PIANO NAZIONALE DI RIPRESA E RESILIENZA (PNRR) MISSIONE 6 - COMPONENTE 2 - INVESTIMENTO 2.1 VALORIZZAZIONE E

PIANO NAZIONALE DI RIPRESA E RESILIENZA (PNRR) MISSIONE 6 - COMPONENTE 2 - INVESTIMENTO 2.1 VALORIZZAZIONE E

POTENZIAMENTO DELLA RICERCA BIOMEDICA DEL SSN

Convenzione attuativa tra la Ex Direzione generale della ricerca ed innovazione in sanità, Dipartimento della prevenzione, della ricerca e delle emergenze sanitarie del Ministero della salute, il Soggetto attuatore- beneficiario Istituto nazionale per lo studio e la cura dei tumori Fondazione X. Xxxxxxx e il Principal Investigator della ricerca Xxxxxxxxx Xxxxxxxx, per la regolamentazione dello svolgimento del progetto della sezione Malattie Croniche non Trasmissibili (MCnT1) ad alto impatto sui sistemi sanitari e socio- assistenziali con codice WFR PNRR-MCNT1-2023-12378005, dal titolo “Spatial radiomIcs and tRanscriptomics to the dIscovery of the cross-link between colon cancer and chrOnic kidney disease in the SIRIO study.” afferente al secondo avviso pubblico PNRR.

Premesso che

VISTA la legge 7 agosto 1990, n. 241 “Nuove norme in materia di procedimento amministrativo e di diritto di accesso ai documenti amministrativi” e s.m.i.;

VISTA la legge 14 gennaio 1994 n. 20 “Disposizioni in materia di giurisdizione e controllo della Corte dei Conti” e s.m.i.;

VISTO l’articolo 12 bis, comma 3, del decreto legislativo 30 dicembre 1992, n. 502/1992 e s.m.i.; VISTO il decreto del Presidente del Consiglio dei Ministri 11 febbraio 2014, n. 59, recante il regolamento di organizzazione del Ministero della salute e, in particolare, gli articoli 1, comma 7, e 12, comma 2;

VISTO il decreto del Presidente della Repubblica 28 marzo 2013, n. 44, recante il regolamento di riordino degli organi collegiali e degli altri organismi operanti presso il Ministero della salute e, in particolare gli artt. 3 e 4 che prevedono la composizione del Comitato tecnico sanitario;

VISTO il decreto del Ministro della salute 8 agosto 2013, registrato dall’Ufficio centrale di bilancio presso il Ministero della salute in data 13 agosto 2013, visto n. 934 e, in particolare, l’articolo 1, che dispone la ripartizione dei componenti tra le sezioni del Comitato tecnico sanitario;

VISTO il decreto del Ministro della salute 15 dicembre 2021, registrato dall’Ufficio centrale del bilancio presso il Ministero della salute in data 7 gennaio 2022, visto n. 33, recante la ricostituzione del Comitato tecnico sanitario, avente una durata di tre anni dalla data di insediamento;

VISTO il Regolamento (UE) 2021/241 del Parlamento europeo e del Consiglio del 12 febbraio 2021 che istituisce il dispositivo per la ripresa e la resilienza dell’Unione Europea;

VISTO il Piano Nazionale di Ripresa e Resilienza (PNRR) valutato positivamente con Decisione del Consiglio ECOFIN del 13 luglio 2021, notificata all’Italia dal Segretariato generale del Consiglio con nota LT161/21, del 14 luglio 2021, ed in particolare la Missione 6, Componente 2, Investimento 2.1 “Valorizzazione e potenziamento della ricerca biomedica del SSN”, che consiste nel “rafforzare il sistema della ricerca biomedica tramite due linee di intervento: a) il finanziamento di progetti Proof of Concept (PoC), sostenendo lo sviluppo di tecnologie con un basso grado di maturità tecnologica e promuovendo il trasferimento di tecnologie verso l'industria; b) il finanziamento di programmi o progetti di ricerca nel campo delle malattie rare e dei tumori rari e di altre malattie altamente invalidanti”;

VISTO il Regolamento (UE) 2018/1046 del 18 luglio 2018, che stabilisce le regole finanziarie applicabili al bilancio generale dell’Unione, che modifica i Regolamenti (UE) n. 1296/2013, n. 1301/2013, n. 1303/2013, n. 1304/2013, n. 1309/2013, n. 1316/2013, n. 223/2014, n. 283/2014 e la decisione n. 541/2014/UE e abroga il regolamento (UE, Euratom) n. 966/2012;

VISTO il decreto legge del 31 maggio 2021, n. 77, convertito con modificazioni dalla legge 29 luglio 2021,

n. 108 «Governance del Piano nazionale di ripresa e resilienza e prime misure di rafforzamento delle strutture amministrative e di accelerazione e snellimento delle procedure»;

VISTO il decreto del Presidente del Consiglio dei ministri 9 luglio 2021 recante l’individuazione delle amministrazioni centrali titolari di interventi previsti nel PNRR, ai sensi dell’articolo 8, comma 1, del citato decreto legge 31 maggio 2021, n. 77, convertito, con modificazioni, dalla legge 29 luglio 2021, n. 108;

VISTO il decreto del Ministro dell’economia e delle finanze del 6 agosto 2021 relativo all’assegnazione delle risorse in favore di ciascuna Amministrazione titolare degli interventi PNRR e corrispondenti milestone e target;

VISTO il decreto del Ministro della salute, di concerto con il Ministro dell’economia e delle finanze 15 settembre 2021, di istituzione dell’Unità di Missione del Ministero della salute titolare di interventi PNRR, ai sensi dell’articolo 8 del citato decreto legge n. 77 del 2021;

VISTO l’atto di indirizzo del Ministro del 12 ottobre 2021 con il quale sono stati individuati i relativi Soggetti Attuatori nell’ambito degli interventi e sub-interventi di investimento del piano Nazionale di ripresa e resilienza (PNRR) a titolarità del Ministero della salute;

VISTO il decreto legge 6 novembre 2021, n. 152 “Disposizioni urgenti per l'attuazione del Piano nazionale di ripresa e resilienza (PNRR) e per la prevenzione delle infiltrazioni mafiose”;

VISTA la legge 16 gennaio 2003, n. 3 “Disposizioni ordinamentali in materia di pubblica amministrazione” e, in particolare, l’articolo 11, comma 2-bis, ai sensi del quale “Gli atti amministrativi anche di natura regolamentare adottati dalle Amministrazioni di cui all’articolo 1, comma 2, del decreto legislativo 30 marzo 2001, n. 165, che dispongono il finanziamento pubblico o autorizzano l’esecuzione di progetti di investimento pubblico, sono nulli in assenza dei corrispondenti codici di cui al comma 1 che costituiscono elemento essenziale dell'atto stesso”;

VISTA la delibera del CIPE n. 63 del 26 novembre 2020 che introduce la normativa attuativa della riforma del CUP;

VISTO l’articolo 1, comma 1042, della legge 30 dicembre 2020, n. 178 ai sensi del quale con uno o più decreti del Ministro dell’economia e delle finanze sono stabilite le procedure amministrativo-contabili per la gestione delle risorse di cui ai commi da 1037 a 1050, nonché le modalità di rendicontazione della gestione del Fondo di cui al comma 1037;

VISTO l’articolo 1, comma 1043, secondo periodo, della legge 30 dicembre 2020, n. 178, ai sensi del quale al fine di supportare le attività di gestione, di monitoraggio, di rendicontazione e di controllo delle componenti del Next Generation EU, il Ministero dell'economia e delle finanze - Dipartimento della Ragioneria generale dello Stato sviluppa e rende disponibile un apposito sistema informatico;

VISTO l’articolo 17 del Regolamento (UE) 2020/852 che definisce gli obiettivi ambientali, tra cui il principio di non arrecare un danno significativo (DNSH, “Do no significant harm”), e la Comunicazione della Commissione UE 2021/C 58/01“Orientamenti tecnici sull’applicazione del principio «non arrecare un danno significativo» a norma del regolamento sul dispositivo per la ripresa e la resilienza”;

VISTI i principi trasversali previsti dal PNRR, quali, tra l’altro, il principio del contributo all’obiettivo climatico e digitale (c.d. tagging), il principio di parità di genere e l’obbligo di protezione e valorizzazione dei giovani;

VISTI gli obblighi di assicurare il conseguimento di target e milestone e degli obiettivi finanziari stabiliti nel PNRR;

VISTO il Regolamento delegato (UE) 2021/2106 della Commissione del 28 settembre 2021 che integra il regolamento (UE) 2021/241 del Parlamento europeo e del Consiglio, che istituisce il dispositivo per la ripresa e la resilienza, stabilendo gli indicatori comuni e gli elementi dettagliati del quadro di valutazione della ripresa e della resilienza, che prevede, in particolare, che “affinché il quadro di valutazione, compresi gli indicatori comuni, sia aggiornato in modo coerente e uniforme due volte l’anno, tutti gli Stati membri riferiscono alla Commissione due volte l’anno nell’ambito del semestre europeo sui progressi compiuti nella realizzazione dei piani per la ripresa e la resilienza, comprese le modalità operative, e sugli indicatori comuni.”

VISTE le “Linee Guida per lo svolgimento delle attività connesse al monitoraggio del PNRR”, predisposte dal Servizio Centrale per il PNRR, presso il Ministero dell’economia e delle finanze (MEF) - Dipartimento Ragioneria generale dello Stato (RGS), che descrivono le funzionalità del sistema informativo “ReGiS” sviluppato dal Ministero dell’economia e delle finanze – Dipartimento della Ragioneria Generale dello Stato in attuazione dell’articolo 1, comma 1043, della legge 30 dicembre 2020,

n. 178;

VISTO il documento “Sistema di Gestione e Controllo (Xx.Xx.Xx.) PNRR - Ministero della salute”, adottato con Decreto del 29 luglio 2022 e ss.mm.ii.; VISTE le “Linee Guida per lo svolgimento delle attività di controllo e rendicontazione delle Misure PNRR di competenza delle Amministrazioni centrali e dei Soggetti attuatori”, predisposte dal Servizio Centrale per

il PNRR, presso il Ministero dell’economia e delle finanze (MEF) - Dipartimento Ragioneria generale dello Stato (RGS), che contengono indicazioni procedurali per un corretto espletamento delle attività di controllo e rendicontazione delle spese e di Milestone & Target e di ogni altro adempimento previsto dalla normativa comunitaria e nazionale applicabile al PNRR, a norma dell’art. 8, punto 3, del decreto legge 77 del 31 maggio 2021, come modificato dalla legge di conversione 29 luglio 2021, n. 108;

VISTO il decreto del Presidente del Consiglio dei Ministri 15 settembre 2021 “Modalità, regole e strumenti per il conferimento dei dati”;

VISTA la Circolare MEF-RGS del 14 ottobre 2021, n. 21 “Piano Nazionale di Ripresa e Resilienza (PNRR)

- Trasmissione delle Istruzioni Tecniche per la selezione dei progetti PNRR”;

VISTO il Decreto interministeriale del 7 dicembre 2021 per l’adozione delle linee guida volte a favorire la pari opportunità di genere e generazionali, nonché l'inclusione lavorativa delle persone con disabilità nei contratti pubblici finanziati con le risorse del PNRR e del PNC;

VISTA la Circolare MEF-RGS del 30 dicembre 2021, n. 32, recante “Guida operativa per il rispetto del principio di non arrecare danno significativo all’ambiente”;

VISTA la Circolare MEF-RGS del 31 dicembre 2021, n. 33 “Piano Nazionale di Ripresa e Resilienza (PNRR) – Nota di chiarimento sulla Circolare del 14 ottobre 2021, n. 21 - Trasmissione delle Istruzioni Tecniche per la selezione dei progetti PNRR – Addizionalità, finanziamento complementare e obbligo di assenza del c.d. doppio finanziamento”

VISTA la Circolare MEF-RGS del 21 giugno 2022, n. 27 “Monitoraggio delle misure PNRR”;

VISTA la Circolare MEF-RGS dell’11 agosto 2022, n. 30 sulle procedure di controllo e rendicontazione delle misure PNRR;

VISTA la Circolare del 28 marzo 2024, n. 13 “Integrazione delle Linee Guida per lo svolgimento delle attività di controllo e rendicontazione delle Misure PNRR di competenza delle Amministrazioni centrali e dei Soggetti Attuatori. Adozione delle Appendici tematiche: La prevenzione e il controllo del conflitto di interessi ex art. 22 Reg. (UE) 2021/241; La duplicazione dei finanziamenti ex art. 22 par. 2 lett. c) Reg. (UE) 2021/241”;

VISTA la Comunicazione della Commissione 2014/C 198/01 “Disciplina degli aiuti di Stato a favore di ricerca, sviluppo e innovazione” e s.m.i.;

VISTO il Regolamento (UE) n. 651/2014 della Commissione, del 17 giugno 2014, che dichiara alcune categorie di aiuti compatibili con il mercato interno in applicazione degli articoli 107 e 108 del trattato; VISTA la comunicazione della Commissione 2016/C 262/01 sulla nozione di aiuto di Stato di cui all'articolo 107, paragrafo 1, del trattato sul funzionamento dell'Unione europea;

VISTA la Comunicazione della Commissione del 19 marzo 2020, C(2020) 1863 “Quadro temporaneo per le misure di aiuto di Stato a sostegno dell'economia nell'attuale emergenza della COVID-19”, da ultimo rettificata attraverso la comunicazione del 18 novembre 2021, C(2021) 8442 “Sesta modifica del quadro temporaneo per le misure di aiuto di Stato a sostegno dell'economia nell'attuale emergenza della COVID- 19 e modifica dell'allegato della comunicazione della Commissione agli Stati membri sull'applicazione degli articoli 107 e 108 del trattato sul funzionamento dell'Unione europea all'assicurazione del credito all'esportazione a breve termine”;

VISTO il decreto del Ministro della salute 1° aprile 2022, che nella annessa tabella A ha distinto gli interventi di cui alla Missione 6, Componente 2, Investimento 2.1 – “Valorizzazione e potenziamento della ricerca biomedica del Servizio Sanitario Nazionale” del Piano Nazionale di Ripresa e Resilienza nei sub- interventi, per risorse complessive pari a €524.140.000,00 così ripartite:

- 2.1.1 – progetti di ricerca finanziati con voucher Proof of concept, per € 100.000.000,

- 2.1.2 – progetti di ricerca finanziati per Malattie rare e Tumori rari, per € 100.000.000

- 2.1.3 – progetti di ricerca finanziati per Malattie altamente invalidanti, per € 324.140.000;

VISTO il decreto direttoriale n.27 del 2 novembre 2022, registrato con visto n.1054 dall’ufficio centrale di bilancio in data 18 novembre 2022 con il quale è stata approvata la graduatoria dei progetti di ricerca del primo avviso pubblico PNRR - Missione 6, Componente 2, Investimento 2.1;

VISTO il secondo avviso pubblico PNRR del 14 aprile 2023, registrato dall’ufficio centrale di bilancio presso questo Dicastero il 5 maggio 2023, al n. 541, per la presentazione e selezione di progetti di ricerca da finanziare nell’ambito del PNRR, Missione 6, Componente 2, Investimento 2.1, sulle tematiche: 1. Proof of concept (PoC) 2. Tumori Rari (TR) 3. Malattie Rare (MR) 4. Malattie Croniche non Trasmissibili (MCnT2) ad alto impatto sui sistemi sanitari e socioassistenziali: a. Innovazione in campo diagnostico; b.

Innovazione in campo terapeutico; 5. Malattie Croniche non Trasmissibili (MCnT1) ad alto impatto sui sistemi sanitari e socioassistenziali: a. Fattori di rischio e prevenzione; b. Eziopatogenesi e meccanismi di malattia;

VISTO il decreto del Ministro della salute del 28 dicembre 2023 n.136, registrato dall’Ufficio centrale di bilancio presso il Ministero della salute in data 19 gennaio 2024 con n.62 e dalla Corte dei conti in data 5 febbraio 2024 con n.263 con il quale, a seguito delle risultanze della graduatoria dei progetti di ricerca afferenti al primo avviso pubblico PNRR, approvata con decreto direttoriale n.27 del 2 novembre 2022, è modificata l’allocazione delle risorse finanziarie indicate nell’allegato 1 del sopracitato decreto ministeriale 1° aprile 2022 assegnate al secondo avviso pubblico PNRR per i progetti di ricerca sulle seguenti tematiche progettuali: Proof of Concept, Malattie rare, Malattie croniche non trasmissibili, ad alto impatto sui sistemi sanitari e socioassistenziali (tematiche: Fattori di rischio e prevenzione; Eziopatogenesi e meccanismi di malattia);

VISTO il decreto n.5 del 29 marzo 2024 del Capo ad interim del Dipartimento della prevenzione, della ricerca e delle emergenze sanitarie del Ministero della salute, registrato dall’ufficio centrale di bilancio presso questo Ministero in data 4 aprile 2024 al n.225, con il quale, in osservanza alle disposizioni del Comitato tecnico sanitario, sezione c) espresse all’unanimità nella riunione del 26 marzo 2024, è stata approvata la graduatoria dei progetti di ricerca del secondo avviso pubblico PNRR- Missione 6 - Componente 2 - Investimento 2.1, afferenti alle tematiche progettuali Proof of Concept, Xxxxxx Xxxx, Malattie Rare, Malattie Croniche non Trasmissibili, ad alto impatto sui sistemi sanitari e socio-assistenziali (tematiche: Innovazione in campo diagnostico; Innovazione in campo terapeutico), Malattie Croniche non Trasmissibili, ad alto impatto sui sistemi sanitari e socio-assistenziali (tematiche: Fattori di rischio e prevenzione; Eziopatogenesi e meccanismi di malattia), e sono stati individuati i Destinatari istituzionali e i Principal Investigator;

VISTO il Decreto del Presidente del Consiglio dei Ministri 30 ottobre 2023, n. 196, recante il nuovo

«Regolamento di organizzazione del Ministero della salute» ai sensi dell’articolo 6-bis del decreto legge 11 novembre 2023, n. 173, che abroga il precedente Regolamento di organizzazione di cui al Decreto del Presidente del Consiglio dei Ministri 11 febbraio 2014, n. 59;

VISTO il decreto del Ministro della Salute del 3 gennaio 2024, recante la disciplina transitoria dell’assetto organizzativo del Ministero della Salute previsto dal D.P.C.M. 30 ottobre 2023, n. 196;

VISTO il decreto del Presidente della Repubblica del 21 febbraio 2024 registrato alla Corte dei conti il 29 febbraio 2024 al n. 433 con il quale il xxxx. Xxxxxxxx Xxxxxxxx è stato nominato Capo ad interim del Dipartimento della prevenzione, della ricerca e delle emergenze sanitarie del Ministero della salute; TENUTO CONTO che la ex Direzione generale della Ricerca e dell’innovazione in sanità risulta attualmente priva di titolare;

VISTO il decreto del Ministro della Salute del 4 marzo 2024, comunicato agli organi di controllo, con il quale per il corrente esercizio finanziario ai dirigenti generali titolari dei Centri di responsabilità amministrativa, sulla base delle linee programmatiche, degli obiettivi strategici e dei risultati attesi definiti nella Direttiva generale per l’attività amministrativa e la gestione per l’anno 2024, emanata dal Ministro della Salute in data 29 febbraio 2024 e in corso di registrazione, sono stati assegnati i contingenti delle risorse umane, nonché le risorse economico-finanziarie indicate nei rispettivi programmi di spesa e relative azioni sottostanti dello stato di previsione del Ministero della Salute;

CONSIDERATO che il citato decreto del 4 marzo 2024 ha assegnato al Dipartimento della Prevenzione, della ricerca e delle emergenze sanitarie anche le risorse economico-finanziarie del programma 17.20 Ricerca per il settore della sanità pubblica, con le relative azioni sottostanti;

VISTO il decreto del Ministro dell’8 aprile 2015, recante “Individuazione degli uffici dirigenziali di livello non generale”;

VISTO il decreto direttoriale del 22 febbraio 2022, registrato dalla Corte dei Conti in data 23 marzo 2022 al numero 670, con il quale ai sensi dell’art. 19, comma 5, del D. Lgs. n. 165/2001, è stato conferito, alla Dr.ssa Xxxxx Xxxxxx Camera D’Afflitto, Direttore dell’Ufficio 4 della Ex Direzione generale della ricerca e dell’Innovazione in sanità, l’incarico dirigenziale non generale di durata triennale, a decorre dal 1° marzo 2022 fino al 28 febbraio 2025;

CONSIDERATO che l’Ufficio 3 di questa Direzione generale è competente, tra l’altro, alla sottoscrizione, al monitoraggio e alla verifica dei progetti di ricerca concernenti gli Istituti di ricovero e cura a carattere scientifico (IRCCS);

TENUTO CONTO che dal 1° aprile 2024 l’incarico di direttore dell’Ufficio 3 ex DGRIC risulta vacante a seguito del collocamento a riposo del Dirigente titolare;

VISTO il decreto del Capo Dipartimento ad interim del 22 aprile 2024 con il quale è stata affidata alla dott.ssa Xxxxx Xxxxxx Camera d’Afflitto la sottoscrizione delle convenzioni relative ai progetti di ricerca di cui al 2° avviso pubblico nell’ambito del PNRR, sia relativamente agli IRCCS che relativamente a tutti gli altri soggetti attuatori-beneficiari delle risorse ovvero Regioni e Province autonome e Istituto superiore di sanità;

VISTO il messaggio trasmesso da questa amministrazione per il tramite della piattaforma Workflow della ricerca in data 8 aprile 2024 con il quale è stato comunicato al Soggetto attuatore-beneficiario che la valutazione della proposta progettuale ha avuto esito positivo e che, pertanto, la stessa è stata ammessa a finanziamento;

tanto premesso si stipula e si conviene quanto segue tra

il Ministero della Salute (di seguito “Ministero”), in qualità di Amministrazione titolare, rappresentato dalla Dr.ssa Xxxxx Xxxxxx Camera d’Afflitto – Direttore dell’Ufficio 4 della Ex Direzione generale della ricerca e dell’innovazione in sanità (di seguito “Ex DGRIC”)

e

il Soggetto attuatore-beneficiario Istituto nazionale per lo studio e la cura dei tumori Fondazione X. Xxxxxxx del progetto, rappresentato dal Xxxx. XXXXXXX XXXXXXX XXXXXXX XXXXXXX in qualità di legale rappresentante, codice fiscale 00911350635 (di seguito “Soggetto attuatore-beneficiario”)

e

il/la xxxx. Xxxxxxxxx Xxxxxxxx (codice fiscale XXXXXX00X00X000X) in qualità di PRINCIPAL INVESTIGATOR del progetto con codice PNRR-MCNT1-2023-12378005 dal titolo “Spatial radiomIcs and tRanscriptomics to the dIscovery of the cross-link between colon cancer and chrOnic kidney disease in the SIRIO study.”

di seguito congiuntamente definite le “Parti”

Art. 1 Premesse

1. Le premesse sono parte integrante e sostanziale della presente Convenzione.

2. Fa altresì parte integrante e sostanziale della presente Convenzione, quale oggetto della stessa, il progetto di ricerca, i cui contenuti sono definiti ed eventualmente aggiornati nel tempo, mediante condivisione delle parti, senza necessità di espressa nuova sottoscrizione della presente Convenzione.

Art. 2 Soggetto attuatore-beneficiario e Principal Investigator

Il Soggetto attuatore-beneficiario e il Principal Investigator sono i responsabili dell’attuazione del progetto in questione e della regolarità delle relative spese ai sensi del bando e della normativa vigente.

1. È individuato quale Xxxxxxxx attuatore-beneficiario Istituto nazionale per lo studio e la cura dei tumori Fondazione X. Xxxxxxx codice fiscale 00911350635;

2. È individuato quale Principal investigator (di seguito anche “PI”) il/la xxxx. Xxxxxxxxx Xxxxxxxx, codice fiscale XXXXXX00X00X000X;

Art. 3 Oggetto

1. La presente Convenzione disciplina i rapporti tra le Parti per la realizzazione del progetto codice PNRR- MCNT1-2023-12378005 dal titolo “Spatial radiomIcs and tRanscriptomics to the dIscovery of the cross-link

between colon cancer and chrOnic kidney disease in the SIRIO study.”, nell’ambito della realizzazione degli obiettivi previsti dal PNRR, Missione 6 – Componente 2 – Investimento 2.1.

2. La presente Convenzione definisce, tra l’altro, gli obblighi delle Parti, le procedure di rendicontazione e quelle di pagamento.

3. Il soggetto attuatore-beneficiario e il Principal Investigator svolgono il progetto di ricerca secondo quanto riportato nel progetto presentato, parte integrante della presente convenzione, e approvato dal Ministero e in ottemperanza a quanto previsto dal presente avviso pubblico.

Art. 4 Termini di attuazione del progetto, durata e importo della Convenzione

1. La presente convenzione ha la durata di 24 mesi prorogabile eventualmente di ulteriori 6 mesi come previsto dal successivo articolo 11.

2. L’attività di ricerca, da svolgersi nell’arco temporale della vigenza della convenzione, deve avere inizio improrogabilmente entro e non oltre il 31 agosto 2024, comunicando la data effettiva di avvio con nota sottoscritta digitalmente dal proprio rappresentante legale e dal Principal investigator della ricerca che deve essere trasmessa almeno 30 giorni prima dell’inizio effettivo, correlata di documentazione di cui al successivo comma 4.

3. Il Soggetto attuatore-beneficiario entro e non oltre 15 giorni dall’invio della presente convenzione da parte del Ministero per la sottoscrizione provvede alla restituzione della convenzione firmata dal legale rappresentate e controfirmata dal Principal Investigator, tramite il sistema di monitoraggio del WFR, accompagnata dalla comunicazione del codice CUP MASTER e dei codici fiscali delle singole Unità operative. Le parti riconoscono che il bando di cui alle premesse prevede la decadenza dal finanziamento in caso di inadempienza della presente disposizione.

4. Il Soggetto-beneficiario, entro e non oltre 30 giorni precedenti la scadenza del termine di cui al comma 2 del presente articolo, pena la decadenza dal finanziamento, è tenuto a trasmettere - con nota sottoscritta digitalmente in maniera congiunta dal proprio rappresentante legale e dal Principal Investigator della ricerca

- la seguente documentazione, soggetta a verifica da parte del Ministero al fine di autorizzare l’avvio del progetto:

a) la dichiarazione da parte del legale rappresentante e del Principal Investigator con cui si dichiari che il progetto in questione o parti significative di esso non siano oggetto di altri finanziamenti pubblici a favore dell’Ente attuatore-beneficiario o del Principal Investigator e che, in ogni caso, sarà posta in essere ogni iniziativa volta ad evitare il doppio finanziamento;

b) la dichiarazione da parte del legale rappresentante e del ricercatore responsabile di ciascuna unità operativa partecipante con cui si dichiari che per la propria attività attinente al progetto in questione o per parti significative di esso non siano oggetto di altri finanziamenti pubblici a favore dell’Unità operativa medesima o dei ricercatori di tali unità operative elencati nella proposta progettuale e che, in ogni caso, sarà posta in essere ogni iniziativa volta ad evitare il doppio finanziamento;

c) la dichiarazione da parte degli Enti che svolgono funzioni di unità operativa e dei relativi responsabili di accettazione dei termini della presente convenzione;

d) la dichiarazione con la quale il Soggetto attuatore-beneficiario attesta che il Principal Investigator svolgerà la propria attività di ricerca, per l’intero periodo relativo all’attuazione del progetto, esclusivamente presso la propria sede o presso la struttura del S.S.N. afferente al medesimo, controfirmata dall’interessato;

e) il parere positivo del Comitato etico competente e/o l’autorizzazione di cui all’articolo 31 del decreto legislativo n. 26 del 4 marzo 2014 riguardante la sperimentazione animale, ove previsti;

f) la comunicazione del codice CUP delle singole Unità operative e per ognuna di esse anche il codice fiscale dei soggetti designati a operare sul sistema ReGiS attraverso specifico format excel che verrà condiviso da parte della Ex DGRIC che dovrà essere restituito firmato digitalmente;

g) la traduzione in lingua italiana della proposta progettuale senza apportare alcuna modifica alla versione in inglese allegata alla presente convenzione.

5. Per la realizzazione delle attività, l’importo ammesso a finanziamento è pari a €930.500,00 (novecentotrentamilacinquecento/00) a valere sulle risorse assegnate per le tematiche progettuali, stanziate in base alla tabella allegata al decreto ministeriale 1° aprile 2022, modificato con decreto ministeriale del 28 dicembre 2023 n.136, concernente la ripartizione degli interventi di investimento della Missione 6, Componente 2, Investimento 2.1 del Piano Nazionale di Ripresa e Resilienza relativo

all'innovazione, alla ricerca e alla digitalizzazione del Servizio sanitario nazionale e al potenziamento del sistema della ricerca biomedica.

6. La presentazione della richiesta di pagamento della rata intermedia delle spese al Ministero, secondo le modalità previste dall’art. 13, paragrafo 13.1 del bando, dovrà essere effettuata, previo caricamento della documentazione a supporto nel sistema ReGiS, entro 10 giorni dall’invio della comunicazione da parte del Ministero dell’approvazione della relazione scientifica intermedia.

7. La presentazione della richiesta di pagamento finale delle spese al Ministero dovrà essere effettuata successivamente all’invio entro 30 giorni dalla data di conclusione del progetto eventualmente prorogata secondo i termini della presente convenzione della relazione scientifica finale e della relativa rendicontazione economica complessiva del progetto e avverrà solo dopo l’invio della comunicazione da parte del Ministero dell’approvazione della relazione scientifica finale.

8. Il mancato adempimento di quanto previsto dai commi 2 e 3 del presente articolo equivale alla rinuncia a realizzare il progetto e comporta la decadenza dal contributo previsto e la decadenza dal finanziamento.

Art. 5 Obblighi del Soggetto attuatore-beneficiario e del Principal Investigator

1. Con la sottoscrizione della presente Convenzione, il Soggetto attuatore-beneficiario e il Principal Investigator, per quanto di competenza, si obbligano a:

1) assicurare il rispetto di tutte le disposizioni previste dalla normativa comunitaria e nazionale, con particolare riferimento a quanto previsto dal Reg. (UE) 2021/241 e dal D. L. n. 77 del 31/05/2021, convertito con modificazioni dalla L. 29 luglio 2021, n. 108;

2) garantire il rispetto di eventuali previsioni normative, orientamenti o istruzioni tecniche emanate dal Ministero della salute, dal Ministero dell’economia e delle finanze, dalla Commissione Europea ovvero da altri soggetti coinvolti nell’attuazione verifica e controllo delle azioni relative al PNRR, anche successivamente alla sottoscrizione della presente Convenzione;

3) assicurare l’adozione di misure adeguate volte a rispettare il principio di sana gestione finanziaria secondo quanto disciplinato nel Regolamento finanziario (UE, Euratom) 2018/1046 e nell’art. 22 del Regolamento (UE) 2021/241, in particolare in materia di prevenzione e contrasto dei conflitti di interessi, delle frodi, della corruzione, del doppio finanziamento e di recupero e restituzione dei fondi che sono stati indebitamente assegnati;

4) rispettare, a pena di sospensione o revoca del finanziamento in caso di accertata violazione, il principio di “non arrecare danno significativo” (DSNH) agli obiettivi ambientali a norma dell’articolo 17 del Regolamento (UE) 2020/852, i principi trasversali previsti dal PNRR quali, tra l’altro, il principio del contributo all’obiettivo climatico e digitale (c.d. tagging), la parità di genere, producendo dati relativi ai destinatari effettivi dei progetti anche disaggregati per genere (in relazione agli articoli 2, 3, paragrafo 3, del TUE, 8, 10, 19 e 157 del TFUE, e 21 e 23 della Carta dei diritti fondamentali dell’Unione europea), l’obbligo di protezione e valorizzazione dei giovani ed eventuali ulteriori requisiti e condizionalità specifiche dell’investimento oggetto della presente Convenzione;

5) adottare proprie procedure interne, assicurando la conformità ai regolamenti comunitari e a quanto indicato dal Ministero nella descrizione delle funzioni e delle procedure in essere dal Ministero;

6) dare piena attuazione al progetto così come illustrato nel Programma di ricerca, ammesso a finanziamento dal Ministero, garantendo l’avvio tempestivo delle attività progettuali per non incorrere in ritardi attuativi e concludere il progetto nella forma, nei modi e nei tempi previsti, nel rispetto della tempistica prevista dal relativo cronoprogramma di attuazione e di sottoporre al Ministero le eventuali modifiche al progetto;

7) assicurare il rispetto della normativa vigente sugli aiuti di Stato;

8) assicurare il rispetto dei criteri di ammissibilità delle spese e delle quote percentuali previste dal presente avviso pubblico per le varie voci di costo, che saranno calcolate, a consuntivo, sulle spese rendicontate, al netto di eventuali economie riscontrate sul finanziamento assegnato e sulle sole spese eleggibili, dopo verifica da parte del Ministero;

9) garantire, nel caso in cui si faccia ricorso alle procedure di appalto, il rispetto di quanto previsto dal decreto legislativo n. 50/2016 e s.m.i.; rispettare, in caso di ricorso diretto ad esperti esterni all’Amministrazione, la conformità alla pertinente disciplina comunitaria e nazionale, nonché alle eventuali specifiche circolari/disciplinari che potranno essere adottati dal Ministero;

10) individuare eventuali fattori che possano determinare ritardi che incidano in maniera considerevole sulla

tempistica attuativa e di spesa definita nel cronoprogramma, relazionando il Ministero sugli stessi;

11) mitigare e gestire i rischi connessi al progetto nonché porre in essere azioni mirate connesse all’andamento gestionale ed alle caratteristiche tecniche;

12) effettuare i controlli ordinari di gestione e di regolarità amministrativo-contabile previsti dalla normativa vigente, e le verifiche sul conflitto di interessi, sul doppio finanziamento e quelle previste dalla normativa antiriciclaggio (“titolare effettivo”);

13) utilizzare il sistema informatico “ReGiS, finalizzato a raccogliere, registrare e archiviare in formato elettronico i dati per ciascuna operazione necessari per la sorveglianza, la valutazione, la gestione finanziaria, la verifica e l’audit, secondo quanto previsto dall’art. 22.2 lettera d) del Regolamento (UE) 2021/241 e tenendo conto delle indicazioni che verranno fornite dagli organi competenti per il tramite del Ministero;

14) caricare sul portale Workflow della Ricerca e nel sistema “ReGiS” la documentazione tecnico scientifica sullo stato di avanzamento del progetto atta a comprovare il corretto svolgimento dello stesso;

15) caricare sul sistema informativo “ReGiS” la documentazione atta a comprovare il corretto svolgimento dei controlli ordinari previsti dalla normativa vigente in merito alle procedure di gara espletate per l’aggiudicazione degli eventuali appalti o subcontratti e eventuali altra documentazione richiesta dalle Amministrazioni centrali deputate alla gestione complessiva del PNRR;

16) garantire la correttezza, l’affidabilità e la congruenza con il tracciato informativo previsto per l’alimentazione del sistema informativo “ReGiS” dei dati di monitoraggio riferiti al CUP Master e ai CUP delle singole Unità operative sull’avanzamento finanziario, fisico e procedurale, e di quelli che comprovano il conseguimento degli obiettivi dell’intervento quantificati in base agli stessi indicatori adottati per le milestones e i target della misura e assicurarne l’inserimento con cadenza almeno bimestrale delle spese (nel termine massimo di 10 giorni successivi all’ultimo giorno del bimestre) nel portale Workflow della Ricerca e sul sistema informativo “ReGiS”, unitamente alla documentazione probatoria pertinente, salvo diversa comunicazione;

17) rispettare l’obbligo di indicazione del CUP su tutti gli atti amministrativo/contabili relativi al progetto e sui documenti collegati alle relative procedure di acquisto e fatturazione;

18) fornire tutte le informazioni richieste relativamente alle procedure e alle verifiche in relazione alle spese rendicontate conformemente alle procedure e agli strumenti adottati dal Ministero;

19) garantire la conservazione della documentazione progettuale in fascicoli cartacei e/o informatici per assicurare la completa tracciabilità delle operazioni - nel rispetto di quanto previsto all’art. 9, punto 4, del

D.L. n. 77 del 31 maggio 2021, convertito con modificazioni dalla L. n. 108/2021 - che, nelle diverse fasi di controllo e verifica previste dal sistema di gestione e controllo del PNRR, dovranno essere messi prontamente a disposizione su richiesta dell’Amministrazione centrale titolare di intervento PNRR, del Servizio centrale per il PNRR del MEF, dell’Unità di Audit, della Commissione europea, dell’OLAF, della Corte dei Conti europea (ECA), della Procura europea (EPPO) e delle competenti Autorità giudiziarie nazionali, autorizzando la Commissione, l'OLAF, la Corte dei conti e l'EPPO a esercitare i diritti di cui all'articolo 129, paragrafo 1, del regolamento finanziario (UE; EURATOM) 1046/2018;

20) facilitare le verifiche dell’Ufficio competente per i controlli del Ministero, dell’Unità di Audit, della Commissione europea e di altri organismi autorizzati, che verranno eventualmente effettuate anche attraverso controlli in loco;

21) assicurare che le spese del Progetto di ricerca non siano oggetto, anche parzialmente, di altri finanziamenti, contributi o agevolazioni a valere su fondi pubblici nazionali e/o comunitari (divieto del doppio finanziamento);

22) garantire la disponibilità dei documenti giustificativi relativi alle spese sostenute e ai target realizzati così come previsto ai sensi dell’articolo 9 punto 4 del decreto legge n. 77 del 31/05/2021, convertito in legge 29 luglio 2021, n. 108;

23) predisporre i pagamenti secondo le procedure stabilite dal Ministero, nel rispetto del piano finanziario e cronogramma di spesa approvato, inserendo, allo scadere dei 12 e 24 mesi (prorogabili eventualmente di 6 mesi) nel portale Workflow della Ricerca e sul sistema informativo “ReGiS” i relativi documenti riferiti alle procedure e i giustificativi di spesa e pagamento necessari ai controlli ordinari di legalità e ai controlli amministrativo-contabili previsti dalla legislazione nazionale applicabile, nel rispetto di quanto previsto dall’articolo 22 del Reg. (UE) n. 2021/241 e dell’art. 9 del decreto legge n. 77 del 31/05/2021, convertito in legge 29 luglio 2021, n. 108 la documentazione;

24) assicurare che tutte le spese rendicontate siano state effettuate entro il periodo di svolgimento del progetto e che gli eventuali pagamenti per fatture emesse nel periodo di svolgimento del progetto siano completate entro i 30 giorni successivi alla scadenza progettuale e in tempo utile per il caricamento sul sistema di rendicontazione ReGiS;

25) inoltrare, allo scadere dei 12 e 24 mesi (prorogabili eventualmente di 6 mesi),le richieste di pagamento al Ministero tramite il portale Workflow della Ricerca e/o il sistema informativo “ReGiS” con allegata la rendicontazione dettagliata delle spese effettivamente sostenute e del contributo al perseguimento delle milestones e dei target associati alla misura PNRR di riferimento, unitamente ai documenti giustificativi appropriati secondo le tempistiche e le modalità riportate nei dispositivi attuativi;

26) garantire l’utilizzo di un conto corrente dedicato necessario per l’erogazione dei pagamenti e l’adozione di una contabilità separata o di un’apposita codificazione contabile e informatizzata per tutte le transazioni relative al progetto al fine di assicurare la tracciabilità dell’utilizzo delle risorse del PNRR;

27) assicurare, direttamente o attraverso le Istituzioni da esso dipendenti in cui saranno svolte le attività di ricerca, l’anticipazione delle somme necessarie allo svolgimento della ricerca;

28) partecipare, ove richiesto, alle riunioni convocate dal Ministero.

29) garantire, anche attraverso la trasmissione di relazioni periodiche sullo stato di avanzamento del progetto, che il Ministero riceva tutte le informazioni necessarie, relative alle linee di attività per l’elaborazione delle relazioni annuali di cui all’articolo 31 del Regolamento (UE) n. 2021/241, nonché qualsiasi altra informazione eventualmente richiesta;

30) conseguire il raggiungimento degli obiettivi dell’intervento, quantificati secondo gli stessi indicatori adottati per le milestones e i target della misura PNRR di riferimento, e fornire, su richiesta dal Ministero, le informazioni necessarie per la predisposizione delle dichiarazioni sul conseguimento di target e milestones e delle relazioni e documenti sull’attuazione dei progetti;

31) garantire il rispetto degli obblighi in materia di comunicazione e informazione previsti dall’art. 34 del Regolamento (UE) 2021/241 indicando nella documentazione progettuale che il progetto è finanziato nell’ambito del PNRR, con esplicito riferimento al finanziamento da parte dell’Unione europea e all’iniziativa Next Generation EU (ad es. utilizzando la frase “finanziato dall’Unione europea – Next Generation EU – PNRR M6C2 - Investimento 2.1 Valorizzazione e potenziamento della ricerca biomedica del SSN”), riportando nella documentazione progettuale il logo dell’Unione europea e fornire un’adeguata diffusione e promozione del progetto, anche online, sia web sia social, in linea con quanto previsto dalla Strategia di Comunicazione del PNRR;

32) fornire i documenti e le informazioni necessarie secondo le tempistiche previste e le scadenze stabilite dai Regolamenti comunitari e dal Ministero e per tutta la durata del progetto;

33) garantire una tempestiva diretta informazione agli organi preposti, tenendo informato il Ministero sull’avvio e l’andamento di eventuali procedimenti di carattere giudiziario, civile, penale o amministrativo che dovessero interessare le operazioni oggetto del progetto, comunicare le irregolarità, le frodi, i casi di corruzione e di conflitti di interessi, nonché i casi di doppio finanziamento, riscontrati a seguito delle verifiche di competenza e adottare le misure necessarie, nel rispetto delle procedure adottate dallo stesso Ministero in linea con quanto indicato dall’art. 22 del Regolamento (UE) 2021/2041;

34) garantire che il Ministero riceva attraverso il sistema “ReGiS” tutte le informazioni necessarie per l’aggiornamento dell’indicatore comune n. 8 “Ricercatori che lavorano in centri di ricerca beneficiari di un sostegno”, riconducibile alla misura oggetto del presente avviso pubblico, tenuto conto che, ai sensi dell’art. 3, comma 3, del Regolamento delegato (UE) 2021/2106 della Commissione del 28 settembre 2021 che integra il regolamento (UE) 2021/241 del Parlamento europeo e del Consiglio, che istituisce il dispositivo per la ripresa e la resilienza “la comunicazione di informazioni per l’aggiornamento degli indicatori comuni ha luogo ogni anno entro il 28 febbraio e il 31 agosto. Il periodo di riferimento copre l’intero periodo di attuazione del piano, dal 1° febbraio 2020 in poi, se del caso, fino alle rispettive date limiti del 31 dicembre e del 30 giugno di ogni anno.”

Art. 6 Procedura di monitoraggio e rendicontazione della spesa e dei target

1. Il Ministero con la presente convenzione rappresenta alla controparte che il monitoraggio tecnico- scientifico sarà svolto dalla Ex DGRIC, mentre i controlli rispetto alla rendicontazione delle spese saranno svolte dall’Unità di missione per l'attuazione degli interventi del PNRR presso il Ministero della salute.

2. Il Soggetto attuatore-beneficiario, secondo le indicazioni fornite dal Ministero, deve registrare su base almeno bimestrale, entro 10 giorni successivi all’ultimo giorno del periodo considerato, i dati sull’avanzamento finanziario, fisico e procedurale del progetto nel sistema informatico “ReGiS” e implementare tale sistema con la documentazione specifica relativa a ciascuna procedura di affidamento e a ciascun atto giustificativo di spesa e di pagamento, al fine di consentire l’espletamento dei controlli amministrativo-contabili a norma dell’art. 22 del Reg. (UE) 2021/241 da parte dall’Unità di missione per l'attuazione degli interventi del PNRR presso il Ministero della salute.

3. Il Soggetto attuatore-beneficiario, allo scadere dei 12 e 24 mesi (prorogabili eventualmente di 6 mesi) deve trasmettere i dati sull’avanzamento tecnico-scientifico del progetto tramite il portale Workflow della Ricerca e il sistema “ReGiS” corredata di documentazione specifica relativa a ciascuna procedura di affidamento e a ciascun atto giustificativo di spesa e di pagamento, al fine di consentire l’espletamento dei controlli amministrativo-contabili e delle verifiche sullo stato di avanzamento del progetto.

4. Il Soggetto attuatore-beneficiario, pertanto, dovrà inoltrare allo scadere dei 12 e 24 mesi (prorogabili eventualmente di 6 mesi) tramite il portale Workflow della Ricerca e il sistema informatico “ReGiS”, la richiesta rendicontazione delle spese volte a supportare le richieste di pagamento che dovranno essere formalmente trasmesse all’Unità di Missione del Ministero comprensiva dell’elenco di tutte le spese effettivamente sostenute nel periodo di riferimento, gli avanzamenti relativi agli indicatori di intervento/progetto con specifico riferimento alle milestones e ai target del PNRR. Tale richiesta dovrà essere corredata dalla documentazione specificatamente indicata nelle procedure in essere del Ministero.

5. Le spese incluse nelle richieste di pagamento del Soggetto attuatore/beneficiario, se afferenti ad operazioni estratte a campione, sono sottoposte, per il tramite del Sistema Informatico “ReGiS”, alle verifiche, se del caso anche in loco da parte delle strutture deputate al controllo del Ministero.

6. Nello specifico, l’Unità di missione per l'attuazione degli interventi del PNRR del Ministero della Salute e eventuali altre amministrazioni coinvolte a diversi livelli di controllo eseguono le verifiche sulle procedure, sulle spese e sui target in conformità con quanto stabilito dall’art. 22 del Regolamento (UE) 2021/241 al fine di garantire la tutela degli interessi finanziari dell'Unione, la prevenzione, individuazione e rettifica di frodi, di casi di corruzione e di conflitti di interessi, nonché il recupero di somme erroneamente versate o utilizzate in modo non corretto.

7. La Ex DGRIC del Ministero della Salute svolge nel merito le funzioni di verifica tecnico-scientifica sullo stato di avanzamento del progetto in questione in coerenza con lo stato di rendicontazione delle spese.

Art. 7 Valutazione intermedia

1. Allo scadere dei 12 mesi dall’inizio dell’attività della ricerca e comunque non oltre trenta (30) giorni da tale termine, il Soggetto attuatore-beneficiario trasmette al Ministero tramite il portale Workflow della ricerca la relazione intermedia sullo stato d’attuazione scientifica della ricerca, sottoscritta digitalmente dal legale rappresentante del Soggetto attuatore/beneficiario e dal Principal Investigator, contenente la descrizione delle attività progettuali svolte complessivamente e dalle singole unità operative, da cui risulti lo stato avanzamento lavori (SAL) e il regolare svolgimento della ricerca, secondo quanto riportato nel progetto approvato. Tale relazione deve contenere una sintesi, a cura del Principal Investigator, che illustri, nella globalità, lo stato di avanzamento dei lavori, inclusa la descrizione delle attività realizzate da eventuali Enti co-finanziatori e l’apporto fornito da eventuali subcontraenti. La relazione intermedia, previa verifica tecnico-scientifica da parte della Ex DGRIC, sarà caricata dal Soggetto attuatore/beneficiario e dal Principal Investigator all’interno del sistema informativo “ReGiS”.

2. Il Ministero ha facoltà, previa comunicazione preventiva al Soggetto attuatore-beneficiario, di attivare le procedure per la sospensione del finanziamento e il recupero delle somme erogate, comprensive degli eventuali interessi legali maturati, qualora il Soggetto attuatore/beneficiario non adempia a quanto previsto entro i termini di cui al comma 1 del presente articolo.

3. La Ex DGRIC del Ministero della Salute, previa comunicazione preventiva al Soggetto attuatore- beneficiario, ha facoltà di comunicare all’Unità di missione per l'attuazione degli interventi del PNRR del medesimo Ministero, che sussistono le condizioni per non erogare le successive quote a rimborso, subordinandole all’ esito positivo del giudizio in ordine alla relazione finale, qualora la relazione intermedia, all’esito dell’istruttoria, non sia considerata idonea a dimostrare che siano stati pienamente

raggiunti gli obiettivi medio termine o emerga che essa sia stata condotta non in piena conformità con quanto previsto nel progetto approvato. In tal caso il Ministero potrà procedere con il rimborso a saldo. Laddove non vengano rispettati i termini di cui alla presente convenzione, che non consentano la tempestiva erogazione dei fondi, il Soggetto attuatore-beneficiario esonera il Ministero da qualsiasi responsabilità per eventuali ritardi nell’erogazione delle somme spettanti.

4. Il Ministero, previa comunicazione preventiva al Soggetto attuatore-beneficiario, può sottoporre al Comitato tecnico sanitario sez. c), un dossier, qualora la relazione intermedia, all’esito della istruttoria ministeriale, non consenta di esprimere un compiuto motivato parere. La decisione del suddetto Comitato è vincolante per il Soggetto attuatore-beneficiario ai fini del prosieguo della convenzione.

Art. 8 Valutazione finale

1. Fatta salva l’eventuale concessione di proroga della durata delle attività progettuali, al termine di ventiquattro mesi e comunque non oltre trenta (30) giorni dopo la data fissata per il termine della ricerca ai fini dell’erogazione del saldo, il Soggetto attuatore-beneficiario, con nota firmata digitalmente dal rappresentante legale, trasmette contestualmente al Ministero la seguente documentazione, redatta dal Principal Investigator e recante la firma digitale dello stesso:

- la relazione finale della ricerca, contenente quanto posto in essere anche da eventuali Enti cofinanziatori, che documenti, per ciascuna unità operativa, la coerenza delle attività svolte con il progetto approvato e gli obiettivi raggiunti;

- copia dei lavori pubblicati su riviste impattate a seguito dello svolgimento della ricerca;

- la rendicontazione delle spese sostenute con i fondi ministeriali;

- indicazioni del repository pubblico dove sono resi disponibili i dati grezzi progettuali e quelli utilizzati per le pubblicazioni scientifiche correlate;

- il rispetto dei costi sostenuti rispetto ai vincoli del bando in materia di gender e spese effettuate da parte di istituzioni nell’aree del meridione.

2. La rendicontazione economica dovrà essere corredata da una relazione di certificazione e di apposita check list di verifica dei requisiti minimi del bando, rilasciata da un Revisore esterno indipendente, iscritto all’Ordine dei Dottori Commercialisti ed Esperti Contabili e al Registro dei Revisori Legali, in possesso dei requisiti richiesti dalla Direttiva 2014/56/UE del Parlamento europeo e del Consiglio, del 16 aprile 2014, che modifica la direttiva 2006/43/CE relativa alle revisioni legali dei conti annuali e dei conti consolidati, e dalla relativa legislazione nazionale di attuazione, che certifichi la regolarità amministrativo-contabile delle spese sostenute per la realizzazione del progetto, la loro conformità alla normativa di riferimento vigente, il rispetto delle condizionalità e di tutti i requisiti previsti dal presente avviso pubblico e dalla presente Convenzione il rispetto delle normative nazionali ed europee in materia e la congruenza con le attività svolte ed i risultati raggiunti.

3. Tutta la sopra richiamata documentazione deve essere redatta e trasmessa tramite il portale Workflow della ricerca e il sistema informatico “ReGiS” e secondo le indicazioni previste dal sistema informatico di monitoraggio economico e utilizzando congiuntamente il sistema di comunicazione del Workflow della ricerca, a disposizione dei destinatari istituzionali che può essere integrato con comunicazioni tramite posta elettronica certificata (PEC) da parte del Soggetto attuatore/beneficiario.

4. La documentazione di supporto deve essere a disposizione del Ministero e degli Organi di controllo e verifica del PNRR, presso il Soggetto attuatore-beneficiario, che deve provvedere alla relativa custodia.

5. La Ex DGRIC del Ministero della salute provvede ad applicare una decurtazione pari al 10% della rata del saldo, qualora la documentazione di cui al comma 1 del presente articolo sia trasmessa al Ministero in un periodo compreso tra il trentunesimo e il quarantesimo giorno dalla data di conclusione del progetto.

6. Il Ministero provvede ad applicare una decurtazione pari al 20% della rata del saldo, qualora la documentazione di cui al comma 1 del presente articolo sia trasmessa al Ministero in un periodo compreso tra il quarantunesimo e il cinquantesimo giorno dalla data di conclusione del progetto.

7. Il Ministero, previa comunicazione preventiva al Soggetto attuatore-beneficiario, attiva le procedure per la sospensione del finanziamento e la conseguente economia della rata finale, nonché per il recupero di tutte delle somme già erogate, anche quelle già utilizzate per il personale facente parte del gruppo della ricerca,

comprensive degli interessi legali maturati, qualora la documentazione di cui al comma 1 del presente articolo non sia trasmessa al Ministero entro il cinquantesimo giorno dalla data di conclusione del progetto.

8. Il Ministero si riserva la facoltà di chiedere informazioni ed eventuale documentazione integrativa al Soggetto attuatore/beneficiario, che deve fornire riscontro entro e non oltre i successivi 15 giorni, qualora:

- la relazione finale non sia considerata idonea a dimostrare il regolare svolgimento della ricerca, in conformità a quanto previsto nel progetto e nel piano finanziario approvati;

- la rendicontazione risulti incompleta o incongruente sia sui dati contabili sia sulle descrizioni.

9. Il Ministero provvederà ad emettere la valutazione finale sulla base di quanto acquisito agli atti. In caso di mancato o esaustivo riscontro da parte del Soggetto attuatore-beneficiario delle richieste di cui al precedente comma, il Ministero comunica al Soggetto attuatore-beneficiario il parere negativo in ordine alla relazione finale e conseguentemente in ordine all’erogazione del saldo ed ha facoltà di chiedere la restituzione delle somme già erogate, comprensive degli interessi legali maturati, in caso di mancato riscontro oppure laddove dall’istruttoria della documentazione integrativa emerga che sono stati disattesi gli obiettivi di cui al progetto

10. Il Ministero, previa comunicazione preventiva al Soggetto attuatore-beneficiario, può sottoporre al Comitato tecnico sanitario sez. c) un dossier, qualora la relazione finale, all’esito della istruttoria ministeriale, non consenta di esprimere un compiuto motivato parere. La decisione del suddetto Comitato è vincolante per il Soggetto attuatore-beneficiario ai fini del prosieguo della convenzione.

Art. 9 Verifica finanziaria preventiva

Il Soggetto attuatore-beneficiario, al fine dell’erogazione del finanziamento, deve trasmettere al Ministero della salute, Unità di missione per l’attuazione degli investimenti del PNRR, tramite il sistema “ReGiS” la rendicontazione economica corredata da certificato di verifica finanziaria, di cui al comma 2 dell’articolo 8 della presente convenzione, redatto in lingua inglese ed in italiano da parte di soggetti qualificati all’Audit a livello europea, che certifichi la correttezza della procedura di spese, la completezza della documentazione in base alle disposizioni del bando e alle norme nazionale e a quelle europee.

Art. 10 Procedura di pagamento al Soggetto beneficiario

1. Le procedure di erogazione dei fondi su richiesta del Soggetto attuatore-beneficiario a titolo di anticipazione e a titolo di rimborso all’Unità di missione del Ministero della salute seguono le specifiche modalità in conformità con quanto indicato nel presente avviso pubblico e di seguito riportate:

- massimo 40% al momento della comunicazione, da parte del Soggetto beneficiario, dell’inizio dell’attività di ricerca, a titolo di anticipazione.

- quota a rimborso per un ulteriore massimo complessivo pari al 70% dopo l’invio, al 12° mese dall’inizio delle attività progettuali, da parte del Soggetto attuatore-beneficiario della relazione scientifica intermedia e dopo la sua approvazione, sulla base della presentazione delle richieste di pagamento a titolo di rimborso per le spese effettivamente sostenute dal Soggetto beneficiario, come risultanti dal sistema informatico di cui all’articolo 1, comma 1043, della legge 30 dicembre 2020, n. 178.

- quota a rimborso residuale a saldo pari al 30% (ovverosia fino al 100% della richiesta complessiva) a conclusione della ricerca, dopo l’invio da parte del Soggetto attuatore-beneficiario della relazione scientifica finale e della rendicontazione economica, sulla base della presentazione della richiesta di pagamento finale attestante la conclusione del progetto, in coerenza con le risultanze del sistema di monitoraggio di cui all’articolo 1, comma 1043, della legge 30 dicembre 2020, n. 178.

2. A garanzia della coerenza con l’inizio dell’attività dichiarata, il Soggetto attuatore-beneficiario si impegna ad anticipare le risorse economiche necessarie, nell’eventualità in cui le somme da corrispondersi da parte del Ministero siano in regime di perenzione.

3. Laddove non vengano rispettati i termini di cui alla presente convenzione, che non consentano la tempestiva erogazione dei fondi, il Soggetto attuatore-beneficiario esonera il Ministero da qualsiasi responsabilità per eventuali ritardi nell’erogazione delle somme spettanti.

4. Al termine delle verifiche la Ex DGRIC del Ministero della Salute comunicherà dall’Unità di missione per l'attuazione degli interventi del PNRR del Ministero Salute le risultanze delle verifiche per consentire l’effettuazione degli eventuali successivi pagamenti.

Art. 11 Variazioni del progetto e del piano dei costi

1. A partire dal 3° mese successivo all’avvio del progetto e fino a 3 mesi prima della scadenza del progetto, il Soggetto attuatore-beneficiario, con nota firmata dal proprio rappresentate legale e dal Principal Investigator, trasmessa tramite il portale Workflow della ricerca e il sistema informatico “ReGiS”, può proporre variazioni al progetto, coerenti con gli obiettivi progettuali, o alla distribuzione di fondi tra le unità operative, purché non comportino un aumento del finanziamento complessivo a carico del Ministero, che dovranno essere accolte con autorizzazione scritta del Ministero. La richiesta di modifica deve dimostrare le necessità scientifiche alla base della richiesta e l’equivalenza della modifica proposta rispetto al raggiungimento degli obiettivi progettuali previsti, modifica che avrà efficacia solo dopo l’approvazione da parte del Ministero con successivo necessario adeguamento del piano dei costi per il CUP Master e per i CUP delle singole Unità operative da parte del Soggetto attuatore-beneficiario.

2. Non è consentito al di fuori del periodo di cui al comma 1 avanzare richieste di modifica. In caso di eventuale necessità di un’ulteriore modifica progettuale è possibile presentare tale richiesta di modifica solo dopo 3 mesi dall’approvazione da parte del Ministero dell’ultima modifica progettuale della stessa tipologia ovverosia scientifica o economica.

3. Il piano dei costi, riportato nella proposta progettuale, è da ritenersi vincolante relativamente al solo totale del finanziamento assegnato e al riparto iniziale tra unità operative, mentre ha valore meramente indicativo per quanto riguarda la ripartizione tra voci di costo e le motivazioni fornite a giustificazione di tali costi.

4. La distribuzione delle somme tra le diverse voci di costo, nell’ambito di ogni singola unità operativa, è consentita sotto la responsabilità del Soggetto attuatore-beneficiario che ha presentato il progetto e che dovrà verificare il rispetto delle percentuali ed i vincoli previste dal bando.

5. Qualsiasi proposta emendativa deve essere adeguatamente motivata dal Principal Investigator per documentare che quanto richiesto risulti indispensabile per assicurare il raggiungimento degli obiettivi a suo tempo prefissati.

6. Solo dopo l’approvazione del Ministero, il soggetto attuatore-beneficiario potrà procedere all’applicazione delle modifiche di cui al comma 1 del presente articolo. In caso di eventuali inadempimenti al presente articolo il Ministero ha facoltà di procedere sia alla risoluzione della convenzione, dandone comunicazione al Soggetto attuatore/beneficiario, sia alla sospensione del finanziamento, nonché al recupero di tutto l’importo erogato.

Art. 12 Proroga

1. Il termine della ricerca può essere prorogato dal Ministero per un periodo massimo di 6 mesi dalla data di scadenza originale, solo a seguito di formale, motivata e documentata istanza firmata digitalmente dal legale rappresentante del Soggetto attuatore-beneficiario e dal Principal Investigator, trasmessa tramite il portale Workflow della ricerca.

2. La richiesta di cui al comma 1 può essere avanzata solo dopo la presentazione della relazione di medio termine ovverosia dopo 12 mesi dall’avvio progetto e fino a 3 mesi precedenti il termine del progetto, con formale e motivata istanza da parte del Soggetto attuatore-beneficiario e del Principal Investigator, che dimostri le necessità scientifiche alla base della richiesta rispetto alle necessità per il raggiungimento degli obiettivi progettuali previsti e avrà efficacia solo dopo l’approvazione da parte del Ministero.

Art. 13 Proprietà e diffusione dei risultati

1. La proprietà degli studi, dei prodotti e delle metodologie sviluppati nell’ambito del progetto è regolamentata dalla normativa vigente in materia, salvo particolari accordi stipulati tra le parti firmatarie del presente atto, ferma restando la possibilità dei soggetti istituzionali del Servizio Sanitario Nazionale di fruirne, previa richiesta alle parti firmatarie.

2. Nel caso in cui il Soggetto attuatore/beneficiario intenda trasferire ad altri soggetti qualsiasi diritto, anche parziale, relativo alla ricerca in questione, ai risultati della stessa o ad eventuali brevetti derivati deve darne preventiva comunicazione al Ministero.

3. Il Soggetto attuatore-beneficiario si impegna a garantire un’adeguata diffusione e promozione del progetto, anche online, sia sul web che sui social media.

4. Qualsiasi documento prodotto, ivi comprese le pubblicazioni scientifiche inerenti al progetto di ricerca oggetto della presente convenzione – per i quali deve essere assicurato l’accesso non oneroso al Ministero

- deve contenere l’indicazione che il progetto è finanziato nell’ambito del PNRR, con un’esplicita dichiarazione che reciti "finanziato dall’Unione europea – Next Generation EU – PNRR M6C2 - Investimento 2.1 Valorizzazione e potenziamento della ricerca biomedica del SSN", l’emblema dell’Unione Europea ed il codice del progetto.

5. I prodotti di cui al precedente comma 4 devono essere resi pubblici attraverso sistemi che consentano l’immediata fruizione da parte del pubblico (ad esempio open-access) e non potranno essere oggetto di pubblicazione scientifica per la quale sia necessario il pagamento di una sottoscrizione ovvero il pagamento per la consultazione relativa L’eventuale violazione del presente comma, anche per una sola pubblicazione, sarà oggetto di una penale pari al 25% del finanziamento complessivo

6. Il Ministero non riconosce l’eleggibilità dei costi delle pubblicazioni sui propri fondi qualora in dette pubblicazioni non si faccia espressa menzione del finanziamento ottenuto nell’ambito del PNRR e del codice progetto.

7. Le parti convengono che il Ministero possa dare direttamente diffusione, anche attraverso il proprio sito web, dell’estratto della proposta progettuale e dei risultati della ricerca sia in forma completa che sintetica e delle pubblicazioni scientifiche da essa derivate.

Art. 14 Casi di riduzione, sospensione o revoca del contributo

1. Il Ministero procede a dichiarare la sospensione o revoca totale o parziale del finanziamento concesso, con conseguente eventuale restituzione delle somme già erogate, comprensive degli interessi legali maturati, nei seguenti casi:

a. modifiche ingiustificate alla composizione del gruppo di ricerca;

b. mancato rispetto dei vincoli previsti dal presente avviso pubblico;

c. mancato rispetto degli obblighi di cui all’art. 5 della presente Convenzione;

d. mancato raggiungimento, nei tempi assegnati, delle milestones e dei target previsti per lo svolgimento del progetto;

e. mancata o ritardata presentazione della relazione intermedia sullo stato d’attuazione della ricerca;

f. mancata o ritardata presentazione - oltre il cinquantesimo giorno dalla data di conclusione del progetto - della relazione finale della ricerca e della rendicontazione delle spese sostenute con i fondi ministeriali;

g. modifiche del progetto o variazioni nella distribuzione dei fondi tra le unità operative non autorizzate.

2. Il Ministero applica riduzioni finanziarie in misura variabile e/o consistenti nel mancato riconoscimento delle spese nei seguenti casi:

a. mancato rispetto dei criteri di ammissibilità di cui all’art. 10 del presente avviso pubblico; spese eccedenti i massimali previsti per alcune categorie di spese dall’art. 10 dell’Avviso; costi delle pubblicazioni in cui non si faccia espressa menzione del finanziamento ottenuto nell’ambito del PNRR e del codice progetto;

b. riduzione finanziaria nella misura del 5% della rata del saldo nel caso in cui il Soggetto attuatore/beneficiario al termine delle attività progettuali inoltri copia dei lavori pubblicati su riviste impattate a seguito dello svolgimento della ricerca dalla quale risulti che solo alcune pubblicazioni prodotte recano la menzione del finanziamento ottenuto nell’ambito del PNRR e del codice progetto;

c. riduzione finanziaria nella misura del 10% della rata del saldo qualora la relazione finale della ricerca e la rendicontazione delle spese sostenute siano trasmesse al Ministero in un periodo compreso tra il trentunesimo e il quarantesimo giorno dalla data di conclusione del progetto;

d. riduzione finanziaria nella misura del 20% della rata del saldo qualora la relazione finale della ricerca e la rendicontazione delle spese sostenute siano trasmesse al Ministero in un periodo compreso tra il quarantunesimo e il cinquantesimo giorno dalla data di conclusione del progetto;

e. riduzione finanziaria nella misura del 5% dell’intero finanziamento nel caso in cui il Soggetto attuatore/beneficiario al termine delle attività progettuali inoltri copia dei lavori pubblicati su riviste impattate a seguito dello svolgimento della ricerca privi della menzione del finanziamento ottenuto nell’ambito del PNRR e del codice progetto;

f. riduzione finanziaria nella misura del 10% dell’intero finanziamento nel caso in cui il Soggetto attuatore/beneficiario al termine delle attività progettuali non inoltri la copia dei lavori pubblicati su riviste impattate a seguito dello svolgimento della ricerca e/o le indicazioni del repository pubblico dove sono resi disponibili i dati grezzi progettuali e quelli utilizzati per le pubblicazioni scientifiche correlate.

Art. 15 Risoluzione di controversie

1. Per qualsiasi controversia, il Soggetto attuatore-beneficiario può rivolgersi agli Uffici della Ex DGRIC del Ministero della salute, che sottoporranno le eventuali problematiche al parere di competenza del Comitato tecnico sanitario (CTS) operante presso il Ministero. Le parti, con la sottoscrizione della presente convenzione, accettano fin d’ora il parere che sarà espresso dal Comitato tecnico sanitario (CTS) in caso di controversie sulla conduzione scientifica del progetto e le eventuali ricadute economiche.

2. Con la firma della presente convenzione il Principal Investigator accetta quanto previsto dal precedente comma 1.

3. Qualora a seguito della valutazione del CTS, di cui al comma 1 sussistano ulteriori eventuali controversie, diverse da quelle del comma 1, che dovessero sorgere in ordine al presente avviso pubblico il Foro competente è il Foro di Roma.

Art. 16 Risoluzione per inadempimento

1. Il Ministero potrà avvalersi della facoltà di risolvere la presente Convenzione qualora il Soggetto attuatore- beneficiario non rispetti gli obblighi imposti a suo carico e, comunque, pregiudichi l’assolvimento da parte dello stesso Ministero degli obblighi imposti dalla normativa comunitaria.

Art. 17 Diritto di recesso

1. Il Ministero potrà recedere in qualunque momento dagli impegni assunti con la presente Convenzione nei confronti del Xxxxxxxx attuatore-beneficiario qualora, a proprio giudizio, nel corso di svolgimento delle attività, intervengano fatti o provvedimenti che modifichino la situazione esistente all’atto della stipula della presente Convenzione o ne rendano impossibile o inopportuna la conduzione a termine.

Art. 18 Comunicazioni e scambio di informazioni

1. Ai fini della digitalizzazione dell’intero ciclo di vita del progetto, tutte le comunicazioni con il Ministero della salute devono avvenire attraverso il sistema di monitoraggio delle ricerche denominato Workflow della ricerca, a disposizione del Soggetto attuatore-beneficiario e laddove necessario attraverso il sistema messo a disposizione dal Ministero dell’Economie e Finanze denominato “ReGiS”.

2. Il Soggetto attuatore/beneficiario attraverso il proprio rappresentate legale, nonché il Principal Investigator devono firmare digitalmente tutti gli atti inerenti alla ricerca.

Art. 19 Tracciabilità dei flussi finanziari

1. Le parti si impegnano all’osservanza, per quanto di rispettiva competenza, delle disposizioni inerenti alla tracciabilità dei flussi finanziari di cui all’art. 3 della Legge 13 agosto 2010, n. 136 e s.m.i..

Art. 20 Protezione dei dati personali

1. Nel corso dell’esecuzione delle attività oggetto della presente Convenzione, ciascuna delle Parti potrà trovarsi nella condizione di dover trattare dati personali riferibili a dipendenti e/o collaboratori dell’altra Parte, motivo per cui le stesse si impegnano sin d’ora a procedere al trattamento di tali dati personali in conformità alle disposizioni di cui al Regolamento (UE) 2016/679 del Parlamento europeo e del Consiglio, del 27 aprile 2016, relativo alla protezione delle persone fisiche con riguardo al trattamento dei dati personali, nonché alla libera circolazione di tali dati e che abroga la direttiva 95/46/CE (Regolamento generale sulla protezione dei dati - GDPR) e successive norme nazionali di adeguamento.

2. Le Parti si impegnano a condurre le suddette attività di trattamento sulla base dei principi di correttezza, liceità, trasparenza e tutela della riservatezza dei soggetti interessati e per il solo ed esclusivo fine di perseguire le finalità di cui alla presente Convenzione, nonché degli eventuali obblighi di legge allo stesso connessi. Tali dati saranno trattati dalle Parti con sistemi cartacei e/o automatizzati ad opera di propri dipendenti e/o collaboratori che, in ragione della propria funzione e/o attività, hanno la necessità di trattarli, per le sole finalità suindicate e limitatamente al periodo di tempo necessario al loro conseguimento.

Art. 21 Efficacia

1. La presente convenzione, vincolante all'atto della sottoscrizione per il Soggetto attuatore-beneficiario e il Principal Investigator, diventerà efficace per il Ministero a seguito della registrazione da parte degli organi di controllo.

Art. 22 Disposizioni Finali

1. Per quanto non previsto dalla presente Convenzione si rinvia alle norme comunitarie e nazionali di riferimento.

Letto, confermato e sottoscritto con firma digitale, ai sensi del decreto legislativo 7 marzo 2005, n. 82 e s.m.i.. Roma, (data della sottoscrizione come quella dell’ultima firma digitale apposta)

per il Ministero della salute

Dr.ssa Xxxxx Xxxxxx Camera d’Afflitto - Direttore dell’Ufficio 4 Ex Direzione generale della ricerca e dell’innovazione in sanità

per il Soggetto attuatore-beneficiario Istituto nazionale per lo studio e la cura dei tumori Fondazione

X. Xxxxxxx,

XXXXXXX XXXXXXX XXXXXXX XXXXXXX, codice fiscale XXXXXX00X00X000X (Legale

rappresentante)

Per presa visione ed accettazione:

Il Principal Investigator - Xxxxxxxxx Xxxxxxxx, codice fiscale XXXXXX00X00X000X

1 - General information

Project code: PNRR-MCNT1-2023-12378005

PI / Coordinator: Xxxxxxxx Xxxxxxxxx

Project topic: D2) Malattie croniche non trasmissibili (MCnT1) ad alto impatto sui sistemi sanitari e socio- assistenziali: eziopatogenesi e meccanismi di malattia

Applicant Institution: Istituto nazionale tumori Fondazione

Xxxxxxxx Xxxxxxx

Call section: Proposal title:

Malattie Croniche non Trasmissibili (MCnT1) ad alto impatto sui sistemi sanitari e socio-assistenziali

Spatial radiomIcs and tRanscriptomics to the dIscovery of the cross-link between colon cancer and chrOnic kidney disease in the SIRIO study.

Duration in months: 24

MDC primary: Oncologia

MDC secondary: Nefrologia e Urologia

Project Classification IRG: Project Classification SS:

Oncology 2 - Translational Clinical Cancer Biomarkers - CBSS

X

Project Keyword 1:

Development of novel methods for biostatistical analysis, informatics, and modeling that facilitate the discovery, evaluation, and use of markers

Project Request: Animals:

Project total financing request to the MOH: € 930.500

Humans:

Clinical trial:

Free keywords: Cancer; Colon; transcriptomics; kidney disease

Declarations

In case of a Synergy grant application 'Principal Investigator'(PI) means 'corresponding Principal Investigator on behalf of all Principal Investigators', and 'Host Institution' means 'corresponding Host Institution'.

1) The Principal Investigator declares to have the written consent of all participants on their participation and on the content of this proposal, as well as of any researcher mentioned in the proposal as participating in the project (either as other PI, team member or collaborator).	X
2) The Principal Investigator declares that the information contained in this proposal is correct and complete.	X
3) The Principal Investigator declares that all parts of this proposal comply with ethical principles (including the highest standards of research integrity — as set out, for instance, in the European Code of Conduct for Research Integrity — and including, in particular, avoiding fabrication, falsification, plagiarism or other research misconduct).	X
4) The Principal Investigator is only responsible for the correctness of the information relating to his/her own organisation. Each applicant remains responsible for the correctness of the information related to him and declared above.	X

Personal data protection

The assessment of your grant application will involve the collection and processing of personal data (such as your name, address and CV), which will be performed pursuant to Regulation (EC) No 45/2001 on the protection of individuals with regard to the processing of personal data by the Community institutions and bodies and on the free movement of such data. Unless indicated otherwise, your replies to the questions in this form and any personal data requested are required to assess your grant application in accordance with the specifications of the call for proposals and will be processed solely for that purpose. Details concerning the purposes and means of the processing of your personal data as well as information on how to exercise your rights are available in the privacy statement. Applicants may lodge a complaint about the processing of their personal data with the European Data Protection Supervisor at any time.

Abstract

The incidence of colorectal cancer (CRC) is higher in patients with chronic kidney disease (CKD) compared to general population. Causal factors have not been clarified so far, although some hypothesis could be formulated. Tumor microenvironment (TME) impacts cancer progression and is influenced by different chronic diseases associated with systemic inflammation. In our study, we aim to address this relevant issue by an in-deep characterization of TME in CKD patients with CRC undergoing surgery. This will provide genes expression directly on tumor tissues.

Our network includes three high national relevance hospitals (INT IRCCS Xxxxxxx, XXX Xxxxxxxxxx and XXX Xxxxxx) and a Genetic Research Institute (Biogem Scarl). We will recruit two comparing groups of CRC patients eligible for surgical cancer resection: 1. Patients with I-II stage CRC alone, and 2. Patients with I-II stage CRC and CKD. Anthropological, clinical and laboratory tests data will be collected and organized in a database for epidemiological and descriptive analysis of the enrolled cohorts. Patients will be matched by age, gender and cancer stage and will be stratified by the estimated renal function (application of BSA eGFR formula by Xxxxxxxx T et al, J Clin Oncol, 2017). Patients will undergo preoperative high resolution abdominal MRI for high throughput accurate macroscopic assessment of TME by radiomic approach. During surgery, tumor tissue samples will be collected and promptly frozen at -80°C for subsequent analysis. CRC tissue samples will be analyzed combining spatially resolved and single-cell transcriptomic approach, providing a sensitive and unbiased lens for identifying the key mechanisms of the interplay between CRC and immune context, preserving their tissue architecture. Our study involves the usage of Visium Cytassist Spatial Gene Expression, a powerful tool based on in situ capturing methods, providing the whole transcriptome information from tissue sections.

Data collected by radiomics and tissue transcriptomics will undergo integrated analysis by a bioinformatic approach based on

computational methods. TME will be macroscopically characterized on tumor images to map specific tissue areas of interest. By spatial tumor sections analysis, initial segregation of non-malignant TME cells from malignant ones will be performed and then the identification of differentially expressed genes and pathways between the two groups of patients will be finalized.

These methodologies will allow the full characterization of CRC environment and will highlight possible differences between groups in TME macroscopic imaging features and gene expression. This will permit the discovery of possible specific tumor imaging-detected patterns and the associated molecular pathways specially promoted or deregulated in CKD patients with CRC. These evidences will enhance the value of possible prognostic parameters and the identification of early biomarkers of CRC and future development of targeted therapies. In the era of precision medicine, these goals appear relevant to address the increasing cost and social impact of both CRC and CKD.

Yes

In order to best review your application, do you agree that the above non-confidential proposal title and abstract can be used, without disclosing your identity, when contacting potential reviewers?

2 - Participants & contacts

Operative Units
Institution that perform as UO	CF Institution	Department / Division / Laboratory	Role in the project	Southern Italy	SSN
1 - Istituto nazionale tumori Fondazione Xxxxxxxx Xxxxxxx	00911350635	Department CORP-S of Clinical- Diagnostic Services to support oncological pathways /Radiodiagnostic Division	Coordination of the project; patient registration; execution of diagnostic procedures; data collection; Image Processing and statistical analysis.	X	X
2 - Azienda Ospedaliera Universitaria Xxxxx Xxxxxxxxxx	06908670638	UOC Nefrologia e Dialisi	Clinical and Diagnostic Activities	X	X
3 - Biogem scarl	02071230649	Translational Neprology Laboratory	Laboratory analysis	X
4 - X. Xxxxxx Hospital	02315520920	Nephrology, Dialysis and Transplantation Department	Clinical and Diagnostic Activities		X

Principal Research Collaborators
Key Personnel Name	Operative Unit	Role in the project
1 - XXXXX XXXXXX	Istituto nazionale tumori Fondazione Xxxxxxxx Xxxxxxx	Co-PI: Multimodal Treatment of HPB Cancers
2 - XXXXXXXX XXXXXXX	Istituto nazionale tumori Fondazione Xxxxxxxx Xxxxxxx	Main collaborator: management of diagnosis and treatment of tumors
3 - DI XXXXXX XXXXXXXX	Istituto nazionale tumori Fondazione Xxxxxxxx Xxxxxxx	Main collaborator: the management of diagnosis and treatment of tumors.
4 - XXXXXXX XXXXXXXXXXX	Xxxxxxx Ospedaliera Universitaria Xxxxx Xxxxxxxxxx	Main collaborator: Nephrology research
5 - XXXXXXXX XXXXXX	Xxxxxx scarl	Main collaborator: bioinformatic, omic-sciences and high-throughput techniques
6 Under 40 - XXXXXX XXXXXX	X. Xxxxxx Hospital	Under-40 collaborator: assessment of clinical and epigenetic data related to oncological risk in cancer patients
7 Under 40 - DELLA CORTE XXXXXXXX XXXXX	Biogem scarl	Under-40 collaborator: oncology management

Key Personnel Name	Co-PI	Resp. CE	Resp. Animal	Birth Date	Gender
1 - XXXXX XXXXXX	X			24/08/1979	M
2 - XXXXXXXX XXXXXXX				23/10/1981	F
3 - DI XXXXXX XXXXXXXX				21/08/1978	F
4 - XXXXXXX XXXXXXXXXXX				09/08/1972	F
5 - XXXXXXXX XXXXXX				09/08/1985	F
6 Under 40 - XXXXXX XXXXXX				27/06/1985	M
7 Under 40 - DELLA CORTE CARMINIA XXXXX				20/02/1987	F

Additional research collaborators under 40 to hire
Key Personnel Name	Operative Unit	Birth Date	Gender	Role in the project	Degree	Actual Pos. and Inst.
0 - Xx Xxxxx Xxxxxxx	Istituto nazionale tumori Fondazione Xxxxxxxx Xxxxxxx	15/06/1992	M	Under-40 collaborator for Bioinformatics and Computational Biology	Bachelor Degree of Computer Science at University of Naples Parthenope	Bioinformatics and Computational Biology
1 - Xxxxxxxxx Xxxxx	Istituto nazionale tumori Fondazione Xxxxxxxx Xxxxxxx	21/12/1991	F	Under-40 collaborator for Molecular oncology	Bachelor Degree in Biology at the University of Sannio, Benevento	Molecular oncology

2.1 Administrative data of participating

Operative Unit Number 1:

Address: Xxx Xxxxxxx Xxxxxxx, 00000 Xxxxxx (XX) - Xxxxx

PEC: xxxxxxxxxxxxxxxxxxxx@xxx.xxxxxxxxxxxxxx.xx.xx

Operative Unit Number 2:

Address: Xxxxxx Xxxxx Xxxxxxxx, 0 00000 Xxxxxx (XX) - Xxxxx

PEC: xxxxxxxxxxx.xxxxxxx.xxxx@xx.xxxxx.xx

Operative Unit Number 3:

Address: Via Camporeale Area P.I.P. Xxxxxx Xxxxxx (AV) - Italy

PEC: xxxxxx@xxx.xx

Operative Unit Number 4:

Address: Xxxxxxxx Xxxxxxxxxx Xxxxxx, 0, 00000 Xxxxxxxxx XX - Xxxxx

PEC: xxxxxxxxxx.xxxxxxxx@xxx.xxxxxxxx.xx

Operative Unit Number 5 (self financing):

Address: NA

PEC: NA

2.2 Principal Investigator (PI) Profile

Last Name: Xxxxxxxx

First Name: Xxxxxxxxx

Last name at birth:

Gender: F

Title: Principal investigator

Nationality: Italiana

Date of birth: 03/12/1956

Official H index (Scopus or Web of Science): 38.0

Country of residence: ITALY Country of Birth: ITALY Place of Birth: Caserta

Scopus Author Id:7003382567 ORCID ID:0000-0003-2465-5370 RESEARCH ID:J-5450-2018

Contact address

Current organisation name: Istituto nazionale tumori Fondazione Xxxxxxxx Xxxxxxx

Current Department / Faculty / Institute / Laboratory name: Department CORP-S of Clinical-Diagnostic Services to support

oncological pathways /Radiodiagnostic Division

Street: Via Xxxxxxx Xxxxxxx

Postcode / Cedex: 80131 Town: Napoli

Phone:x000000000000 Phone 2: 0000000000

Education / training
Educational institution and location	Degree	Field of study	From year	To year
University of Xxxxxx Xxxxxxxx XX	Specialization / Specializzazione	Specialty Degrees in Diagnostic Radiology	1992	1994
University of Xxxxxx Xxxxxxxx XX	Specialization / Specializzazione	Specialty Degrees in Nuclear Medicine	1986	1988
University of Xxxxxx Xxxxxxxx XX	Master's Degree / Laurea Magistrale	Degree in Medicine and Surgery	1980	1985

Personal Statement:

Dr. Xxxxxxxx has been involved in basic research before moving to the diagnostic imaging, and is currently involved in studies for diagnosis and treatment of solid tumors. As Director of Diagnostic Imaging Division she favored the development of a pluri-specialistic team, the acquisition of technologies state of art, also for small animals, and development of new approaches performing pre-clinical and clinical trials either with diagnostic and therapeutic purposes. She has long experience in oncology, especially in colon-rectal cancer.

Positions and honors

Positions
Institution	Division / Research group	Location	Position	From year	To year
National Cancer Institute of Xxxxxx Xxxxxxx Foundation	Radiodiagnostic Unit	Naples - Italy	Director of Radiodiagnostic Division	2011	2023
National Cancer Institute of Xxxxxx Xxxxxxx Foundation	Radiodiagnostic Division	Naples - Italy	Head of the Simple Operative Structure of Breast Radiology	2008	2011
National Cancer Institute of Xxxxxx Xxxxxxx Foundation	Radiodiagnostic Division	Naples - Italy	Medical Radiologist with High Specialty Degree in MRI imaging	2003	2008
National Cancer Institute of Xxxxxx Xxxxxxx Foundation	Radiodiagnostic Division	Naples - Italy	Medical Radiologist, with special interest in Magnetic Resonance Imaging	1992	2001

Other awards and honors

Certificate of Appreciation at ESGAR 2011: Standardized Index of Shape (SIS): an effective DCE-MRI semi quantitative index to assess preoperative radio-chemo therapy (pCRT) in Locally Advanced Rectal Cancer (LARC).

Certificate of Appreciation atESCP 6th Scientific & Annual Meeting Copenhagen 2011: Standardized Intensity Ratio: robust, effective and reproducible DCE-MRI semi-quantitative index to monitor LARC before and after preoperative combined radio and chemo-therapy.

Other CV informations

She is Main Author or Co-author in more than 239 publications in National and International Journals and has authored several chapters in Medicine Books.

She has author of 1 patent: WO2015079311A1.

Selected peer-reviewed publications of the PI valid for minimum expertise level
Title	Type	Pag	Vol	Year	DOI	PMID	Cit.**	P.*
Irreversible electroporation of hepatocellular carcinoma: preliminary report on the diagnostic accuracy of magnetic resonance, computer tomography, and contrast-enhanced ultrasound in evaluation of the ablated area	Article	122-131	121	2016	10.1007/s11547-015- 0582-5	26345332	40	L
Contrast-Enhanced ultrasound in the characterization of complex cystic focal liver lesions	Article	1301- 1310	41	2015	10.1016/j.ultrasmedbio.2 014.12.667	25666723	41	L
Percutaneous ablation therapy of hepatocellular carcinoma with irreversible electroporation: MRI findings	Article	1000- 1007	204	2015	10.2214/AJR.14.12509	25905934	41	L
Diagnostic performance and confidence of contrast-enhanced ultrasound in the differential diagnosis of cystic and cysticlike liver lesions	Article	W119- W127	209	2017	10.2214/AJR.16.17062	28639831	41	L

Title	Type	Pag	Vol	Year	DOI	PMID	Cit.**	P.*
Standardized Index of Shape (SIS): a quantitative DCE-MRI parameter to discriminate responders by non-responders after neoadjuvant therapy in LARC	Article	1935- 1945	25	2015	10.1007/s00330-014- 3581-3	25577525	44	F
Standardized Index of Shape (DCE-MRI) and Standardized Uptake Value (PET/CT): Two quantitative approaches to discriminate chemo- radiotherapy locally advanced rectal cancer responders under a functional profile	Article	8143- 8153	8	2017	10.18632/oncotarget.141 06	28042958	44	F
Critical analysis of the major and ancillary imaging features of LI-RADS on 127 proven HCCs evaluated with functional and morphological MRI: Lights and shadows	Article	51224- 51237	8	2017	10.18632/oncotarget.172 27	NOT_FOUND	45	L
Early radiological assessment of locally advanced pancreatic cancer treated with electrochemotherapy	Article	4767- 4778	23	2017	10.3748/wjg.v23.i26.476 7	28765698	46	L
Diagnostic performance of gadoxetic acid- enhanced liver MRI versus multidetector CT in the assessment of colorectal liver metastases compared to hepatic resection	Article	000	00	0000	10.1186/s12876-019- 1036-7	31340755	46	L
The current role and future prospectives of functional parameters by diffusion weighted imaging in the assessment of histologic grade of HCC	Article	NOT_FO UND	13	2018	10.1186/s13027-018- 0194-5	29988667	49	L
Immediate adverse reactions to gadolinium- based MR contrast media: A retrospective analysis on 10,608 examinations	Article	NOT_FO UND	2016	2016	10.1155/2016/3918292	27652261	57	L
Intravoxel incoherent motion (IVIM) in diffusion- weighted imaging (DWI) for Hepatocellular carcinoma: Correlation with histologic grade	Article	79357- 79364	7	2016	10.18632/oncotarget.000 00	00000000	00	L
Early assessment of colorectal cancer patients with liver metastases treated with antiangiogenic drugs: The role of intravoxel incoherent motion in diffusion-weighted imaging	Article	NOT_FO UND	10	2015	10.1371/journal.pone.01 42876	26566221	74	L
Magnetic resonance imaging in the assessment of pancreatic cancer with quantitative parameter extraction by means of dynamic contrast-enhanced magnetic resonance imaging, diffusion kurtosis imaging and intravoxel incoherent motion diffusion-weighted imagin	Article	NOT_FO UND	13	2020	10.1177/1756284819885 052	32499833	32	L
Radiomics-derived data by contrast enhanced magnetic resonance in RAS mutations detection in colorectal liver metastases	Article	1-12	13	2021	10.3390/cancers130304 53	33504085	44	L
Preliminary Report on Computed Tomography Radiomics Features as Biomarkers to Immunotherapy Selection in Lung Adenocarcinoma Patients	Article	3992	13	2021	10.3390/cancers131639 92	34439148	37	L

Title	Type	Pag	Vol	Year	DOI	PMID	Cit.**	P.*
Diffusion and perfusion MR parameters to assess preoperative short-course radiotherapy response in locally advanced rectal cancer: a comparative explorative study among Standardized Index of Shape by DCE-MRI, intravoxel incoherent motion- and diffusion kur	Article	3683- 3700	44	2019	10.1007/s00261-018- 1801-z	30361867	36	L
Diagnostic accuracy of magnetic resonance, computed tomography and contrast enhanced ultrasound in radiological multimodality assessment of peribiliary liver metastases	Article	NOT_FO UND	12	2017	10.1371/journal.pone.01 79951	28632786	36	L
Integration of DCE-MRI and DW-MRI Quantitative Parameters for Breast Lesion Classification	Article	NOT_FO UND	2015	2015	10.1155/2015/237863	26339597	39	L
Diffusion-weighted mri and diffusion kurtosis imaging to detect ras mutation in colorectal liver metastasis	Article	1-14	12	2020	10.3390/cancers120924 20	32858990	35	L

* Position: F=First L=Last C=Correspondent O=Other N=Not applicable

** Autocertificated

Selected peer-reviewed publications of the PI for the evaluation CV
Title	Type	Pag	Vol	Year	DOI	PMID	Cit.**
Diagnostic accuracy of magnetic resonance, computed tomography and contrast enhanced ultrasound in radiological multimodality assessment of peribiliary liver metastases	Article	NOT_FO UND	12	2017	10.1371/journal.pone.01 79951	28632786	36
Abbreviated breast dynamic contrast-enhanced MR imaging for lesion detection and characterization: the experience of an Italian oncologic center	Article	401-410	164	2017	10.1007/s10549-017- 4264-y	28447241	34
Assessing response to neo-adjuvant therapy in locally advanced rectal cancer using Intra-voxel Incoherent Motion modelling by DWI data and Standardized Index of Shape from DCE-MRI	Article	NOT_FO UND	10	2018	10.1177/1758835918809 875	30479672	27
Microvascular invasion and grading in hepatocellular carcinoma: correlation with major and ancillary features according to LIRADS	Article	2788- 2800	44	2019	10.1007/s00261-019- 02056-6	31089780	33
Breast imaging and cancer diagnosis during the COVID-19 pandemic: recommendations from the Italian College of Breast Radiologists by SIRM	Article	926-930	125	2020	10.1007/s11547-020- 01254-3	32661780	34
Diffusion-weighted mri and diffusion kurtosis imaging to detect ras mutation in colorectal liver metastasis	Article	1-14	12	2020	10.3390/cancers120924 20	32858990	35
Quantitative imaging decision support (QIDS<sup>TM</sup>) tool consistency evaluation and radiomic analysis by means of 594 metrics in lung carcinoma on chest CT scan	Article	NOT_FO UND	28	2021	10.1177/1073274820985 786	33567876	42
Validation of the standardized index of shape tool to analyze DCE-MRI data in the assessment of neo- adjuvant therapy in locally advanced rectal cancer	Article	1044- 1054	126	2021	10.1007/s11547-021- 01369-1	34041663	33

Title	Type	Pag	Vol	Year	DOI	PMID	Cit.**
Radiomics textural features by MR imaging to assess clinical outcomes following liver resection in colorectal liver metastases	Article	461¿470	127	2022	10.1007/s11547-022- 01477-6	NOT_FOUND	27
Prediction of Breast Cancer Histological Outcome by Radiomics and Artificial Intelligence Analysis in Contrast-Enhanced Mammography	Article	2132	14	2022	10.3390/cancers140921 32	35565261	7

** Autocertificated

Grant
Funded by Institution	Researcher inst. where xxxxx is/was performed	Year	Title	Position in Projects	Fund (euro)	Source website grant listed
Ministero della Salute	National Cancer Institute of Xxxxxx Xxxxxxx Foundation	2021	"Programma nazionale di oncologia personalizzata per gli IRCCS della Rete ACC -RCR-2021-2367121 - WP 12: Radiomics predictive modeling based on real world data"	Collaborator	30.450,00	xxxxx://xxxxxxxxx.xxxxx xxxxxxxxx.xx.xx/
Ministero della Salute	National Cancer Institute of Xxxxxx Xxxxxxx Foundation	2022	"Progetto di Ricerca Corrente dal titolo: SVILUPPO E VALIDAZIONE DI MODELLI DI RADIOMICA E DI INTELLIGENZA ARTIFICIALE IN RISONANZA MAGNETICA MULTIPARAMETRICA DELLA MAMMELLA PER LA PREDIZIONE DEI LINFONODI METASTATICI."	Coordinator	25.000,00	xxxxx://xxxxxxxxx.xxxxx xxxxxxxxx.xx.xx/
Ministero della Salute	National Cancer Institute of Xxxxxx Xxxxxxx Foundation	2015	"Progetto di Ricerca Corrente dal titolo: Valutazione della risposta precoce alla terapia neoadiuvante con imaging combinato DCE-MRI, DWI e PET-TC nel cancro al retto localmente avanzato"	Coordinator	45.000,00	xxxxx://xxxxxxxxx.xxxxx xxxxxxxxx.xx.xx/

Funded by Institution	Researcher inst. where xxxxx is/was performed	Year	Title	Position in Projects	Fund (euro)	Source website grant listed
Regione Campania	National Cancer Institute of Xxxxxx Xxxxxxx Foundation	2014	"POR FESR POR 2007/2013 - Obiettivo Operativo 2.1 - Impegno e liquidazione in favore dell'ATS con capofila/mandataria GMI GENERAL MEDICAL ITALIA SRL per la corresponsione del saldo del contributo concesso per la realizzazione del progetto PI-EVO: SISTEMA RADIOLOGICO DA CORSIA, CUP B68C12000690007."	Collaborator	508.363,00	xxxx://xxxx.xxxxxxx.xx xxxxxx.xx
Regione Campania	National Cancer Institute of Xxxxxx Xxxxxxx Foundation	2018	"POR FESR CAMPANIA 2014/2020- O.S. 1.1 - Avviso pubblico Progetti di trasferimento tecnologico e di prima industrializzazione per le imprese innovative ad alto potenziale per la lotta alle patologie oncologiche - Concessione del contributo in forma di sovvenzione Progetto PIEVO ONC.DELUXE - Soggetto capofila GENERAL MEDICAL ITALIA SRL-CUP B33D18000130007"	Collaborator	981.171,00	xxxx://xxxx.xxxxxxx.xx xxxxxx.xx

2.3 CO-PI Profile

Last Name: XXXXX

First Name: XXXXXX

Last name at birth:

Gender: M

Title: Co-PI: Multimodal Treatment of HPB Cancers

Nationality: ITALIANA

Date of birth: 24/08/1979

Official H index (Scopus or Web of Science): 30.0

Country of residence: ITALY Country of Birth: ITALY Place of Birth: NAPOLI

Scopus Author Id:57201961254 ORCID ID:0000-0002-6252-573X RESEARCH ID:CDV-7242-2022

Contact address

Current organisation name: Istituto nazionale tumori Fondazione Xxxxxxxx Xxxxxxx

Current Department / Faculty / Institute / Laboratory name: Department CORP-S of Clinical-Diagnostic Services to support

oncological pathways /Radiodiagnostic Division

Street: XXX XXXXXXX XXXXXXX 00

Postcode / Cedex: 80131 Town: NAPOLI

Phone:00393335374013 Phone 2: 0000000000

Education / training
Educational institution and location	Degree	Field of study	From year	To year
University of Verona, Italy	PhD	Doctor Of Philosophy ¿ Surgical Sciences And Hepatobiliary And Pancreatic Illnesses	2012	2015
Xxxxxxxxxx Xxxxxxxx XX, Naples, Italy	Specialization / Specializzazione	Residency in General Surgery	2004	2010
Xxxxxxxxxx Xxxxxxxx XX - Naples, Italy	Master's Degree / Laurea Magistrale	Medical School	1997	2003

Personal Statement:

-National Scientific Habilitation Associate Professor In General Surgery (Sector 06/C1)

-Member of several scientific national and international scientific societies (such as ESSO, IHPBA, EAHPBA, AICEP, SIC etc.).

-Former Member of the Council of AICEP Italian Chapter of the EA-HPBA/IHPBA (2020-2022)

-Member of the Multidisciplinary Group NET Napoli Center of Excellence of the European Neuroendocrine Tumors Society (ENETS)

-Member of the Editorial Board of: HPB, Mini-Invasive Surgery (Associate Editor), Frontiers in Oncology

Positions and honors

Positions
Institution	Division / Research group	Location	Position	From year	To year
National Cancer Institute X. Xxxxxxx IRCCS, Naples - Italy	Department of Abdominal Oncology - Division of Hepato-Biliary Surgical Oncology	Naples - Italy	Surgical Oncologist	2019	2023
National Cancer Institute X. Xxxxxxx XXXXX, Naples - Italy	Department of Abdominal Oncology - Division of Abdominal Surgical Oncology	Naples - Italy	Consultant Surgical Oncologist	2013	2018
National Cancer Institute X. Xxxxxxx XXXXX, Naples - Italy	Department of Abdominal Oncology - Division of Abdominal Surgical Oncology	Naples - Italy	Clinical and Research Fellow	2011	2013
University of Barcelona, - Hospital Clinic, Barcelona - Catalunya- Spain	Department of Surgery Service of Pancreatic Surgery and Pancreas Transplantation	Hospital Clinic, Barcelona - Catalunya- Spain	Clinical and Research Fellow	2009	2009
University of Creteil ¿ Paris XII ¿ Xxxxx Xxxxxx Hospital APHP	Service of Digestive Surgery and Liver Transplantation	Xxxxx Xxxxxx Hospital APHP, Creteil- France	Clinical and Research Fellow	2009	2010

Other awards and honors

- Winner of the Travel Grant for Young Surgeons of the Japanese Society of Hepato- Pancreato-Billiary Association (JHPBA) (2014)

-Winner of the Trojanielllo¿s Award of the Neapolitan Society of Surgery (2013)

-Selected for Best Oral Presentation - XX World Congress of the International Hepato- Pancreato-Billiary Association (IHPBA) (2012)

-Winner of the Video-Lectures for young Surgeons¿ Award - IRCAD; Taiwan - 3rd International Congress Mini-invasive surgery what's new? (2012)

Other CV informations

-Referee for several international journals (such as British Journal of Surgery, HPB, Oncotarget, International Surgery, BMC Surgery, Updates in Surgery, Cancers, World Journal of Gastroenterology etc.)

- Guest Editor of the following Special Issues: Multimodal Treatment of HPB Cancers (FRONTIERS IN ONCOLOGY IF:6.244); Diagnostic and therapeutic Advances in Pancreatic Cancers (CANCERS IF:6.575)

Selected peer-reviewed publications of the Co-PI valid for minimum expertise level
Title	Type	Pag	Vol	Year	DOI	PMID	Cit.**	P.*
An unusual metastatic site for primary lung cancer: The spleen	Article	128-129	11	2016	10.1016/j.jtho.2015.08.0 05	26762748	3	F
¿Scarless¿ and no-stoma surgery for low rectal cancer: the laparoscopic pull-through delayed ¿high¿ colo-anal anastomosis	Article	99-104	68	2016	10.1007/s13304-016- 0358-z	27040273	11	C
Reappraisal of pull-through delayed colo-anal anastomosis for surgical treatment of low rectal cancer: do we have to look back to go forward?	Article	97	3	2018	10.21037/ales.2018.12.0 1	NOT_FOUND	0	F

Title	Type	Pag	Vol	Year	DOI	PMID	Cit.**	P.*
Robotic surgery of gallbladder cancer	Article	NOT_FO UND	4	2020	10.20517/2574- 1225.2020.70	NOT_FOUND	4	F
Minimally invasive surgical treatment of intrahepatic cholangiocarcinoma: A systematic review	Review	2203- 2215	13	2021	10.4251/wjgo.v13.i12.22 03	35070052	9	L
Bone metastases as initial presentation of hepatocellular carcinoma	Article	e549	20	2019	10.1016/S1470- 2045(19)30417-6	31486371	1	F
Clinical value and cost-effectiveness of minimally invasive distal pancreatectomy	Article	205-207	9	2020	10.21037/hbsn.2019.10. 19	32355680	0	F
Mils for HCC: the state of art	Article	105-109	67	2015	10.1007/s13304-015- 0316-1	26164139	6	F
Liver resection for hepatocellular carcinoma in patients with portal hypertension: the role of laparoscopy	Article	417-421	4	2015	10.3978/j.issn.2304- 3881.2015.12.02	26734627	25	F
Minimally Invasive ALPPS Procedure: A Review of Feasibility and Short-Term Outcomes	Article	NOT_FO UND	15	2023	10.3390/cancers150617 00	36980586	0	L

* Position: F=First L=Last C=Correspondent O=Other N=Not applicable

** Autocertificated

Grant
Funded by Institution	Researcher inst. where xxxxx is/was performed	Year	Title	Position in Projects	Fund (euro)	Source website grant listed
Ministero della Salute	National Cancer Institute of Naples	2022	Progetto di Ricerca	Coordinator	60.000,00	xxxxx://xxxxxxxxx.xxxxx
	Xxxxxxx Foundation		Corrente dal titolo:			xxxxxxxxx.xx.xx/
			CREAZIONE DI UN
			DATABASE CLINICO SUL
			COLANGIOCARCINOMA
			PER IMPLEMENTARE LE
			ATTIVITÀ CLINICO-
			TRASLAZIONALI
			CONNESSE AL GOM
			COLANGIOCARCINOMA
			(Ricerca Corrente L4/2)

2.3 Research Collaborators n. 2

Last Name: XXXXXXXX

First Name: XXXXXXX

Last name at birth: Xxxxxxxx

Gender: F

Title: Main collaborator: management of diagnosis and treatment of tumors

Nationality: Italiana

Date of birth: 23/10/1981

Official H index (Scopus or Web of Science): 20.0

Country of residence: ITALY Country of Birth: ITALY Place of Birth: Caserta

Scopus Author Id:55349805200 ORCID ID:0000-0002-9337-5885 RESEARCH ID:J-4963-2018

Contact address

Current organisation name: Istituto nazionale tumori Fondazione Xxxxxxxx Xxxxxxx

Current Department / Faculty / Institute / Laboratory name: Department CORP-S of Clinical-Diagnostic Services to support

oncological pathways /Radiodiagnostic Division

Street: Via Xxxxxxx xxxxxxx

Postcode / Cedex: 81130 Town: Napoli

Phone:x000000000000 Phone 2:

Education / training
Educational institution and location	Degree	Field of study	From year	To year
University of Naples Xxxxx Xxxxxxxxxx	Specialization / Specializzazione	Medical Oncology	2008	2012
University of Naples Xxxxx Xxxxxxxxxx	Master's Degree / Laurea Magistrale	Medicine and Surgery	2001	2007

Personal Statement:

Oncologist at IRCCS National Cancer Institute X Xxxxxxx Foundation

Positions and honors

Positions
Institution	Division / Research group	Location	Position	From year	To year
National Cancer Institute of Xxxxxx Xxxxxxx Foundation	Department of Urology and Gynecology	Naples, Italy	Medical Oncologist	2012	2023

Other awards and honors

From 2021 she is the Coordinator of the Multidisciplinary Oncological Group for testistumors. She is member of several scientific societies. Main activities: participation to clinical activity of both hospitalized and out-clinic oncologic patients. Principal-investigator in several phase II-III clinical trials in the field of uro-gynecological oncology, and sub-investigator in several phase II-III clinical trials of uro-oncology.

Grant
Funded by Institution	Researcher inst. where xxxxx is/was performed	Year	Title	Position in Projects	Fund (euro)	Source website grant listed
Ministero della Salute	National Cancer Institute of Naples,	2000	"Progetto di Ricerca	Coordinator	0,00	xxxxx://xxxxxxxxx.xxxxx
	Fondazione Xxxxxxx		Xxxxxxxx dal Titolo:			xxxxxxxxx.xx.xx/
			Identificazione di mutazioni
			geniche predittive di
			sopravvivenza e risposta
			alla terapia nel carcinoma
			renale a cellule renali
			chiare"

2.4 Research Collaborators n. 3

Last Name: DI NAPOLI

First Name: XXXXXXXX

Last name at birth: DI NAPOLI

Gender: F

Title: Main collaborator: the management of diagnosis and treatment of tumors.

Nationality: italiana

Date of birth: 21/08/1978

Official H index (Scopus or Web of Science): 16.0

Country of residence: ITALY Country of Birth: ITALY Place of Birth: Agropoli

Scopus Author Id:35589797600 ORCID ID:0000-0003-4516-7341 RESEARCH ID:GSO-1684-2022

Contact address

Current organisation name: Istituto nazionale tumori Fondazione Xxxxxxxx Xxxxxxx

Current Department / Faculty / Institute / Laboratory name: Department CORP-S of Clinical-Diagnostic Services to support

oncological pathways /Radiodiagnostic Division

Street: via xxxxxxx xxxxxxx

Postcode / Cedex: 80131 Town: Napoli

Phone:x000000000000 Phone 2:

Education / training
Educational institution and location	Degree	Field of study	From year	To year
University of Naples Xxxxx Xxxxxxxxxx	Specialization / Specializzazione	Medical Oncology with grade 70/70 summa cum laude	2008	2012
University of Naples Xxxxx Xxxxxxxxxx	Master's Degree / Laurea Magistrale	Graduated in Medicine and Surgery with grade 110/110	1999	2007

Personal Statement:

From 2021 she is the Coordinator of the Multidisciplinary Oncological Group for renal cancer tumors. Main activities: participation to clinical activity of both hospitalized and out-clinic oncologic patients. Principal-investigator in several phase II-III clinical trials in the field of uro-gynecological oncology, and sub-investigator in several phase II-III clinical trials of uro- oncology.

Participation in multidisciplinary groups for the management of diagnosis and treatment of uro-gynecological tumors.

Positions and honors

Positions
Institution	Division / Research group	Location	Position	From year	To year
National Cancer Institute of Naples, Fondazione Xxxxxxx	Department of Urology and Gynecology	Naples, Italy	Medical Oncologist	2012	2023

Other awards and honors

Member of several scientific societies such as Italian Association of Medical Oncology (AIOM), MITO (Multicenter Italian Trials in Ovarian cancer and gynecologic malignancies) and Meet-Uro; ESMO.

Grant
Funded by Institution	Researcher inst. where xxxxx is/was performed	Year	Title	Position in Projects	Fund (euro)	Source website grant listed
NA	NA	NA	NA	Collaborator	0,00	NA

2.5 Research Collaborators n. 4

Last Name: XXXXXXX

First Name: XXXXXXXXXXX

Last name at birth: Xxxxxxx

Gender: F

Title: Main collaborator: Nephrology research

Nationality: Italiana

Date of birth: 09/08/1972

Official H index (Scopus or Web of Science): 12.0

Country of residence: ITALY Country of Birth: ITALY Place of Birth: Fontegreca

Scopus Author Id:56543000100 ORCID ID:0000-0001-8203-9416 RESEARCH ID:AFQ-3815-2022

Contact address

Current organisation name: Azienda Ospedaliera Universitaria Xxxxx Xxxxxxxxxx

Current Department / Faculty / Institute / Laboratory name: UOC Nefrologia e Dialisi

Street: AOU Xxxxx Xxxxxxxxxx Polo Cappella Cangiani UOC Nefrologia e Dialisi -II Policlinico - Xxx Xxxxxxx 0

Postcode / Cedex: 80131 Town: Napoli

Phone:x000000000000 Phone 2:

Education / training
Educational institution and location	Degree	Field of study	From year	To year
University of Campania Xxxxx Xxxxxxxxxx - Naples (Italy)	Specialization / Specializzazione	PhD in Nephrology	2013	2016
University of Campania Xxxxx Xxxxxxxxxx - Naples (Italy)	Specialization / Specializzazione	Specialization in Nephrology	2005	2010
University of Campania Xxxxx Xxxxxxxxxx - Caserta (Italy)	Master's Degree / Laurea Magistrale	Degree in Medicine and Surgery	1997	2004

Personal Statement:

Type B fixed-term researcher - principal collaborator

Positions and honors

Positions
Institution	Division / Research group	Location	Position	From year	To year
Xxxxx Xxxxxxxxxx University Hospital	Unit of Nephrology and Dialysis	Naples (Italy)	Academic Nephrologist	2019	2023
Materdomini University Hospital	Nephrology and Dialysis Unit directed by Prof. G Fuiano	Viale Europa, Località Germaneto - Catanzaro (Italy)	Consultant Nephrologist	2016	2019
University of Catanzaro Magna Graecia	-	Viale Europa, Località Germaneto - Catanzaro (Italy)	Research Fellow - Group of Xxxx. Xxxxxxx Xxxxxx	2013	2016
University College of London	Department of Renal Medicine	Xxxxxxxx St - W1T 3AA London (UK)	Research Fellow - Group of Prof. Xxxxxx X Xxxxx	1998	2001

Other awards and honors

- Winner of the Clinical Case Contest 2018 Edition at the Italian Academy of Medicine.

- Secretary-Treasurer of the Calabria Section of the Italian Society of Nephrology from 2014 to 2018

- Secretary-Treasurer of the Calabria Section of the Italian Society of Nephrology from 2019 to 2021

Grant
Funded by Institution	Researcher inst. where xxxxx is/was performed	Year	Title	Position in Projects	Fund (euro)	Source website grant listed
Azienda Ospedaliera	Azienda Ospedaliera Universitaria	2020	REscue of mutated V2R	Coordinator	19.000,00	xxxxx://xxx.xxxxxxx
Universitaria Xxxxx	Xxxxx Xxxxxxxxxx		Nephrogenic Diabetes			xxxx.xx/xxxxx.xxx/xxxxx
Vanvitelli			Insipidus (NDI) by			ca/bandi-di-ateneo-
			Chaperone drugs			programma-
						valere/programma-
						valere-2020

2.6 Research Collaborators n. 5

Last Name: XXXXXXXX

First Name: XXXXXX

Last name at birth:

Gender: F

Title: Main collaborator: bioinformatic, omic-sciences and high- throughput techniques

Nationality: italiana

Date of birth: 09/08/1985

Official H index (Scopus or Web of Science): 14.0

Country of residence: ITALY Country of Birth: ITALY Place of Birth: napoli

Scopus Author Id:55760087300 ORCID ID:0000-0002-8611-0678 RESEARCH ID:FAF-7052-2022

Contact address

Current organisation name: Biogem scarl

Current Department / Faculty / Institute / Laboratory name: Translational Neprology Laboratory

Street: via camporeale

Postcode / Cedex: 83031 Town: xxxxxx xxxxxx

Phone:x000000000000 Phone 2:

Education / training
Educational institution and location	Degree	Field of study	From year	To year
University of Xxxxxx Xxxxxxxx XX	PhD	Department of Chemical Sciences, Naples (Italy), PhD Expression purification and characterization of proteins. Recombinant production in bacteria and yeasts (i.e. S. cerevisiae and P. pastoris), Directed evolution of proteins, HPLC analyses, metagenomic analyses.	2012	2015
University of Xxxxxx Xxxxxxxx XX, Naples (Italy)	Master's Degree / Laurea Magistrale	Master's Degree Expression, purification and characterization of a pathogenic variant of the fibrillogenic polypeptide of ApoA- I. Expression, purification characterization of protein, SPR studies, HPLC analyses, Circular dichroism analyses.	2009	2011

Personal Statement:

The expertise in bioinformatic, omic-sciences and high-throughput techniques supported by the wide experiences acquired in several different chemical biological and clinical fields, would give a crucial contribution to achieve the overall goal of the project aimed at the study the tumor microenvironment and correlation between colon cancer progression in CDK patients.

Positions and honors

Positions
Institution	Division / Research group	Location	Position	From year	To year
Biogem scarl	Protein Factory Units	Xxxxxx Xxxxxx (AV) (Italy)	Researcher	2018	2023
Biopox srl	N/A	Naples (NA), Itaky	Senior researcher	2016	2018
University of Xxxxxx Xxxxxxxx XX	Department of Chemical Science	Naples (NA), Italy	Post-doc	2015	2015
Michigan state University	Lansing (MI)	iomass Conversion Research Laboratory (BCRL)	Visiting PhD student	2014	2014

Other awards and honors

First prize: Ecotrophelia Italia 2015; Fresh-App, An eco-innovative drink obtained from orange and apple peel. July 15, 2015, Milano Expo

Silver prize: Ecotrophelia Europe 2015; Fresh-App, An eco-innovative drink obtained from orange and apple peel. October 6, 2015, Milano Expo

Grant
Funded by Institution	Researcher inst. where xxxxx is/was performed	Year	Title	Position in Projects	Fund (euro)	Source website grant listed
NA	NA	NA	NA	Collaborator	0,00	NA

2.7 Research Collaborators n. 6 - Under 40

Last Name: XXXXXX

First Name: XXXXXX

Last name at birth: XXXXXX

Gender: M

Title: Under-40 collaborator: assessment of clinical and epigenetic data related to oncological risk in cancer patients

Nationality: ITALIANA

Date of birth: 27/06/1985

Official H index (Scopus or Web of Science): 10.0

Country of residence: ITALY Country of Birth: ITALY Place of Birth: CAGLIARI

Scopus Author Id:57190770893 ORCID ID:0000-0001-5557-9791 RESEARCH ID:ABH-1274-2020

Contact address

Current organisation name: X. Xxxxxx Hospital

Current Department / Faculty / Institute / Laboratory name: Nephrology, Dialysis and Transplantation Department

Street: OSPEDALE BROTZU - XXXXXXXX XXXXXX X.0

Postcode / Cedex: 09100 Town: CAGLIARI

Phone:x000000000000 Phone 2:

Education / training
Educational institution and location	Degree	Field of study	From year	To year
Università degli Studi di Cagliari	Specialization / Specializzazione	Neprology Doctor of Medicine (M.D.), Neprology	2009	2015
Università degli Studi di Cagliari	Master's Degree / Laurea Magistrale	Medicine	2003	2009

Personal Statement:

In the project development, Dr. Xxxxxx Xxxxxx will collaborate to:

- submit the study protocol to the Ethical Committee of the Sardinian region

- contribute to developing the tool relative to the cancer risk (assessment of clinical and epigenetic data related to oncological risk in cancer patients

- patients selection

- implement the dissemination of the study findings through publications, presentations, lessons, and seminars

Positions and honors

Positions
Institution	Division / Research group	Location	Position	From year	To year
S. Bortolo Hospital (during Nephrology residency)	International renal research institute of Vicenza	Vicenza, Italy	Research Fellow	2011	2022
University of Virginia (during Nephrology residency)	Nephrology Department	Charlottesville (VA) USA	Visiting Instructor	2014	2014
University of Cagliari Nephrology	Dialysis and Transplantation Unit	Cagliari, Italy	Nephrology resident and fellow	2010	2015

Other awards and honors

- 2014: Selected for Globus DOC. Financial grant in order to support fellowship at Nephrology Unit, University of Virginia Charlottesville USA

- 2012 Selected for ASN Program for Medical Students and Residents; selected as foreign resident for the attendance of American Society of Nephrology Annual Meeting. November 1-4, 2012 San Diego (CA)

- 2010 Selected for Master & Back: Financial grant in order to support fellowship at International Renal Research Institute of Vicenza

Grant
Funded by Institution	Researcher inst. where xxxxx is/was performed	Year	Title	Position in Projects	Fund (euro)	Source website grant listed
NA	NA	NA	NA	Collaborator	0,00	NA

2.8 Research Collaborators n. 7 - Under 40

Last Name: DELLA CORTE

First Name: XXXXXXXX XXXXX

Last name at birth: DELLA CORTE

Gender: F

Title: Under-40 collaborator: oncology management

Nationality: italiana

Date of birth: 20/02/1987

Official H index (Scopus or Web of Science): 25.0

Country of residence: ITALY

Country of Birth: ITALY

Place of Birth: xxx xxxxxxx xxxxxxxxx

Scopus Author Id:55786812000 ORCID ID:0000-0002-3396-8099 RESEARCH ID:XXX-1377-2021

Contact address

Current organisation name: Biogem scarl

Current Department / Faculty / Institute / Laboratory name: Translational Neprology Laboratory

Street: via xxxxxx xxxxxxx 5

Postcode / Cedex: 80131 Town: napoli

Phone:x000000000000 Phone 2:

Education / training
Educational institution and location	Degree	Field of study	From year	To year
PhD school University of Campania X. Xxxxxxxxxx	PhD	Novel therapies in solid tumors	2017	2020
University of Campania X. Xxxxxxxxxx	Specialization / Specializzazione	Medical Oncology	2012	2017
Second University of Naples Faculty of Medicine	Master's Degree / Laurea Magistrale	Oncology	2006	2011

Personal Statement:

Qualification: Researcher; Scientific disciplinary sector: MED/06; Department: Department of Precision Medicine

Positions and honors

Positions
Institution	Division / Research group	Location	Position	From year	To year
University of Campania X. Xxxxxxxxxx	Dept. Medicina di Precisione	Naples - Italy	RTDB	2022	2023
University of Campania X. Xxxxxxxxxx	Dept. Medicina di Precisione	Naples - Italy	RTDA	2020	2021
MDACC-Texas	Department of Thoracic and Head and Neck cancers	Texa	Post doc fellow	2018	2019

Other awards and honors

July 2019: Winner of FY19 postdoctoral travel award from Office of postdoctoral affairs and development of MD Xxxxxxxx

Cancer Center, Houston, TX, USA. October 2019: Winner of Best poster award for poster presentation at ESMO annual Congress 2019, Barcellona, Spain.

Grant
Funded by Institution	Researcher inst. where xxxxx is/was performed	Year	Title	Position in Projects	Fund (euro)	Source website grant listed
MFAG AIRC	University of Campania X. Xxxxxxxxxx	2021	DDR inhibition sustains activation of innate immune pathways and overcome immune resistance in SCLC	Coordinator	180.000,00	xxxxx://xxx.xxxx.xx/

2.9 Additional Research Collaborators n. 2 - Under 40 to hire

Last Name: Xx Xxxxx

First Name: Xxxxxxx

Last name at birth:

Gender: M

Title: Under-40 collaborator for Bioinformatics and Computational Biology

Nationality: Italiana

Date of birth: 15/06/1992

Official H index (Scopus or Web of Science): 2.0

Country of residence: ITALY Country of Birth: ITALY Place of Birth: Xxxxxxx Xxxxxxxx

Scopus Author Id:57224845611 ORCID ID:0000-0003-2396-3101 RESEARCH ID:CMV-9127-2022

Contact address

Current organisation name: Istituto nazionale tumori Fondazione Xxxxxxxx Xxxxxxx

Current Department / Faculty / Institute / Laboratory name: Department CORP-S of Clinical-Diagnostic Services to support

oncological pathways /Radiodiagnostic Division

Street: Contrada Camporeale

Postcode / Cedex: 83031 Town: Xxxxxx Xxxxxx

Phone:x000000000000 Phone 2:

Education / training
Educational institution and location	Degree	Field of study	From year	To year
Univeristy of Xxxxxx Xxxxxxxx XX	PhD	Computational And Quantitative Biology	2020	2023
University of Naples Parthenope	Master's Degree / Laurea Magistrale	Applied Computer Science (Machine Learning and Big Data)	2017	2020
University of Naples Parthenope	Bachelor Degree / Laurea Triennale	Computer Science	2013	2017

Personal Statement:

Bioinformatics and Computational Biology expert.

Positions and honors

Positions
Institution	Division / Research group	Location	Position	From year	To year
CAREBIOS	Bioinformatics and Computational Biology	Xxxxxx Xxxxxx (AV)	Researcher	2020	2023

Other awards and honors

2018, Hackaton Best `Vision is APP to you¿ prototype (VISMAC 2018) 2017, Apple Developer WWDC 2017 Scholarship

Grant
Funded by Institution	Researcher inst. where xxxxx is/was performed	Year	Title	Position in Projects	Fund (euro)	Source website grant listed
NA	NA	NA	NA	Collaborator	0,00	NA

2.10 Additional Research Collaborators n. 3 - Under 40 to hire

Last Name: Xxxxxxxxx

First Name: Xxxxx

Last name at birth:

Gender: F

Title: Under-40 collaborator for Molecular oncology

Nationality: Italiana

Date of birth: 21/12/1991

Official H index (Scopus or Web of Science): 1.0

Country of residence: ITALY Country of Birth: ITALY Place of Birth: Xxxxxxxx

Xxxxxx Author Id:57218951682 ORCID ID:0000-0001-6618-6694 RESEARCH ID:IAP-8898-2023

Contact address

Current organisation name: Istituto nazionale tumori Fondazione Xxxxxxxx Xxxxxxx

Current Department / Faculty / Institute / Laboratory name: Department CORP-S of Clinical-Diagnostic Services to support

oncological pathways /Radiodiagnostic Division

Street: Via Camporeale, area P.I.P.

Postcode / Cedex: 83031 Town: Xxxxxx Xxxxxx

Phone:x000000000000 Phone 2:

Education / training
Educational institution and location	Degree	Field of study	From year	To year
University ¿Alma Mater Studiorum¿, Bologna	Master's Degree / Laurea Magistrale	Cellular Therapy. Screening of antineoplastic drugs	2014	2016
University of Sannio, Benevento	Bachelor Degree / Laurea Triennale	Biology. Effects of prebiotics compounds on gastrointestinal mucosal.	2011	2014

Personal Statement:

Xxxxx Xxxxxxxxx has obtained her Master¿s degree in 2016 from the University of Bologna ¿Alma Mater Studiorum¿. During her educational studies, she joined the Cellular Therapy lab, and she was involved in the in vitro screening of antineoplastic drugs aimed to investigate their immunogenic effects on acute myeloid leukemia cells. She is now employed in a Molecular Oncology lab to improve her technical skills related to deep sequencing of cell free DNA.

Positions and honors

Positions
Institution	Division / Research group	Location	Position	From year	To year
Italsur srl	Food quality control	Notaresco (TE)	Technologist	2017	2018
De Matteis agroalimentare spa	Food quality control	Flumeri (AV)	Technologist	2019	2019
Carebios surl	Molecular oncology	Xxxxxx Xxxxxx (AV)	Technologist	2020	2023

Other awards and honors

NA

Grant
Funded by Institution	Researcher inst. where xxxxx is/was performed	Year	Title	Position in Projects	Fund (euro)	Source website grant listed
NA	NA	NA	NA	Collaborator	0,00	NA

2.17 Expertise Research Collaborators

Selected peer-reviewed publications of the Research Group / Collaborators
Collaborato	Title	Type	Pag	Vol	Year	DOI	PMID	Cit.**	P.*
XXXXXXXX XXXXXX	Regulation of cellulase and hemicellulase gene expression in fungi	Review	230-249	14	2013	10.2174/1389202911314 040002	NOT_FOUND	160	O
XXXXX XXXXXX	Xxxxxxx resection for hepatocellular carcinoma in patients with Child-Pugh's A cirrhosis: Is clinical evidence of portal hypertension a contraindication?	Article	78-84	15	2013	10.1111/j.1477- 2574.2012.00594.x	23216782	112	O
XXXXXXXX XXXXXX	The effect of Pleurotus ostreatus arabinofuranosidase and its evolved variant in lignocellulosic biomasses conversion	Article	162-167	72	2014	10.1016/j.fgb.2014.07.00 3	25046861	25	O
XXXXXX XXXXXX	Xxxxxxxxxx diseases and cancer: evaluation of underlying malignancy	Review	143-152	29	2016	10.1007/s40620-015- 0234-9	26498294	68	O
XXXXXX XXXXXX	Xxxxxxxx mitigates renal ischemia-reperfusion injury by modulating systemic iron homeostasis	Article	2800- 2814	26	2015	10.1681/ASN.20141010 37	25788528	118	O
XXXXXXXX XXXXXX	Exploring the microbiota dynamics related to vegetable biomasses degradation and study of lignocellulose- degrading bacteria for industrial biotechnological application	Article	NOT_FO UND	5	2015	10.1038/srep08161	25641069	93	O
DI XXXXXX XXXXXXXX	INfluenza Vaccine Indication during therapy with Immune checkpoint inhibitors: A multicenter prospective observational study (INVIDIa- 2)	Article	NOT_FO UND	9	2021	10.1136/jitc-2021- 002619	34016723	11	O
XXXXXXXX XXXXXXX	Xxxxxxxx after Sunitinib in metastatic renal cancer: Preliminary results from Italian "Real-World" SAX Study	Article	NOT_FO UND	7	2016	10.3389/fphar.2016.003 31	NOT_FOUND	15	L
DI XXXXXX XXXXXXXX	Xxxxxxxxx in metastatic renal cancer: A "real-world" experience at National Cancer Institute "Fondazione X. Xxxxxxx"	Article	NOT_FO UND	7	2016	10.3389/fphar.2016.002 87	NOT_FOUND	18	O

Collaborato	Title	Type	Pag	Vol	Year	DOI	PMID	Cit.**	P.*
XXXXXXX XXXXXXXXXXX	How to improve duration and efficiency of the antiproteinuric response to Ramipril: RamiPROT¿a prospective cohort study	Article	95-102	30	2017	10.1007/s40620-015- 0256-3	26707494	21	X
XXXXXXX XXXXXXXXXXX	Quality of life, clinical outcome, personality and coping in chronic hemodialysis patients	Article	45-53	39	2017	10.1080/0886022X.2016 .1244077	27778533	45	O
XXXXXXXX XXXXXXX	Metabolic syndrome, endocrine disruptors and prostate cancer associations: Biochemical and pathophysiological evidences	Article	30606- 30616	8	2017	10.18632/oncotarget.167 25	NOT_FOUND	5	O
XXXXXXXX XXXXXXX	Sequential treatment with pazopanib and everolimus in metastatic renal cell carcinoma	Article	NOT_FO UND	8	2017	10.3389/fphar.2017.004 84	NOT_FOUND	5	F
XXXXXXXX XXXXXXX	Micrornas in prostate cancer: An overview	Review	50240- 50251	8	2017	10.18632/oncotarget.169 33	NOT_FOUND	5	X
XXXXXXX XXXXXXXXXXX	XXXXXX: A dietary recommender system for chronic diseases monitoring and management	Article	93-104	153	2018	10.1016/j.cmpb.2017.10. 014	29157465	43	O
XXXXXX XXXXXX	Opening an onconephrology clinic: Recommendations and basic requirements	Review	1503- 1510	33	2018	10.1093/ndt/gfy188	29982771	38	O
XXXXXXXX XXXXXX	Xxxxxxx pretreatment for agrofood wastes valorization	Article	59-65	265	2018	10.1016/j.biortech.2018. 05.108	29883847	60	F
XXXXX XXXXXX	Surgical site infection after gastrointestinal surgery in high-income, middle-income, and low-income countries: a prospective, international, multicentre cohort study	Article	516-525	18	2018	10.1016/S1473- 3099(18)30101-4	29452941	206	O
De Xxxxx Xxxxxxx	An UAV autonomous warehouse inventorying by deep learning	Article	443-453	11751 LNCS	2019	10.1007/978-3-030- 30642-7_40	NOT_FOUND	4	F
XXXXXXX XXXXXXXXXXX	An open-label, randomized, placebo-controlled study on the effectiveness of a novel probiotics administration protocol (ProbiotiCKD) in patients with mild renal insufficiency (stage 3a of CKD)	Article	2145- 2156	58	2019	10.1007/s00394-018- 1785-z	30076458	33	O
XXXXXXXX XXXXXXX	Biomarkers of Prognosis and Efficacy of Anti-angiogenic Therapy in Metastatic Clear Cell Renal Cancer	Article	NOT_FO UND	9	2019	10.3389/fonc.2019.0140 0	NOT_FOUND	9	O
Xxxxxxxxx Xxxxx	A screening of antineoplastic drugs for acute myeloid leukemia reveals contrasting immunogenic effects of etoposide and fludarabine	Article	1-20	21	2020	10.3390/ijms21186802	32948017	3	O

Collaborato	Title	Type	Pag	Vol	Year	DOI	PMID	Cit.**	P.*
XXXXXXX XXXXXXXXXXX	Secondary hyperparathyroidism and hypertension: An intriguing couple	Review	NOT_FO UND	9	2020	10.3390/jcm9030629	NOT_FOUND	9	F
DELLA CORTE CARMINIA XXXXX	STING Pathway Expression Identifies NSCLC With an Immune-Responsive Phenotype	Article	777-791	15	2020	10.1016/j.jtho.2020.01.0 09	32068166	64	F
DI XXXXXX XXXXXXXX	Impact of Previous Nephrectomy on Clinical Outcome of Metastatic Renal Carcinoma Treated With Immune-Oncology: A Real- World Study on Behalf of Meet-URO Group (MeetUro- 7b)	Article	NOT_FO UND	11	2021	10.3389/fonc.2021.6824 49	NOT_FOUND	8	O
Xx Xxxxx Xxxxxxx	Xxxxxxxx one-class Gaussian processes allow accurate prioritization of oncology drug targets	Article	1420- 1427	37	2021	10.1093/bioinformatics/b taa968	33165571	0	F
DELLA CORTE CARMINIA XXXXX	Immunotherapy in advanced Non-Small Cell Lung Cancer patients with poor performance status: The role of clinical- pathological variables and inflammatory biomarkers	Article	165-173	152	2021	10.1016/j.lungcan.2020. 12.027	33421923	19	O
DELLA CORTE CARMINIA XXXXX	Patterns of transcription factor programs and immune pathway activation define four major subtypes of SCLC with distinct therapeutic vulnerabilities	Article	346- 360.e7	39	2021	10.1016/j.ccell.2020.12.0 14	33482121	234	O
XXXXX XXXXXX	Effect of COVID-19 pandemic lockdowns on planned cancer surgery for 15 tumour types in 61 countries: an international, prospective, cohort study	Article	1507- 1517	22	2021	10.1016/S1470- 2045(21)00493-9	34624250	90	O
XXXXX XXXXXX	Elective cancer surgery in COVID-19-free surgical pathways during the SARS- CoV-2 pandemic: An international, multicenter, comparative cohort study	Article	66-78	39	2021	10.1200/JCO.20.01933	33021869	122	O
XXXXXX XXXXXX	Chronic kidney disease of undetermined etiology around the world	Review	142-151	46	2021	10.1159/000513014	33845480	8	F
XXXXX XXXXXX	Minimally invasive surgical treatment of intrahepatic cholangiocarcinoma: A systematic review	Review	2203- 2215	13	2021	10.4251/wjgo.v13.i12.22 03	NOT_FOUND	9	L

Collaborato	Title	Type	Pag	Vol	Year	DOI	PMID	Cit.**	P.*
DI XXXXXX XXXXXXXX	The prognostic value of the previous nephrectomy in pretreated metastatic renal cell carcinoma receiving immunotherapy: a sub- analysis of the Meet-URO 15 study	Article	NOT_FO UND	20	2022	10.1186/s12967-022- 03601-6	36180954	2	O
Xxxxxxxxx Xxxxx	Genomic Characterization of the Emerging SARS-CoV-2 Lineage in Two Districts of Campania (Italy) Using Next- Generation Sequencing	Article	NOT_FO UND	2	2022	10.3389/fviro.2022.8141 14	NOT_FOUND	4	O
DELLA CORTE CARMINIA XXXXX	Which treatment after first line therapy in NSCLC patients without genetic alterations in the era of immunotherapy?	Review	NOT_FO UND	169	2022	10.1016/j.critrevonc.202 1.103538	NOT_FOUND	10	L
XXXXXX XXXXXX	Xxxx Non-Coding RNAs as Novel Biomarkers in the Clinical Management of Papillary Renal Cell Carcinoma Patients: A Promise or a Pledge?	Review	NOT_FO UND	11	2022	10.3390/cells11101658	35626699	3	O
XXXXXXXX XXXXXX	The DiaCoVAb Study in South Italy: Immune Response to SARS-CoV-2 Vaccination in Dialysis Patients	Article	467-474	47	2022	10.1159/000524034	35318291	4	O
DI XXXXXX XXXXXXXX	Xxxxxxxxx-ipilimumab in renal cell carcinoma metastatic to the bones: A case report	Article	e2022132	93	2022	10.23750/abm.v93iS1.12 876	35765962	0	F
DELLA CORTE CARMINIA XXXXX	Anti-tumor activity of cetuximab plus avelumab in non-small cell lung cancer patients involves innate immunity activation: findings from the CAVE-Lung trial	Article	NOT_FO UND	41	2022	10.1186/s13046-022- 02332-2	35346313	3	F
De Xxxxx Xxxxxxx	A variational algorithm to detect the clonal copy number substructure of tumors from scRNA-seq data	Article	NOT_FO UND	14	2023	10.1038/s41467-023- 36790-9	36841879	1	F

* Position: F=First L=Last C=Correspondent O=Other N=Not applicable

** Autocertificated

3 - Ethics

1. HUMAN EMBRYOS/FOETUSES
Does your research involve Human Embryonic Stem Cells (hESCs)?	No
Does your research involve the use of human embryos?	No
Does your research involve the use of human foetal tissues / cells?	No

2. HUMANS
Does your research involve human participants?	Yes
Does your research involve physical interventions on the study participants?	No
3. HUMAN CELLS / TISSUES
Does your research involve human cells or tissues (other than from Human Embryos/ Foetuses?	Yes
4. PERSONAL DATA
Does your research involve personal data collection and/or processing?	Yes
Does your research involve further processing of previously collected personal data (secondary use)?	No
5. ANIMALS
Does your research involve animals?	No
6. ENVIRONMENT & HEALTH and SAFETY
Does your research involve the use of elements that may cause harm to the environment, to animals or plants?	No
Does your research deal with endangered fauna and/or flora and/or protected areas?	No
Does your research involve the use of elements that may cause harm to humans, including research staff?	No
7. DUAL USE
Does your research involve dual-use items in the sense of Regulation 428/2009, or other items for which an	No
8. EXCLUSIVE FOCUS ON CIVIL APPLICATIONS
Could your research raise concerns regarding the exclusive focus on civil applications?	No
9. MISUSE
Does your research have the potential for misuse of research results?	No
10. OTHER ETHICS ISSUES
Are there any other ethics issues that should be taken into consideration? Please specify	No

X

I confirm that I have taken into account all ethics issues described above and that, if any ethics issues apply, I will complete the ethics self-assessment and attach the required documents.

4 - Call-specific questions

Eligibility
I acknowledge that I am aware of the eligibility requirements for applying as specified in the Call- PNRRXXXX_M6/C2, and certify that, to the best of my knowledge my application is in compliance with all these requirements. I understand that my proposal may be declared ineligible at any point during the evaluation or granting process if it is found not to be compliant with these eligibility criteria.	X
I confirm that the proposal that I am about to submit draws substantially don’t repeat on an existing or recently finished GRANT funded.	X
Data-Related Questions and Data Protection (Consent to any question below is entirely voluntary. A positive or negative answer will not affect the evaluation of your project proposal in any form and will not be communicated to the evaluators of your project.)
For communication purposes only, the MoH asks for your permission to publish,in whatever form and medium, your name, the proposal title, the proposal acronym, the panel, and host institution, should your proposal be retained for funding.	X
Some national and regional public research funding authorities run schemes to fund MoH applicants that score highly in the MoH's evaluation but which can not be funded by the MoH due to its limited budget. In case your proposal could not be selected for funding by the MoH do you consent to allow the MoH to disclose the results of your evaluation (score and ranking range) together with your name, non- confidential proposal title and abstract, proposal acronym, host institution and your contact details to such authorities?	X
The MoH is sometimes contacted for lists of MoH funded researchers by institutions that are awarding prizes to excellent researchers. Do you consent to allow the MoH to disclose your name, non-confidential proposal title and abstract, proposal acronym, host institution and your contact details to such institutions?	X
The Ministry of Health occasionally could contacts Principal Investigators of funded proposals for various purposes such as communication campaigns, pitching events, presentation of their project's evolution or outcomes to the public, invitations to represent the Ministry of Health in national and international forums, studies etc. Should your proposal be funded, do you consent to the Ministry of Health staff contacting you for such purposes?	X
For purposes related to monitoring, study and evaluating implementation of MoH actions, the MoH may need that submitted proposals and their respective evaluation data be processed by external parties. Any processing will be conducted in compliance with the requirements of Regulation 45/2001.

5 – Description Project

Summary description

Onconephrology is an emerging field that is quickly advancing. An up to two-fold increase in the incidence of CRC has been reported in patients with CKD, but the possible determining factors have not been clarified so far. TME impacts cancer progression and is influenced by different chronic diseases that are characterized by systemic inflammation. We aim to explore TME in CKD patients with colon cancer undergoing surgery. We will apply preoperative spatial radiomics and single cell omics to CRC tissue samples obtained during surgery. This will provide both macroscopic TME characterization by non-

invasive imaging and genes expression in tissues of patients with CRC alone and patients with CKD and CRC.

Background / State of the art and Preliminary data (if available)

An increased incidence of CRC with a worse prognosis in CKD patients has been reported, although the pathogenetic mechanisms explaining this association have not been described so far. Intestinal dysbiosis (ID) is widely described in CKD. Nitrogen waste substances accumulate in the gastrointestinal tract of CKD patients and are metabolized by fermenting bacteria responsible of various uremic toxins production. We have recently obtained encouraging preliminary data on the correlation between two ID-related uremic toxins (indoxyl sulphate and p-cresyl sulphate) and the increased progression of CRC. We presented results of our study at 2023 Epigenetica vs Oncologia Disease Pathways Congress demonstrating that these toxins (tested at concentrations detected in patients with CKD) can increase proliferation and migration of three different CRC cell lines (Lovo, HT-29 and HCT 116) (fig. 1). Previous studies have validated spatial omics in TME characterization on formalin fixed paraffin-embedded (FFPE), fresh-frozen (FF) tissues and on in vivo models [2-3]. We aim at using these innovative techniques to characterize tridimensional genes expression in the TME on FF colon cancer tissue samples obtained by surgical procedure from CRC patients with CKD.

Description and distribution of activities of each operating unit

Operating Unit:

- INT XXXXX Xxxxxxx Foundation, AOU Xxxxx Xxxxxxxxxx and XXX Xxxxxx are involved in recruitment, in clinical, diagnostic and surgical procedures of healthy people and patients with both I-II stage CRC and CKD, following the inclusion and exclusion criteria;

- Biogem is involved in Spatial transcriptomics, bioinformatic analysis and Spatial radiomics and transcriptomics integration data.

5.4 Specific Aims and Experimental Design

Specific aim 1

The first aim of the study is the recruitment of patients with both I-II stage CRC and CKD, and patients with I-II stage CRC alone that are eligible for cancer surgical removal. These patients will be enrolled in all INT IRCCS Xxxxxxx Foundation, AOU Xxxxx Xxxxxxxxxx and XXX Xxxxxx. Two of these Hospitals are located in Naples area and collect patients with cancer from all areas in Campania Region and other near Regions, while AOU Brotzu is located in Cagliari and collects patients with cancer from all areas in Sardinia. According to Oncologic Multidisciplinary Group (OMG) reports 800 CRC patients/year newly access the INT Xxxxxxx and 450 of them yearly undergo surgical cancer removal; XXX Xxxxxxxxxx has in charge around 1500 CRC patients with 180 new CRC diagnosis/year, while 90 surgical interventions on CRC patients are carried out every year; AOU Brotztu has 180 new access/year and 90 surgical interventions on CRC patients/year are performed in this unit.

The incidence of CKD in cancer patients is higher than in general population and increases with age and comorbidity burden. An even higher incidence is observed for CRC in CKD patients. There are many aspects that a nephrologist has to manage in this complex patient typology (cancer therapies nephrotoxicity, contrast-induced nephropathy, paraneoplastic kidney involvement, acid-base and electrolytes unbalances, etc.). In all three hospitals in our network there is an Onconephrology Outpatient and the nephrologists involved are part of multi-disciplinary committees in all the three institutions belonging to the National Health System (NHS). More than 150 CRC+CKD patients are recorded in the Onconephrology Outpatients at INT IRCCS Xxxxxxx Foundation with increasing incidence since 2020, when this service was implemented on an agreement with AOU Xxxxx Xxxxxxxxxx. Nephrology assistance is delivered to the patients of Xxxxxxx Hospital since that time and this activity is increasing exponentially year by year. Moreover, 144 nephrology visits to CRC patients admitted to the xxxx of the Abdominal Surgery unit of INT Xxxxxxx have been performed over last three years.

Similarly, 75 new CRC+CKD patients entered the Onconephrology Outpatient at AOU Xxxxx Xxxxxxxxxx and more than 200 visits at the xxxx have been performed between January 2021 and January 2023. The estimated incidence of CRC+CKD patients belonging to AOU Vanvitelli unit is around 100 new cases out of 400 new cases/per year. Even AOU Brotzu has a

large Onconephrology Outpatients with more than 300 prevalent patients, of which 67 have CRC. Year-incidence of new CRC+CKD patients at AOU Brotzu is 14 patients out of 100. Globally, the catchment area profiled in our network appears suitable for recruitment in this study of patients with both I-II stage CRC and CKD. For the group of Onco-nephrological patients, inclusion criteria are: I-II CRC patients suitable for surgery; BSA eGFR ¿60 ml/min/1.73 mq. Exclusion criteria are: kidney transplantation, autoimmune diseases; inflammatory bowel diseases; other than CRC oncological or onco- hematological diseases; recent steroids/immunosuppressant therapies. For the control group, inclusion criteria are: I-II CRC patients suitable for surgery; BSA eGFR ¿60 ml/min/1.73 mq. Exclusion criteria are: kidney transplantation, autoimmune diseases; inflammatory bowel diseases; other than CRC oncological or onco-hematological diseases; recent steroids/immunosuppressant therapies. All patients will be enrolled into multi-disciplinary committees with possibility of discussion of clinical and therapeutic issues. Patients will be consented for the present study and their imaging data and surgical samples will be analyzed as described below. All biological material needed for diagnosis and staging will be preserved. Experimental analysis will include both tumor and TME images and specimens. Clinical history and outcome will be collected and correlated for statistical purpose.

Specific aim 2

As an emerging analysis method, radiomics can extract high-throughput quantitative features from medical images to describe biological information such as tumor characteristics and heterogeneity to then guide clinical practice. The research processes of radiomics mainly include image acquisition, image segmentation, feature extraction, data analysis and modeling, focusing on image feature extraction. Through in-depth mining and analysis of existing medical images, radiomics is expected to yield imaging features on the macroscopic expression of genomics or proteomics. Radiomics can infer various tumor phenotypes through quantitative analysis of medical images, thereby providing relevant information for predict tumor grade, prognostic evaluation, and efficacy prediction. These resources can inform the development of diagnostic, predictive, or prognostic radiomic models to support clinical decision-making strategies and improve individualized treatment selection. Presently, radiomic research on the TME is increasing, and the correlation between radiomic features and TME components has been gradually confirmed. The performance and potential clinical utility of radiomic models developed using innovative techniques such as machine learning may be critical for the continued progress and clinical implementation of radiomics in TME prediction. This new approach will be applied to the patients selected for our study. During surgery, CRC tissue samples from patients will be collected and analyzed combining spatially resolved and single-cell transcriptomic approach. Novel spatially-resolved high-plex molecular profiling technologies are powerful tools to construct the first spatially-resolved gene expression atlas of tumor-microenviroment interaction at the colon tumor boundaries. The combination of spatial transcriptomics, histology, and computational approaches allows us to broaden our understanding of cancer cell interactions with their surroundings by expanding our knowledge of both single resolution technologies and histological datasets. Among the variety of spatially resolved technologies (SRT), 10X Genomic Visium Cytassist is the most suitable for our research, using spatially barcoded probes for targeting the whole transcriptome. The resulting dataset of spatially barcoded probe after the sequencing are mapped back to understand the spatial distribution of gene expression, and spatial barcodes are used to connect the readings to the tissue slice images.

One of the main advantages of this method is the high flexibility of starting material; the usage of FF or FFPE tissue section,

allows the analysis of archived samples. Moreover, the matrix design permits the utilization of both 6.5X6.5 mm and 11X11 mm capture areas, allowing a high comprehensive exploration of TME. A limitation of SRT based on mRNA capture is its resolution, which is restricted by the diameter of each capture spot on the Visium array (55um). To improve the specificity of spot mapping at single cell resolution and to identify rare cells that may contribute to the progression of the disease, computational analytic methods are developed to integrate probe-based SRT and scRNA-seq (single cell RNA sequencing). This provides the unbiased opportunity to map the transcriptomic and cellular architecture of tumor tissue, deciphering the interplay between tumor cells within their tissue context. Spatial transcriptomic has rapidly gained popularity due to their enormous application, from gene expression pattern to cell-to-cell interaction, allowing also in deep identification of rare cell types combined with their spatial organization, which can be difficult to achieve with traditional

methods. This method can also broaden our future research in clonal structure characterization and the discovery of novel targets for therapeutic interventions.

Specific aim 3

The last aim is to use Spatial radiomics and transcriptomics data to study both TME macroscopic imaging features to be integrated with gene expression patterns in CRC tissue samples of patients with CKD compared with those without, that could provide insights into how the presence of this condition affects tumor development and progression and help identify potential biomarkers or therapeutic targets that could be used to improve CRC prognosis, diagnosis and treatment. The first step of the bioinformatic analysis is the pre-processing of the raw data. This is usually a quality check to ensure that images and tissue samples are of good quality and free of technical artefacts. Normalization methods are then applied to correct the batch effect. The next step is to separate non-malignant from malignant TME cells. This can be achieved by using computational methods for cell type deconvolution.

Once non-malignant cells in the TME have been identified, differential expression analysis can be performed to identify genes and pathways that are differentially expressed between non-malignant and malignant cells. The analysis can be performed using various statistical methods. The results of the differential expression analysis can be visualized using volcano plots or heatmaps, which show the fold-change and statistical significance of the differentially expressed genes. In addition, the clonal structure of malignant cells will be characterized, with the support of spatial information, and cell subpopulations with different copy number alteration will be identified to individual possible specific subpopulations of patients with chronic renal failure.

To also identify differentially regulated biological pathways between non-malignant and malignant TME cells, pathway analysis can be performed using tools such as Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) or pathway overrepresentation analysis. These methods check whether specific pathways are enriched with differentially expressed genes than would be expected by chance. The results of pathway analysis can provide insights into biological processes that are altered during tumor progression and may suggest potential therapeutic targets.

Finally, another key approach is the analysis through the integration of radiomics and spatial transcriptomics data. Data integration allows radiomic features based on imaging to be correlated with the underlying molecular characteristics of tissues. This integration can help identify genes or molecular pathways associated with specific radiomic patterns and provide a more comprehensive view of the spatial heterogeneity and microenvironment of the tumor.

Spatial alignment methods can be used to map the spatial transcriptomic coordinates onto the corresponding regions of the radiomic data, thus enabling the fusion of radiomic and transcriptomic characteristics at the corresponding spatial positions. Various statistical or machine-learning approaches can also be used to integrate the radiomic and transcriptomic data, such as multivariate regression, principal component analysis (PCA) or canonical correlation analysis (CCA) and pattern recognition approaches typically of Artificial Intelligence field including random forests, support vector machines (SVMs) or deep learning approaches, that can be used to build predictive models or classifiers based on the integrated data.

This integration may involve the construction of joint feature spaces or the identification of common patterns between the two types of data. Afterwards statistical methods, such as correlation or regression analysis, can be used to identify relationships or associations between the integrated radiomic and transcriptomic features. Data visualization techniques, such as heatmaps, scatter plots or spatial maps, can be used to visualize integrated data and identify spatial patterns or clusters.

Experimental design aim 1

To collect anthropometric, clinical, radiomic, and transcriptomic data from public biobanks to assess an explorative comparison between CRC + CKD patients and normal function CRC patients. To collect blood and tumor tissue samples from CRC patients with or without CKD undergoing endoscopic or surgical cancer removal for centralized ctDNA detection and spatial and single-cell transcriptomic analysis.

To acquire CT and RMI images from CT and RMI scans conducted in the CRC patients population within the SIRIO network for centralized analysis.

Experimental design aim 2

To capture and analyze images from CT and RMI scans to characterize differential tumor aggressiveness between compared groups. Moreover, these data will undergo analysis for tumor structure mapping and subsequent integration with lab data.

To detect and measure circulating cancer DNA (ctDNA) to explore the future possibility of CRC prediction and prognosis assessment with a non-invasive test.

To conduct spatial and single-cell transcriptomic analysis to explore tumor differential gene expression and TME in CRC patients with CKD compared to those with normal renal function.

Experimental design aim 3

Integrative bioinformatic analysis by artificial intelligence of anthropometric, clinical, radiomic, and transcriptomic data with a comparison of the two in-study groups to understand possible different humoral and tissue gene expression and tumor architecture in CKD patients compared to those with normal renal function.

This aim will also involve results interpretation, validation, and dissemination. Picture to support preliminary data Poster_Epigenetica_Rossella_Di_Paola.pdf

Hypothesis and significance

The integrated analysis among spatial Radiomics and Transcriptomics to the discovery of the cross-link between CRC and chronic kidney disease can provide valuable insights into tumor biology, heterogeneity, treatment response and personalized medicine approaches.

These methodologies will allow the complete characterization of the CRC environment and highlight possible between- group differences in TME macroscopic imaging features and gene expression. This will enable the discovery of possible specific patterns detected by tumor imaging and associated molecular pathways. These findings will enhance the value of possible prognostic parameters and the identification of early biomarkers of CRC and the future development of targeted therapies.

5.5 Methodologies and statistical analyses

Methods of data collection

The project will be organized into nine work packages (WP) [see GANTT].

WP1. Public dataset enquiring. Anthropometric, clinical, radiomic, and transcriptomic data of CRC patients with CKD or normal kidney function will be extracted from various public sources.

WP2: Anthropometric, clinical, and behavior data collection. Relying on a large catchment population in the SIRIO network and according to preliminary sample size power analysis, at least 40 CRC patients with CKD and 40 CRC patients without CKD will be enrolled. A database including anthropometric (age, gender, race, weight, height, geographical area, work, etc.), clinical (comorbidities, most recent lab test, blood pressure, etc.), and behavior (smoking habits, alcohol consumption, physical activity, fruit, and vegetable consumption, etc.) variables will be held by unit 1 and filled in by all units involved in patients recruitment (unit 1, 2 and 4).

WP3. Blood collection for circulating DNA assessment. To provide biological samples for future identification and validation of CRC-specific circulating DNA (liquid biopsy) identified in the SIRIO study, blood samples will be collected in at least two cryogenic containers from each patient in units 1, 2, and 4 according to the Operative Procedures (OPs) provided by unit 3. WP4. Tumor tissue collection. The SIRIO study will enroll eligible patients undergoing therapeutic endoscopic or surgical CRC removal. After the above procedures, samples of at least 7 mm3 in size, including at least 1 mm of macroscopically disease-free tissue, will be collected by a surgeon. After collection, samples will be divided into two parts: half to be fixed and half to be frozen. On fixed samples, spatial transcriptomics and single-cell analysis will be performed (see WP 7).

Frozen samples will be used for a second step of analysis based on the first analysis results for the investigation of specific

genomic/proteomic features (see WP5).

WP5. Biobanking. Samples collected in WP3 and WP4 will reach Unit 3 Biobank in cryobiological containers, ready for a systematic arrangement according to the Biogem Biobanks guidelines. Upon cryogenic container registration, in compliance with ISO20387, every vial will be uniquely identified through a QR code and then located in a specific position inside a 42K vial cryogenic container (MVE HEco 1500 Freezer). Clinical data and histology features (only for tumor tissue samples) related to any patient will be simultaneously recorded. Any biobanking action, like cryogenic container registration, data encryption, vial storage, recovery, and management, will be performed exclusively by qualified personnel according to ISO 20387. Data treatment and management will comply with the Biogem ethical board guidelines and in respect of the GDPR- 2018.

WP6. Imaging data collection and analysis. Images in CT or RMI scans belonging to eligible patients will be acquired in Units 1, 2, and 4 according to a high-quality standard protocol provided by Unit 1 for centralized radiomics analysis.

Radiomic features will be extracted by volume of interest as median values using PyRadiomics and the 3D Slicer platform. WP7. Spatial and single-cell transcriptomics analysis. Fixed tissues collected during the surgery will be used for spatial transcriptomic and single-cell RNA sequencing, whose technical procedures are briefly explained below.

WP8. Big data bioinformatic analysis. Publicly available and generated (anthropometric, clinical, radiomic, and transcriptomic) data will be integrated using artificial intelligence techniques. Various statistical or machine-learning approaches will also integrate the radiomic and transcriptomic data.

WP9. Results interpretation, validation, and dissemination (all Units). Results obtained in all the previous WPs will be integrated to prioritize genes that regulate key pathways in CKD patients who developed CRC.

Statistic plan

This study will focus on a cohort design including CRC patients with CKD who will be matched with normal function CRC patients according to age, gender, and cancer stage. Inclusion criteria will include CRC patients with confirmed CKD and CRC patients with normal renal function as the control group. All patients with other than CRC cancer types or diagnosed familial CRC, autoimmune diseases, or recent cardiovascular events will be excluded from both groups. To determine the sample size for a clinical study comparing CRC patients with CKD with patients with normal kidney function, we considered a desired significance level (alpha) = 0.05 (corresponding to a 90% confidence interval), a statistical power of 60%, and a moderate size effect of 0.5. We used a power analysis formula to calculate the sample size, commonly used to compare two independent averages. Therefore, a minimum sample size of 40 participants per group will be required to obtain a 90% confidence interval with a power of 60%.

Statistical analysis

Statistical analysis will be stepwise and will follow this escalation:

1. Retrospective analysis of publicly available anthropometric, clinical, radiomic, and transcriptomic data from CRC patients with CKD versus those without CKD.

2. Prospective analysis of anthropometric, clinical, radiomic, and transcriptomic data obtained in our two in-study groups. This involves quality checks to ensure data integrity, normalization to account for technical variations, and the calculation of summary statistics, examination of data distributions, and visualization to understand their features. This phase helps to identify outliers, assess data quality, and guide subsequent analysis choices and is essential to ensure data reliability and comparability.

3. Comparative analysis between the two in-study groups using statistical tests, regression models, or machine learning algorithms to identify significant differences. The studies' statistical significance will be determined using a predetermined significance threshold. To account for multiple hypothesis tests that may occur when exploring associations between a high number of clinical and behavior variables, genes, and radiomic features, appropriate multiple testing correction methods, such as Bonferroni correction or False Discovery Rate adjustment, will be applied. These methods help to control the probability of false positives and reduce the chances of misidentifying significant associations. All differential features determined between the two groups and the performance of the statistical models constructed, such as regression models

or classification algorithms, to predict or classify the two groups based on integrated spatial transcriptomics and radiomics data, will be evaluated using appropriate validation techniques such as cross-validation or external validation on external public data, to ensure the robustness and generalizability of the results, and the reproducibility and the reliability of the associations identified in the analysis.

Timing of analysis data

SIRIO study will be conducted and completed in two years. At least 40 CRC patients in the CKD group and 40 CRC patients in the no CKD group will be enrolled to achieve a suitable sample size in 18 months. This enrolment goal will be completed in the considerable catchment area of the SIRIO network. To ensure efficient storage, organization, and information retrieval for integrative analysis. The databases will be designed with careful consideration of the appropriate data structure and data management systems to handle the specific requirements of the collected data. This includes creating tables or collections (MongoDB) to store different types of anthropometric measurements, demographic information, medical history, laboratory results, and other relevant clinical data. All data will be integrated with the information deposited in the Biobank. Data validation and quality control procedures will be implemented to ensure the accuracy and consistency of the collected data. The databases will also comply with data privacy and security standards to protect the confidentiality and integrity of patient information. Data minimization and anonymization principles will be applied.

Data from public databases will be collected for further analysis within the first 4 months. Public data and data gathered from enrolled patients will undergo pre-processing and integration to ensure cleanliness and standardization.

Anthropometric and clinical data will be collected in an optimized database. Feature extraction of data will be performed; spatial transcriptomics involves quantifying gene expression levels, while radiomics will include image acquisition, post- processing, and analysis for tumor and TME characterization. These data collection and processing activities will be completed in parallel with the enrollment goal in the first 18 months. Once all data have been collected, statistical analysis, using comparative analysis, statistical tests, machine learning algorithms, and clustering techniques, will be performed on each omics and the integration of the omics. This step analysis, aimed at identifying differentially expressed genes and different characteristics between groups, will be completed within 4 months. The analysis interpretation, the visualization by heatmaps, scatter plots, and spatial maps, and the final report to disseminate the results will be completed in the last 4 months. The validation of results will be fundamental at this step, and we plan to search the genes prioritized by analysis in datasets available in the literature. This will permit us to address future investigations on associated molecular pathways.

5.6 Expected outcomes

We expect to observe differential epidemiological, radiomics, and transcriptomics findings in the two in-study groups. This would confirm our hypothesis of a possible carcinogenic role of CKD and permit the selection of specific genetic patterns associated with CRC development and progression in CKD patients. This will also allow the discovery of novel molecular mechanisms sustaining carcinogenesis and the development of non-invasive diagnostic tests and new targeted therapies.

5.7 Risk analysis, possible problems and solutions

In case of insignificant results due to the lack of differences between in-study groups, data collected in the SIRIO study will still be of great interest.

This is in fact the first integrated analysis of epidemiological, clinical, radiomics and transcriptomics data in CRC patients with chronic kidney Disease. This analysis would provide novel insights on genes expression and its interpolation with aggressiveness features of CRC in specific subgroups of patients with CKD.

This will allow focused molecular pathways exploration and the development of new non-invasive diagnostic tools and targeted therapies for CRC treatment.

5.8 Significance and Innovation

SIRIO study addresses a relevant health issue since CRC in CKD has a higher incidence and is associated with a worse prognosis. This study will provide a deep comparison between CRC patients with and without CKD through an advanced high-technology approach based on integrating high throughput data that will be analyzed with bioinformatic tools based on artificial intelligence. The two groups' expected results of differential radiomics and transcriptomics findings will represent the first step forward in the complex understanding of CKD influence in CRC development and progression. Moreover, the exploration of this topic by a highly advanced approach may provide additional information on specific genes expression associated with CRC and its grading and staging. This represents the fundamental basis for understanding the molecular pathways sustaining CRC pathogenesis and developing novel, less invasive diagnostic tools, and targeted therapies.

5.9 Bibliography

1 Xxxxxx Xxxxxxxx, Xxxxxx X. Xxxxxxxx, Xxxxxx Xxxxxxxx, Xxxxxx Xxxxxxxxx, Xxxxx X. Xxxxxx, Xxxxxxx X. Xxxxxx, Xxxxx Xxxxxxxx, Xxxx Xxxxx, Xxxxxxx X. Xxxx, Andy X. Xxxxx, Xxxxxx I. Xxxxxxx, Xxxxx Xxxxxx, and Xxxxxx Xxxx. New Model for Estimating Glomerular Filtration Rate in Patients With Cancer.Journal of Clinical Oncology 2017 35:24, 2798-2805

2 DOI: 10.1002/med.21847

3. Xxxx, X.; Xxx, X.; Xxx, X.; Xx, X.; Xxxx, S. A synthetic neighborhood generation based ensemble learning for the imbalanced data classification. Appl. Intell. 2017, 48, 2441¿2457

4. DOI:xxxxx://xxx.xxx/00.0000/x.xxxx.0000.00.000

5. doi: 10.3390/toxins12050300

6. DOI: 10.1016/j.tcb.2014.11.006

7. xxx.xxx/00.0000/x00000-000-00000-x, doi: 10.1002/biot.202100041

8. doi: 10.4103/0974-1208.97779

5.10 Timeline / Deliverables / Payable Milestones

XXXXX project will last two years. The following milestones are placed.

Milestones 12 month

At month-12 of SIRIO study, the following tasks will have been achieved:

1. Public datasets will have been enquired for possible acquisition of available anthropometric, radiomics and transcriptomics data to be included in preliminar analysis to assess actual prevalence, differential tumor aggressiveness, tumor imaging features, and genes expression of CRC in CKD patients compared to general population (unit 1 and 2).

2. All units in the network will have arranged their staff and facilities for the collection of all anthropometric and clinical data, diagnostic images, and transcriptomics data from CRC patients with or without CKD. In the specific, under-40 researchers to hire and additional staff units will have been recruited and will have signed their two-years contract. Moreover, all units will have bought all needed facilities and half of materials needed for performing the study.

3. At least 20 CRC patients in CKD group and 20 CRC patients without CRC will have been enrolled after release of their informed consent and in accomplishment to Helsinki declaration.

Milestones 24 month

At month-24 of SIRIO study, the following tasks will have been achieved:

1. Enrollment of at least 40 CRC patients in CKD group and 40 CRC patients without CRC will have been completed.

2. The remaining part of technical and informatic facilities and materials needed for the study will have been purchased.

3. Data analysis for patients¿categorization will have been completed.

4. The integrative and comparative analysis of anthropometric, clinical, radiomics and transcriptomics data from CRC patients with or without CKD will have been completed.

5. Results interpretation and the dissemination plan will have been completed.

Gantt chart

Gantt.pdf

5.11 Equipment and resources available

Facilities Available

Unit 1 will provide patients recruitment, blood samples collection, imaging acquisition and analysis, and integrated bioinformatic analysis. It is equipped for all these purposes.The Complex Radiodiagnostics Structure in unit 1 uses high-end equipment, both for routine diagnostics and for research. 128-slice Dual Energy CTs with 2D and 3D processing at workstations, 3T MRI for morphological and functional oncological studies are available. PyRadiomics of 3D Slicer platform and Statistics and Machine Toolbox of MATLAB R2021b (MathWorks, Natick, MA, USA) will be used for centralized images post processing. High-performance personal computers are available for both image post-processing and extracted images storage. Moreover, unit 1 has a dedicated bioengineer with high performance and skill of artificial intelligence and advanced statistical software.

Unit 2 will provide recruitment of patients, imaging acquisition, blood samples collection and ctDNA assay. Laboratories in unit 2 can support this analysis since equipped with PCR, Quant studio 5 real-time PCR and Ion Chef for library preparation (Thermo Xxxxxx Scientific); Next seq 550 system (Illumina), Thermal cyclers for RT-PCR, QX200 Droplet Digital PCR System (Bio-Rad) and Rotor-Gene Q (Qiagen) MDx instrument. The use of this equipment is assisted by specialized technical personnel able to support researchers.

Unit 3 is equipped with a certified biobank and all facilities needed for genomics and transcriptomics analysis of tumour tissue samples.

The following, Embedding Workstation (Thermo scientific Histostar), Microtome HM340E (Thermo Scientific), Transmission Light Microscope (Zeiss), Visium CytAssist (10X Genomics), 10x Genomics, qpcr machine (Quantstudio 7 Flex Applied biosystems), gentleMacs Octo Dissociator (Miltenyi Biotec) and Automated cell counter (Biorad) are all available in unit 3.

This equipment is used by all specialized technical personnel able to support researchers. Unit 4 will provide the recruitment of patients, imaging acquisition and blood sample collection

The unit has the following state-of-the-art equipment: -80°C Freezer, Lab Fridges, and Cooler, temperature-Controlled Centrifuge, Secure Transport Containers, and Uninterruptible Power Supply (UPS).

Researchers in all units will be involved in results interpretation, validation and dissemination.

Subcontract

Not applicable.

5.12 Desc. of the complementarity and sinergy of secondary collab. researchers

This project will be performed by four main units. INT Xxxxxxx

The PI is the Director of Radiodiagnostic Unit. She provides cancer imaging-based diagnosis and prognosis. She is an expert of radiomics applied to the study of different cancer types and TME. Her recent scientific output is mostly based on this innovative approach with particular focus on CRC progression. The PI acquired in their research specific skills and experience on Radiomics approaches.

The co-PI Dr Xxxxxx Xxxxx is an experienced surgeon of the Abdominal Surgery Unit. He performed more than 3000 surgery procedures on gastrointestinal and epato-biliar apparatus so far. His publications focus on oncological topics and report

innovative surgical procedures applied to abdominal cancers.

Two experienced oncologists, Dr Xxxxxxxx di Napoli and Dr Xxxxxxx Xxxxxxxx are members of the MOC and will recruit patients suitable for this study.

This unit will contribute with provision of high quality tumor and TME images for radiomics analysis (PI) and tissue samples for spatial transcriptomics (co-PI).

AOU Vanvitelli

Dr Xxxxxxxxxxx Xxxxxxx is responsible for Onconephrology assistance in INT Xxxxxxx on inter-institutional agreement, and in XXX Xxxxxxxxxx. She is coordinator of the Onconephrology Reaserch Group of the Dept of Traslational Medical Sciences of Unicampania and participate to MOC. She published papers exploring TME in skin cancers and studies on biomarkers and risk factors of cancer development in CKD patients.

Dr. Xxxxxxxx Xxxxx Xxxxx Xxxxx is an experienced oncologist involved in the management of cancers patients, including MOC, patients treatment plans, and clinical trials. She published many paper focused on TME.

This unit will be focused on recruitment of patients suitable for the study. All clinical features andoutcomes will be collected in a database including staging and procedures.

AOU Brotzu

Dr Xxxxxx Xxxxxx is an experienced nephrologist responsible for the Onconephrology Clinic in this hospital and participates to MOC. He has published several articles on onconephrology.

Researcher collaborators under 40 to hire:

Dr Xxxxxxx Xx Xxxxx has a solid background in bioinformatics and data analysis, with particular expertise in single-cell transcriptomics, machine learning, data visualization and statistical analysis.

Dr. Xxxxx Xxxxxxxxx is experienced in single cell sequencing, and she previously worked with other 10X Genomics instruments as Chromium Controller for single-cell GEM Generation and barcoding. In past studies she used microscope, PCR thermocycler and Illumina sequencer.

5.13 Translational relevance and impact for the national health system (SSN)

What is already know about this topic?

The concept of TME has replaced the tumor cell-centered model of cancer development. TME plays a crucial role in tumorigenesis, metastasis, and response to therapies thanks to newly developed spatial technologies. It can be influenced by different systemic conditions characterized by an inflammatory signature. Radiomics has been applied and validated to the study of TME of CRC. Visium ST has also been hinted for TME-related research only in the study of melanoma in Zebrafish model, building the first spatially-resolved gene expression atlas of the interface between cancer and its TME.

Details on what is already know about this topic

CRC is a primary health concern affecting millions worldwide. Intriguingly, patients with CKD have been observed to have a higher incidence of CRC compared to the general population. CKD affects numerous bodily processes and has been linked to systemic inflammation. CKD-related intestinal dysbiosis is a significant source of releasing inflammatory and carcinogenetic uremic toxins into the colon. A pivotal aspect to be considered when studying the impact of systemic disease on cancer progression is its influence on TME. The concept of TME has replaced the tumor cell-centered model of cancer development. It includes blood vessels, immune cells, fibroblasts, and the extracellular matrix, among other components.

Alterations in the extracellular matrix can influence cancer cells' proliferation and spread. Similarly, immune cells within the TME can help protect against cancer or, conversely, can be co-opted to support tumor growth.

What this reasearch adds?

The most common bulk tissue and single-cell RNA sequencing obscure the spatial distribution due to the tissue disassembly. The advent of tridimensional resolved transcriptomic reveals the spatial profiling insight from an expanded range of FFPE samples. Then the integration of Spatial radiomics and transcriptomics data can help identify genes or molecular pathways associated with specific radiomic patterns and provide a more comprehensive view of the spatial heterogeneity and microenvironment of the tumor.

Details on what this reasearch adds

This research will provide novel insights into translational and biomarker studies by elucidating CRC's epidemiology, radiomics, and transcriptomics aspects. SIRIO study will explore the hypothesis that CKD can favor the development and progression of CRC. By comparing the two in-study groups and dissecting the biological, clinical, radiological, and gene expression of tumors, the results of the present study could identify a specific CKD-derived model of cancer development and progression and suggest the interactions of specific molecular pathways and cancer alterations/mutations.

What are the implications for public health, clinical practice, patient care?

Spatially resolved transcriptome analysis can help precision medicine in finding possible biomarkers and signaling pathways to support early diagnosis, prognosis evaluation, targeted therapies development, and noninvasive monitoring.

Details on what are the implications for public health, clinical practice, patient care

The hypothesis of SIRIO study relies on a cancer promoting modification of CRC TME by CKD. Thanks to newly developed spatial technologies, TME can be deeply investigated by the integration of radiomics with ctDNA and intra-tumoral genes expression.

We foresee that results from radiomics and genomic studies may be translated into the clinical scenario and tested in clinical trials as potential diagnostic or predictive factors for CRC patients. Lastly, collecting clinical data regarding the evolution of CKD and CRC may independently guide the testing of novel optimized diagnostic and therapeutic chances.

6 - Budget

Total proposed budget ( Euro )
Costs	TOTAL BUDGET	Co-Funding	List of costs proposed for funding to the MOH	Percentage of total proposed to the MOH
1 Staff Salary	114.180,00	114.180,00	not permitted	0,00
2 Researchers' Contracts	422.211,20	0,00	422.211,20	45,37
3a.1 Equipment (Leasing -	0,00	0,00	0,00	0,00
3a.2 Equipment (buying)	0,00	0,00	0,00	0,00
3b Supplies	247.788,80	0,00	247.788,80	26,63
3c Model Costs	0,00	0,00	0,00	0,00
4 Subcontracts *	0,00	0,00	0,00	0,00
5 Patient Costs	0,00	0,00	0,00	0,00
6 IT Services and Data Bases	90.000,00	0,00	90.000,00	9,67
7 Travels	14.000,00	0,00	14.000,00	1,50
8 Publication Costs	23.500,00	0,00	23.500,00	2,53
9 Dissemination	18.000,00	0,00	18.000,00	1,93
10 Overheads *	65.000,00	0,00	65.000,00	6,99
11 Coordination Costs	50.000,00	0,00	50.000,00	5,37
Total	1.044.680,00	114.180,00	930.500,00	100,00

* percentage calculated as average value between all the Operating Units.

Report the Co-Funding Contributor:

Co-Funding concerns the staff salary cost of the personnel of the National Cancer Institute of Naples Fondazione Xxxxxxx: Permanent researchers will be required for the management and execution of the project: at least 20% of the ordinary work. For U01: 692 hours dedicated to the project per single unit (3 MD) and a standard hourly cost of 55,00 € = 38060,00 € x 3 Medical Doctors = 114180,00 €.

Budget Justification
1 Staff Salary	Permanent researchers will be required for the management and execution of the project.
2 Researchers' Contracts	It requires the hiring of researchers for two years.
3a.1 Equipment (Leasing - Rent)	not provided
3a.2 Equipment (buying)	not provided

3b Supplies	The purchase of supplies for carrying out the activities is envisaged.
3c Model Costs	not provided
4 Subcontracts	not provided
5 Patient Costs	not provided
6 IT Services and Data Bases	To develop a system for the storage, management, data analysis arising from biomedical equipment and biotechnology.
7 Travels	This expense item includes the costs for travel to missions such as national and international conferences to ensure the sharing of results in the scientific community.
8 Publication Costs	The costs of publications in open access journals will be essential to ensure the correct dissemination of the scientific results obtained.
9 Dissemination	The dissemination of knowledge and the specificity of this project will be fundamental. Therefore, regular internal seminars will be organised, starting with the kick-off meeting. These workshops will be organized and coordinated by UO leaders.
10 Overheads	General costs attributable to the general expenses of the individual institution necessary for the conduct of activities under the project.
11 Coordination Costs	These costs will be necessary to manage the project by UO1.

Proposed total budget UO1 Institution: Istituto nazionale tumori Fondazione Xxxxxxxx Xxxxxxx (Euro)

Costs	TOTAL BUDGET	Co-Funding	List of costs proposed for funding to the MOH	Percentage of total proposed to the MOH
1 Staff Salary	114.180,00	114.180,00	not permitted	0,00
2 Researchers' Contracts	150.000,00	0,00	150.000,00	50,00
3a.1 Equipment (Leasing - Rent)	0,00	0,00	0,00	0,00
3a.2 Equipment (buying)	0,00	0,00	0,00	0,00
3b Supplies	20.000,00	0,00	20.000,00	6,67
3c Model Costs	0,00	0,00	0,00	0,00
4 Subcontracts	0,00	0,00	0,00	0,00
5 Patient Costs	0,00	0,00	0,00	0,00
6 IT Services and Data Bases	40.000,00	0,00	40.000,00	13,33
7 Travels	7.000,00	0,00	7.000,00	2,33
8 Publication Costs	12.000,00	0,00	12.000,00	4,00
9 Dissemination	3.000,00	0,00	3.000,00	1,00
10 Overheads	18.000,00	0,00	18.000,00	6,00
11 Coordination Costs	50.000,00	0,00	50.000,00	16,67
Total	414.180,00	114.180,00	300.000,00	100,00

Budget Justification
1 Staff Salary	At least 20% of the ordinary work. For U01: 692 hours dedicated to the project per single unit (3 MD) and a standard hourly cost of 55 €.
2 Researchers' Contracts	It requires the hiring of 2 researchers for two years
3a.1 Equipment (Leasing - Rent)	not provided
3a.2 Equipment (buying)	not provided
3b Supplies	The purchase of IT supplies for carrying out the activities is envisaged.
3c Model Costs	not provided
4 Subcontracts	not provided
5 Patient Costs	not provided
6 IT Services and Data Bases	To develop a system for the storage, management, data analysis arising from biomedical equipment and biotechnology.
7 Travels	This expense item includes the costs for travel to missions such as national and international conferences to ensure the sharing of results in the scientific community.
8 Publication Costs	The costs of publications in open access journals will be essential to ensure the correct dissemination of the scientific results obtained.
9 Dissemination	The dissemination of knowledge and the specificity of this project will be fundamental. Therefore, regular internal seminars will be organised, starting with the kick-off meeting. These workshops will be organized and coordinated by UO leaders.
10 Overheads	General costs attributable to the general expenses of the individual institution necessary for the conduct of activities under the project
11 Coordination Costs	These costs will be necessary to manage the project by UO1

Proposed total budget UO2 Institution: Azienda Ospedaliera Universitaria Xxxxx Xxxxxxxxxx (Euro)

Costs	TOTAL BUDGET	Co-Funding	List of costs proposed for funding to the MOH	Percentage of total proposed to the MOH
1 Staff Salary	0,00	-0,00	not permitted	0,00
2 Researchers' Contracts	70.000,00	0,00	70.000,00	38,78
3a.1 Equipment (Leasing - Rent)	0,00	0,00	0,00	0,00
3a.2 Equipment (buying)	0,00	0,00	0,00	0,00
3b Supplies	55.000,00	0,00	55.000,00	30,47
3c Model Costs	0,00	0,00	0,00	0,00
4 Subcontracts	0,00	0,00	0,00	0,00
5 Patient Costs	0,00	0,00	0,00	0,00
6 IT Services and Data Bases	25.000,00	0,00	25.000,00	13,85
7 Travels	4.000,00	0,00	4.000,00	2,22
8 Publication Costs	7.000,00	0,00	7.000,00	3,88
9 Dissemination	7.500,00	0,00	7.500,00	4,16
10 Overheads	12.000,00	0,00	12.000,00	6,65
11 Coordination Costs	not permitted	not permitted	not permitted	0,00
Total	180.500,00	0,00	180.500,00	100,00

Budget Justification
1 Staff Salary	Not provided
2 Researchers' Contracts	This cost is required for hiring 1 researcher for two years
3a.1 Equipment (Leasing - Rent)	Not provided
3a.2 Equipment (buying)	Not provided
3b Supplies	The purchase of IT supplies for carrying out the activities is envisaged.
3c Model Costs	Not provided
4 Subcontracts	Not provided
5 Patient Costs	Not provided
6 IT Services and Data Bases	IT Services and Data Bases To develop a system for the storage, management, data analysis arising from biomedical equipment and biotechnology.
7 Travels	This expense category covers the expenses related to traveling for missions, including attending national and international conferences, to facilitate the sharing of scientific results within the community.
8 Publication Costs	It is important to consider the expenses involved in publishing in open-access journals to ensure that scientific findings are properly shared.
9 Dissemination	Regular internal seminars will be organized by UO leaders to share knowledge effectively and maintain focus for project success.
10 Overheads	This pertains to the complete cost of the organization required to execute the project tasks.
11 Coordination Costs	Not provided

Proposed total budget UO3 Institution: Biogem scarl (Euro)

Costs	TOTAL BUDGET	Co-Funding	List of costs proposed for funding to the MOH	Percentage of total proposed to the MOH
1 Staff Salary	0,00	-0,00	not permitted	0,00
2 Researchers' Contracts	132.211,20	0,00	132.211,20	44,07
3a.1 Equipment (Leasing - Rent)	0,00	0,00	0,00	0,00
3a.2 Equipment (buying)	0,00	0,00	0,00	0,00
3b Supplies	147.788,80	0,00	147.788,80	49,26
3c Model Costs	0,00	0,00	0,00	0,00
4 Subcontracts	0,00	0,00	0,00	0,00
5 Patient Costs	0,00	0,00	0,00	0,00
6 IT Services and Data Bases	0,00	0,00	0,00	0,00
7 Travels	0,00	0,00	0,00	0,00
8 Publication Costs	0,00	0,00	0,00	0,00
9 Dissemination	0,00	0,00	0,00	0,00
10 Overheads	20.000,00	0,00	20.000,00	6,67
11 Coordination Costs	not permitted	not permitted	not permitted	0,00
Total	300.000,00	0,00	300.000,00	100,00

Budget Justification
1 Staff Salary	Not provided
2 Researchers' Contracts	The researchers will be involved in the organization of the collected samples, according to the ISO established for the biobank. They will be engaged in sequencing, data analysis, and correlation activities.
3a.1 Equipment (Leasing - Rent)	Not provided
3a.2 Equipment (buying)	Not provided
3b Supplies	To carry out the spatial transcriptomic 10x genomics and single cell sequencing FFPE 10x genomics will be used
3c Model Costs	Not provided
4 Subcontracts	Not provided
5 Patient Costs	Not provided
6 IT Services and Data Bases	Not provided
7 Travels	Not provided
8 Publication Costs	Not provided
9 Dissemination	Not provided
10 Overheads	Waste disposal, cleaning, utilities, security service, administrative staff
11 Coordination Costs	Not provided

Proposed total budget UO4 Institution: X. Xxxxxx Hospital (Euro)

Costs	TOTAL BUDGET	Co-Funding	List of costs proposed for funding to the MOH	Percentage of total proposed to the MOH
1 Staff Salary	0,00	-0,00	not permitted	0,00
2 Researchers' Contracts	70.000,00	0,00	70.000,00	46,67
3a.1 Equipment (Leasing - Rent)	0,00	0,00	0,00	0,00
3a.2 Equipment (buying)	0,00	0,00	0,00	0,00
3b Supplies	25.000,00	0,00	25.000,00	16,67
3c Model Costs	0,00	0,00	0,00	0,00
4 Subcontracts	0,00	0,00	0,00	0,00
5 Patient Costs	0,00	0,00	0,00	0,00
6 IT Services and Data Bases	25.000,00	0,00	25.000,00	16,67
7 Travels	3.000,00	0,00	3.000,00	2,00
8 Publication Costs	4.500,00	0,00	4.500,00	3,00
9 Dissemination	7.500,00	0,00	7.500,00	5,00
10 Overheads	15.000,00	0,00	15.000,00	10,00
11 Coordination Costs	not permitted	not permitted	not permitted	0,00
Total	150.000,00	0,00	150.000,00	100,00

Budget Justification
1 Staff Salary	Not provided
2 Researchers' Contracts	This cost is required for hiring 1 researcher for two years
3a.1 Equipment (Leasing - Rent)	Not provided
3a.2 Equipment (buying)	Not provided
3b Supplies	The purchase of IT supplies for carrying out the activities is envisaged.
3c Model Costs	Not provided
4 Subcontracts	Not provided
5 Patient Costs	Not provided
6 IT Services and Data Bases	To develop a system for the storage, management, data analysis arising from biomedical equipment and biotechnology.
7 Travels	This expense category covers the expenses related to traveling for missions, including attending national and international conferences, to facilitate the sharing of scientific results within the community.
8 Publication Costs	It is important to consider the expenses involved in publishing in open-access journals to ensure that scientific findings are properly shared.
9 Dissemination	Regular internal seminars will be organized by UO leaders to share knowledge effectively and maintain focus for project success.
10 Overheads	Overheads This pertains to the complete cost of the organization required to execute the project tasks.
11 Coordination Costs	Not provided

Principal Investigator Data

Cognome: Xxxxxxxx Nome: Xxxxxxxxx Xxxxxx: F

Codice fiscale: XXXXXX00X00X000X

Documento: Carta d'identità, Numero: CA22276AW Data di nascita: 03/12/1956

Luogo di nascita: Caserta Provincia di nascita: CE

Indirizzo lavorativo: Via Xxxxxxx Xxxxxxx Città: Napoli

CAP: 80131

Provincia: CE

Email: xxxxxxxxxxxxxxxxx0@xxxxx.xxx Altra email: x.xxxxxxxx@xxxxxxxxxxxxxx.xx.xx Telefono: x000000000000

Altro telefono: 0000000000

Qualifica: Dirigente Medico Radiologo Direttore Struttura Complessa Struttura: Radiodiagnostica

Istituzione: Istituto Nazionale dei Tumori IRCCS di Napoli Fondazione X. Xxxxxxx Xxxxxx/ente di lavoro? Yes

Datore/ente di lavoro SSN? Yes Nome datore/ente di lavoro non SSN:

Nome istituzione SSN: Istituto Nazionale Tumori IRCCS "Fondazione X. Xxxxxxx" Tipo contratto: Lavoro Subordinato a Tempo Indeterminato

Con l'invio della presente proposta si dichiara che la stessa o parti significative di essa non sono oggetto di altri finanziamenti pubblici o privati e che di conseguenza vi è assenza del c.d. doppio finanziamento ai sensi dell'art. 9 del Regolamento (UE) 2021/241, ossia che non ci sia una duplicazione del finanziamento degli stessi costi da parte di altri programmi dell'Unione, nonché con risorse ordinarie da Bilancio statale.

By submitting this proposal, I declare that no significant part or parts of it are recipient of any other public or private funding and that consequently there isn't any so-called double financing pursuant to art. 9 of Regulation (EU) 2021/241, i.e. that there is no duplication in the financing of the same costs by other Euopean Union programs or any other ordinary resources from the State budget.

Project validation result

Message:

Success

Work Packages

Bimester

1st

2nd

3rd

4th

5th

6th

7th

8th

9th

10th

11th

12th

General organization and Ethic committee application (all units)

WP1. Public dataset enquiring (unit 1)

WP2. Anthropometric, clinical and behavior data collection (unit 1 - 2 - 4)

WP3. Blood collection for biomarkers assessment (unit 1 - 2 - 4)

WP4. Tumour tissue collection (unit 1 - 2 - 4)

WP5. Biobanking (unit 3)

WP6. Imaging data collection (unit 1 - 2 - 4) and analysis (unit 1)

WP7. Spatial and single cell transcriptomics analysis (unit 3)

WP8. Big data bioinformatic analysis (unit 1)

WP9. Results interpretation and dissemination (all units)