eluční objem od 100 µl; součástí kitu je proteinaza K;

1 vzorek

200

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Kit pro izolaci DNA ze stolice

Kit validovaný pro různé typy vzorků jak mražených, tak čerstvých; kit obsahuje kolonky pro eliminaci (oddělení) PCR inhibitorů; součástí kitu jsou homogenizační zkumavky; eluční objem je minimálně od 30 µl; délka purifikovaných fragmentů od cca 200 bp až po minimálně 50 kb;

1 vzorek

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Kit pro izolaci DNA z rostlin v 96-jamkovém formátu

kit obsahuje komponenty pro všechny tyto kroky v 96-jamkovém formátu: lyzační roztok, precipitační roztok, Rnase A, eluční roztok, 2 promývací pufry, nanášecí pufr, promývací destička, destička pro navázání DNA; validovaný kit pro rostlinný materiál; možnost purifikace za použití centrifugy; rozsah získané DNA cca 50 bp - 50 kb; kompatibilní s downstream aplikacemi: PCR

Baleno po 24x96

1 vzorek

2 304

2304

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Set reagencií pro purifikaci DNA v 96-jamkovém formátu

set obsahuje tyto komponenty: lyzační roztoky, precipitační roztok (50 ml), Rnase A, eluční roztok (125 ml), 2 promývací pufry, nanášecí pufr; uvedený set komponentů musí být plně kompatibilní s celým kitem pro izolaci DNA z rostlin v 96- jamkovém formátu

Baleno po 4x96

1 vzorek

384

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Kit pro izolaci RNA z rostlin a mycélia

kit kompatibilní s downstream aplikacemi: PCR, next-generation sequencing; možnost purifikace total RNA, včetně small RNA; kit musí zajistit maximální odstranění gDNA; protokol umožňuje oddělení small and large RNA frakcí; kit obsahuje zkumakvy s gelem pro separaci organické a vodní fáze během extrakce

1 vzorek

600

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Kit pro izolaci RNA

1 vzorek

200

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Kit pro purifikaci gDNA a PCR produktů

kit umoňuje purifikaci PCR produktů i genomic DNA; eluční objem od 6 µl (případně méně); kapacita kolonky alespoň 5 µg DNA; délka purifikovaných amplikonů od cca 50 bp až po minimálně 20 kb; kit umožňuje purifikaci plasmidové DNA

Doba dodání do 5 pracovních dní

1 vzorek

1 000

250

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Nanášecí kolonky

kolonky plně kompatibilní s kitem pro purifikaci gDNA a PCR

produktů

1 kolonka

1 000

100

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Kit pro purifikaci DNA z agarózových gelů

eluční objem od 6 µl (případně méně); eluovaná DNA je vhodná pro tyto downstream aplikace: DNA sekvenace, digesce restrikčními enzymy, ligace; délka purifikovaných amplikonů od cca 50 bp až po minimálně 20 kb

Doba dodání do 5 pracovních dní

1 vzorek

200

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Pufr pro promytí purifikované DNA na kolonce

pufr umožňuje vymytí enzymů, detergentů a nukleotidů z nanášecí

kolonky

1 ml

200

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Kit pro purifikaci RNA fragmentů z gelu

kapacita nanášecí kolonky alespoň 10 µg RNA; eluční objem od 6 µl (může být i méně); downstream aplikace: reverzní transkripce

1 vzorek

200

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Master Mix pro qPCR pro kvantifikaci DNA

kompatibilní s Roche LC 480 a hydrolyzačními sondami; modré zbarvení master mixu pro kontrolu pipetovacích chyb; mastermix obsahuje Hot Start Taq DNA polymerázu;

expirace minimálně 8 měsíců

reakce (1 reakce

= 20 µl celkového objemu)

3 000

500

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Master Mix pro qPCR pro kvantifikaci RNA

kompatibilní s Roche LC 480 a hydrolyzačními sondami; modré zbarvení master mixu pro kontrolu pipetovacích chyb; mastermix obsahuje reverzní transkriptázu pro přímou amplifikaci RNA z purifikované RNA

expirace minimálně 8 měsíců

reakce (1 reakce

= 20 µl celkového objemu)

1 500

500

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Master Mix pro qPCR pro kvantifikaci DNA s interkalačním barvivem

kompatibilní s Roche LC 480; modré zbarvení master mixu pro kontrolu pipetovacích chyb; mastermix obsahuje Hot Start Taq DNA polymerázu;

expirace minimálně 8 měsíců

reakce (1 reakce

= 20 µl celkového objemu)

3 000

500

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Master Mix pro qPCR pro kvantifikaci RNA bez interkalačního barviva

kompatibilní s Roche LC 480; modré zbarvení master mixu pro kontrolu pipetovacích chyb; mastermix obsahuje reverzní transkriptázu pro přímou amplifikaci z purifikované RNA

expirace minimálně 8 měsíců

reakce (1 reakce

= 20 µl celkového objemu)

1 500

500

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

barvivo pro detekci DNA a RNA vzorků pro analýzu fragmentů po gelové elektroforéze

kompatibilní s transluminátorem Safeview Blue Light Transilluminator (Cleaver Scientific), barvivo musí být nekarcinogenní, citlivost minimálně jako ethidium bromid; ředění 1:20 000 - 1: 50 000

1 ml

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Nanášecí pufr (loading dye)

pufr pro nanášení PCR produktů na agarózový gel; nevytváří UV

stín; obsahuje Ficoll;

1 ml

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

DNA ladder pro analýzu krátkých fragmentů s nanášecím pufrem

ladder s fragmenty o těchto délkách: 100 bp - 1000 bp s jednotlivými proužky po 100 bp; obsahuje nanášecí pufr pro rychlejší nanášení na gel

1 nanesení (1

nanesení = (0,5 μg)

1 875

375

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

DNA ladder pro analýzu dlouhých fragmentů s nanášecím pufrem

ladder o rozsahu 0,5 kb - cca 40-50 kb; ladder obsahuje minimálně fragmenty o těchto délkách: 0,5kb, 1kb, 2kb, 3 kb, 5 kb, 10 kb, 20 kb; obsahuje nanášecí pufr pro rychlejší nanášení na gel

1 nanesení (1

nanesení = (0,5 μg)

500

125

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

DNA ladder pro analýzu fragmentů DNA a velkém rozsahu

ladder o rozsahu 75 bp - 20 kb; ladder obsahuje minimálně fragmenty o těchto délkách: 200 bp, 500 bp, 1 kb, 5 kb, 20 kb; obsahuje nanášecí pufr pro rychlejší nanášení na gel

1 nanesení (1

nanesení = 0,5 μg)

2 000

500

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Klonovací kit s kompetentními buňkami

kit umožňuje klonování PCR produktů amplifikovaných pomocí Taq polymerázy; kit obsahuje promotory pro transkripci a sekvenaci. Každý vektor také obsahuje M13F and M13R oblasti

pro sekvenaci;

1 reakce

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Klonovací kit pro klonování PCR produktů

kit umožňuje klonování PCR produktů s TA přesahy i s tupými konci; kit obsahuje vektor s SP6 a T7 promotory, pozitivní kontrolu (amplikon) a také klonovací buňky E. coli ; kit umožňuje klonování PCR produktů bez nutnosti jejich purifikace;

minimální expirace 6 měsíců; dodání do 5 pracovních dní; bez poplatku za dodání na suchém ledu

1 reakce

100

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Kultivační médium pro kompetenční buňky

médium musí být kompatibilní s kitem pro klonování PCR produktů

300

100

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Kompetenční buňky E. coli

kompatibilní s klonovacím kitem pro klonování PCR produktů

bez poplatku za dodání na suchém ledu

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Master mix pro ligování fragmentů DNA

master mix vhodný pro ligaci fragmentů s TA přesahy i s tupými

konci;

1 reakce

100

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

T4 RNA Ligase 2, truncated

purifikovaný enzym z E. coli ; ligáza spicificky liguje pre- adenylované 5´konce DNA nebo RNA k 3´koncům RNA; ATP není pro reakci třeba

Units

8 000

2000

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

DNase enzym

enzym schopný degradace jak jedno, tak dvou-vlákné DNA,

RNA:DNA hybridů a chromatinu; RNase-free

Units

3 000

1000

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

RNase A

enzym nesmí mít DNase aktivitu; enzym je dodán v lyofilizované formě; určení: pro degradaci RNA během izolace DNA

500

100

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Reverzní transkriptáza

Reverzní transkriptáza pro syntézu cDNA vlákna, polyA templát

nebo celková RNA

Expirace alespoň 6 měsíců

30 000

10 000

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Kit pro reverzní transkripci RNA

Reverzní transkriptáza pro syntézu cDNA vlákna, polyA templát

nebo celková RNA, reakční čas 10 minut

Expirace alespoň 6 měsíců

1 reakce (20 µl)

1000

200

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Termostabilní reverzní transkriptáza

termostabilní reverzní transkriptáza určená pro přípravu cDNA pro následnou qPCR; aktivní i nad 60°C; celkový čas reverzní transkripce za max. 20 min.

expirace minimálně 8 měsíců

reakce (1 reakce

= 20 µl celkového objemu)

500

100

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Kit pro fluorometrickou kvantifikaci DNA ve vzorcích

kit musí být plně kompatibilní s přístrojem Qubit Fluorometer; kit obsahuje vlastní reagencie pro kvantifikaci, ředící pufr a DNA standardy; rozsah kvantifikace: 2-1000 ng

1 reakce

500

100

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Kit pro fluorometrickou kvantifikaci RNA ve vzorcích

kit musí být plně kompatibilní s přístrojem Qubit Fluorometer; kit obsahuje vlastní reagencie pro kvantifikaci, ředící pufr a RNA standardy; rozsah kvantifikace: 20-1000 ng

1 reakce

500

100

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Kit pro izotermální "loop-mediated" amplifikaci DNA i RNA templátů

kit musí obsahovat všechny komponenty LAMP, včetně reverzní transkriptázy (kromě primerů); kit obsahuje fluorescenční barvivo pro detekci amplifikovaných produktů

1 reakce (1 reakce = 25 µl celkového

objemu)

200

100

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Master mix pro izotermální "loop-mediated" amplifikaci DNA i RNA templátů

master mix umožňuje vizuální vyhodnocení amplifikace / ne- amplifikace cílové sekvence barevnou změnou vlastního master mixu; reakce musí proběhnout max. do 60 minut

1 reakce (1 reakce = 25 µl celkového

objemu)

200

100

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

DNA izolační kit

kapacita vázací kolonky je minimálně 30 µg DNA; dostupný protokol pro purifikaci již izolované DNA; purifikovaná DNA v doložené kvalitě vhodné pro PCR, qPCR a NGS aplikace; RNA kontaminace menší než-li 1%

1 vzorek

900

150

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Lyzační pufr

Pufr plně kompatibilní s kitem pro izolaci DNA (položka č. 41).

1 ml

340

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Nanášecí pufr

Pufr kompatibilní s DNA izolačním kitem pro navázání DNA na

kolonku (položka č. 41).

650

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Promývací pufr

Pufr pro promytí DNA navázané na kolonce; kompatibilní s DNA

izolačním kitem (položka č. 41)

600

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Eluční pufr

Pufr pro eluci DNA z kolonky; kompatibilní s DNA izolačním kitem (položka č. 41).

340

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Purifikační kolonky

Kolonky pro purifikaci DNA; plně kompatibilní s DNA izolačním

kitem (položka č. 41).

1 kolonka

1 000

100

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

RNase

RNasa v roztoku o koncentraci 20mg/ml; plně kompatibilní s DNA

izolačním kitem (položka č. 41).

1 ml

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

nabídková cena za část

0,00 Kč

limitní cena za část

1 600 000,00 Kč

část 3

Kity a reagencie pro přípravu knihoven pro sekvenování na sekvenátorech

Illumina, kity pro přímou amplifikaci DNA z rostlinného materiálu, kity pro amplifikaci cDNA konců

ano/ne

Kit pro přípravu "small RNA" (krátkých fragmentů RNA) knihoven pro NGS

kit pro přípravu knihoven small RNAs; plně kompatibilní s Illumina MiniSeq a MiSeq; kit obsahuje indexy pro přípravu alespoň 12 knihoven; možnost kombinace (pooling) 2 setů indexů;

ano

expirace minimálně 6 měsíců

ano

1 reakce

44 000,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Kit pro přímou amplifikaci DNA z rostlinného materiálu s nanášecím pufrem

Kit s robustní hot start DNA polymerázou, která umožňuje amplifikovat DNA přímo ze vzorku bez nutnosti DNA extrakce; obsahuje master mix s nanášecím pufrem pro elektroforézu; kit je validovaný pro použití pro vzorky rostlin i hub

ano

1 reakce

5 000

1250

14 597,00 Kč

58 388,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Hot-Start polymeráza pro použití s kitem pro přímou amplifikaci DNA ze vzorků

přesnost cca 2X Taq ; výsledné konce PCR produktů: tupé; polymeráza musí být plně kompatibilní s kitem pro přímou amplifikaci DNA ze vzorků rostlin / mycélia

ano

Units

1 200

200

3 207,00 Kč

19 242,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Kit pro přímou amplifikaci DNA z rostlinného materiálu bez nanášecího pufru

Kit s robustní hot start DNA polymerázou, která umožňuje amplifikovat DNA přímo ze vzorku bez nutnosti DNA extrakce; kit je validovaný pro použití z rostlinného materiálu i z hub

ano

1 reakce

10 000

500

6 501,00 Kč

130 020,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Kit pro simultánní amplifikaci 5´ a 3´ cDNA konců

kit umožnuje amplifikaci 3´ i 5´konců RNA; protokol nezahrnuje žádné ligační kroky pro vyšší účinnost/citlivost; součástí kitu je klonovací kit, kompetenční buňky pro klonování a také purifikační kit pro purifikaci PCR produktu z PCR mixu i z gelu;

ano

1 reakce

150

46 446,00 Kč

348 345,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

nabídková cena za část

114 751,00 Kč

599 995,00 Kč

limitní cena za část

600 000,00 Kč

část 4

Reagencie pro sekvenaci na sekvenátorech Illumina

ano/ne

MiniSeq High Output Reagent Kit (75-cycles)

kompatibilní s Illumina MiniSeq přístrojem

ano

expirace minimálně 3 měsíce

ano

kit

25 833,00 Kč

309 996,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

nabídková cena za část

25 833,00 Kč

309 996,00 Kč

limitní cena za část

310 000,00 Kč

část 5

Kity a reagencie pro analýzu RNA na Tape Station 4200 (Agilent)

ano/ne

High Sensitivity RNA ScreenTape

kompatibilita s Tape Station 4200 (Agilent)

Expirace alespoň 3 měsíce

kit

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

High Sens. RNA ScreenTape Sample Buffer

kompatibilita s Tape Station 4200 (Agilent)

Expirace alespoň 3 měsíce

kit

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

High Sensitivity RNA ScreenTape Ladder

kompatibilita s Tape Station 4200 (Agilent)

Expirace alespoň 3 měsíce

kit

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

nabídková cena za část

0,00 Kč

limitní cena za část

120 000,00 Kč

část 6

Kity a reagencie pro izolaci DNA, RNA, pro reverzní transkripci a pro qPCR

(real-time PCR)

ano/ne

Kit pro izolaci DNA z půdy

Součástí kitu jsou homogenizační kuličky ve zkumavkách (lze dodat i mimo vlastní izolační kit), kam je možné dát cca alespoň 0,25 g půdního vzorku; vhodné pro různé typy půd, včetně kompostu a různých sedimentů; kit musí být kolonkový; protokol musí zahrnovat dva srážecí kroky; izolavaná DNA musí být v kvalitě použitelné pro tyto následující aplikace: PCR, qPCR

1 vzorek

500

100

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Kit pro izolaci RNA z půdy

Součástí kitu jsou homogenizační kuličky ve zkumavkách (lze dodat i mimo vlastní kit), kam je možné dát cca 2 g půdního vzorku; vhodné pro různé typy půd, včetně kompostu a různých sedimentů; izolavaná RNA musí být v kvalitě použitelné pro tyto následující aplikace: reverzní transkripce, RT-PCR, RT-qPCR

1 vzorek

150

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

PCR kit pro kvantifikaci miRNAs

kit pro kvantifikaci a detekci miRNAs; mastermix obsahuje referenční barvivo ROX; kit umožňuje simultání detekci miRNAs a mRNA; možná detekce snoRNAs; mastermix zoptimalizovaný pro použití na real-time PCR cyklerech

expirace minimálně 3 měsíce

1 reakce

600

200

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Kit pro reverzní transkripci miRNA z rostlinných vzorků

kit je kompatibilní s touto downstream aplikací: qPCR; kit je vhodný pro cDNA syntézu i piRNAs (piwi-interacting RNAs); umožňuje transkripci 3'-end, 2'-O-Me modifikovaných small RNAs

Expirace alespoň 6 měsíců

reakce

100

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

nabídková cena za část

0,00 Kč

limitní cena za část

200 000,00 Kč

část 7

Chemikálie pro molekulární biologii

ano/ne

2-mercaptoethanol

for molecular biology, >=99%

0,1

0,025

0,00 Kč

60-24-2

24327000-2

Různé organické chemické látky

agaroza

for molecular biology

1,2

0,1

0,00 Kč

9012-36-3

24327000-2

Různé organické chemické látky

aktivní uhlí

for plant cell culture

0,5

0,00 Kč

7440-44-0

24954000-6

Aktivní uhlí

ampicilin trihydrát

anhydrous (HPLC)

0,2

0,1

0,00 Kč

7177-48-2

24327000-2

Různé organické chemické látky

chloroform

containing amylenes as stabilizer

0,00 Kč

67-66-3

24327000-2

Různé organické chemické látky

maltoza

for cell culture

0,00 Kč

6363-53-7

24327000-2

Různé organické chemické látky

MS xxxxxxxxx xxxxx medium

for plant cell culture

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Nuclease free water (DEPC)

for cell culture

1,5

0,1

0,00 Kč

7732-18-5

24316000-2

Destilovaná voda

PEG solution

for hybridoma

0,5

0,25

0,00 Kč

00000-00-0

24327000-2

Různé organické chemické látky

phenol-chloroform-isoamyl alcohol mixture

pro izolaci NK

0,5

0,00 Kč

136112-00-0

24327000-2

Různé organické chemické látky

sacharoza

for plant cell culture

0,00 Kč

57-50-1

24327000-2

Různé organické chemické látky

STE Buffer solution

for MB

0,5

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Tris-EDTA buffer solution

for MB

0,5

0,1

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Tris-HCl pufr

molecular biology grade, pH=8 ; 1 M roztok

1 lt.

0,00 Kč

1185-53-1

24327000-2

Různé organické chemické látky

TBE pufr (10x)

molecular biology grade; skládá se z těchto komponent: Tris,

EDTA-Na2-salt, kyselina boritá

1 l

2,5

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

Ribavirin

Ribavirin ≥98% - Guanosine (ribonucleic) analog used in threatments against DNA and RNA viral infections. Can not be in tablets/pills

0,00 Kč

00000-00-0

24327000-2

Různé organické chemické látky

Orange serum agar

Dehidrated culture media for cultivation of fungi and aciduric, putrefactive acid tolerant microorganisms that are capable of surviving in citrus acids and products. Ingredients: Tryptone, Yeast extract,

Dextrose (Glucose),

Dipotassium hydrogen phosphate, Orange serum and Agar

0,5

0,00 Kč

NEMÁ

24327000-2

Různé organické chemické látky

nabídková cena za část

0,00 Kč

limitní cena za část

250 000,00 Kč

část 8

Homogenizační zkumavky velké

ano/ne

Zkumavky pro homogenizaci vzorků o větším objemu

15 ml zkumavky pro homogenizaci vzorků o váze 2-4g. Zkumavky musí být plně kompatibilní s přístrojem Precellys Evolution a adaptérem na 15ml zkumavky. Zkumavky obsahují keramické kuličky o různé velikosti.

500

0,00 Kč

33192500-7

Zkumavky

Zkumavky pro homogenizaci vzorků o objemu 15ml (lysing matrix 15ml)

500

0,00 Kč

33192500-7

Zkumavky

Metal tubes 7ml

7 ml zkumavky pro homogenizaci vzorků, plně kompatibilní s Precellys Evolution homogenizérem a nástavcem na 7 ml zkumavky., včetně speciálního držáku a destičky kompatibilní s Precellys Evolution.

0,00 Kč

33192500-7

Zkumavky

Zkumavky pro homogenizaci vzorků 7ml (lysing matrix 7ml)

7 ml zkumavky pro homogenizaci vzorků, plně kompatibilní s Precellys Evolution, zkumavky musí obsahovat skleněné kuličky o různé velikosti

400

0,00 Kč

33192500-7

Zkumavky

nabídková cena za část

0,00 Kč

limitní cena za část

290 000,00 Kč

část 9

Homogenizační zkumavky malé

ano/ne

zkumavky pro homogenizaci mycélia

2 ml zkumavky s keramickou kuličkou o průměru 6,35 mm a granátové vločky o velikosti 0,56 - 0,7 mm; zkumavky musí být RNase a DNase free

2 000

500

0,00 Kč

33192500-7

Zkumavky

zkumavky pro homogenizaci půdních vzorků

2 ml zkumavky s keramickými (1,4 mm) a silikátovými kuličkami (0,1 mm) a s jednou skleněnou kuličkou o průměru 4 mm; zkumavky musí být RNase a DNase free

500

100

0,00 Kč

33192500-7

Zkumavky

zkumavky pro homogenizaci mycélia (prázdné)

prázdné zkumavky o objemu 2 ml pro homogenizaci (rozdrcení) na přístroji Precellys Evolution s nástavcem pro 2 ml zkumavky; včetně víčka

500

0,00 Kč

33192500-7

Zkumavky

Zkumavky pro homogenizaci vzorků 2ml (lysing matrix 2ml)

zkumavky o objemu 2 ml pro homogenizaci (rozdrcení) na přístroji Precellys Evolution s nástavcem pro 2 ml zkumavky; zkumavky obsahují skleněné nebo silikátové kuličky, testované pro homogenizaci hub

1 000

0,00 Kč

33192500-7

Zkumavky

nabídková cena za část

0,00 Kč

limitní cena za část

190 000,00 Kč

Celkem 3 665 000,00 Kč

s DPH 4 434 650,00 Kč

Ostatní povinné parametry:

ano/ne

Cena musí zahrnovat u všech položek poštovné a balné.

ano

Dodání do 3 týdnů, pokud není ve specifikaci uvedeno jinak.

ano

Garantovaná expirace u chemikálií min. 3 měsíce, pokud neuvedeno ve specifikaci jinak.

ano

Vyřízení reklamace do 1 měsíce.

ano

Document Metadata

Table of Contents

pro nadlimitní veřejnou zakázku

Document Metadata