PIANO NAZIONALE DI RIPRESA E RESILIENZA (PNRR) MISSIONE 6 - COMPONENTE 2 - INVESTIMENTO 2.1 VALORIZZAZIONE E

PIANO NAZIONALE DI RIPRESA E RESILIENZA (PNRR) MISSIONE 6 - COMPONENTE 2 - INVESTIMENTO 2.1 VALORIZZAZIONE E

POTENZIAMENTO DELLA RICERCA BIOMEDICA DEL SSN

Convenzione attuativa tra la Ex Direzione generale della ricerca ed innovazione in sanità, Dipartimento della prevenzione, della ricerca e delle emergenze sanitarie del Ministero della salute, il Soggetto attuatore- beneficiario Regione Autonoma della Sardegna e il Principal Investigator della ricerca xxxxxxxx xxxxxxx xxxxx, per la regolamentazione dello svolgimento del progetto della sezione Malattie Croniche non Trasmissibili (MCnT1) ad alto impatto sui sistemi sanitari e socio-assistenziali con codice WFR PNRR-MCNT1-2023-12376993, dal titolo “Human endogenous retrovirus K and propagation of TDP-43 proteinopathy” afferente al secondo avviso pubblico PNRR.

Premesso che

VISTA la legge 7 agosto 1990, n. 241 “Nuove norme in materia di procedimento amministrativo e di diritto di accesso ai documenti amministrativi” e s.m.i.;

VISTA la legge 14 gennaio 1994 n. 20 “Disposizioni in materia di giurisdizione e controllo della Corte dei Conti” e s.m.i.;

VISTO l’articolo 12 bis, comma 3, del decreto legislativo 30 dicembre 1992, n. 502/1992 e s.m.i.;

VISTO il decreto del Presidente del Consiglio dei Ministri 11 febbraio 2014, n. 59, recante il regolamento di organizzazione del Ministero della salute e, in particolare, gli articoli 1, comma 7, e 12, comma 2;

VISTO il decreto del Presidente della Repubblica 28 marzo 2013, n. 44, recante il regolamento di riordino degli organi collegiali e degli altri organismi operanti presso il Ministero della salute e, in particolare gli artt. 3 e 4 che prevedono la composizione del Comitato tecnico sanitario;

VISTO il decreto del Ministro della salute 8 agosto 2013, registrato dall’Ufficio centrale di bilancio presso il Ministero della salute in data 13 agosto 2013, visto n. 934 e, in particolare, l’articolo 1, che dispone la ripartizione dei componenti tra le sezioni del Comitato tecnico sanitario;

VISTO il decreto del Ministro della salute 15 dicembre 2021, registrato dall’Ufficio centrale del bilancio presso il Ministero della salute in data 7 gennaio 2022, visto n. 33, recante la ricostituzione del Comitato tecnico sanitario, avente una durata di tre anni dalla data di insediamento;

VISTO il Regolamento (UE) 2021/241 del Parlamento europeo e del Consiglio del 12 febbraio 2021 che istituisce il dispositivo per la ripresa e la resilienza dell’Unione Europea;

VISTO il Piano Nazionale di Ripresa e Resilienza (PNRR) valutato positivamente con Decisione del Consiglio ECOFIN del 13 luglio 2021, notificata all’Italia dal Segretariato generale del Consiglio con nota LT161/21, del 14 luglio 2021, ed in particolare la Missione 6, Componente 2, Investimento 2.1 “Valorizzazione e potenziamento della ricerca biomedica del SSN”, che consiste nel “rafforzare il sistema della ricerca biomedica tramite due linee di intervento: a) il finanziamento di progetti Proof of Concept (PoC), sostenendo lo sviluppo di tecnologie con un basso grado di maturità tecnologica e promuovendo il trasferimento di tecnologie verso l'industria; b) il finanziamento di programmi o progetti di ricerca nel campo delle malattie rare e dei tumori rari e di altre malattie altamente invalidanti”;

VISTO il Regolamento (UE) 2018/1046 del 18 luglio 2018, che stabilisce le regole finanziarie applicabili al bilancio generale dell’Unione, che modifica i Regolamenti (UE) n. 1296/2013, n. 1301/2013, n. 1303/2013, n. 1304/2013, n. 1309/2013, n. 1316/2013, n. 223/2014, n. 283/2014 e la decisione n. 541/2014/UE e abroga il regolamento (UE, Euratom) n. 966/2012;

VISTO il decreto legge del 31 maggio 2021, n. 77, convertito con modificazioni dalla legge 29 luglio 2021,

n. 108 «Governance del Piano nazionale di ripresa e resilienza e prime misure di rafforzamento delle strutture amministrative e di accelerazione e snellimento delle procedure»;

VISTO il decreto del Presidente del Consiglio dei ministri 9 luglio 2021 recante l’individuazione delle amministrazioni centrali titolari di interventi previsti nel PNRR, ai sensi dell’articolo 8, comma 1, del citato decreto legge 31 maggio 2021, n. 77, convertito, con modificazioni, dalla legge 29 luglio 2021, n. 108;

VISTO il decreto del Ministro dell’economia e delle finanze del 6 agosto 2021 relativo all’assegnazione

delle risorse in favore di ciascuna Amministrazione titolare degli interventi PNRR e corrispondenti milestone e target;

VISTO il decreto del Ministro della salute, di concerto con il Ministro dell’economia e delle finanze 15 settembre 2021, di istituzione dell’Unità di Missione del Ministero della salute titolare di interventi PNRR, ai sensi dell’articolo 8 del citato decreto legge n. 77 del 2021;

VISTO l’atto di indirizzo del Ministro del 12 ottobre 2021 con il quale sono stati individuati i relativi Soggetti Attuatori nell’ambito degli interventi e sub-interventi di investimento del piano Nazionale di ripresa e resilienza (PNRR) a titolarità del Ministero della salute;

VISTO il decreto legge 6 novembre 2021, n. 152 “Disposizioni urgenti per l'attuazione del Piano nazionale di ripresa e resilienza (PNRR) e per la prevenzione delle infiltrazioni mafiose”;

VISTA la legge 16 gennaio 2003, n. 3 “Disposizioni ordinamentali in materia di pubblica amministrazione” e, in particolare, l’articolo 11, comma 2-bis, ai sensi del quale “Gli atti amministrativi anche di natura regolamentare adottati dalle Amministrazioni di cui all’articolo 1, comma 2, del decreto legislativo 30 marzo 2001, n. 165, che dispongono il finanziamento pubblico o autorizzano l’esecuzione di progetti di investimento pubblico, sono nulli in assenza dei corrispondenti codici di cui al comma 1 che costituiscono elemento essenziale dell'atto stesso”;

VISTA la delibera del CIPE n. 63 del 26 novembre 2020 che introduce la normativa attuativa della riforma del CUP;

VISTO l’articolo 1, comma 1042, della legge 30 dicembre 2020, n. 178 ai sensi del quale con uno o più decreti del Ministro dell’economia e delle finanze sono stabilite le procedure amministrativo-contabili per la gestione delle risorse di cui ai commi da 1037 a 1050, nonché le modalità di rendicontazione della gestione del Fondo di cui al comma 1037;

VISTO l’articolo 1, comma 1043, secondo periodo, della legge 30 dicembre 2020, n. 178, ai sensi del quale al fine di supportare le attività di gestione, di monitoraggio, di rendicontazione e di controllo delle componenti del Next Generation EU, il Ministero dell'economia e delle finanze - Dipartimento della Ragioneria generale dello Stato sviluppa e rende disponibile un apposito sistema informatico;

VISTO l’articolo 17 del Regolamento (UE) 2020/852 che definisce gli obiettivi ambientali, tra cui il principio di non arrecare un danno significativo (DNSH, “Do no significant harm”), e la Comunicazione della Commissione UE 2021/C 58/01“Orientamenti tecnici sull’applicazione del principio «non arrecare un danno significativo» a norma del regolamento sul dispositivo per la ripresa e la resilienza”;

VISTI i principi trasversali previsti dal PNRR, quali, tra l’altro, il principio del contributo all’obiettivo climatico e digitale (c.d. tagging), il principio di parità di genere e l’obbligo di protezione e valorizzazione dei giovani;

VISTI gli obblighi di assicurare il conseguimento di target e milestone e degli obiettivi finanziari stabiliti nel PNRR;

VISTO il Regolamento delegato (UE) 2021/2106 della Commissione del 28 settembre 2021 che integra il regolamento (UE) 2021/241 del Parlamento europeo e del Consiglio, che istituisce il dispositivo per la ripresa e la resilienza, stabilendo gli indicatori comuni e gli elementi dettagliati del quadro di valutazione della ripresa e della resilienza, che prevede, in particolare, che “affinché il quadro di valutazione, compresi gli indicatori comuni, sia aggiornato in modo coerente e uniforme due volte l’anno, tutti gli Stati membri riferiscono alla Commissione due volte l’anno nell’ambito del semestre europeo sui progressi compiuti nella realizzazione dei piani per la ripresa e la resilienza, comprese le modalità operative, e sugli indicatori comuni.”

VISTE le “Linee Guida per lo svolgimento delle attività connesse al monitoraggio del PNRR”, predisposte dal Servizio Centrale per il PNRR, presso il Ministero dell’economia e delle finanze (MEF) - Dipartimento Ragioneria generale dello Stato (RGS), che descrivono le funzionalità del sistema informativo “ReGiS” sviluppato dal Ministero dell’economia e delle finanze – Dipartimento della Ragioneria Generale dello Stato in attuazione dell’articolo 1, comma 1043, della legge 30 dicembre 2020,

n. 178;

VISTO il documento “Sistema di Gestione e Controllo (Xx.Xx.Xx.) PNRR - Ministero della salute”, adottato con Decreto del 29 luglio 2022 e ss.mm.ii.;

VISTE le “Linee Guida per lo svolgimento delle attività di controllo e rendicontazione delle Misure PNRR di competenza delle Amministrazioni centrali e dei Soggetti attuatori”, predisposte dal Servizio Centrale per il PNRR, presso il Ministero dell’economia e delle finanze (MEF) - Dipartimento Ragioneria generale dello

Stato (RGS), che contengono indicazioni procedurali per un corretto espletamento delle attività di controllo e rendicontazione delle spese e di Milestone & Target e di ogni altro adempimento previsto dalla normativa comunitaria e nazionale applicabile al PNRR, a norma dell’art. 8, punto 3, del decreto legge 77 del 31 maggio 2021, come modificato dalla legge di conversione 29 luglio 2021, n. 108;

VISTO il decreto del Presidente del Consiglio dei Ministri 15 settembre 2021 “Modalità, regole e strumenti per il conferimento dei dati”;

VISTA la Circolare MEF-RGS del 14 ottobre 2021, n. 21 “Piano Nazionale di Ripresa e Resilienza (PNRR)

- Trasmissione delle Istruzioni Tecniche per la selezione dei progetti PNRR”;

VISTO il Decreto interministeriale del 7 dicembre 2021 per l’adozione delle linee guida volte a favorire la pari opportunità di genere e generazionali, nonché l'inclusione lavorativa delle persone con disabilità nei contratti pubblici finanziati con le risorse del PNRR e del PNC;

VISTA la Circolare MEF-RGS del 30 dicembre 2021, n. 32, recante “Guida operativa per il rispetto del principio di non arrecare danno significativo all’ambiente”;

VISTA la Circolare MEF-RGS del 31 dicembre 2021, n. 33 “Piano Nazionale di Ripresa e Resilienza (PNRR) – Nota di chiarimento sulla Circolare del 14 ottobre 2021, n. 21 - Trasmissione delle Istruzioni Tecniche per la selezione dei progetti PNRR – Addizionalità, finanziamento complementare e obbligo di assenza del c.d. doppio finanziamento”

VISTA la Circolare MEF-RGS del 21 giugno 2022, n. 27 “Monitoraggio delle misure PNRR”;

VISTA la Circolare MEF-RGS dell’11 agosto 2022, n. 30 sulle procedure di controllo e rendicontazione delle misure PNRR;

VISTA la Circolare del 28 marzo 2024, n. 13 “Integrazione delle Linee Guida per lo svolgimento delle attività di controllo e rendicontazione delle Misure PNRR di competenza delle Amministrazioni centrali e dei Soggetti Attuatori. Adozione delle Appendici tematiche: La prevenzione e il controllo del conflitto di interessi ex art. 22 Reg. (UE) 2021/241; La duplicazione dei finanziamenti ex art. 22 par. 2 lett. c) Reg. (UE) 2021/241”;

VISTA la Comunicazione della Commissione 2014/C 198/01 “Disciplina degli aiuti di Stato a favore di ricerca, sviluppo e innovazione” e s.m.i.;

VISTO il Regolamento (UE) n. 651/2014 della Commissione, del 17 giugno 2014, che dichiara alcune categorie di aiuti compatibili con il mercato interno in applicazione degli articoli 107 e 108 del trattato; VISTA la comunicazione della Commissione 2016/C 262/01 sulla nozione di aiuto di Stato di cui all'articolo 107, paragrafo 1, del trattato sul funzionamento dell'Unione europea;

VISTA la Comunicazione della Commissione del 19 marzo 2020, C(2020) 1863 “Quadro temporaneo per le misure di aiuto di Stato a sostegno dell'economia nell'attuale emergenza della COVID-19”, da ultimo rettificata attraverso la comunicazione del 18 novembre 2021, C(2021) 8442 “Sesta modifica del quadro temporaneo per le misure di aiuto di Stato a sostegno dell'economia nell'attuale emergenza della COVID- 19 e modifica dell'allegato della comunicazione della Commissione agli Stati membri sull'applicazione degli articoli 107 e 108 del trattato sul funzionamento dell'Unione europea all'assicurazione del credito all'esportazione a breve termine”;

VISTO il decreto del Ministro della salute 1° aprile 2022, che nella annessa tabella A ha distinto gli interventi di cui alla Missione 6, Componente 2, Investimento 2.1 – “Valorizzazione e potenziamento della ricerca biomedica del Servizio Sanitario Nazionale” del Piano Nazionale di Ripresa e Resilienza nei sub- interventi, per risorse complessive pari a €524.140.000,00 così ripartite:

- 2.1.1 – progetti di ricerca finanziati con voucher Proof of concept, per € 100.000.000,

- 2.1.2 – progetti di ricerca finanziati per Malattie rare e Tumori rari, per € 100.000.000

- 2.1.3 – progetti di ricerca finanziati per Malattie altamente invalidanti, per € 324.140.000;

VISTO il decreto direttoriale n.27 del 2 novembre 2022, registrato con visto n.1054 dall’ufficio centrale di bilancio in data 18 novembre 2022 con il quale è stata approvata la graduatoria dei progetti di ricerca del primo avviso pubblico PNRR - Missione 6, Componente 2, Investimento 2.1;

VISTO il secondo avviso pubblico PNRR del 14 aprile 2023, registrato dall’ufficio centrale di bilancio presso questo Dicastero il 5 maggio 2023, al n. 541, per la presentazione e selezione di progetti di ricerca da finanziare nell’ambito del PNRR, Missione 6, Componente 2, Investimento 2.1, sulle tematiche: 1. Proof of concept (PoC) 2. Tumori Rari (TR) 3. Malattie Rare (MR) 4. Malattie Croniche non Trasmissibili (MCnT2) ad alto impatto sui sistemi sanitari e socioassistenziali: a. Innovazione in campo diagnostico; b. Innovazione in campo terapeutico; 5. Malattie Croniche non Trasmissibili (MCnT1) ad alto impatto sui

sistemi sanitari e socioassistenziali: a. Fattori di rischio e prevenzione; b. Eziopatogenesi e meccanismi di malattia;

VISTO il decreto del Ministro della salute del 28 dicembre 2023 n.136, registrato dall’Ufficio centrale di bilancio presso il Ministero della salute in data 19 gennaio 2024 con n.62 e dalla Corte dei conti in data 5 febbraio 2024 con n.263 con il quale, a seguito delle risultanze della graduatoria dei progetti di ricerca afferenti al primo avviso pubblico PNRR, approvata con decreto direttoriale n.27 del 2 novembre 2022, è modificata l’allocazione delle risorse finanziarie indicate nell’allegato 1 del sopracitato decreto ministeriale 1° aprile 2022 assegnate al secondo avviso pubblico PNRR per i progetti di ricerca sulle seguenti tematiche progettuali: Proof of Concept, Malattie rare, Malattie croniche non trasmissibili, ad alto impatto sui sistemi sanitari e socioassistenziali (tematiche: Fattori di rischio e prevenzione; Eziopatogenesi e meccanismi di malattia);

VISTO il decreto n.5 del 29 marzo 2024 del Capo ad interim del Dipartimento della prevenzione, della ricerca e delle emergenze sanitarie del Ministero della salute, registrato dall’ufficio centrale di bilancio presso questo Ministero in data 4 aprile 2024 al n.225, con il quale, in osservanza alle disposizioni del Comitato tecnico sanitario, sezione c) espresse all’unanimità nella riunione del 26 marzo 2024, è stata approvata la graduatoria dei progetti di ricerca del secondo avviso pubblico PNRR- Missione 6 - Componente 2 - Investimento 2.1, afferenti alle tematiche progettuali Proof of Concept, Xxxxxx Xxxx, Malattie Rare, Malattie Croniche non Trasmissibili, ad alto impatto sui sistemi sanitari e socio-assistenziali (tematiche: Innovazione in campo diagnostico; Innovazione in campo terapeutico), Malattie Croniche non Trasmissibili, ad alto impatto sui sistemi sanitari e socio-assistenziali (tematiche: Fattori di rischio e prevenzione; Eziopatogenesi e meccanismi di malattia), e sono stati individuati i Destinatari istituzionali e i Principal Investigator;

VISTO il Xxxxxxx xxx Xxxxxxxxxx xxx Xxxxxxxxx xxx Xxxxxxxx 00 ottobre 2023, n. 196, recante il nuovo

«Regolamento di organizzazione del Ministero della salute» ai sensi dell’articolo 6-bis del decreto legge 11 novembre 2023, n. 173, che abroga il precedente Regolamento di organizzazione di cui al Decreto del Presidente del Consiglio dei Ministri 11 febbraio 2014, n. 59;

VISTO il decreto del Ministro della Salute del 3 gennaio 2024, recante la disciplina transitoria dell’assetto organizzativo del Ministero della Salute previsto dal D.P.C.M. 30 ottobre 2023, n. 196;

VISTO il decreto del Presidente della Repubblica del 21 febbraio 2024 registrato alla Corte dei conti il 29 febbraio 2024 al n. 433 con il quale il xxxx. Xxxxxxxx Xxxxxxxx è stato nominato Capo ad interim del Dipartimento della prevenzione, della ricerca e delle emergenze sanitarie del Ministero della salute; TENUTO CONTO che la ex Direzione generale della Ricerca e dell’innovazione in sanità risulta attualmente priva di titolare;

VISTO il decreto del Ministro della Salute del 4 marzo 2024, comunicato agli organi di controllo, con il quale per il corrente esercizio finanziario ai dirigenti generali titolari dei Centri di responsabilità amministrativa, sulla base delle linee programmatiche, degli obiettivi strategici e dei risultati attesi definiti nella Direttiva generale per l’attività amministrativa e la gestione per l’anno 2024, emanata dal Ministro della Salute in data 29 febbraio 2024 e in corso di registrazione, sono stati assegnati i contingenti delle risorse umane, nonché le risorse economico-finanziarie indicate nei rispettivi programmi di spesa e relative azioni sottostanti dello stato di previsione del Ministero della Salute;

CONSIDERATO che il citato decreto del 4 marzo 2024 ha assegnato al Dipartimento della Prevenzione, della ricerca e delle emergenze sanitarie anche le risorse economico-finanziarie del programma 17.20 Ricerca per il settore della sanità pubblica, con le relative azioni sottostanti;

VISTO il decreto del Ministro dell’8 aprile 2015, recante “Individuazione degli uffici dirigenziali di livello non generale”;

VISTO il decreto direttoriale del 22 febbraio 2022, registrato dalla Corte dei Conti in data 23 marzo 2022 al numero 670, con il quale ai sensi dell’art. 19, comma 5, del D. Lgs. n. 165/2001, è stato conferito, alla Dr.ssa Xxxxx Xxxxxx Camera D’Afflitto, Direttore dell’Ufficio 4 della Ex Direzione generale della ricerca e dell’Innovazione in sanità, l’incarico dirigenziale non generale di durata triennale, a decorre dal 1° marzo 2022 fino al 28 febbraio 2025;

CONSIDERATO che l’Ufficio 3 di questa Direzione generale è competente, tra l’altro, alla sottoscrizione, al monitoraggio e alla verifica dei progetti di ricerca concernenti gli Istituti di ricovero e cura a carattere scientifico (IRCCS);

TENUTO CONTO che dal 1° aprile 2024 l’incarico di direttore dell’Ufficio 3 ex DGRIC risulta vacante a seguito del collocamento a riposo del Dirigente titolare;

VISTO il decreto del Capo Dipartimento ad interim del 22 aprile 2024 con il quale è stata affidata alla dott.ssa Xxxxx Xxxxxx Camera d’Afflitto la sottoscrizione delle convenzioni relative ai progetti di ricerca di cui al 2° avviso pubblico nell’ambito del PNRR, sia relativamente agli IRCCS che relativamente a tutti gli altri soggetti attuatori-beneficiari delle risorse ovvero Regioni e Province autonome e Istituto superiore di sanità;

VISTO il messaggio trasmesso da questa amministrazione per il tramite della piattaforma Workflow della ricerca in data 8 aprile 2024 con il quale è stato comunicato al Soggetto attuatore-beneficiario che la valutazione della proposta progettuale ha avuto esito positivo e che, pertanto, la stessa è stata ammessa a finanziamento;

tanto premesso si stipula e si conviene quanto segue tra

il Ministero della Salute (di seguito “Ministero”), in qualità di Amministrazione titolare, rappresentato dalla Dr.ssa Xxxxx Xxxxxx Camera d’Afflitto – Direttore dell’Ufficio 4 della Ex Direzione generale della ricerca e dell’innovazione in sanità (di seguito “Ex DGRIC”)

e

il Soggetto attuatore-beneficiario Regione Autonoma della Sardegna del progetto, rappresentato dal Xxxx. Xxxx Xxxxxxx in qualità di legale rappresentante, codice fiscale 80002870923 (di seguito “Soggetto attuatore-beneficiario”)

e

il/la xxxx. xxxxxxxx xxxxxxx xxxxx (codice fiscale XXXXXX00X00X000X) in qualità di PRINCIPAL INVESTIGATOR del progetto con codice PNRR-MCNT1-2023-12376993 dal titolo “Human endogenous retrovirus K and propagation of TDP-43 proteinopathy”

di seguito congiuntamente definite le “Parti”

Art. 1 Premesse

1. Le premesse sono parte integrante e sostanziale della presente Convenzione.

2. Fa altresì parte integrante e sostanziale della presente Convenzione, quale oggetto della stessa, il progetto di ricerca, i cui contenuti sono definiti ed eventualmente aggiornati nel tempo, mediante condivisione delle parti, senza necessità di espressa nuova sottoscrizione della presente Convenzione.

Art. 2 Soggetto attuatore-beneficiario e Principal Investigator

Il Soggetto attuatore-beneficiario e il Principal Investigator sono i responsabili dell’attuazione del progetto in questione e della regolarità delle relative spese ai sensi del bando e della normativa vigente.

1. È individuato quale Soggetto attuatore-beneficiario Regione Autonoma della Sardegna codice fiscale

80002870923;

2. È individuato quale Principal investigator (di seguito anche “PI”) il/la xxxx. xxxxxxxx xxxxxxx xxxxx, codice fiscale XXXXXX00X00X000X;

Art. 3 Oggetto

1. La presente Convenzione disciplina i rapporti tra le Parti per la realizzazione del progetto codice PNRR- MCNT1-2023-12376993 dal titolo “Human endogenous retrovirus K and propagation of TDP-43 proteinopathy”, nell’ambito della realizzazione degli obiettivi previsti dal PNRR, Missione 6 – Componente

2 – Investimento 2.1.

2. La presente Convenzione definisce, tra l’altro, gli obblighi delle Parti, le procedure di rendicontazione e quelle di pagamento.

3. Il soggetto attuatore-beneficiario e il Principal Investigator svolgono il progetto di ricerca secondo quanto riportato nel progetto presentato, parte integrante della presente convenzione, e approvato dal Ministero e in ottemperanza a quanto previsto dal presente avviso pubblico.

Art. 4 Termini di attuazione del progetto, durata e importo della Convenzione

1. La presente convenzione ha la durata di 24 mesi prorogabile eventualmente di ulteriori 6 mesi come previsto dal successivo articolo 11.

2. L’attività di ricerca, da svolgersi nell’arco temporale della vigenza della convenzione, deve avere inizio improrogabilmente entro e non oltre il 31 agosto 2024, comunicando la data effettiva di avvio con nota sottoscritta digitalmente dal proprio rappresentante legale e dal Principal investigator della ricerca che deve essere trasmessa almeno 30 giorni prima dell’inizio effettivo, correlata di documentazione di cui al successivo comma 4.

3. Il Soggetto attuatore-beneficiario entro e non oltre 15 giorni dall’invio della presente convenzione da parte del Ministero per la sottoscrizione provvede alla restituzione della convenzione firmata dal legale rappresentate e controfirmata dal Principal Investigator, tramite il sistema di monitoraggio del WFR, accompagnata dalla comunicazione del codice CUP MASTER e dei codici fiscali delle singole Unità operative. Le parti riconoscono che il bando di cui alle premesse prevede la decadenza dal finanziamento in caso di inadempienza della presente disposizione.

4. Il Soggetto-beneficiario, entro e non oltre 30 giorni precedenti la scadenza del termine di cui al comma 2 del presente articolo, pena la decadenza dal finanziamento, è tenuto a trasmettere - con nota sottoscritta digitalmente in maniera congiunta dal proprio rappresentante legale e dal Principal Investigator della ricerca

- la seguente documentazione, soggetta a verifica da parte del Ministero al fine di autorizzare l’avvio del progetto:

a) la dichiarazione da parte del legale rappresentante e del Principal Investigator con cui si dichiari che il progetto in questione o parti significative di esso non siano oggetto di altri finanziamenti pubblici a favore dell’Ente attuatore-beneficiario o del Principal Investigator e che, in ogni caso, sarà posta in essere ogni iniziativa volta ad evitare il doppio finanziamento;

b) la dichiarazione da parte del legale rappresentante e del ricercatore responsabile di ciascuna unità operativa partecipante con cui si dichiari che per la propria attività attinente al progetto in questione o per parti significative di esso non siano oggetto di altri finanziamenti pubblici a favore dell’Unità operativa medesima o dei ricercatori di tali unità operative elencati nella proposta progettuale e che, in ogni caso, sarà posta in essere ogni iniziativa volta ad evitare il doppio finanziamento;

c) la dichiarazione da parte degli Enti che svolgono funzioni di unità operativa e dei relativi responsabili di accettazione dei termini della presente convenzione;

d) la dichiarazione con la quale il Soggetto attuatore-beneficiario attesta che il Principal Investigator svolgerà la propria attività di ricerca, per l’intero periodo relativo all’attuazione del progetto, esclusivamente presso la propria sede o presso la struttura del S.S.N. afferente al medesimo, controfirmata dall’interessato;

e) il parere positivo del Comitato etico competente e/o l’autorizzazione di cui all’articolo 31 del decreto legislativo n. 26 del 4 marzo 2014 riguardante la sperimentazione animale, ove previsti;

f) la comunicazione del codice CUP delle singole Unità operative e per ognuna di esse anche il codice fiscale dei soggetti designati a operare sul sistema ReGiS attraverso specifico format excel che verrà condiviso da parte della Ex DGRIC che dovrà essere restituito firmato digitalmente;

g) la traduzione in lingua italiana della proposta progettuale senza apportare alcuna modifica alla versione in inglese allegata alla presente convenzione.

5. Per la realizzazione delle attività, l’importo ammesso a finanziamento è pari a €998.000,00 (novecentonovantottomila/00) a valere sulle risorse assegnate per le tematiche progettuali, stanziate in base alla tabella allegata al decreto ministeriale 1° aprile 2022, modificato con decreto ministeriale del 28 dicembre 2023 n.136, concernente la ripartizione degli interventi di investimento della Missione 6, Componente 2, Investimento 2.1 del Piano Nazionale di Ripresa e Resilienza relativo all'innovazione, alla ricerca e alla digitalizzazione del Servizio sanitario nazionale e al potenziamento del sistema della ricerca

biomedica.

6. La presentazione della richiesta di pagamento della rata intermedia delle spese al Ministero, secondo le modalità previste dall’art. 13, paragrafo 13.1 del bando, dovrà essere effettuata, previo caricamento della documentazione a supporto nel sistema ReGiS, entro 10 giorni dall’invio della comunicazione da parte del Ministero dell’approvazione della relazione scientifica intermedia.

7. La presentazione della richiesta di pagamento finale delle spese al Ministero dovrà essere effettuata successivamente all’invio entro 30 giorni dalla data di conclusione del progetto eventualmente prorogata secondo i termini della presente convenzione della relazione scientifica finale e della relativa rendicontazione economica complessiva del progetto e avverrà solo dopo l’invio della comunicazione da parte del Ministero dell’approvazione della relazione scientifica finale.

8. Il mancato adempimento di quanto previsto dai commi 2 e 3 del presente articolo equivale alla rinuncia a realizzare il progetto e comporta la decadenza dal contributo previsto e la decadenza dal finanziamento.

Art. 5 Obblighi del Soggetto attuatore-beneficiario e del Principal Investigator

1. Con la sottoscrizione della presente Convenzione, il Soggetto attuatore-beneficiario e il Principal Investigator, per quanto di competenza, si obbligano a:

1) assicurare il rispetto di tutte le disposizioni previste dalla normativa comunitaria e nazionale, con particolare riferimento a quanto previsto dal Reg. (UE) 2021/241 e dal D. L. n. 77 del 31/05/2021, convertito con modificazioni dalla L. 29 luglio 2021, n. 108;

2) garantire il rispetto di eventuali previsioni normative, orientamenti o istruzioni tecniche emanate dal Ministero della salute, dal Ministero dell’economia e delle finanze, dalla Commissione Europea ovvero da altri soggetti coinvolti nell’attuazione verifica e controllo delle azioni relative al PNRR, anche successivamente alla sottoscrizione della presente Convenzione;

3) assicurare l’adozione di misure adeguate volte a rispettare il principio di sana gestione finanziaria secondo quanto disciplinato nel Regolamento finanziario (UE, Euratom) 2018/1046 e nell’art. 22 del Regolamento (UE) 2021/241, in particolare in materia di prevenzione e contrasto dei conflitti di interessi, delle frodi, della corruzione, del doppio finanziamento e di recupero e restituzione dei fondi che sono stati indebitamente assegnati;

4) rispettare, a pena di sospensione o revoca del finanziamento in caso di accertata violazione, il principio di “non arrecare danno significativo” (DSNH) agli obiettivi ambientali a norma dell’articolo 17 del Regolamento (UE) 2020/852, i principi trasversali previsti dal PNRR quali, tra l’altro, il principio del contributo all’obiettivo climatico e digitale (c.d. tagging), la parità di genere, producendo dati relativi ai destinatari effettivi dei progetti anche disaggregati per genere (in relazione agli articoli 2, 3, paragrafo 3, del TUE, 8, 10, 19 e 157 del TFUE, e 21 e 23 della Carta dei diritti fondamentali dell’Unione europea), l’obbligo di protezione e valorizzazione dei giovani ed eventuali ulteriori requisiti e condizionalità specifiche dell’investimento oggetto della presente Convenzione;

5) adottare proprie procedure interne, assicurando la conformità ai regolamenti comunitari e a quanto indicato dal Ministero nella descrizione delle funzioni e delle procedure in essere dal Ministero;

6) dare piena attuazione al progetto così come illustrato nel Programma di ricerca, ammesso a finanziamento dal Ministero, garantendo l’avvio tempestivo delle attività progettuali per non incorrere in ritardi attuativi e concludere il progetto nella forma, nei modi e nei tempi previsti, nel rispetto della tempistica prevista dal relativo cronoprogramma di attuazione e di sottoporre al Ministero le eventuali modifiche al progetto;

7) assicurare il rispetto della normativa vigente sugli aiuti di Stato;

8) assicurare il rispetto dei criteri di ammissibilità delle spese e delle quote percentuali previste dal presente avviso pubblico per le varie voci di costo, che saranno calcolate, a consuntivo, sulle spese rendicontate, al netto di eventuali economie riscontrate sul finanziamento assegnato e sulle sole spese eleggibili, dopo verifica da parte del Ministero;

9) garantire, nel caso in cui si faccia ricorso alle procedure di appalto, il rispetto di quanto previsto dal decreto legislativo n. 50/2016 e s.m.i.; rispettare, in caso di ricorso diretto ad esperti esterni all’Amministrazione, la conformità alla pertinente disciplina comunitaria e nazionale, nonché alle eventuali specifiche circolari/disciplinari che potranno essere adottati dal Ministero;

10) individuare eventuali fattori che possano determinare ritardi che incidano in maniera considerevole sulla tempistica attuativa e di spesa definita nel cronoprogramma, relazionando il Ministero sugli stessi;

11) mitigare e gestire i rischi connessi al progetto nonché porre in essere azioni mirate connesse all’andamento gestionale ed alle caratteristiche tecniche;

12) effettuare i controlli ordinari di gestione e di regolarità amministrativo-contabile previsti dalla normativa vigente, e le verifiche sul conflitto di interessi, sul doppio finanziamento e quelle previste dalla normativa antiriciclaggio (“titolare effettivo”);

13) utilizzare il sistema informatico “ReGiS, finalizzato a raccogliere, registrare e archiviare in formato elettronico i dati per ciascuna operazione necessari per la sorveglianza, la valutazione, la gestione finanziaria, la verifica e l’audit, secondo quanto previsto dall’art. 22.2 lettera d) del Regolamento (UE) 2021/241 e tenendo conto delle indicazioni che verranno fornite dagli organi competenti per il tramite del Ministero;

14) caricare sul portale Workflow della Ricerca e nel sistema “ReGiS” la documentazione tecnico scientifica sullo stato di avanzamento del progetto atta a comprovare il corretto svolgimento dello stesso;

15) caricare sul sistema informativo “ReGiS” la documentazione atta a comprovare il corretto svolgimento dei controlli ordinari previsti dalla normativa vigente in merito alle procedure di gara espletate per l’aggiudicazione degli eventuali appalti o subcontratti e eventuali altra documentazione richiesta dalle Amministrazioni centrali deputate alla gestione complessiva del PNRR;

16) garantire la correttezza, l’affidabilità e la congruenza con il tracciato informativo previsto per l’alimentazione del sistema informativo “ReGiS” dei dati di monitoraggio riferiti al CUP Master e ai CUP delle singole Unità operative sull’avanzamento finanziario, fisico e procedurale, e di quelli che comprovano il conseguimento degli obiettivi dell’intervento quantificati in base agli stessi indicatori adottati per le milestones e i target della misura e assicurarne l’inserimento con cadenza almeno bimestrale delle spese (nel termine massimo di 10 giorni successivi all’ultimo giorno del bimestre) nel portale Workflow della Ricerca e sul sistema informativo “ReGiS”, unitamente alla documentazione probatoria pertinente, salvo diversa comunicazione;

17) rispettare l’obbligo di indicazione del CUP su tutti gli atti amministrativo/contabili relativi al progetto e sui documenti collegati alle relative procedure di acquisto e fatturazione;

18) fornire tutte le informazioni richieste relativamente alle procedure e alle verifiche in relazione alle spese rendicontate conformemente alle procedure e agli strumenti adottati dal Ministero;

19) garantire la conservazione della documentazione progettuale in fascicoli cartacei e/o informatici per assicurare la completa tracciabilità delle operazioni - nel rispetto di quanto previsto all’art. 9, punto 4, del

D.L. n. 77 del 31 maggio 2021, convertito con modificazioni dalla L. n. 108/2021 - che, nelle diverse fasi di controllo e verifica previste dal sistema di gestione e controllo del PNRR, dovranno essere messi prontamente a disposizione su richiesta dell’Amministrazione centrale titolare di intervento PNRR, del Servizio centrale per il PNRR del MEF, dell’Unità di Audit, della Commissione europea, dell’OLAF, della Corte dei Conti europea (ECA), della Procura europea (EPPO) e delle competenti Autorità giudiziarie nazionali, autorizzando la Commissione, l'OLAF, la Corte dei conti e l'EPPO a esercitare i diritti di cui all'articolo 129, paragrafo 1, del regolamento finanziario (UE; EURATOM) 1046/2018;

20) facilitare le verifiche dell’Ufficio competente per i controlli del Ministero, dell’Unità di Audit, della Commissione europea e di altri organismi autorizzati, che verranno eventualmente effettuate anche attraverso controlli in loco;

21) assicurare che le spese del Progetto di ricerca non siano oggetto, anche parzialmente, di altri finanziamenti, contributi o agevolazioni a valere su fondi pubblici nazionali e/o comunitari (divieto del doppio finanziamento);

22) garantire la disponibilità dei documenti giustificativi relativi alle spese sostenute e ai target realizzati così come previsto ai sensi dell’articolo 9 punto 4 del decreto legge n. 77 del 31/05/2021, convertito in legge 29 luglio 2021, n. 108;

23) predisporre i pagamenti secondo le procedure stabilite dal Ministero, nel rispetto del piano finanziario e cronogramma di spesa approvato, inserendo, allo scadere dei 12 e 24 mesi (prorogabili eventualmente di 6 mesi) nel portale Workflow della Ricerca e sul sistema informativo “ReGiS” i relativi documenti riferiti alle procedure e i giustificativi di spesa e pagamento necessari ai controlli ordinari di legalità e ai controlli amministrativo-contabili previsti dalla legislazione nazionale applicabile, nel rispetto di quanto previsto dall’articolo 22 del Reg. (UE) n. 2021/241 e dell’art. 9 del decreto legge n. 77 del 31/05/2021, convertito in legge 29 luglio 2021, n. 108 la documentazione;

24) assicurare che tutte le spese rendicontate siano state effettuate entro il periodo di svolgimento del progetto

e che gli eventuali pagamenti per fatture emesse nel periodo di svolgimento del progetto siano completate entro i 30 giorni successivi alla scadenza progettuale e in tempo utile per il caricamento sul sistema di rendicontazione ReGiS;

25) inoltrare, allo scadere dei 12 e 24 mesi (prorogabili eventualmente di 6 mesi),le richieste di pagamento al Ministero tramite il portale Workflow della Ricerca e/o il sistema informativo “ReGiS” con allegata la rendicontazione dettagliata delle spese effettivamente sostenute e del contributo al perseguimento delle milestones e dei target associati alla misura PNRR di riferimento, unitamente ai documenti giustificativi appropriati secondo le tempistiche e le modalità riportate nei dispositivi attuativi;

26) garantire l’utilizzo di un conto corrente dedicato necessario per l’erogazione dei pagamenti e l’adozione di una contabilità separata o di un’apposita codificazione contabile e informatizzata per tutte le transazioni relative al progetto al fine di assicurare la tracciabilità dell’utilizzo delle risorse del PNRR;

27) assicurare, direttamente o attraverso le Istituzioni da esso dipendenti in cui saranno svolte le attività di ricerca, l’anticipazione delle somme necessarie allo svolgimento della ricerca;

28) partecipare, ove richiesto, alle riunioni convocate dal Ministero.

29) garantire, anche attraverso la trasmissione di relazioni periodiche sullo stato di avanzamento del progetto, che il Ministero riceva tutte le informazioni necessarie, relative alle linee di attività per l’elaborazione delle relazioni annuali di cui all’articolo 31 del Regolamento (UE) n. 2021/241, nonché qualsiasi altra informazione eventualmente richiesta;

30) conseguire il raggiungimento degli obiettivi dell’intervento, quantificati secondo gli stessi indicatori adottati per le milestones e i target della misura PNRR di riferimento, e fornire, su richiesta dal Ministero, le informazioni necessarie per la predisposizione delle dichiarazioni sul conseguimento di target e milestones e delle relazioni e documenti sull’attuazione dei progetti;

31) garantire il rispetto degli obblighi in materia di comunicazione e informazione previsti dall’art. 34 del Regolamento (UE) 2021/241 indicando nella documentazione progettuale che il progetto è finanziato nell’ambito del PNRR, con esplicito riferimento al finanziamento da parte dell’Unione europea e all’iniziativa Next Generation EU (ad es. utilizzando la frase “finanziato dall’Unione europea – Next Generation EU – PNRR M6C2 - Investimento 2.1 Valorizzazione e potenziamento della ricerca biomedica del SSN”), riportando nella documentazione progettuale il logo dell’Unione europea e fornire un’adeguata diffusione e promozione del progetto, anche online, sia web sia social, in linea con quanto previsto dalla Strategia di Comunicazione del PNRR;

32) fornire i documenti e le informazioni necessarie secondo le tempistiche previste e le scadenze stabilite dai Regolamenti comunitari e dal Ministero e per tutta la durata del progetto;

33) garantire una tempestiva diretta informazione agli organi preposti, tenendo informato il Ministero sull’avvio e l’andamento di eventuali procedimenti di carattere giudiziario, civile, penale o amministrativo che dovessero interessare le operazioni oggetto del progetto, comunicare le irregolarità, le frodi, i casi di corruzione e di conflitti di interessi, nonché i casi di doppio finanziamento, riscontrati a seguito delle verifiche di competenza e adottare le misure necessarie, nel rispetto delle procedure adottate dallo stesso Ministero in linea con quanto indicato dall’art. 22 del Regolamento (UE) 2021/2041;

34) garantire che il Ministero riceva attraverso il sistema “ReGiS” tutte le informazioni necessarie per l’aggiornamento dell’indicatore comune n. 8 “Ricercatori che lavorano in centri di ricerca beneficiari di un sostegno”, riconducibile alla misura oggetto del presente avviso pubblico, tenuto conto che, ai sensi dell’art. 3, comma 3, del Regolamento delegato (UE) 2021/2106 della Commissione del 28 settembre 2021 che integra il regolamento (UE) 2021/241 del Parlamento europeo e del Consiglio, che istituisce il dispositivo per la ripresa e la resilienza “la comunicazione di informazioni per l’aggiornamento degli indicatori comuni ha luogo ogni anno entro il 28 febbraio e il 31 agosto. Il periodo di riferimento copre l’intero periodo di attuazione del piano, dal 1° febbraio 2020 in poi, se del caso, fino alle rispettive date limiti del 31 dicembre e del 30 giugno di ogni anno.”

Art. 6 Procedura di monitoraggio e rendicontazione della spesa e dei target

1. Il Ministero con la presente convenzione rappresenta alla controparte che il monitoraggio tecnico- scientifico sarà svolto dalla Ex DGRIC, mentre i controlli rispetto alla rendicontazione delle spese saranno svolte dall’Unità di missione per l'attuazione degli interventi del PNRR presso il Ministero della salute.

2. Il Soggetto attuatore-beneficiario, secondo le indicazioni fornite dal Ministero, deve registrare su base

almeno bimestrale, entro 10 giorni successivi all’ultimo giorno del periodo considerato, i dati sull’avanzamento finanziario, fisico e procedurale del progetto nel sistema informatico “ReGiS” e implementare tale sistema con la documentazione specifica relativa a ciascuna procedura di affidamento e a ciascun atto giustificativo di spesa e di pagamento, al fine di consentire l’espletamento dei controlli amministrativo-contabili a norma dell’art. 22 del Reg. (UE) 2021/241 da parte dall’Unità di missione per l'attuazione degli interventi del PNRR presso il Ministero della salute.

3. Il Soggetto attuatore-beneficiario, allo scadere dei 12 e 24 mesi (prorogabili eventualmente di 6 mesi) deve trasmettere i dati sull’avanzamento tecnico-scientifico del progetto tramite il portale Workflow della Ricerca e il sistema “ReGiS” corredata di documentazione specifica relativa a ciascuna procedura di affidamento e a ciascun atto giustificativo di spesa e di pagamento, al fine di consentire l’espletamento dei controlli amministrativo-contabili e delle verifiche sullo stato di avanzamento del progetto.

4. Il Soggetto attuatore-beneficiario, pertanto, dovrà inoltrare allo scadere dei 12 e 24 mesi (prorogabili eventualmente di 6 mesi) tramite il portale Workflow della Ricerca e il sistema informatico “ReGiS”, la richiesta rendicontazione delle spese volte a supportare le richieste di pagamento che dovranno essere formalmente trasmesse all’Unità di Missione del Ministero comprensiva dell’elenco di tutte le spese effettivamente sostenute nel periodo di riferimento, gli avanzamenti relativi agli indicatori di intervento/progetto con specifico riferimento alle milestones e ai target del PNRR. Tale richiesta dovrà essere corredata dalla documentazione specificatamente indicata nelle procedure in essere del Ministero.

5. Le spese incluse nelle richieste di pagamento del Soggetto attuatore/beneficiario, se afferenti ad operazioni estratte a campione, sono sottoposte, per il tramite del Sistema Informatico “ReGiS”, alle verifiche, se del caso anche in loco da parte delle strutture deputate al controllo del Ministero.

6. Nello specifico, l’Unità di missione per l'attuazione degli interventi del PNRR del Ministero della Salute e eventuali altre amministrazioni coinvolte a diversi livelli di controllo eseguono le verifiche sulle procedure, sulle spese e sui target in conformità con quanto stabilito dall’art. 22 del Regolamento (UE) 2021/241 al fine di garantire la tutela degli interessi finanziari dell'Unione, la prevenzione, individuazione e rettifica di frodi, di casi di corruzione e di conflitti di interessi, nonché il recupero di somme erroneamente versate o utilizzate in modo non corretto.

7. La Ex DGRIC del Ministero della Salute svolge nel merito le funzioni di verifica tecnico-scientifica sullo stato di avanzamento del progetto in questione in coerenza con lo stato di rendicontazione delle spese.

Art. 7 Valutazione intermedia

1. Allo scadere dei 12 mesi dall’inizio dell’attività della ricerca e comunque non oltre trenta (30) giorni da tale termine, il Soggetto attuatore-beneficiario trasmette al Ministero tramite il portale Workflow della ricerca la relazione intermedia sullo stato d’attuazione scientifica della ricerca, sottoscritta digitalmente dal legale rappresentante del Soggetto attuatore/beneficiario e dal Principal Investigator, contenente la descrizione delle attività progettuali svolte complessivamente e dalle singole unità operative, da cui risulti lo stato avanzamento lavori (SAL) e il regolare svolgimento della ricerca, secondo quanto riportato nel progetto approvato. Tale relazione deve contenere una sintesi, a cura del Principal Investigator, che illustri, nella globalità, lo stato di avanzamento dei lavori, inclusa la descrizione delle attività realizzate da eventuali Enti co-finanziatori e l’apporto fornito da eventuali subcontraenti. La relazione intermedia, previa verifica tecnico-scientifica da parte della Ex DGRIC, sarà caricata dal Soggetto attuatore/beneficiario e dal Principal Investigator all’interno del sistema informativo “ReGiS”.

2. Il Ministero ha facoltà, previa comunicazione preventiva al Soggetto attuatore-beneficiario, di attivare le procedure per la sospensione del finanziamento e il recupero delle somme erogate, comprensive degli eventuali interessi legali maturati, qualora il Soggetto attuatore/beneficiario non adempia a quanto previsto entro i termini di cui al comma 1 del presente articolo.

3. La Ex DGRIC del Ministero della Salute, previa comunicazione preventiva al Soggetto attuatore- beneficiario, ha facoltà di comunicare all’Unità di missione per l'attuazione degli interventi del PNRR del medesimo Ministero, che sussistono le condizioni per non erogare le successive quote a rimborso, subordinandole all’ esito positivo del giudizio in ordine alla relazione finale, qualora la relazione intermedia, all’esito dell’istruttoria, non sia considerata idonea a dimostrare che siano stati pienamente raggiunti gli obiettivi medio termine o emerga che essa sia stata condotta non in piena conformità con quanto

previsto nel progetto approvato. In tal caso il Ministero potrà procedere con il rimborso a saldo. Laddove non vengano rispettati i termini di cui alla presente convenzione, che non consentano la tempestiva erogazione dei fondi, il Soggetto attuatore-beneficiario esonera il Ministero da qualsiasi responsabilità per eventuali ritardi nell’erogazione delle somme spettanti.

4. Il Ministero, previa comunicazione preventiva al Soggetto attuatore-beneficiario, può sottoporre al Comitato tecnico sanitario sez. c), un dossier, qualora la relazione intermedia, all’esito della istruttoria ministeriale, non consenta di esprimere un compiuto motivato parere. La decisione del suddetto Comitato è vincolante per il Soggetto attuatore-beneficiario ai fini del prosieguo della convenzione.

Art. 8 Valutazione finale

1. Fatta salva l’eventuale concessione di proroga della durata delle attività progettuali, al termine di ventiquattro mesi e comunque non oltre trenta (30) giorni dopo la data fissata per il termine della ricerca ai fini dell’erogazione del saldo, il Soggetto attuatore-beneficiario, con nota firmata digitalmente dal rappresentante legale, trasmette contestualmente al Ministero la seguente documentazione, redatta dal Principal Investigator e recante la firma digitale dello stesso:

- la relazione finale della ricerca, contenente quanto posto in essere anche da eventuali Enti cofinanziatori, che documenti, per ciascuna unità operativa, la coerenza delle attività svolte con il progetto approvato e gli obiettivi raggiunti;

- copia dei lavori pubblicati su riviste impattate a seguito dello svolgimento della ricerca;

- la rendicontazione delle spese sostenute con i fondi ministeriali;

- indicazioni del repository pubblico dove sono resi disponibili i dati grezzi progettuali e quelli utilizzati per le pubblicazioni scientifiche correlate;

- il rispetto dei costi sostenuti rispetto ai vincoli del bando in materia di gender e spese effettuate da parte di istituzioni nell’aree del meridione.

2. La rendicontazione economica dovrà essere corredata da una relazione di certificazione e di apposita check list di verifica dei requisiti minimi del bando, rilasciata da un Revisore esterno indipendente, iscritto all’Ordine dei Dottori Commercialisti ed Esperti Contabili e al Registro dei Revisori Legali, in possesso dei requisiti richiesti dalla Direttiva 2014/56/UE del Parlamento europeo e del Consiglio, del 16 aprile 2014, che modifica la direttiva 2006/43/CE relativa alle revisioni legali dei conti annuali e dei conti consolidati, e dalla relativa legislazione nazionale di attuazione, che certifichi la regolarità amministrativo-contabile delle spese sostenute per la realizzazione del progetto, la loro conformità alla normativa di riferimento vigente, il rispetto delle condizionalità e di tutti i requisiti previsti dal presente avviso pubblico e dalla presente Convenzione il rispetto delle normative nazionali ed europee in materia e la congruenza con le attività svolte ed i risultati raggiunti.

3. Tutta la sopra richiamata documentazione deve essere redatta e trasmessa tramite il portale Workflow della ricerca e il sistema informatico “ReGiS” e secondo le indicazioni previste dal sistema informatico di monitoraggio economico e utilizzando congiuntamente il sistema di comunicazione del Workflow della ricerca, a disposizione dei destinatari istituzionali che può essere integrato con comunicazioni tramite posta elettronica certificata (PEC) da parte del Soggetto attuatore/beneficiario.

4. La documentazione di supporto deve essere a disposizione del Ministero e degli Organi di controllo e verifica del PNRR, presso il Soggetto attuatore-beneficiario, che deve provvedere alla relativa custodia.

5. La Ex DGRIC del Ministero della salute provvede ad applicare una decurtazione pari al 10% della rata del saldo, qualora la documentazione di cui al comma 1 del presente articolo sia trasmessa al Ministero in un periodo compreso tra il trentunesimo e il quarantesimo giorno dalla data di conclusione del progetto.

6. Il Ministero provvede ad applicare una decurtazione pari al 20% della rata del saldo, qualora la documentazione di cui al comma 1 del presente articolo sia trasmessa al Ministero in un periodo compreso tra il quarantunesimo e il cinquantesimo giorno dalla data di conclusione del progetto.

7. Il Ministero, previa comunicazione preventiva al Soggetto attuatore-beneficiario, attiva le procedure per la sospensione del finanziamento e la conseguente economia della rata finale, nonché per il recupero di tutte delle somme già erogate, anche quelle già utilizzate per il personale facente parte del gruppo della ricerca, comprensive degli interessi legali maturati, qualora la documentazione di cui al comma 1 del presente

articolo non sia trasmessa al Ministero entro il cinquantesimo giorno dalla data di conclusione del progetto.

8. Il Ministero si riserva la facoltà di chiedere informazioni ed eventuale documentazione integrativa al Soggetto attuatore/beneficiario, che deve fornire riscontro entro e non oltre i successivi 15 giorni, qualora:

- la relazione finale non sia considerata idonea a dimostrare il regolare svolgimento della ricerca, in conformità a quanto previsto nel progetto e nel piano finanziario approvati;

- la rendicontazione risulti incompleta o incongruente sia sui dati contabili sia sulle descrizioni.

9. Il Ministero provvederà ad emettere la valutazione finale sulla base di quanto acquisito agli atti. In caso di mancato o esaustivo riscontro da parte del Soggetto attuatore-beneficiario delle richieste di cui al precedente comma, il Ministero comunica al Soggetto attuatore-beneficiario il parere negativo in ordine alla relazione finale e conseguentemente in ordine all’erogazione del saldo ed ha facoltà di chiedere la restituzione delle somme già erogate, comprensive degli interessi legali maturati, in caso di mancato riscontro oppure laddove dall’istruttoria della documentazione integrativa emerga che sono stati disattesi gli obiettivi di cui al progetto

10. Il Ministero, previa comunicazione preventiva al Soggetto attuatore-beneficiario, può sottoporre al Comitato tecnico sanitario sez. c) un dossier, qualora la relazione finale, all’esito della istruttoria ministeriale, non consenta di esprimere un compiuto motivato parere. La decisione del suddetto Comitato è vincolante per il Soggetto attuatore-beneficiario ai fini del prosieguo della convenzione.

Art. 9 Verifica finanziaria preventiva

Il Soggetto attuatore-beneficiario, al fine dell’erogazione del finanziamento, deve trasmettere al Ministero della salute, Unità di missione per l’attuazione degli investimenti del PNRR, tramite il sistema “ReGiS” la rendicontazione economica corredata da certificato di verifica finanziaria, di cui al comma 2 dell’articolo 8 della presente convenzione, redatto in lingua inglese ed in italiano da parte di soggetti qualificati all’Audit a livello europea, che certifichi la correttezza della procedura di spese, la completezza della documentazione in base alle disposizioni del bando e alle norme nazionale e a quelle europee.

Art. 10 Procedura di pagamento al Soggetto beneficiario

1. Le procedure di erogazione dei fondi su richiesta del Soggetto attuatore-beneficiario a titolo di anticipazione e a titolo di rimborso all’Unità di missione del Ministero della salute seguono le specifiche modalità in conformità con quanto indicato nel presente avviso pubblico e di seguito riportate:

- massimo 40% al momento della comunicazione, da parte del Soggetto beneficiario, dell’inizio dell’attività di ricerca, a titolo di anticipazione.

- quota a rimborso per un ulteriore massimo complessivo pari al 70% dopo l’invio, al 12° mese dall’inizio delle attività progettuali, da parte del Soggetto attuatore-beneficiario della relazione scientifica intermedia e dopo la sua approvazione, sulla base della presentazione delle richieste di pagamento a titolo di rimborso per le spese effettivamente sostenute dal Soggetto beneficiario, come risultanti dal sistema informatico di cui all’articolo 1, comma 1043, della legge 30 dicembre 2020, n. 178.

- quota a rimborso residuale a saldo pari al 30% (ovverosia fino al 100% della richiesta complessiva) a conclusione della ricerca, dopo l’invio da parte del Soggetto attuatore-beneficiario della relazione scientifica finale e della rendicontazione economica, sulla base della presentazione della richiesta di pagamento finale attestante la conclusione del progetto, in coerenza con le risultanze del sistema di monitoraggio di cui all’articolo 1, comma 1043, della legge 30 dicembre 2020, n. 178.

2. A garanzia della coerenza con l’inizio dell’attività dichiarata, il Soggetto attuatore-beneficiario si impegna ad anticipare le risorse economiche necessarie, nell’eventualità in cui le somme da corrispondersi da parte del Ministero siano in regime di perenzione.

3. Laddove non vengano rispettati i termini di cui alla presente convenzione, che non consentano la tempestiva erogazione dei fondi, il Soggetto attuatore-beneficiario esonera il Ministero da qualsiasi responsabilità per eventuali ritardi nell’erogazione delle somme spettanti.

4. Al termine delle verifiche la Ex DGRIC del Ministero della Salute comunicherà dall’Unità di missione per l'attuazione degli interventi del PNRR del Ministero Salute le risultanze delle verifiche per consentire l’effettuazione degli eventuali successivi pagamenti.

Art. 11 Variazioni del progetto e del piano dei costi

1. A partire dal 3° mese successivo all’avvio del progetto e fino a 3 mesi prima della scadenza del progetto, il Soggetto attuatore-beneficiario, con nota firmata dal proprio rappresentate legale e dal Principal Investigator, trasmessa tramite il portale Workflow della ricerca e il sistema informatico “ReGiS”, può proporre variazioni al progetto, coerenti con gli obiettivi progettuali, o alla distribuzione di fondi tra le unità operative, purché non comportino un aumento del finanziamento complessivo a carico del Ministero, che dovranno essere accolte con autorizzazione scritta del Ministero. La richiesta di modifica deve dimostrare le necessità scientifiche alla base della richiesta e l’equivalenza della modifica proposta rispetto al raggiungimento degli obiettivi progettuali previsti, modifica che avrà efficacia solo dopo l’approvazione da parte del Ministero con successivo necessario adeguamento del piano dei costi per il CUP Master e per i CUP delle singole Unità operative da parte del Soggetto attuatore-beneficiario.

2. Non è consentito al di fuori del periodo di cui al comma 1 avanzare richieste di modifica. In caso di eventuale necessità di un’ulteriore modifica progettuale è possibile presentare tale richiesta di modifica solo dopo 3 mesi dall’approvazione da parte del Ministero dell’ultima modifica progettuale della stessa tipologia ovverosia scientifica o economica.

3. Il piano dei costi, riportato nella proposta progettuale, è da ritenersi vincolante relativamente al solo totale del finanziamento assegnato e al riparto iniziale tra unità operative, mentre ha valore meramente indicativo per quanto riguarda la ripartizione tra voci di costo e le motivazioni fornite a giustificazione di tali costi.

4. La distribuzione delle somme tra le diverse voci di costo, nell’ambito di ogni singola unità operativa, è consentita sotto la responsabilità del Soggetto attuatore-beneficiario che ha presentato il progetto e che dovrà verificare il rispetto delle percentuali ed i vincoli previste dal bando.

5. Qualsiasi proposta emendativa deve essere adeguatamente motivata dal Principal Investigator per documentare che quanto richiesto risulti indispensabile per assicurare il raggiungimento degli obiettivi a suo tempo prefissati.

6. Solo dopo l’approvazione del Ministero, il soggetto attuatore-beneficiario potrà procedere all’applicazione delle modifiche di cui al comma 1 del presente articolo. In caso di eventuali inadempimenti al presente articolo il Ministero ha facoltà di procedere sia alla risoluzione della convenzione, dandone comunicazione al Soggetto attuatore/beneficiario, sia alla sospensione del finanziamento, nonché al recupero di tutto l’importo erogato.

Art. 12 Proroga

1. Il termine della ricerca può essere prorogato dal Ministero per un periodo massimo di 6 mesi dalla data di scadenza originale, solo a seguito di formale, motivata e documentata istanza firmata digitalmente dal legale rappresentante del Soggetto attuatore-beneficiario e dal Principal Investigator, trasmessa tramite il portale Workflow della ricerca.

2. La richiesta di cui al comma 1 può essere avanzata solo dopo la presentazione della relazione di medio termine ovverosia dopo 12 mesi dall’avvio progetto e fino a 3 mesi precedenti il termine del progetto, con formale e motivata istanza da parte del Soggetto attuatore-beneficiario e del Principal Investigator, che dimostri le necessità scientifiche alla base della richiesta rispetto alle necessità per il raggiungimento degli obiettivi progettuali previsti e avrà efficacia solo dopo l’approvazione da parte del Ministero.

Art. 13 Proprietà e diffusione dei risultati

1. La proprietà degli studi, dei prodotti e delle metodologie sviluppati nell’ambito del progetto è regolamentata dalla normativa vigente in materia, salvo particolari accordi stipulati tra le parti firmatarie del presente atto, ferma restando la possibilità dei soggetti istituzionali del Servizio Sanitario Nazionale di fruirne, previa richiesta alle parti firmatarie.

2. Nel caso in cui il Soggetto attuatore/beneficiario intenda trasferire ad altri soggetti qualsiasi diritto, anche parziale, relativo alla ricerca in questione, ai risultati della stessa o ad eventuali brevetti derivati deve darne preventiva comunicazione al Ministero.

3. Il Soggetto attuatore-beneficiario si impegna a garantire un’adeguata diffusione e promozione del progetto,

anche online, sia sul web che sui social media.

4. Qualsiasi documento prodotto, ivi comprese le pubblicazioni scientifiche inerenti al progetto di ricerca oggetto della presente convenzione – per i quali deve essere assicurato l’accesso non oneroso al Ministero

- deve contenere l’indicazione che il progetto è finanziato nell’ambito del PNRR, con un’esplicita dichiarazione che reciti "finanziato dall’Unione europea – Next Generation EU – PNRR M6C2 - Investimento 2.1 Valorizzazione e potenziamento della ricerca biomedica del SSN", l’emblema dell’Unione Europea ed il codice del progetto.

5. I prodotti di cui al precedente comma 4 devono essere resi pubblici attraverso sistemi che consentano l’immediata fruizione da parte del pubblico (ad esempio open-access) e non potranno essere oggetto di pubblicazione scientifica per la quale sia necessario il pagamento di una sottoscrizione ovvero il pagamento per la consultazione relativa L’eventuale violazione del presente comma, anche per una sola pubblicazione, sarà oggetto di una penale pari al 25% del finanziamento complessivo

6. Il Ministero non riconosce l’eleggibilità dei costi delle pubblicazioni sui propri fondi qualora in dette pubblicazioni non si faccia espressa menzione del finanziamento ottenuto nell’ambito del PNRR e del codice progetto.

7. Le parti convengono che il Ministero possa dare direttamente diffusione, anche attraverso il proprio sito web, dell’estratto della proposta progettuale e dei risultati della ricerca sia in forma completa che sintetica e delle pubblicazioni scientifiche da essa derivate.

Art. 14 Casi di riduzione, sospensione o revoca del contributo

1. Il Ministero procede a dichiarare la sospensione o revoca totale o parziale del finanziamento concesso, con conseguente eventuale restituzione delle somme già erogate, comprensive degli interessi legali maturati, nei seguenti casi:

a. modifiche ingiustificate alla composizione del gruppo di ricerca;

b. mancato rispetto dei vincoli previsti dal presente avviso pubblico;

c. mancato rispetto degli obblighi di cui all’art. 5 della presente Convenzione;

d. mancato raggiungimento, nei tempi assegnati, delle milestones e dei target previsti per lo svolgimento del progetto;

e. mancata o ritardata presentazione della relazione intermedia sullo stato d’attuazione della ricerca;

f. mancata o ritardata presentazione - oltre il cinquantesimo giorno dalla data di conclusione del progetto - della relazione finale della ricerca e della rendicontazione delle spese sostenute con i fondi ministeriali;

g. modifiche del progetto o variazioni nella distribuzione dei fondi tra le unità operative non autorizzate.

2. Il Ministero applica riduzioni finanziarie in misura variabile e/o consistenti nel mancato riconoscimento delle spese nei seguenti casi:

a. mancato rispetto dei criteri di ammissibilità di cui all’art. 10 del presente avviso pubblico; spese eccedenti i massimali previsti per alcune categorie di spese dall’art. 10 dell’Avviso; costi delle pubblicazioni in cui non si faccia espressa menzione del finanziamento ottenuto nell’ambito del PNRR e del codice progetto;

b. riduzione finanziaria nella misura del 5% della rata del saldo nel caso in cui il Soggetto attuatore/beneficiario al termine delle attività progettuali inoltri copia dei lavori pubblicati su riviste impattate a seguito dello svolgimento della ricerca dalla quale risulti che solo alcune pubblicazioni prodotte recano la menzione del finanziamento ottenuto nell’ambito del PNRR e del codice progetto;

c. riduzione finanziaria nella misura del 10% della rata del saldo qualora la relazione finale della ricerca e la rendicontazione delle spese sostenute siano trasmesse al Ministero in un periodo compreso tra il trentunesimo e il quarantesimo giorno dalla data di conclusione del progetto;

d. riduzione finanziaria nella misura del 20% della rata del saldo qualora la relazione finale della ricerca e la rendicontazione delle spese sostenute siano trasmesse al Ministero in un periodo compreso tra il quarantunesimo e il cinquantesimo giorno dalla data di conclusione del progetto;

e. riduzione finanziaria nella misura del 5% dell’intero finanziamento nel caso in cui il Soggetto attuatore/beneficiario al termine delle attività progettuali inoltri copia dei lavori pubblicati su riviste impattate a seguito dello svolgimento della ricerca privi della menzione del finanziamento ottenuto nell’ambito del PNRR e del codice progetto;

f. riduzione finanziaria nella misura del 10% dell’intero finanziamento nel caso in cui il Soggetto

attuatore/beneficiario al termine delle attività progettuali non inoltri la copia dei lavori pubblicati su riviste impattate a seguito dello svolgimento della ricerca e/o le indicazioni del repository pubblico dove sono resi disponibili i dati grezzi progettuali e quelli utilizzati per le pubblicazioni scientifiche correlate.

Art. 15 Risoluzione di controversie

1. Per qualsiasi controversia, il Soggetto attuatore-beneficiario può rivolgersi agli Uffici della Ex DGRIC del Ministero della salute, che sottoporranno le eventuali problematiche al parere di competenza del Comitato tecnico sanitario (CTS) operante presso il Ministero. Le parti, con la sottoscrizione della presente convenzione, accettano fin d’ora il parere che sarà espresso dal Comitato tecnico sanitario (CTS) in caso di controversie sulla conduzione scientifica del progetto e le eventuali ricadute economiche.

2. Con la firma della presente convenzione il Principal Investigator accetta quanto previsto dal precedente comma 1.

3. Qualora a seguito della valutazione del CTS, di cui al comma 1 sussistano ulteriori eventuali controversie, diverse da quelle del comma 1, che dovessero sorgere in ordine al presente avviso pubblico il Foro competente è il Foro di Roma.

Art. 16 Risoluzione per inadempimento

1. Il Ministero potrà avvalersi della facoltà di risolvere la presente Convenzione qualora il Soggetto attuatore- beneficiario non rispetti gli obblighi imposti a suo carico e, comunque, pregiudichi l’assolvimento da parte dello stesso Ministero degli obblighi imposti dalla normativa comunitaria.

Art. 17 Diritto di recesso

1. Il Ministero potrà recedere in qualunque momento dagli impegni assunti con la presente Convenzione nei confronti del Xxxxxxxx attuatore-beneficiario qualora, a proprio giudizio, nel corso di svolgimento delle attività, intervengano fatti o provvedimenti che modifichino la situazione esistente all’atto della stipula della presente Convenzione o ne rendano impossibile o inopportuna la conduzione a termine.

Art. 18 Comunicazioni e scambio di informazioni

1. Ai fini della digitalizzazione dell’intero ciclo di vita del progetto, tutte le comunicazioni con il Ministero della salute devono avvenire attraverso il sistema di monitoraggio delle ricerche denominato Workflow della ricerca, a disposizione del Soggetto attuatore-beneficiario e laddove necessario attraverso il sistema messo a disposizione dal Ministero dell’Economie e Finanze denominato “ReGiS”.

2. Il Soggetto attuatore/beneficiario attraverso il proprio rappresentate legale, nonché il Principal Investigator devono firmare digitalmente tutti gli atti inerenti alla ricerca.

Art. 19 Tracciabilità dei flussi finanziari

1. Le parti si impegnano all’osservanza, per quanto di rispettiva competenza, delle disposizioni inerenti alla tracciabilità dei flussi finanziari di cui all’art. 3 della Legge 13 agosto 2010, n. 136 e s.m.i..

Art. 20 Protezione dei dati personali

1. Nel corso dell’esecuzione delle attività oggetto della presente Convenzione, ciascuna delle Parti potrà trovarsi nella condizione di dover trattare dati personali riferibili a dipendenti e/o collaboratori dell’altra Parte, motivo per cui le stesse si impegnano sin d’ora a procedere al trattamento di tali dati personali in conformità alle disposizioni di cui al Regolamento (UE) 2016/679 del Parlamento europeo e del Consiglio, del 27 aprile 2016, relativo alla protezione delle persone fisiche con riguardo al trattamento dei dati personali, nonché alla libera circolazione di tali dati e che abroga la direttiva 95/46/CE (Regolamento generale sulla protezione dei dati - GDPR) e successive norme nazionali di adeguamento.

2. Le Parti si impegnano a condurre le suddette attività di trattamento sulla base dei principi di correttezza,

liceità, trasparenza e tutela della riservatezza dei soggetti interessati e per il solo ed esclusivo fine di perseguire le finalità di cui alla presente Convenzione, nonché degli eventuali obblighi di legge allo stesso connessi. Tali dati saranno trattati dalle Parti con sistemi cartacei e/o automatizzati ad opera di propri dipendenti e/o collaboratori che, in ragione della propria funzione e/o attività, hanno la necessità di trattarli, per le sole finalità suindicate e limitatamente al periodo di tempo necessario al loro conseguimento.

Art. 21 Efficacia

1. La presente convenzione, vincolante all'atto della sottoscrizione per il Soggetto attuatore-beneficiario e il Principal Investigator, diventerà efficace per il Ministero a seguito della registrazione da parte degli organi di controllo.

Art. 22 Disposizioni Finali

1. Per quanto non previsto dalla presente Convenzione si rinvia alle norme comunitarie e nazionali di riferimento.

Letto, confermato e sottoscritto con firma digitale, ai sensi del decreto legislativo 7 marzo 2005, n. 82 e s.m.i.. Roma, (data della sottoscrizione come quella dell’ultima firma digitale apposta)

per il Ministero della salute

Dr.ssa Xxxxx Xxxxxx Camera d’Afflitto - Direttore dell’Ufficio 4 Ex Direzione generale della ricerca e dell’innovazione in sanità

per il Soggetto attuatore-beneficiario Regione Autonoma della Sardegna, Xxxx Xxxxxxx, codice fiscale XXXXXX00X00X000X (Legale rappresentante)

Per presa visione ed accettazione:

Il Principal Investigator - xxxxxxxx xxxxxxx xxxxx, codice fiscale XXXXXX00X00X000X

1 - General information

Project code: PNRR-MCNT1-2023-12376993

Project topic: D2) Malattie croniche non trasmissibili (MCnT1) ad alto impatto sui sistemi sanitari e socio- assistenziali: eziopatogenesi e meccanismi di malattia

Applicant Institution: Sardegna

PI / Coordinator: xxxxx xxxxxxxx xxxxxxx

Istitution that perform as UO for UO1:

Azienda Ospedaliera Universitaria di Sassari

Call section: Proposal title:

Malattie Croniche non Trasmissibili (MCnT1) ad alto impatto sui sistemi sanitari e socio-assistenziali Human endogenous retrovirus K and propagation of TDP-43 proteinopathy

Duration in months: 24

MDC primary: Neurologia

MDC secondary: Malattie Infettive

Project Classification IRG: Project Classification SS:

Brain Disorders and Clinical Neuroscience

Clinical Neuroscience and Neurodegeneration - CNN

Project Keyword 1:

Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) and related motor neuron disorders.

X

Project Request: Animals:

Project total financing request to the MOH: € 998.000

Free keywords: ALS, HERV, TDP43

Declarations

Humans:

Clinical trial:

In case of a Synergy grant application 'Principal Investigator'(PI) means 'corresponding Principal Investigator on behalf of all Principal Investigators', and 'Host Institution' means 'corresponding Host Institution'.

1) The Principal Investigator declares to have the written consent of all participants on their participation and on the content of this proposal, as well as of any researcher mentioned in the proposal as participating in the project (either as other PI, team member or collaborator).	X
2) The Principal Investigator declares that the information contained in this proposal is correct and complete.	X
3) The Principal Investigator declares that all parts of this proposal comply with ethical principles (including the highest standards of research integrity — as set out, for instance, in the European Code of Conduct for Research Integrity — and including, in particular, avoiding fabrication, falsification, plagiarism or other research misconduct).	X
4) The Principal Investigator is only responsible for the correctness of the information relating to his/her own organisation. Each applicant remains responsible for the correctness of the information related to him and declared above.	X

Personal data protection

The assessment of your grant application will involve the collection and processing of personal data (such as your name, address and CV), which will be performed pursuant to Regulation (EC) No 45/2001 on the protection of individuals with regard to the processing of personal data by the Community institutions and bodies and on the free movement of such data. Unless indicated otherwise, your replies to the questions in this form and any personal data requested are required to assess your grant application in accordance with the specifications of the call for proposals and will be processed solely for that purpose. Details concerning the purposes and means of the processing of your personal data as well as information on how to exercise your rights are available in the privacy statement. Applicants may lodge a complaint about the processing of their personal data with the European Data Protection Supervisor at any time.

Abstract

Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) and frontotemporal dementia (FTD) are debilitating, fatal neurological diseases characterized by the accumulation of TDP-43 aggregates in the central nervous system (1). The inter-cellular movement of "prion-like" TDP43 is thought to explain the propagation of neurodegeneration between cells, but unlike transmissible prion diseases, ALS and FTD are not infectious, and injection of aggregated TDP-43 is not sufficient to cause disease. There must be a missing component of a positive feedback necessary to sustain disease progression. Our previous research has shown that endogenous retrovirus (ERV) expression and TDP-43 proteinopathy are mutually reinforcing. HERV-K (HML-2) can modulate the immune system by inducing the expression of proinflammatory mediators such as IL-6, IFN-gamma, and TNF- alfa (2). Elevated levels of antibodies (Abs) against HERV-K and TDP-43 have been found in ALS patients, with a positive correlation between the two proteins that appears to strengthen with disease progression (3-5). ALS patients also showed higher expression levels of HERV-K and production of specific Abs against its envelope epitope, potentially playing a protective role in ALS progression. In a Drosophila-based study, it was found that chronic defects in TBPH/TDP-43 function lead to the activation of retrotransposable elements (RTEs), resulting in DNA damage and activation of the inflammatory- innate immune response (6). Finally, the expression of ERVs can induce cytoplasmic aggregation of TDP-43, and viral transmission triggers TDP-43 prion-like pathology in recipient cells expressing physiological levels of TDP-43 (7). The purpose of this grant proposal is to investigate the molecular and mechanistic relationships between the events described above in the onset and progression of ALS, as well as their clinical implications. To achieve this, we plan to integrate a clinical strategy involving the analysis of biological samples from ALS patients with a molecular strategy employing advanced human brain 3D models and Drosophila with TDP-43 mutations. We will use the Drosophila model to evaluate the feasibility of therapeutic interventions. Given the correlation between TDP-43 and HERV-K, we aim to investigate the mechanisms underlying their interaction and the reactivation of HERV-K in ALS pathology, with a focus on the role played by microRNAs. The outcomes of this research will enhance ALS screening procedures and lead to the development of novel therapeutic approaches based on the individual characteristics of each patient.

Yes

In order to best review your application, do you agree that the above non-confidential proposal title and abstract can be used, without disclosing your identity, when contacting potential reviewers?

2 - Participants & contacts

Operative Units
Institution that perform as UO	CF Institution	Department / Division / Laboratory	Role in the project	Southern Italy	SSN
1 - Azienda Ospedaliera Universitaria di Sassari	02268260904	AZIENDA OSPEDALIERA UNIVERSITARIA DI SASSARI, Italy	COORDINATOR	X	X
2 - Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico	04724150968	Dipartimento di Fisiopatologia Medico-Chirurgica e dei Trapianti	PARTNER		X

Principal Research Collaborators
Key Personnel Name	Operative Unit	Role in the project
1 - XXXXX XXXXX	Xxxxxxx Ospedaliera Universitaria di Sassari	Co-PI, supervision experimental data and lab management
2 - xxxxxxxxxx xxxxxx	Xxxxxxxxxx IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico	Principal Collaborator, recruiting patients and responsible of neuropathology studies
3 - Xxxx Xxxxxxx Xxxxxx	Xxxxxxxxxx IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Xxxxxxxxxxx	Principal collaborator, Coordinator of UO2
4 - XXXXX XXXXXXXXX XXXXX XXXXXXXXX	Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico	Principal Collaborator, biomarker detection
5 - COGIAMANIAN XXXXXXX XXXXX	Xxxxxxxxxx IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico	Principal Collaborator, human samples, neuropathology
6 Under 40 - Xxxx Xxxxxxx	Xxxxxxx Ospedaliera Universitaria di Sassari	Principal Collaborator, Recruitment, follow up and analysis of ALS patients
7 Under 40 - Xxxxxxxxx Xxxxx	Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico	Principal Collaborator, data collection

Key Personnel Name	Co-PI	Resp. CE	Resp. Animal	Birth Date	Gender
1 - XXXXX XXXXX	X		X	08/02/1971	M
2 - xxxxxxxxxx xxxxxx				13/07/1978	M
3 - Xxxx Xxxxxxx Xxxxxx				07/11/1958	M
4 - XXXXX XXXXXXXXX XXXXX XXXXXXXXX				30/10/1979	F
5 - COGIAMANIAN XXXXXXX XXXXX				26/01/1974	M
6 Under 40 - Xxxx Xxxxxxx				09/08/1989	F
7 Under 40 - Xxxxxxxxx Xxxxx				22/09/1984	F

Additional research collaborators under 40 to hire
Key Personnel Name	Operative Unit	Birth Date	Gender	Role in the project	Degree	Actual Pos. and Inst.
0 - XXXX XXXXX	Xxxxxxx Ospedaliera Universitaria di Sassari	19/04/1994	F	Additional collaborator. Analysis of HERVs expression, TDP43	MS	PhD Student at the last year in Life Sciences and Biotechnologies at UNISS
1 - XXXXXXXXX XXXXX	Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico	25/10/1990	F	Additional collaborator. Analysis of xxXXX in ALS patients,	MD	Neurology specialist
2 - FAIS MILENA	Azienda Ospedaliera Universitaria di Sassari	22/06/1986	F	Additional collaborator. Drosophila model and molecular studies	PhD	Molecular biologist at University of Sassari

2.1 Administrative data of participating

Operative Unit Number 1:

Address: AOU SASSARI - Azienda Ospedaliera Universitaria di Sassari Xxxxx X. Xxxxxx, 00, 00000, Xxxxxxx (XX)

PEC: xxxxxxxxxx@xxx.xxx.xx.xx

Operative Unit Number 2:

Address: Fondazione Ca'Granda - Ospedale Maggiore Policlinico

Xxx Xxxxxxxxx Xxxxxx 00, 00000, Xxxxxx (XX) regione Lombardia

PEC: xxxxxxxxxx@xxx.xxxxxxxxxxx.xx.xx

Operative Unit Number 3:

Address: NA

PEC: NA

Operative Unit Number 4:

Address: NA

PEC: NA

Operative Unit Number 5 (self financing):

Address: NA

PEC: NA

2.2 Principal Investigator (PI) Profile

Last Name: xxxxx

First Name: xxxxxxxx xxxxxxx

Last name at birth:

Gender: M

Title: Principal investigator

Nationality: Italiana

Date of birth: 13/06/1965

Official H index (Scopus or Web of Science): 45.0

Country of residence: ITALY Country of Birth: ITALY Place of Birth: Ittiri

Scopus Author Id:35480017300 ORCID ID:0000-0003-0566-2049 RESEARCH ID:Y-3109-2018

Contact address

Current organisation name: Azienda Ospedaliera Universitaria di Sassari

Current Department / Faculty / Institute / Laboratory name: XXXXXXX XXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXX XX XXXXXXX, Xxxxx

Street: Struttura Complessa di Microbiologia e Virologia, AOU sassari

Postcode / Cedex: 07100 Town: Sassari

Phone:x000000000000 Phone 2: 0000000000

Education / training
Educational institution and location	Degree	Field of study	From year	To year
University of Sasssari	Specialization / Specializzazione	Microbiology and Virology Specialty	1989	1992

Personal Statement:

COORDINATOR of the project. Expert of the host pathogens interactions in autoimmune diseases. Recently has focused his scientific attention on the role of HERVs in neurological diseases in particular ALS and interaction with HERV K. Prof. Xxxxx leads since several years a consolidated research group that has attracted several fundings.

Positions and honors

Positions
Institution	Division / Research group	Location	Position	From year	To year
University of Sassari	Dipartimento di Scienze Biomediche	Sassari	Full Professor	2007	2023
University of Sassari	Dipartimento di Scienze Biomediche	Sassari	Associate Professor	2001	0000
Xxxxxx Xxxxxxxxxx	Xxxxxxxxxxxx	Xxxxxxxxxxxx, XXX	Postdoctoral fellow	1990	1995
University of Sassari	Facoltà di SS.MM.FF.NN.	Sassari	Assistant Professor	1995	2001

Other awards and honors

(2007) 1° classified Scientific Productivicty Award, Università di Sassari,

(2018-2021) Member of the National qualification Commission (ASN) for the evaluation of Microbiology

Professorship for the Italian Universities (A3/06, SSD MED/07)

(212-2015) Member "Gruppo Esperti Valutatori (GEV) 06 (Scienze Mediche) ANVUR" 2013-present. Director of the PhD School of life sciences (xxxxx://xxx.xxxxx.xx/xxxx/0000) 2018-present, regional delegate Italian Society for Microbiology

Other CV informations

My studies are focused on the host-pathogens interaction and association with inflammatory disorders. In particular, I investigate on the reactivation of Human Endogenous Retroviruses which may trigger different autoimmune diseases such as Amyotrophic Lateral Syndrome (HERV-K), Multiple Sclerosis (EBV and HERV-W), Type 1 Diabetes (M. paratuberculosis and HERV-W), Crohn's disease (M. paratuberculosis), Rheumatoid Arthritis (EBV, M. paratuberculosis and HERV-W) and the role of HERVs in human cancer (HERV-K in Prostate Tumor).

Full profile at: xxxxx://xxx.xxxxxxxxxxxx.xxx/xxxxxxx/Xxxxxxxx-Xxxxx-0 xxxxx://xxxxxxx.xxxxxx.xx/xxxxxxxxx?xxxxx0XxX_XxXXXXX&xxxxx

Selected peer-reviewed publications of the PI valid for minimum expertise level
Title	Type	Pag	Vol	Year	DOI	PMID	Cit.**	P.*
Immune response induced by Xxxxxxx-Xxxx virus and Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis peptides in current and past infectious mononucleosis: a risk for multiple sclerosis?	Article	140-147	23	2016	10.1111/ene.12821	26453465	11	L
Humoral cross reactivity between ¿-synuclein and herpes simplex-1 epitope in Parkinson's disease, a triggering role in the disease?	Article	110-114	291	2016	10.1016/j.jneuroim.2016. 01.007	26857504	47	X
Xxxxxxx Xxxx Virus and Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis peptides are recognized in sera and cerebrospinal fluid of MS patients	Article	22401	6	2016	10.1038/srep22401	26956729	34	L
Identification of a HERV-K env surface peptide highly recognized in Rheumatoid Arthritis (RA) patients: a cross-sectional case-control study	Article	127-131	189(1)	2017	10.1111/cei.12964	28324619	31	L
Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis and myelin basic protein specific epitopes are highly recognized by sera from patients with Neuromyelitis optica spectrum disorder	Article	97-102	318	2018	10.1016/j.jneuroim.2018. 02.013	29519720	12	L
Serum BAFF levels, Methypredsinolone therapy, Xxxxxxx-Xxxx Virus and Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis infection in Multiple Sclerosis patients	Article	29268	6	2016	10.1038/srep29268	27383531	16	L
Soluble BAFF Level Is Not Correlated to Mycobacterium avium Subspecies Paratuberculosis Antibodies and Increases After Interferon-ß Therapy in Multiple Sclerosis Patients	Article	91-3	60	2016	10.1007/s12031-016- 0787-7	27370541	7	L
Identification of a HERV-K env surface peptide highly recognized in Rheumatoid Arthritis (RA) patients: a cross-sectional case-control study	Article	127-131	189	2017	10.1111/cei.12964	28324619	31	L
HERV-K Modulates the Immune Response in ALS Patients	Article	0000	0(0)	0000	00.0000/microorganisms 9081784	34442863	10	L

Title	Type	Pag	Vol	Year	DOI	PMID	Cit.**	P.*
TDP-43 and HERV-K Envelope-Specific Immunogenic Epitopes Are Recognized in ALS Patients	Article	0000	00(00)	0000	00.0000/v13112301	34835107	6	L
Current Advancement of Immunomodulatory Drugs as Potential Pharmacotherapies for Autoimmunity Based Neurological Diseases	Review	000	00(0)	0000	00.0000/ph15091077	36145298	1	L
Humoral immune responses of type 1 diabetes patients to Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis lend support to the infectious trigger hypothesis	Article	320-326	15(2)	2008	10.1128/CVI.00381-07	18077612	52	X
Xxxxxxx-Xxxx virus and Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis peptides are cross recognized by anti-myelin basic protein antibodies in multiple sclerosis patients	Article	51-55	270 (0-0)	0000	00.0000/j.jneuroim.2014. 02.013	24642384	55	L
Differential expression of xxXXX 155 and xxXXX 146a in Parkinson's disease patients	Article	1-4	13	2018	10.1016/j.ensci.2018.09. 002	30255159	68	L
Association of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis with multiple sclerosis in Sardinian patients	Article	e18482	6	2011	10.1371/journal.pone.00 18482	21533236	71	L
Mycobacterium avium ss. paratuberculosis Zoonosis - The Hundred Year War - Beyond Crohn's Disease	Review	96	4	2015	10.3389/fimmu.2015.000 96	25788897	000	X
Xxxxxxxxxx XXX0 and alpha-synuclein peptides stimulate a T cell response in Parkinson's disease	Article	26-31	310	2017	10.1016/j.jneuroim.2017. 06.004	28778441	31	L
Humoral immunity response to human endogenous retroviruses K/W differentiates between amyotrophic lateral sclerosis and other neurological diseases	Article	1076-e84	25	2018	10.1111/ene.13648	29603839	25	L
Inflammation, infectious triggers, and Parkinson's disease	Review	10:122	eCollectio n 10	2019	10.3389/fneur.2019.001 22	30837941	118	L
Detection and Isolation of Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis from intestinal mucosal biopsies of patients with and without Crohn's disease in Sardinia	Article	1529-36	100	2005	10.1111/j.1572- 0241.2005.41415.x	15984976	162	F

* Position: F=First L=Last C=Correspondent O=Other N=Not applicable

** Autocertificated

Selected peer-reviewed publications of the PI for the evaluation CV
Title	Type	Pag	Vol	Year	DOI	PMID	Cit.**
Human Endogenous Retrovirus K (HML-2) in Health and Disease	Article	1690.	11	2020	10.3389/fmicb.2020.016 90	32765477	32
Quantitative lung T cell responses aid the rapid diagnosis of pulmonary tuberculosis	Article	847-53	64	2009	10.1136/thx.2009.11637 6	19592392	54
The Consensus from the Mycobacterium avium ssp. paratuberculosis (MAP) Conference 2017	Article	208	5	2017	10.3389/fpubh.2017.002 08	29021977	66

Title	Type	Pag	Vol	Year	DOI	PMID	Cit.**
Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis infection in cases of irritable bowel syndrome and comparison with Crohn's disease and Johne's disease: common neural and immune pathogenicities	Article	3883-90	45	2007	10.1128/JCM.01371-07	17913930	106
Clinical utility of a commercial LAM-ELISA assay for TB diagnosis in HIV-infected patients using urine and sputum samples	Article	e9848	5	2010	10.1371/journal.pone.00 09848	20352098	118
Within-subject variability and boosting of T-cell interferon-gamma responses after tuberculin skin testing	Article	49-58	180	2009	10.1164/rccm.200811- 1704OC	19342414	162
Comparison of the incidence of virulence determinants and antibiotic resistance between Enterococcus faecium strains of dairy, animal and clinical origin	Article	291-304	88	2003	10.1016/s0168- 1605(03)00191-0	14597001	210
Antimicrobial activities of Xxxxxxx and Cinnamaldehyde against the human gastric pathogen Helicobacter pylori	Article	4	20	2005	10.1186/1476-0711-4-20	16371157	239
Detection of Mycobacterium tuberculosis by PCR analysis of urine and other clinical samples from AIDS and non-HIV-infected patients	Article	281-285	11	1997	10.1006/mcpr.1997.0119	9281414	50
Mycobacterium avium ss. paratuberculosis Zoonosis - The Hundred Year War - Beyond Crohn's Disease	Review	96	6	2015	10.3389/fimmu.2015.000 96	25788897	100

** Autocertificated

Grant
Funded by Institution	Researcher inst. where xxxxx is/was performed	Year	Title	Position in Projects	Fund (euro)	Source website grant listed
Regione Autonoma della Sardegna	University of Xxxxxxx	0000	Human Endogenous Retroviruses in neurological diseases (Multiple Sclerosis, Parkinson, Autism Spectrum Disease) and Type 1 Diabetes	Coordinator	823.000,00	xxxxx://xxx.xxxxxxx. xxxxxxxx.xx/xxxxxxx ti/1_422_202212141 33833.pdf
AriSLA	Department of Biomedical Sciences , University of Xxxxxxx	0000	IRKALS, role of HERV-K in Amyotrophic Lateral Disease.	Coordinator	57.000,00	xxxxx://xxx.xxxxxx.xx g/wp- content/uploads/201 8/01/4-scheda- progetto-2017- IRKALS.pdf
Improvement of prevention, diagnosis and treatment of Sarcoidosis and Crohn¿s Disease. Acronym: SACHRON	University of Xxxxxxx	0000	Improvement of prevention, diagnosis and treatment of Sarcoidosis and Crohn¿s Disease. Acronym: SACHRON	Collaborator	220.000,00	xxxxx://xxxxxx.xxxxxx. eu/project/id/QLK2- CT-2000-00928/es
FP6 EU project	University of Sassari	2006- 2008	Multi-parametric detection of bio-molecules coniugated with nanoparticles in the Tuberculosis, acronym ¿Nanomyc¿ (coordinator Xxxx Xxxxxxxxxxxxx),	Collaborator	300.000,00	xxxxx://xxxxxx.xxxxxx. eu/project/id/36812

Funded by Institution	Researcher inst. where xxxxx is/was performed	Year	Title	Position in Projects	Fund (euro)	Source website grant listed
EDCTP	University of Cape Town , University of Xxxxxxx	0000	P.I. of unit 2 within the project financed by ¿European & Developing Countries Clinical Trial Partnership¿ EDCTP, entitled: The utility of intensified case finding combined with a package of novel TB diagnostics performed at community- based clinics in Africa- a multi-centric prospective cohort study. Coordinator prof. K. Dheda, South Africa	Collaborator	45.000,00	xxxxx://xxx.xxxxx.xx g/publication/edctp- project-portfolio-a- compendium-of- clinical-trial-capacity- building-and- networking-projects- 2003-2015/
Minister of University and Research	University of Xxxxxxx	0000	Interazioni batterio-cellula ospite: analisi genetica e molecolare di meccanismi di virulenza di patogeni enterici di rilevanza clinica con particolare riferimento alla loro capacità di alterare a proprio vantaggio la risposta immune innata dell¿ospite. PI unit 5	Collaborator	135.000,00	xxxxx://xxxx.xxx.xxx.xx /Ricerca?Filtro.Anno =%25&Filtro.Ateneo= %25&Filtro.Argoment o=&Filtro.Cognome= cappuccinelli
Federazione Italiana Sclerosi Multipla (FISM)	University of Xxxxxxx	0000	Geoepidemiologia della sclerosi multipla: i fattori ambientali,	Collaborator	220.000,00	xxxxx://xxx.xxxx.xx/xx tes/default/files/Com pendio_della_ricerca _AISM_FISM_2014.p df. page 145
Ministero della Salute	University of Sassari	2011	Risk evaluation of human exposure to Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (Map) and comparative analysis of strains of human and animal origin. November 2011 - October 2014. Protocollo: RF-2009-1545765	Coordinator	320.000,00	xxxxx://xxx.xxxxxx.xx/x ancadati_ricerca/risk- evaluation-of-human- exposure-to- mycobacterium- avium-subsp- paratuberculosis- map-and- comparative- analysis-of-strains- of-human-and- animal-origin/
Federazione Italiana Sclerosi Multipla	University of Xxxxxxx	0000	LINKING GENES AND ENVIRONMENT IN MULTIPLE SCLEROSIS	Coordinator	25.000,00	xxxxx://xxxxxxxx.xxxx.xx /manager/UploadFile /2/20120828_118_ric erca.pdf
Minister of University and Research , PRIN	University of Sassary	2009	STUDIO SULL'ASSOCIAZIONE TRA MYCOBACTERIUM AVIUM SUBSPECIES PARATUBERCULOSIS E IL DIABETE MELLITO DI TIPO 1	Coordinator	68.208,00	xxxxx://xxxx.xxx.xxx.xx /Ricerca?Filtro.Anno =%25&Filtro.Ateneo= %25&Filtro.Argoment o=&Filtro.Cognome= sechi

2.3 CO-PI Profile

Last Name: SOLLA

First Name: XXXXX

Last name at birth:

Gender: M

Title: Co-PI, supervision experimental data and lab management

Nationality: Italiana

Date of birth: 08/02/1971

Official H index (Scopus or Web of Science): 24.0

Country of residence: ITALY Country of Birth: ITALY Place of Birth: Cagliari

Scopus Author Id:10539295100 ORCID ID:0000-0002-2982-0665 RESEARCH ID:R-5366-2016

Contact address

Current organisation name: Azienda Ospedaliera Universitaria di Sassari

Current Department / Faculty / Institute / Laboratory name: XXXXXXX XXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXX XX XXXXXXX, Xxxxx

Street: Xxxxx xxx Xxxxxx, 00

Postcode / Cedex: 07100 Town: Sassari

Phone:x000000000000 Phone 2:

Education / training
Educational institution and location	Degree	Field of study	From year	To year
University of Cagliari	Single-cycle master's degree / Laurea magistrale a ciclo unico	Medicine	1995	2001
University of Cagliari	Specialization / Specializzazione	Neurology	2002	2006
University of Cagliari	PhD	Cardiovascular and Neurological Sciences	2010	2013

Personal Statement:

Xxxx. Xxxxx is the CoPI and it will be responsible for the recruitment of ALS patients at the AOU of Sassari. His long standing experience on dealing with clinical studies will assure the success of the project.

Positions and honors

Positions
Institution	Division / Research group	Location	Position	From year	To year
AOU Cagliari	Neurology	CAGLIARI	Consultant	2017	2021
University of Cagliari	Neurology	Cagliari	Researcher	2013	2016
University of Sassari	Neurology, department of clinical medicine	Sassari	Associate professor	2021	2023

Other awards and honors

Scientific director of the project "Study of cardiovascular reflexes in Sardinian patients suffering from Parkinson's disease and their correlation with motor and non-motor disorders", at University of Cagliari, from 2013 to 2015.

Scientific director of the project "Sardinian dance and Parkinson's disease: study of the efficacy of a non-pharmacological therapeutic approach on motor rehabilitation and non-motor symptoms of disease", at the University of Cagliari, from 2014 to 2016

Other CV informations

- PhD Academic Board Member in Life Sciences and Biotechnologies of the University of Sassari 2007-at present/ Member of Accademia LIMPE- DISMOV

2007-at present/ Member of Italian Society of Neurology (SIN).

2011-at present/ Member of The International Parkinson and Movement Disorder Society (MDS)

Selected peer-reviewed publications of the Co-PI valid for minimum expertise level
Title	Type	Pag	Vol	Year	DOI	PMID	Cit.**	P.*
Olfactory Impairment in Parkinson's Disease Patients with Tremor Dominant Subtype Compared to Those with Akinetic Rigid Dominant Subtype: A Pilot Study	Article	000	00	0000	10.3390/brainsci120201 96	35203959	2	F
Olfactory Impairment Correlates with Executive Functions Disorders and Other Specific Cognitive Dysfunctions in Parkinson¿s Disease	Article	000	00	0000	10.3390/biology1201011 2	36671804	2	F
An unusual delusion of duplication in a patient affected by Dementia with Lewy bodies	Article	563-6	27	2013	10.3233/BEN-129026	23242362	3	F
An unusual delusion of duplication in a patient affected by Dementia with Lewy bodies	Article	78	17	2017	10.1186/s12883-017- 0842-1	28424054	5	F
Chronic Inflammatory Demyelinating Polyneuropathy after ChAdOx1 nCoV-19 Vaccination	Article	1502	12	2021	10.3390/vaccines912150 2	34960248	8	L
Fluctuating Cotard syndrome in a patient with advanced Parkinson disease	Article	70-2.	19	2015	10.1097/NRL.00000000 00000010	25692512	9	F
Clozapine-induced persistent hiccup in a patient with Alzheimer's disease	Article	615-6	108	2006	10.1016/j.clineuro.2005. 05.012	16024169	11	F
Dopaminergic-induced paraphilias associated with impulse control and related disorders in patients with Parkinson disease	Article	2752-4.	259	2012	10.1007/s00415-012- 6691-3	23096066	12	F
Paraphilic behaviours in a parkinsonian patient with hedonistic homeostatic dysregulation	Article	767-8	9	2006	10.1017/S14611457050 06437	16454868	15	F
Heart rate variability shows different cardiovascular modulation in Parkinson's disease patients with tremor dominant subtype compared to those with akinetic rigid dominant subtype	Article	1441-6.	122	2015	10.1007/s00702-015- 1393-5	25797035	16	F
Dopamine agonist withdrawal syndrome (DAWS) symptoms in Parkinson's disease patients treated with levodopa-carbidopa intestinal gel infusion	Article	968-71	8	2015	10.1016/j.parkreldis.201 5.05.018	26071817	19	F
Frequency and Determinants of Olfactory Hallucinations in Parkinson's Disease Patients	Article	000	00	0000	10.3390/brainsci110708 41	34202903	20	F

Title	Type	Pag	Vol	Year	DOI	PMID	Cit.**	P.*
Levodopa/carbidopa/entacapone-induced acute Pisa syndrome in a Parkinson's disease patient	Article	54-6	275	2008	10.1016/j.jns.2008.07.01 7	18814889	22	F
Therapeutic interventions and adjustments in the management of Parkinson disease: role of combined carbidopa/levodopa/entacapone (Stalevo)	Article	483-90	6	2010	10.2147/ndt.s5190	20856911	22	F
Association between fatigue and other motor and non-motor symptoms in Parkinson's disease patients	Article	382-91	261	2014	10.1007/s00415-013- 7207-5	24375016	24	F
Xxxxxxxxxxx and paraphilic disorders in Parkinson's disease: A systematic review of the literature	Article	604-13	30	2015	10.1002/mds.26157	25759330	29	F
Sex-related differences in olfactory function and evaluation of possible confounding factors among patients with Parkinson's disease	Article	57-63	267	2020	10.1007/s00415-019- 09551-2	31555978	29	F
Heat shock protein 27 R127W mutation: Evidence of a continuum between axonal Charcot-Xxxxx-Xxxxx and distal hereditary motor neuropathy	Article	958-62	81	2010	10.1136/jnnp.2009.1816 36	20660910	32	F
Sardinian Folk Dance for Individuals with Parkinson's Disease: A Randomized Controlled Pilot Trial	Article	305-316	25	2019	10.1089/acm.2018.0413	30624952	40	F
Gender differences in motor and non-motor symptoms among Sardinian patients with Parkinson's disease	Article	33-9	323	2012	10.1016/j.jns.2012.07.02 6	22935408	99	F

* Position: F=First L=Last C=Correspondent O=Other N=Not applicable

** Autocertificated

Grant
Funded by Institution	Researcher inst. where xxxxx is/was performed	Year	Title	Position in Projects	Fund (euro)	Source website grant listed
European Commission	University of Cagliari	2014	ECOST-STSM-BM1101-	Collaborator	30.000,00	xxxxx://x-
			020514-043037			xxxxxxxx.xxxx.xx/xxxx
			Grant, Dystonia Europe
			(Brussels, Belgium, BE)
			National and Regional
			Grants
Fondazione di	University of Cagliari	2013	Studio dei riflessi	Coordinator	15.000,00	xxxxx://xxx.xxxxxxxx
Sardegna			cardiovascolari in pazienti			xxxxxxxxxxxx.xx/xxxx
			sardi affetti da Malattia di			a/0/92900676841104
			Parkinson e loro			/bilancio_consuntivo_
			correlazione con disturbi			2013.pdf
			motori e non motori
Fondazione di	Dipartimento di Sanità Pubblica,	2014	Ballo sardo e Malattia di	Coordinator	20.000,00	xxxxx://xxx.xxxxxxxx
Sardegna RAS	Medicina Clinica e Molecolare		Parkinson: studio			xxxxxxxxxxxx.xx/xxxx
	(CA)2014		dell'efficacia di un approccio			a/0/75531339243035
			terapeutico non			/bilancio_consuntivo_
			farmacologico sulla riabilitazione motoria e sui			2014.pdf
			sintomi non motori di
			malattia

2.3 Research Collaborators n. 2

Last Name: xxxxxxxxxx

First Name: xxxxxx

Last name at birth:

Gender: M

Title: Principal Collaborator, recruiting patients and responsible of neuropathology studies

Nationality: italiana

Date of birth: 13/07/1978

Official H index (Scopus or Web of Science): 9.0

Country of residence: ITALY Country of Birth: ITALY Place of Birth: milano

Scopus Author Id:26644855700 ORCID ID:0000-0003-2262-8811 RESEARCH ID:J-9209-2016

Contact address

Current organisation name: Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico

Current Department / Faculty / Institute / Laboratory name: Dipartimento di Fisiopatologia Medico-Chirurgica e dei Trapianti

Street: Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico Istituto di Ricovero e Cura a Carattere Scientifico di natura pubblica xxx Xxxxxxxxx Xxxxxx, 00

Postcode / Cedex: 20122 Town: milano

Phone:x000000000000 Phone 2:

Education / training
Educational institution and location	Degree	Field of study	From year	To year
University of Pavia	PhD	Public Health	2007	2011
University of Pavia	Specialization / Specializzazione	Specialty in Neurology	2003	2007
University of Milan	Single-cycle master's degree / Laurea magistrale a ciclo unico	Medicine and Surgery	1997	2003

Personal Statement:

Graduated in Medicine and Surgery in 2003 at the University of Milan, he obtained his specialization in Psychiatry in 2007 at the University of Pavia with a thesis on Borderline Personality Disorder, collaborating, during the specialty, with the Interdepartmental Research Center on Personality Disorders.

Since August 2016 he has been working as a Psychiatric Medical Director at Fondazione IRCCS Cà Granda Ospedale Maggiore Policlinico di Milano - Department of Neuroscience and Mental Health - UOC Psychiatry. He has done clinical work in SPDC, CPS, is currently responsible for the medical coordination of the High-Assistance Rehabilitation Community including ALS patients in Xxx Xxxxxxxxx 00.

Positions and honors

Positions
Institution	Division / Research group	Location	Position	From year	To year
Fondazione Cà Granda Ospedale Maggiore Policlinico, Milan	Neuroscience	Milan, IT	Psychiatrist	2016	2013

Other awards and honors

None

Grant
Funded by Institution	Researcher inst. where xxxxx is/was performed	Year	Title	Position in Projects	Fund (euro)	Source website grant listed
NA	NA	NA	NA	Collaborator	0,00	NA

2.4 Research Collaborators n. 3

Last Name: Comi

First Name: Xxxxxxx Xxxxxx

Last name at birth:

Gender: M

Title: Principal collaborator, Coordinator of UO2

Nationality: Italiana

Date of birth: 07/11/1958

Official H index (Scopus or Web of Science): 75.0

Country of residence: ITALY Country of Birth: ITALY Place of Birth: BERGAMO

Scopus Author Id:7201788293 ORCID ID:0000-0002-1383-5248 RESEARCH ID:K-5702-2016

Contact address

Current organisation name: Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico

Current Department / Faculty / Institute / Laboratory name: Dipartimento di Fisiopatologia Medico-Chirurgica e dei Trapianti

Street: xxx Xxxxxxxxx Xxxxxx 00

Postcode / Cedex: 20122 Town: MILANO

Phone:x000000000000 Phone 2: 0000000000

Education / training
Educational institution and location	Degree	Field of study	From year	To year
University of Milan, Milan, Italy	Specialization / Specializzazione	Neurology	1985	1989
University of Milan, Italy	Single-cycle master's degree / Laurea magistrale a ciclo unico	Medicine and Surgery	1979	1985

Personal Statement:

Our project aims to assess the role of Human endogenous retrovirus K and its impact on the propagation of TDP-43 proteinopathy from pre-clinical models to clinical stages. Professor Xxxx'x expertise in neuromuscular and neurodegenerative disorders, coupled with his experience in clinical medicine and research, provides a unique perspective for innovative translational research. The Neurogenetic Lab, which he directs, is renowned internationally for its neurogenomic and translational studies. With over 40 clinical trials, specifically for neuromuscular diseases, he brings extensive experience to the project and will oversee the molecular analysis and review the overall project.

Positions and honors

Positions
Institution	Division / Research group	Location	Position	From year	To year
I.R.C.C.S. Ca Granda Ospedale	UOSD Malattie Neuromuscolari e Rare	Neuromuscolari e Rare Milano Italy	Director	2018	2023
University of Milan	Department of Pathophysiology and Transplantation	Milan, Italy	Full Professor of Neuroology	2019	2023
Foundation I.R.C.C.S. Foundation Ca Granda Maggiore Hospital	Neuropediatric Unit Milan	Milan Italy	Director	2013	2016
Foundation X.X.X.X.X. Xx Xxxxxx Xxxxxxxx Xxxxxxxx Xxxxxxxxxxx Xxxxxxxx	Xxxxx Xxxxxx Xxxxxx Xxxxx, Xxxxx Director of Motor Neuron Center outpatient service	Milan	Director	2012	2018
Foundation X.X.X.X.X. Xx Xxxxxx Xxxxxxxx Xxxxxxxx Xxxxxxxxxxx Xxxxxxxx	Xxxxxxxxx Xxxx Xxxxx	Xxxxx, Xxxxx	Neurologist	1997	2018
University of Milan Faculty of Medicine	Faculty of Medicine Xxxxx	Xxxxx, italy	Associate Professor of Neurology	2002	2018
University of Milan	Genetic and biochemistry Lab	Milan Italy	Director	1997	2002

Other awards and honors

President of Italian Association of Myology

Member of the Society for Neuroscience, European Academy of Neurology, Italian neurological Society Vice-Director of the "Xxxx Xxxxxxx Center for the Neuromuscular and Neurodegenerative disorders

Grant
Funded by Institution	Researcher inst. where xxxxx is/was performed	Year	Title	Position in Projects	Fund (euro)	Source website grant listed
Ministero della salute	Fondazione IRCCS Ca' Granda	2018-	A novel stem cell therapy for	Coordinator	431.587,00	xxxxx://xxx.xxxxxx.xx
	Ospeedale Maggiore Policlinico	2023	Amyotrophic Lateral			x.xx/xxxxxxx/xxxxxxxXx
			Sclerosis targeting upper			nitaria/homeRicerca
			motor neurons			Sanitaria.jsp
FRRB	Fondazione IRCCS Ca' Granda	2018-	ITF-Becker: nuovo	Coordinator	914.041,00	xxxxx://xxx.xxxx.xx/
	Ospedale Maggiore Policlinico	2021	approccio terapeutico alla
			distrofia muscolare di
			Xxxxxx (DMB) 914.041,62
FRRB	Fondazione IRCCS Ca' Granda	2017-	Translating molecular	Collaborator	278.880,00	xxxxx://xxx.xxxx.xx/
	Ospedale MAggiore Policlinico	2020	mechanisms to ALS risk
			and patient¿s well-being
			(TRANS-ALS), Durata:
			2017- 2020, Budget:
			278.880€

Funded by Institution	Researcher inst. where xxxxx is/was performed	Year	Title	Position in Projects	Fund (euro)	Source website grant listed
Fondazione Telethon	Università degli Studi di Milano	2015-	Gene therapy and long term	Collaborator	225.720,00	xxxxx://xxx.xxxxxxxx.x
		2019	evaluation of different			t/cosa-
			dietary regimens in a			facciamo/ricerca/pro
			Glycogen Storage Disease			getti-
			Type III KO mouse model			finanziati/?gclid=Cj0
						KCQjwsdiTBhD5ARI
						sAIpW8CK6oLvJwY
						NwcvotPgKSG2jNn6
						VWQVDhuNAYG_-
						cHKPgic_S2qmgHoE
						aAkjmEALw_wcB
Ministero della Salute	Fondazione IRCCS Ca' Granda	2016-	ALS and FTD: changing	Collaborator	106.000,00	xxxxx://xxx.xxxxxx.xx
	Ospedale Maggiore Policlinico	2019	paradigms in the genotype-			x.xx/xxxxxxx/xxxxxxxXx
			phenotype correlation due			nitaria/homeRicerca
			to C9orf72 and other gene			Sanitaria.jsp
			characterization
Ministero della Salute	Fondazione IRCCS Ca' Granda	2015-	Optimized transplantation of	Coordinator	100.000,00	xxxx://xxx.xxx-
	Xxxxxxxx Xxxxxxxx Xxxxxxxxxxx	0000	hIPSC derived			xxxxxxxx.xxx/
			LEX+CXCR4+VLA4+ neural
			stem cells as a therapy for
			SMARD1
Telethon	UOC Neurologia - IRCCS	2016-	Long term natural history in	Collaborator	18.000,00	xxxx://xxx.xxxxx
	Fondazione Cà Granda Ospedale	2019	Duchenne muscular			xxx.xx/xxxxxxxxxxxxxxx/
	Maggiore Policlinico di Milano		dystrophy			progetti -
						finanziati/dettagl
						i/developmentof- a-
						registryand-
						adatabase- for-
						anation-
						wideitaliancollaborati
						ve
Telethon	Dipartimento di Scienze	2014-	Complete molecular	Collaborator	8.000,00	xxxx://xxx.xxxxx
	Neurologiche UNIMI, via X. Xxxxxx	2016	characterization of patients			xxx.xx/xxxxxxxxxxxxxxx/
	35 Milan Italy		affected by congenital			progetti -
			muscular dystrophies.			finanziati/dettagl
						i/completemolecularc
						haracterization -of-
						patientsaffected-
						bycongenitalmuscula
						rdystrophies
Telethon	Dipartimento di Scienze	2012-	Development of a registry	Collaborator	13.000,00	xxxx://xxx.xxxxx
	Neurologiche, UNIMI, via X. Xxxxxx	2014	and a database for a nation-			xxx.xx/xxxxxxxxxxxxxxx/
	35 00000 Xxxxx, Xxxxx		wide Italian collaborative			progetti -
			network on congenital			finanziati/dettagl
			muscular dystrophy			i/completemolecularc
						haracterization -of-
						patientsaffected-
						bycongenitalmuscula
						rdystrophies

Funded by Institution	Researcher inst. where xxxxx is/was performed	Year	Title	Position in Projects	Fund (euro)	Source website grant listed
Telethon	Fondazione IRCCS Ca' Granda	2011-	Clinical and laboratory	Coordinator	23.000,00	xxxxx://xxx.xxxxxxxx.x
	Xxxxxxxx Xxxxxxxx Xxxxxxxxxxx	0000	network for LGMD			t/cosa-
			diagnosis, in view of a			facciamo/ricerca/pro
			national registry			getti-
						finanziati/?gclid=Cj0
						KCQjwsdiTBhD5ARI
						sAIpW8CKRsQqPw_
						uJ6klc0cbH5uAH8B1
						MLbig9NZL0UcqBjjJ
						gKi7bY1JyUMaAoZ8
						EALw_wcB

2.5 Research Collaborators n. 4

Last Name: XXXXX

First Name: XXXXXXXXX XXXXX XXXXXXXXX

Last name at birth:

Gender: F

Title: Principal Collaborator, biomarker detection

Nationality: Italiana

Date of birth: 30/10/1979

Official H index (Scopus or Web of Science): 34.0

Country of residence: ITALY Country of Birth: ITALY Place of Birth: Milano

Scopus Author Id:7003740045 ORCID ID:0000-0001-8974-9453 RESEARCH ID:K-5739-2016

Contact address

Current organisation name: Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico

Current Department / Faculty / Institute / Laboratory name: Dipartimento di Fisiopatologia Medico-Chirurgica e dei Trapianti

Street: Xxx Xxxxxxxxx Xxxxxx 00

Postcode / Cedex: 20122 Town: Milano

Phone:00393384716331 Phone 2: x000000000000

Education / training
Educational institution and location	Degree	Field of study	From year	To year
University of Milan	Single-cycle master's degree / Laurea magistrale a ciclo unico	Medicine and Surgery	1998	2004
University of Milan	Specialization / Specializzazione	Neurology	2004	2009

Personal Statement:

Briefly indicate the overall goals of the project and responsabilities of the key person identified on the Biographical Sketch The program's ultimate objective is to create and apply innovative biomarkers for SMA patients, and Dr. Magri's expertise in the clinical setting makes her well-suited to explore the potential of molecular markers for prognosis assessment. Dr. Xxxxx has participated in multiple clinical trials for neuromuscular disorders, and her primary contribution to the project will involve analyzing and interpreting profiling data sets as well as conducting in vitro experiments. Her previous research and clinical training align perfectly with the investigations she is involved in, setting the stage for successful execution.

Positions and honors

Positions
Institution	Division / Research group	Location	Position	From year	To year
Fondazione IRCSS Cà Granda Ospedale Maggiore Policlinico	Neurology Unit	Milan, IT	Clinical and research contract	2009	2012
University of Milan	Department of Pathophysiology and Transplant	Milan, IT	Researcher	2012	2015
Fondazione IRCSS Cà Granda Ospedale Maggiore Policlinico	Neurology Unit	Milan, IT	Neurologist	2015	2023

Other awards and honors

2011 World muscle society award best research in SMA Member of Italian Association of Myology

Grant
Funded by Institution	Researcher inst. where xxxxx is/was performed	Year	Title	Position in Projects	Fund (euro)	Source website grant listed
Telethon	Fondazione Cà Grande Ospedale	2022-	Natural History of Becker	Collaborator	25.000,00	Xxxxx://xxxxxx...faccia
	Maggiore Policlinico	2025	Muscle distribution: in			mo/ricerca/pr...finanz
			preparation for future clinical			iati/storia-naturale-
			studies			della-distrofia-
						muscolare-di-becker-
						in preparazione-di-
						studi-clinici
Telethon	Fondazione Ca Granda Ospedale	2021-	Characterization of Patients	Collaborator	20.000,00	xxxxx://xxx.xxxxxx..fa
	Maggiore Policlinico	2024	with Duchenne muscular			cciamo/ricerca/pr...fin
			dystrophy who have lost the			anziati/Caratterizzazi
			ability to walk			one di pazienti che
						hanno perso la
						capacità di
						camminare

2.6 Research Collaborators n. 5

Last Name: COGIAMANIAN

First Name: XXXXXXX XXXXX

Last name at birth:

Gender: M

Title: Principal Collaborator, human samples, neuropathology

Nationality: Italiana

Date of birth: 26/01/1974

Official H index (Scopus or Web of Science): 28.0

Country of residence: ITALY Country of Birth: ITALY Place of Birth: LEGNANO

Scopus Author Id:23472580600 ORCID ID:0000-0001-7810-5281 RESEARCH ID:AAC-5217-2022

Contact address

Current organisation name: Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico

Current Department / Faculty / Institute / Laboratory name: Dipartimento di Fisiopatologia Medico-Chirurgica e dei Trapianti

Street: via X. Xxxxxx 35

Postcode / Cedex: 20122 Town: MILANO

Phone:x000000000000 Phone 2:

Education / training
Educational institution and location	Degree	Field of study	From year	To year
University of Milan: Milan, IT	Single-cycle master's degree / Laurea magistrale a ciclo unico	medical doctor	1993	1999
University of Milan: Milan, IT	Specialization / Specializzazione	Specialist in Neurology	2001	2005

Personal Statement:

I am involved in neurophysiological diagnostics and movement disorders with a focus on Parkinson's Disease and ALS. Over the years, my interest has focused on brain stimulation methods of both non-invasive (transcranial and direct current spinal cord stimulation, tDCS/tsDCS) and invasive (deep brain stimulation, DBS) types. In the project I will be involved in data collection and neuropathological analysis.

Positions and honors

Positions
Institution	Division / Research group	Location	Position	From year	To year
Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico: Milan, Lombardia, IT	Department of Neuropathophysiology	Milan, Lombardia, IT	medical doctor (Department of Neuropathophysiology)	2006	2023

Other awards and honors

2000 research fellow-ship on "Study of the role played by apoptosis in the regulation of inflammatory and regenerative

processes in the peripheral nervous system"

2005 research fellowship on "Mechanisms of action of transcranic stimulation with DC currents and clinical applications in dementia"

Co-inventor of patent No. 11/766,401 titled ""Process for reducing neuromuscular fatigue caused by exercise" Invited speaker in different national scientific meetings

Grant
Funded by Institution	Researcher inst. where xxxxx is/was performed	Year	Title	Position in Projects	Fund (euro)	Source website grant listed
NA	NA	NA	NA	Collaborator	0,00	NA

2.7 Research Collaborators n. 6 - Under 40

Last Name: Frau

First Name: Xxxxxxx

Last name at birth:

Gender: F

Title: Principal Collaborator, Recruitment, follow up and analysis of ALS patients

Nationality: Italiana

Date of birth: 09/08/1989

Official H index (Scopus or Web of Science): 2.0

Country of residence: ITALY Country of Birth: ITALY Place of Birth: Cagliari

Scopus Author Id:57236727200 ORCID ID:0009-0006-0140-8034 RESEARCH ID:IAQ-6850-2023

Contact address

Current organisation name: Azienda Ospedaliera Universitaria di Sassari

Current Department / Faculty / Institute / Laboratory name: XXXXXXX XXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXX XX XXXXXXX, Xxxxx

Street: Xxxxx Xxx Xxxxxx 00 Xxxxxxx

Postcode / Cedex: 07100 Town: Sassari

Phone:x000000000000 Phone 2:

Education / training
Educational institution and location	Degree	Field of study	From year	To year
University of Cagliari	Specialization / Specializzazione	Neurology, thesis title: ¿Ecografia parenchimale cerebrale nella pratica clinica: studio retrospettivo ultrasonografico di una popolazione di pazienti affetti da sindrome parkinsoniana	2016	2020
University of Cagliari	Single-cycle master's degree / Laurea magistrale a ciclo unico	Medicine / Neurology	2008	2015

Personal Statement:

Xxxxxxx Xxxx is a resident Neurologist that works on Parkinson and ALS.She is also at the last year of the PhD in Life Sciences and Biotechnologies with a topic thesis on ALS. Her contribution to the

Positions and honors

Positions
Institution	Division / Research group	Location	Position	From year	To year
University of Sassari	Biomedical Sciences, PhS in Life Sciences and Biotechnologies	Sassari, IT	PhD student third year	2020	2023
Azienda Ospedaliera Universitaria, Sassari	Neurology	Sassari	Dirigente medico	2022	2023

Other awards and honors

2022. Speaker at 29° Congresso Nazionale SINV: Patologia vascolare e degenerativa cerebrale. San Benedetto del Tronto (AP). La Malattia di Parkinson e i Parkinsonismi

2021 Speaker at Malattie neurologiche e depressione: dalla clinica al trattamento. ¿Depressione e stroke¿. University of Sassari, Italy

Grant
Funded by Institution	Researcher inst. where xxxxx is/was performed	Year	Title	Position in Projects	Fund (euro)	Source website grant listed
NA	NA	NA	NA	Collaborator	0,00	NA

2.8 Research Collaborators n. 7 - Under 40

Last Name: Xxxxxxxxx

First Name: Xxxxx

Last name at birth:

Gender: F

Title: Principal Collaborator, data collection

Nationality: italiana

Date of birth: 22/09/1984

Official H index (Scopus or Web of Science): 10.0

Country of residence: ITALY Country of Birth: ITALY Place of Birth: Morbegno

Scopus Author Id:55312195200 ORCID ID:0000-0003-3659-1220 RESEARCH ID:Z-1818-2019

Contact address

Current organisation name: Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico

Current Department / Faculty / Institute / Laboratory name: Dipartimento di Fisiopatologia Medico-Chirurgica e dei Trapianti

Street: via X. Xxxxxx 35,

Postcode / Cedex: 20122 Town: Milano

Phone:x000000000000 Phone 2:

Education / training
Educational institution and location	Degree	Field of study	From year	To year
Università di Milano	Specialization / Specializzazione	Neurology, thesis on Parkinson disease	2011	2016
Università di Milano	Single-cycle master's degree / Laurea magistrale a ciclo unico	Neurology	2004	2010

Personal Statement:

Xxxxx Xxxxxxxxx is a Neurologist with a background in neurodegenative diseases including Parkinson and ALS. As a co- adjuvant for this project, her role is to assist in establishing the involvement of retroviruses in TDP43 pathology, with a particular focus on collecting and analyzing clinical and biological data.

Positions and honors

Positions
Institution	Division / Research group	Location	Position	From year	To year
Fondazione Ospedale Maggiore Policlinico, IRCSS, Milano	Neurofisiopathology Unit	Milan	Clinician	2017	2023
Università di Milano	Unità di Neurofisopatologia, Fondazione Ospedale Maggiore Policlinico, IRCSS	Milan, IT	Contract of collaboration	2017	2017

Other awards and honors

Invited Speaker at different National and International Neurology Meetings

Grant
Funded by Institution	Researcher inst. where xxxxx is/was performed	Year	Title	Position in Projects	Fund (euro)	Source website grant listed
NA	NA	NA	NA	Collaborator	0,00	NA

2.9 Additional Research Collaborators n. 2 - Under 40 to hire

Last Name: NOLI

First Name: XXXXX

Last name at birth:

Gender: F

Title: Additional collaborator. Analysis of HERVs expression, TDP43

Nationality: Italiana

Date of birth: 19/04/1994

Official H index (Scopus or Web of Science): 3.0

Country of residence: ITALY Country of Birth: ITALY Place of Birth: Ozieri

Scopus Author Id:57254018400 ORCID ID:0000-0003-1087-4871 RESEARCH ID:AHD-2616-2022

Contact address

Current organisation name: Azienda Ospedaliera Universitaria di Sassari

Current Department / Faculty / Institute / Laboratory name: XXXXXXX XXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXX XX XXXXXXX, Xxxxx

Street: Xxxxx Xxx Xxxxxx 00x

Postcode / Cedex: 07100 Town: Sassari

Phone:x000000000000 Phone 2:

Education / training
Educational institution and location	Degree	Field of study	From year	To year
University of Sassari, Sassari	Master's Degree / Laurea Magistrale	Medical and veterinary Biotechnology	2018	2020

Personal Statement:

Xxxxx Xxxx is at third year of the PhD in Life Sciences and Biotechnologies of the University of Sassari. She will conclude the PhD in in October. Her project is about the immune response in autoimmune diseases, the influence of infectious diseases and deregulation of HERVs expression. She will be responsible for the expression of HERV-K in patients and in animal models

Positions and honors

Positions
Institution	Division / Research group	Location	Position	From year	To year
University of Sassari	Biomedical Sciences, Life Sciences and biotechnologies	Sassari, IT	Last year PhD Student	2020	2023

Other awards and honors

presentation at Cost action meeting on Parkinson, Istanbul March 2023

Grant
Funded by Institution	Researcher inst. where xxxxx is/was performed	Year	Title	Position in Projects	Fund (euro)	Source website grant listed
NA	NA	NA	NA	Collaborator	0,00	NA

2.10 Additional Research Collaborators n. 3 - Under 40 to hire

Last Name: XXXXXXXXX

First Name: XXXXX

Last name at birth:

Gender: F

Title: Additional collaborator. Analysis of xxXXX in ALS patients,

Nationality: ITALIANA

Date of birth: 25/10/1990

Official H index (Scopus or Web of Science): 9.0

Country of residence: ITALY Country of Birth: ITALY Place of Birth: Bari

Scopus Author Id:57200126382 ORCID ID:0000-0001-8460-938X RESEARCH ID:AAD-6240-2021

Contact address

Current organisation name: Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico

Current Department / Faculty / Institute / Laboratory name: Dipartimento di Fisiopatologia Medico-Chirurgica e dei Trapianti

Street: Xxx Xxxxx xxx Xxxxxxx, 0

Postcode / Cedex: 20135 Town: Milano

Phone:x000000000000 Phone 2:

Education / training
Educational institution and location	Degree	Field of study	From year	To year
Vita-Salute San Xxxxxxxx Xxxxxxxxxx	Single-cycle master's degree / Laurea magistrale a ciclo unico	Medicine and Surgery	2009	2015
Università degli Studi di Milano	Specialization / Specializzazione	Resident in Neurology	2016	2020

Personal Statement:

As a part of a group with great expertise in motor neuron disease and translational medicine, I am excited to be part of this innovative study, which aims to investigate pathogenic mechanisms underlying ALS and to develop novel biomarkers through omics analysis. I have been working on in vitro ALS models and I have expertise in analysis of wet biomarkers in patients with ALS. My responsibilities include conducting extensive research to study pathogenesis and test therapeutics in ALS and to identify potential biomarkers, useful for monitoring disease course and therapeutic response.

Positions and honors

Positions
Institution	Division / Research group	Location	Position	From year	To year
University of Milan	Department of Pathophysiology and Transplantation	Milan, Italy	PhD Student	2020	2023
XXXX Xxxxxxxx Xxxxxxxx xxx Xxxxxxxxx xxx Xxxxxxxxxxxx	Xxxxxxxxxxxx Xxxx	Xxxxxx, XX	Observer Honorary Clinical Fellow	2022	2023
Queen Xxxx Xxxxxxxxxx of London ¿ UCL Queen Square Institute of Neurology	Xxxxxxx Xxxxxx Research Institute, Barts and The London School of Medicine and Dentistry ¿ Department of Neuromuscular Diseases	London, UK	Clinical Research Fellow in Neurogenetics	2022	2023
University of Milan	Department of Pathophysiology and Transplantation	Milano	Resident in Neurology	2016	2020

Other awards and honors

2017: Best oral communication at Giornata dello Specializzando. 2018: EAN Investigator Award 2018 for the best oral presentation.

2021: Member of Editorial Board for the NMD and peripheral neurology section of BMC Neurology journal. 2022: Editor for the NMD and Peripheral Neuropathies section of Frontiers in Neurology journal

2023: Final candidate at EAN Tournament Finals Member of scientific societies (EAN, SIN, AIM, Xxxxx)

Grant
Funded by Institution	Researcher inst. where xxxxx is/was performed	Year	Title	Position in Projects	Fund (euro)	Source website grant listed
NA	NA	NA	NA	Collaborator	0,00	NA

2.11 Additional Research Collaborators n. 4 - Under 40 to hire

Last Name: FAIS

First Name: MILENA

Last name at birth: FAIS

Gender: F

Title: Additional collaborator. Drosophila model and molecular studies

Nationality: Italiana

Date of birth: 22/06/1986

Official H index (Scopus or Web of Science): 4.0

Country of residence: ITALY Country of Birth: ITALY Place of Birth: Sassari

Scopus Author Id:57197812086 ORCID ID:0000-0002-4901-4521 RESEARCH ID:IAQ-4346-2023

Contact address

Current organisation name: Azienda Ospedaliera Universitaria di Sassari

Current Department / Faculty / Institute / Laboratory name: XXXXXXX XXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXX XX XXXXXXX, Xxxxx

Street: Viale San Xxxxxx

Postcode / Cedex: 07100 Town: Sassari

Phone:x000000000000 Phone 2:

Education / training
Educational institution and location	Degree	Field of study	From year	To year
PhD in Life Sciences and Biotechnologies, University of Sassari, SAssari	PhD	Thesis Title: "Parkinson's disease and vesicular trafficking: from molecular pathological mechanism to a therapeutic option"	2018	2021
University of Sassari	PhD	Molecular Biology	2018	2021
MS - Magistrale in Biologia Sperimentale e Applicata Università degli studi di Xxxxxxx, 0000	Master's Degree / Laurea Magistrale	Biology	2014	2016

Personal Statement:

The scientific activity of Xxxxxx Xxxxxx characterized by a solid background in molecular biology. She will be responsible for cell line cultures, protein expression study (Western Blot), gene expression study (RT-PCR), Immunoprecipitation (IP), cell viability assays, Flow cytofluorimetry (Cell cycle and apoptosis), assays of cell growth (Colony formation assay), molecular cloning, adenovirus transfection and transduction and Drosophila model of ALS disease.

Positions and honors

Positions
Institution	Division / Research group	Location	Position	From year	To year
University of Sassari	Scienze Biomediche	Sassari	Borsista	2022	2022

Other awards and honors

2018 Borsa si studio PON Ricerca e Innovazione: Dottorati Innovativi con caratterizzazione Industriale

Grant
Funded by Institution	Researcher inst. where xxxxx is/was performed	Year	Title	Position in Projects	Fund (euro)	Source website grant listed
NA	NA	NA	NA	Collaborator	0,00	NA

2.17 Expertise Research Collaborators

Selected peer-reviewed publications of the Research Group / Collaborators
Collaborato	Title	Type	Pag	Vol	Year	DOI	PMID	Cit.**	P.*
xxxxxxxxxx xxxxxx	Association between serum BDNF levels and maternal perinatal depression: A review: Special Section on ¿Translational and Neuroscience Studies in Affective Disorders¿ Section Editor, Xxxxx Xxxxxx MD, PhD.	Article	271-276	261	2020	10.1016/j.jad.2019.08.00 7	31416610	10	O
xxxxxxxxxx xxxxxx	Xxxxxxxxxxx and character influence on depression treatment outcome	Article	464-474	252	2019	10.1016/j.jad.2019.04.03 1	31005789	20	O
xxxxxxxxxx xxxxxx	The impact of BDNF Val66Met polymorphism on cognition in Bipolar Disorder: A review: Special Section on ¿Translational and Neuroscience Studies in Affective Disorders¿	Review	552-558	243	2019	10.1016/j.jad.2018.07.05 4	30078664	25	O
xxxxxxxxxx xxxxxx	Association between low- activity allele of cathecolamine-o-methyl- transferase (COMT) and borderline personality disorder in an italian population	Article	25-8	00(0)	0000	00.0000/08964289.2012. 722134	23668908	9	F
xxxxxxxxxx xxxxxx	Pharmacological properties of cannabidiol in the treatment of psychiatric disorders: A critical overview	Article	327-335	27(4)	2018	10.1017/S20457960180 00239	29789034	42	O
Xxxx Xxxxxxx Xxxxxx	CHCHD10 mutations in Italian patients with sporadic amyotrophic lateral sclerosis	Article	e372	138(Pt 8)	2015	10.1093/brain/awu384	25576308	57	L
Xxxx Xxxxxxx Xxxxxx	Mutations in DNA2 link progressive myopathy to mitochondrial DNA instability	Article	293-300	92(2)	2013	10.1016/j.ajhg.2012.12.0 14	23352259	104	L
COGIAMANIA N XXXXXXX XXXXX	Xxxxxxxx deep brain stimulation in a freely moving parkinsonian patient	Article	1003-5	30(7)	2015	10.1002/mds.26241	25999288	152	O
COGIAMANIA N XXXXXXX XXXXX	Xxxxxxxxxx and Motor Cortical Transcranial Stimulation Decrease Levodopa-Induced Dyskinesias in Parkinson¿s Disease	Article	43-47	00(0)	0000	00.0000/s12311-015- 0737	26542731	80	O
COGIAMANIA N XXXXXXX XXXXX	Eight-hours adaptive deep brain stimulation in patients with Parkinson disease	Article	e971- e976	00(00)	0000	00.0000/WNL.00000000 00005121	29444973	123	O

Collaborato	Title	Type	Pag	Vol	Year	DOI	PMID	Cit.**	P.*
COGIAMANIA N XXXXXXX XXXXX	Xxxx-lead edema after deep brain stimulation surgery for Parkinson's disease: a prospective magnetic resonance imaging study	Article	533-539	26(3)	2019	10.1111/ene.13852	30358915	20	L
FAIS MILENA	12-O-tetradecanoylphorbol-13- acetate and EZH2 inhibition: A novel approach for promoting myogenic differentiation in embryonal rhabdomyosarcoma cells	Article	2360- 2365	233(3)	2018	10.1002/jcp.26107	28722764	13	O
FAIS MILENA	Levetiracetam treatment ameliorates LRRK2 pathological mutant phenotype	Article	8505- 8510	23(12)	2019	10.1111/jcmm.14674	31560168	4	O
FAIS XXXXXX	Xxxxxxxxx¿s disease-related genes and lipid alteration	Article	0000	00(00)	0000	00.0000/ijms22147630	34299248	13	F
Xxxxxxxxx Xxxxx	Etiology of first-ever ischaemic stroke in European young adults: The 15 cities young stroke study	Article	1431-9.	00(00)	0000	00.0000/ene.12228	23837733	128	O
Xxxxxxxxx Xxxxx	Mutational analysis of COQ2 in patients with MSA in Italy	Article	213.e1- 213.e2	45	2016	10.1016/j.neurobiolaging .2016.05.022	27394078	18	O
Xxxxxxxxx Xxxxx	Xxxx-lead edema after deep brain stimulation surgery for Parkinson's disease: a prospective magnetic resonance imaging study	Article	533-539	26(3)	2019	10.1111/ene.13852	30358915	00	X
XXXXX XXXXXXXXX XXXXX XXXXXXXXX	Xxxxxxxxx XXXx in Duchenne and Xxxxxx muscular dystrophies: role in pathogenesis and future prognostic and therapeutic perspectives	Review	4299- 4313	77(21)	2020	10.1007/s00018-020- 03537-4	32350552	14	O
XXXXX XXXXXXXXX XXXXX XXXXXXXXX	The italian limb girdle muscular dystrophy registry: Relative frequency, clinical features, and differential diagnosis	Article	55-68	00(0)	0000	00.0000/mus.25192	27184587	62	F
XXXXX XXXXXXXXX XXXXX XXXXXXXXX	SOD1 misplacing and mitochondrial dysfunction in amyotrophic lateral sclerosis pathogenesis	Article	336	9	2015	10.3389/fncel.2015.0033 6	26379505	88	O
XXXXX XXXXXXXXX XXXXX XXXXXXXXX	Xxxxxxxx treatment of patients with nonsense mutation dystrophinopathy	Article	477-87	50(4)	2014	10.1002/mus.24332	25042182	310	O
XXXXX XXXXXXXXX XXXXX XXXXXXXXX	Xxxxxxxxx in DNA2 link progressive myopathy to mitochondrial DNA instability	Article	293-300	92(2)	2013	10.1016/j.ajhg.2012.12.0 14	23352259	104	O

Collaborato	Title	Type	Pag	Vol	Year	DOI	PMID	Cit.**	P.*
XXXXX XXXXX	XXXX-K Modulates the Immune Response in ALS Patients	Article	0000	0(0)	0000	00.0000/microorganisms 9081784	34442863	10	O
XXXXX XXXXX	Xxx¿43 and herv¿k envelope¿specific immunogenic epitopes are recognized in als patients	Article	0000	00(00)	0000	00.0000/v13112301	34835107	6	O
XXXXX XXXXX	Xxxxxxxx features and outcomes in CNS demyelinating disorders: Comparison between multiple sclerosis, MOGAD, and AQP4- IgG-positive NMOSD	Article	1011579	13	2023	10.3389/fneur.2022.101 1579	36419536	2	O
XXXXX XXXXX	Xxxxxxxxx Impairment Correlates with Executive Functions Disorders and Other Specific Cognitive Dysfunctions in Parkinson¿s Disease	Article	112.	00(0)	0000	00.0000/biology1201011 2	36671804	2	F
XXXXX XXXXX	Xxxxxxxxxx encephalitis misdiagnosis and mimics	Review	578071	378	2023	10.1016/j.jneuroim.2023. 578071	36989703	0	O
XXXX XXXXX	Increased Presence of Antibodies against Type I Interferons and Human Endogenous Retrovirus W in Intensive Care Unit COVID-19 Patients	Article	e0128022	00(0)	0000	00.0000/spectrum.01280 -22	35852349	5	O
XXXX XXXXX	HERV-K and HERV-H Env Proteins Induce a Humoral Response in Prostate Cancer Patients	Article	00	00(0)	0000	00.0000/pathogens1101 0095	35056043	8	O
FAIS MILENA	Cyanobacteria, cyanotoxins, and neurodegenerative diseases: Dangerous liaisons	Review	0000	00(00)	0000	00.0000/ijms22168726	34445429	19	O
FAIS MILENA	HDAC1 inhibition ameliorates TDP-43-induced cell death in vitro and in vivo	Article	000	00(0)	0000	00.0000/s41419-020- 2580-3	32409664	24	O
XXXXXXXXX XXXXX	Extracellular vesicles and amyotrophic lateral sclerosis: from misfolded protein vehicles to promising clinical biomarkers	Article	561-572	78(2)	2020	10.1007/s00018-020- 03619-3	32803397	27	F
XXXXXXXXX XXXXX	Time Is Motor Neuron: Therapeutic Window and Its Correlation with Pathogenetic Mechanisms in Spinal Muscular Atrophy	Review	6307- 6318	55(8)	2018	10.1007/s12035-017- 0831-9	29294245	39	O
XXXXXXXXX XXXXX	Structural brain connectome and cognitive impairment in Parkinson disease	Article	515-525	283(2)	2017	10.1148/radiol.20161602 74	27924721	64	O

Collaborato	Title	Type	Pag	Vol	Year	DOI	PMID	Cit.**	P.*
Xxxx Xxxxxxx	Xxxxxxxxx Impairment Correlates with Executive Functions Disorders and Other Specific Cognitive Dysfunctions in Parkinson¿s Disease	Article	000	00(0)	0000	00.0000/biology1201011 2	36671804	2	O
Xxxx Xxxxxxx	Xxxx-k modulates the immune response in als patients	Article	0000	0(0)	0000	00.0000/microorganisms 9081784	34442863	10	O
Xxxx Xxxxxxx Xxxxxx	Genome-wide Analyses Identify KIF5A as a Novel ALS Gene	Article	1268- 1283.e6	00(0)	0000	00.0000/j.neuron.2018.0 2.027	29566793	355	O
Xxxx Xxxxxxx Xxxxxx	Exome sequencing in amyotrophic lateral sclerosis identifies risk genes and pathways	Article	1436-41.	000(0000)	0000	00.0000/science.aaa365 0	25700176	679	O
Xxxx Xxxxxxx Xxxxxx	Xxxxxxxx versus warfarin in patients with atrial fibrillation	Article	2093-104	369(22)	2013	10.1056/NEJMoa131090 7	24251359	3647	O
COGIAMANIA N XXXXXXX XXXXX	Evidence-based guidelines on the therapeutic use of transcranial direct current stimulation (tDCS)	Article	56¿00	000(0)	0000	00.0000/j.clinph.2016.10 .087	27866120	906	O
Xxxx Xxxxxxx	Association between olfactory dysfunction and motor subtypes in Parkinson's disease: are non-tremor- dominant subtypes really uncorrelated to olfactory impairment?	Article	729¿000	00(0)	0000	00.0000/s10072-022- 06445-6	36221040	0	F
XXXX XXXXX	HERV-W and Mycobacterium avium Subspecies paratuberculosis Are at Play in Pediatric Patients at Onset of Type 1 Diabetes	Article	0000	00(0)	0000	00.0000/pathogens1009 1135	34578167	6	F
Xxxxxxxxx Xxxxx	Xxxx-lead edema after deep brain stimulation surgery for Parkinson's disease: a prospective magnetic resonance imaging study	Article	533-539	26	2019	10.1111/ene.13852	30358915	20	F
Xxxxxxxxx Xxxxx	Etiology of first-ever ischaemic stroke in European young adults: The 15 cities young stroke study	Article	1431¿143 0	00(00)	0000	00.0000/ene.12228	23837733	127	O
XXXXXXXXX XXXXX	Diagnostic and prognostic value of CSF neurofilaments in a cohort of patients with motor neuron disease: A cross- sectional study	Article	3765¿377 0	00(0)	0000	00.0000/jcmm.16240	33609080	8	F
XXXXXXXXX XXXXX	Regional spreading pattern is associated with clinical phenotype in amyotrophic lateral sclerosis	Article	Online ahead of print	Apr 19	2023	10.1093/brain/awad129	37075222	0	O

* Position: F=First L=Last C=Correspondent O=Other N=Not applicable

** Autocertificated

3 - Ethics

1. HUMAN EMBRYOS/FOETUSES
Does your research involve Human Embryonic Stem Cells (hESCs)?	No
Does your research involve the use of human embryos?	No
Does your research involve the use of human foetal tissues / cells?	No
2. HUMANS
Does your research involve human participants?	No
Does your research involve physical interventions on the study participants?	No
3. HUMAN CELLS / TISSUES
Does your research involve human cells or tissues (other than from Human Embryos/ Foetuses?	Yes
4. PERSONAL DATA
Does your research involve personal data collection and/or processing?	Yes
Does your research involve further processing of previously collected personal data (secondary use)?	No
5. ANIMALS
Does your research involve animals?	Yes
6. ENVIRONMENT & HEALTH and SAFETY
Does your research involve the use of elements that may cause harm to the environment, to animals or plants?	No
Does your research deal with endangered fauna and/or flora and/or protected areas?	No
Does your research involve the use of elements that may cause harm to humans, including research staff?	No
7. DUAL USE
Does your research involve dual-use items in the sense of Regulation 428/2009, or other items for which an	No
8. EXCLUSIVE FOCUS ON CIVIL APPLICATIONS
Could your research raise concerns regarding the exclusive focus on civil applications?	No
9. MISUSE
Does your research have the potential for misuse of research results?	No

10. OTHER ETHICS ISSUES
Are there any other ethics issues that should be taken into consideration? Please specify	No

X

I confirm that I have taken into account all ethics issues described above and that, if any ethics issues apply, I will complete the ethics self-assessment and attach the required documents.

4 - Call-specific questions

Eligibility
I acknowledge that I am aware of the eligibility requirements for applying as specified in the Call- PNRRXXXX_M6/C2, and certify that, to the best of my knowledge my application is in compliance with all these requirements. I understand that my proposal may be declared ineligible at any point during the evaluation or granting process if it is found not to be compliant with these eligibility criteria.	X
I confirm that the proposal that I am about to submit draws substantially don’t repeat on an existing or recently finished GRANT funded.	X
Data-Related Questions and Data Protection (Consent to any question below is entirely voluntary. A positive or negative answer will not affect the evaluation of your project proposal in any form and will not be communicated to the evaluators of your project.)
For communication purposes only, the MoH asks for your permission to publish,in whatever form and medium, your name, the proposal title, the proposal acronym, the panel, and host institution, should your proposal be retained for funding.	X
Some national and regional public research funding authorities run schemes to fund MoH applicants that score highly in the MoH's evaluation but which can not be funded by the MoH due to its limited budget. In case your proposal could not be selected for funding by the MoH do you consent to allow the MoH to disclose the results of your evaluation (score and ranking range) together with your name, non- confidential proposal title and abstract, proposal acronym, host institution and your contact details to such authorities?	X
The MoH is sometimes contacted for lists of MoH funded researchers by institutions that are awarding prizes to excellent researchers. Do you consent to allow the MoH to disclose your name, non-confidential proposal title and abstract, proposal acronym, host institution and your contact details to such institutions?	X
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5 – Description Project

Summary description

Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) is a disease that still lacks early diagnosis and effective treatment. Human Endogenous Retrovirus (HERV-K) in involved in ALS pathogenesis. Multiple integrations of HERV-K in the human genome may alter gene expression and can act synergistically with TDP-43 increasing its pathogenicity.

We identified different microRNAs that can bind to HERV-K mRNA and other proteins, potentially involved in its expression regulation.

Our goals:

1. To validate the HERV-K integrations within the human genome and to investigate their effect on TDP-43 (known to stabilize the anti-HIV-1 factor).

2. To conduct targeted studies to identify synergistic mechanisms between HERV-K and identified proteins (including TD- 43);

3. To investigate the origins of HERV-K regulation, including the role of miRNAs in gene expression regulation.

Our final goal is to prove the pathogenetic, biomarker and therapeutic role of HERV for the benefit of ALS FTD and neurological patients.

Background / State of the art and Preliminary data (if available)

ALS is a disease characterized by the degeneration of motor neurons, which typically results in progressive paralysis and, ultimately, in respiratory failure leading to a fatal outcome within a few years. The involvement of HERV-K in the pathogenesis of ALS has been widely demonstrated. The contribution of HERV-K in neurodegeneration has been hypothesized following the documented expression of the virus in spinal and cortical neurons of ALS patients, a characteristic that completely differentiates ALS patients from healthy subjects (Figure 0). Induced expression of HERV-K in neurons causes retraction and beading in neurites, and a transgenic mouse that expresses the HERV-K envelope gene develops a syndrome similar to ALS. We previously demonstrated that the Human Endogenous Retrovirus HERV-K-env-su glycoprotein can modulate the immune system by inducing the expression of proinflammatory mediators such as IL-6, IFN- gamma, and TNF-alfa. Moreover, we documented a specific humoral response against defined epitopes of the HERV-K envelope (Figure 1). This humoral response was found to be positively correlated with the humoral response against the C- terminal portion of TDP-43, known to be involved in ALS. These characteristics were particularly interesting since they allow discrimination between ALS and HC. Noteworthy, it has been shown in a Drosophila model that the expression of HERV-K and TDP-43 proteinopathy are mutually reinforcing.

Description and distribution of activities of each operating unit

OU1 will validate the HERV-K integrations within the genome and investigate the effects on genes encoding for proteins previously associated with ALS (e.g., TDP-43) or that may play a role in the pathology. HERV-K integrations will be validated through experimental techniques to confirm the presence of identified HERV-K integrations in a ALS cohort. OU2 will contribute providing DNA specimens from ALS patients.

Furthermore, targeted studies to identify synergistic mechanisms between HERV-K and identified proteins will be performed. Through molecular approach as Co-immunoprecipitation (Co-IP), Proximity Ligation Assay (PLA) and RNA interference (RNAi) OU1 will evaluate the synergistic mechanism between HERV-K and candidate proteins.

Moreover, bridging the immunological evidences in humans and the findings on synergistic mechanisms between HERV-K and proteins, OU1 will assess in the Drosophila model the cytokine level profiles to validate synergistic mechanism between HERV-K and candidate proteins given the evolutionary conservation of the innate immune response.

Both units will conduct investigations on the mechanisms controlling HERV-K expression, such as the role of microRNAs (miRNAs). Indeed, miRNAs, as hypothesized for other disorders whose development has been associated with HERV re- activation such as multiple sclerosis (9), can target retroviruses. With this goal, OU1 will first focus on selected miRNAs that have already been demonstrated to be dysregulated in ALS and are capable of binding, through an in-silico prediction, to

the mRNA sequence of HERV-K. The binding between the miRNAs and HERV-K will be determined through co-transfection of the miRNAs and the HERV-K consensus sequence. The activity of the miRNAs will be evaluated in appropriate cell lines that express endogenous levels of HERV-K, to approach a more physiological condition.

OU2 will specifically measure level of predicted xxXXX in biological specimens (cerebrospinal fluid-CSF or serum samples) from banked or newly diagnosed ALS subjects as well as neuromuscular disease patients, whose HERV-K integration will be also tested as above described. OU2 hasextensive experience on xxXXX quantification and they already identified specific xxXXX involved in ALS (10-15).

Moreover, OU2 will use iPSCs, iPSC-derived 2D neural precursors (NPCs), iPSC-derived 2D motoneurons (MNs), or iPSC- derived 3D brain organoids (BrOs) from different genetic background. UO2 has indeed iPSC lines from TDP-43 mutant carriers (n=3), respective isogenic lines (n=2) and healthy control subjects (n=3). OU2 has successfully differentiate one iPSC line with TDP-43 mutation in MNs (Figure 2)

TDP-43 proteinopathy has been associated with repeat expansion in c9ORF72 gene (16). Thus, TDP-43 mutant carriers with TDP-43 proteinopathy might phenocopy also at HERV-K level mechanisms induced in repeat expansion c9ORF72 carriers. To modulate HERV-2, iPSCs or derived differentiated cells will be treated with HML-2 siRNA (17) while to modulate TBP-43 UO2 will use antisense oligonucleotide with morpholino chemistry (PMO) (18). Conversely, forced expression of HERV-K with a CMV-promoter plasmid will be tested during neuronal differentiation (17). Those cellular models will be profiled for miRNAs and mRNA transcript levels.

Finally, UO2 will implement the molecular modulation of up to 3 best identified candidates (xxXXX, proteins, gene) in BrOs HERV-K integration as 3D cellular model for ALS.

5.4 Specific Aims and Experimental Design

Specific aim 1

ALS, a fatal neurological condition that primarily affects motor neurons in the brain and spinal cord, causes progressive paralysis and finally results in death. There isn't a cure at the moment. Unfortunately, the cause of the bulk of ALS cases, which are sporadic and have no documented family history, is still mostly unclear. In reality, despite extensive genome-wide investigations, only 10¿20% of diseases have a clearly recognized genetic cause, and the remainder appear to be acquired.

Since viruses can affect motor neurons, they may have contributed to the onset of ALS. Over the past 20 years, numerous attempts have been made to identify viral genome in ALS patient tissues; however, the clinical data are debatable, and a causative link has not yet been demonstrated (19).

The most significant finding is that TDP-43 can play a role in a variety of viral infections, despite the fact that a causal link between chronic viral infection and the onset of ALS has not yet been proven (20).

Aim 1. The objective of Aim 1 is to validate the HERV-K integrations within the genome that have already been reported in the literature or identified through online tools like UCSC Genome Browser. This aim, conducted on various types of ALS patients, will enable us to correlate the data obtained with the clinical evidence of each patient. This aspect entails the possibility of identifying not only prognostic and progression markers of the disease but also of hypothesizing a targeted intervention, such as the modulation of specific proteins, specific to different ALS forms.

Task 1. Specifically, OU1 will select integrations located in strategic positions of the genome that may potentially regulate the expression of proteins previously implicated in ALS or those that could have a role in the pathology. Following, OU1 will confirm the integrations presence through DNA sequencing in a population of ALS patients, including those at different stages of the disease (initial, middle, and terminal). After identifying the target proteins, OU1 will investigate the gene expression levels of potentially regulated genes by HERV-K through Real Time q-PCR. Furthermore, OU1 will analyze the correlation of these proteins with the -env, -gag, and -pol proteins of HERV-K at the protein level through Western Blot. The same type of analysis will be carried out on a healthy population from the local Blood Donor Center to compare the results

and identify potentially interesting discriminatory features. OU1 and OU2 will be responsible for recruiting blood samples of ALS patients and from Healthy Control subjects and collecting the clinical data.

Specific aim 2

Aim 2. The goal of Aim 2 is to identify synergistic mechanisms between HERV-K, TDP-43, and other identified proteins. By employing different molecular techniques, OU1 will be able to identify and validate the interaction between HERV-K and candidate proteins and determine whether these interactions have a functional consequence on gene expression or protein function. This aim will provide a better understanding of the role of HERV-K and associated proteins in the pathogenesis of ALS and may ultimately lead to the identification of new therapeutic targets for the disease.

Task 2.1. To achieve this, both cell lines transfected with the HERV-K consensus sequence (such as HEK-293) and cell lines expressing HERV-K at the endogenous level (such as Tera-1) will be used. OU1 will employ molecular approaches to evaluate the interactions and functional relationships between HERV-K (at DNA, RNA, and envelope protein levels) and candidate proteins. By using techniques such as Chromatin Immunoprecipitation (ChIP), RNA Immunoprecipitation (RIP), and Co-Immunoprecipitation (Co-IP), OU1 will study the DNA-protein, RNA-protein, and protein-protein interactions and use the Proximity Ligation Assay (PLA) to identify and or validate proximity of protein-protein interactions. By RNA interference (RNAi) technique, OU1 will investigate the co-regulation of HERV-K, TDP-43, and selected genes by reducing their expression. Finally, Real-Time qPCR and Western Blot analysis will be used to determine variations in gene expression and protein levels.

Task 2.2. Investigation of the molecular mechanisms underlying the innate immune response and DNA damage will be exploited in Drosophila TDP-43 models, testing the therapeutic potential of restoring altered metabolic pathways in the Drosophila model of ALS and building on the molecular targets identified in Aim 1 and validated in Task 2.1. Using genetic and pharmacological approaches, we will modulate key metabolic pathways altered in ALS and assess the effects of chemical compounds on ALS-model flies' survival, motor function, and immune status in terms of accumulation of inflammatory cytokines as consequence of concurrent expression of HERV-K.

Specific aim 3

Aim 3. The investigation of the origins of HERV-K expression, including the role of miRNAs in regulating gene expression, is the crucial goal of this aim.

Task 3.1. OU1 will perform in silico analysis to identify, among known ALS dysregulated miRNAs selected from the literature, those that are capable of binding to the mRNA sequence of HERV-K. Co-transfection of the identified miRNAs and the HERV-K consensus sequence will be performed to confirm their binding affinity. Furthermore, the activity of the miRNAs will be assessed in relevant cell lines that express endogenous levels of HERV-K to achieve a more physiological context.

OU2 will measure non previously tested miRNAs or miRNAs predicted to target HERV-K in biological specimens (cerebrospinal fluid-CSF- or serum samples) from already banked or newly diagnosed ALS subjects as well as from neuromuscular disease patients using RT-PCR. Data will be correlated with clinical information and with information on HERV-K inclusion.

Task 3.2. Leveraging the availability of iPSC lines from ALS and healthy subjects and the predicted natural modulation of HERV-K level, OU2 will pinpoint the miRNAs and the molecular profile that correlate/govern HERV-K modulation as prognostic and therapeutic targets. OU2 will i) culture different patient specific iPSC lines (D0); ii) differentiate each line first into NPCs (D6) as described in Xxxxx et al. (21); iii) terminally differentiate each line first into MNs (D14) as described in Xxxxx et al. (21). Cells of each line will be collected at D0, D2, D8, D16 to profile xxXXX and mRNA levels by RNA-seq. Differentiation and longitudinal characterization at all time points will be also performed in iPSCs treated at D0 either with HML-2 siRNA, as in Xxxx et al. (17) or with PMO against TDP-43 as in Xxxxxx et al. (18) or in NPCs forced expressing at D6 HERV-K with CMV-promoter plasmid . The goal is to frame the molecular changes that link TDP-43 and HERV-K level

with xxXXX and gene expression and possibly explain triggered mislocalization and aggregation of TDP-43. Further, TDP- 43 localization and DNA damage, feature associated with TDP-43 proteinopathy, will be monitored by immunofluorescence on terminal MNs at D25.

Task 3.3. Up to three most interesting genes/miRNAs that will be identified by the gene expression comprehensive anralysis regulating HERV-K and/or TDP-43 will be therapeutically modulated (PMO, small molecules, repurposed drugs) by OU2 on adult 3D BrOs from an ALS subject with HERV-K expression. Similarly to 2D culture, TDP-43 localization and DNA damage will be assessed as therapeutic readouts, to confirm the efficacy in a complex in vitro 3D model that better resembles the complexity of the brain.

Indeed, the complexity of the human central nervous system makes it impossible to study it successfully using earlier models such as postmortem brain tissue, in vitro 2D cell cultures, or nonhuman primate tissue (CNS). With the development of induced pluripotent stem cell (PSC) technology, three-dimensional (3D) brain and spinal cord organoids have been created, offering a more precise model for the study of neurodegenerative diseases. In order to recreate mature CNS architecture and demonstrate early molecular pathology of ALS/FTD, OU2 developed a cerebral and spinal organoid model using human induced pluripotent stem cells (iPSCs) for ALS/FTD that will be used in this project. Specifically for this project brain organoids will be used (Figure 3).

Experimental design aim 1

WP1: Biological Sample Collection and Analysis TASK 1.1: Enrollment of ALS Cohort

Recruitment of n=100 ALS subjects will be conducted synergistically by OU1 and OU2 (50 each, including biobanks sample)

TASK 1.2: Enrollment of HDs Cohort. The participants will undergo a rigorous screening process to ensure their eligibility. A cohort of n=100 Healthy Donors (HDs) subjects will be recruited by OU1 and OU2. The recruitment process for the HDs cohort may involve various strategies, including advertisements within the local community. The participants will undergo a rigorous screening process to ensure their eligibility.

TASK 1.3: Biological Samples Processing

The 12mL whole blood samples collected by OU1 and OU2 will undergo prompt processing within 3 hours of collection to maintain sample integrity. The processing involves the isolation of peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) and plasma and their storage in liquid nitrogen or at -80 °C, respectively.

TASK 1.4: Identification of HERV-K genomic integrations

Identification of HERV-K integrations situated in proximity to genes that have been established or indicated to play a potential role in the development or progression of ALS. To identify these integrations, we will assemble a comprehensive database that includes integrations documented in the scientific literature. In addition, we will use advanced online tools such as "UCSC Genome Browser".

TASK 1.5: Validation of HERV-K genomic integrations

Validation of the identified HERV-K integration through DNA sequencing on samples obtained from ALS patients at different stages of the disease. DNA samples from 25 Healthy Donors (HDs), 7 individuals in the early stage of ALS, 7 individuals in the mid-stage of ALS, and 7 individuals in the late stage of ALS will be subjected to sequencing analysis.

TASK 1.6: Gene expression analysis on HERV-K regulated genes

Through Real-Time q-PCR gene expression studies on both ALS and HDs groups, we aim to investigate the expression patterns of genes that are potentially regulated by HERV-K, such as NTRK3 (25), TRIM28, SETDB1 (26) and different miRNAs (27) and those that will arise from TASK 1.5. Furthermore, we will assess the correlation between the expression of these genes and the expression of key HERV-K components, such as -gag, -pol, and -env genes.

TASK 1.7: Protein abundance analysis related to HERV-K regulated genes

The gene expression data obtained from our study will be complemented by protein expression analysis using Western Blot in both ALS and HDs subjects.

This approach will allow us to identify potential discrepancies or regulatory mechanisms that operate at protein level and may contribute to the overall understanding of the molecular processes connecting HERV-K and target proteins.

Experimental design aim 2

WP2 (OU1): Interaction of HERV-K with candidate proteins and investigation of molecular mechanisms in Drosophila ALS model.

TASK 2.1.1: HEK-293 and Tera-1 cell lines maintenance and transfection

The HEK-293 cell line will undergo transfection with the HERV-K construct, allowing us to investigate specific molecular mechanisms.

The Tera-1 cell line will be utilized in its wild-type form, since they naturally express HERV-K.

The use of both transfected HEK-293 cells and Tera-1 cells with endogenous HERV-K expression will allow us to investigate different aspects of HERV-K biology.

TASK 2.1.2: DNA-protein, RNA-protein and Protein-Protein interactions in HERV-K field

The investigation of the interactions between HERV-K and the proteins of interest will be conducted using a variety of experimental approaches on HEK-293 and Tera-1 cell lines. One approach is Chromatin Immunoprecipitation (ChIP) which enables the assessment of DNA-protein interactions.

In addition to ChIP, we will employ RNA Immunoprecipitation (RIP) to examine the interaction between HERV-K and RNA binding proteins.

Furthermore, the Proximity Ligation Assay (PLA) will be utilized to investigate protein-protein interactions involving HERV-K. These approaches will uncover crucial insights into the molecular mechanisms underlying the functions and potential impact of HERV-K in various cellular processes, contributing to our knowledge of its involvement in disease development and progression.

TASK 2.1.3: Gene and protein expression analysis on HERV-K regulated genes in HEK-293 and Tera-1

Parallel quantification of gene and protein expression of HERV-K and candidate proteins will be conducted on the selected cell lines.

Overall, the combined analysis of gene and protein expression will provide a comprehensive understanding of the regulatory mechanisms involving HERV-K and its potential interaction partners in the context of the selected cell lines. TASK 2.2.1: Potential therapeutic intervention to restore altered metabolic pathways in Drosophila model of ALS

We aim to investigate in vivo the molecular mechanisms underlying the correlation between HERV-K infection and innate immune response activation and DNA damage in Drosophila models expressing TDP-43. Further, we plan to prevent retroviruses activation in TBPH/TDP-43 null brains and determine its neurological consequences.

For these experiments, we will analyze the capacity of different reverse-transcriptase inhibitors (NRTIs) like stavudine, tenofovir, or azidothymidine to block retroviruses activation and/or revert the locomotive phenotypes described in TBPH-null alleles. For these studies, we plan to feed TBPH-minus flies with different concentrations of NRTIs as described. In addition, specific RNAis against gypsy expression will be tested in TBPH-minus backgrounds. The impact of retroviruses repression in neurons or glia will be studied utilizing specific GAL-4 drivers (TBPH-/-; elav-GAL4 or Repo-Gal4>Gypsy-IR). The capacity of Gypsy-IR to modify TBPH-minus phenotypes will be evaluated. The role of retrovirus suppression in the activation of the innate immune response in flies will be tested by evaluating the expression levels of the NF-kB and IFN pathway flye homolog genes, namely relish, and Toll respectively, by using qtPCR and specific antibodies in Drosophila brains and fat body tissues.

The incidence of these genetic manipulations on Drosophila motility, life span, muscle innervation, and response to DNA damage will be analyzed.

TASK 2.2.2: Results validation in SHSY5Y cellular model

To validate results from Task 2.2.2 we plan to suppress TDP-43 expression in SHSY5Y cells by RNAi gene silencing and determine the expression levels and/or mRNA splicing patterns of the human NF-kB and Toll genes compared to wild type cells.

Experimental design aim 3

WP3: HERV-K Transcript Binding by microRNAs

TASK 3.1: In-silico identification of miRNAs able to bind HERV-K transcript (xxxxx://xxxxx.xxx/) and validation of HERV-K Transcript Binding by microRNAs. Co-transfection experiments in the HEK-293 cell line of both the consensus sequence of HERV-K and the specific miRNAs of interest will be performed to assess HERV-K/xxXXX interaction in HEK-293 and Tera- 1 cell lines.

TASK 3.2: Molecular and functional consequences of HERV-K in subject specific neural differentiated iPSC cells.

iPSC lines from ALS patients and healthy subjects will be used to investigate the modulation of HERV-K levels in human disease specific and subject specific tissues with primary interest on miRNAs and molecular profiles as potential prognostic and therapeutic targets on the interactions among HERV-K, miRNAs and TDP-43.

OU2 has banked more than 15 ALS (TDP43, n=2, c9ORF72, n=5) and 15 control (isogenic, n=5) iPSC lines. All lines will be tested for HERV-K genomic integration. In the unfortunate event that none has HERV-K integration we will reprogram 3 lines from PBMCs of HERV-K identified carriers recruited by OU1 or OU2. iPSC lines will be differentiated into neural progenitor cells (NPCs) and motor neurons (MNs) as described in Xxxxx et al. (21).

Cells will be collected at X0, X0, X0 xxx X00 xxx XXX-xxx analysis of xxXXX and mRNA.

Based on recent works by Xxxxxxxx al. (28) and Xxxxxxxxxxx et al. (29) which showed neurodegeneration by HERV-K activation via Toll-like receptor 8 and NRTK3 induction respectively, those mechanisms will be also monitored (qRT-PCR, neuronal integrity, caspase 3, calcium response). This comprehensive analysis aims at shedding light on the potential mechanisms underlying the mislocalization and aggregation of TDP-43, a key protein in ALS, in both TDP43 and c9ORF72 carriers, and upon viral replication. Further, iPSCs and differentiated MNs will be treated with HML-2 siRNA, as described in Xxxx et al. (17), or Phosphorodiamidate Morpholino Oligomer (PMO) against TDP-43, as described in Xxxxxx et al. (18), tackling both routes of investigations. OU2 will analyze molecular and functional consequences (TDP43 localization, DNA damage, p62 mislocalization) upon lentivirus HERV-K forced expression in NPCs at D6 of differentiation.

TASK 3.3: Therapeutic modulation of target genes/miRNAs

Gene specific ASO PMOs, small molecules, or repurposed drug will be used to modulate the most interesting genes/miRNAs (up to 3 targets) involved in regulating HERV-K and/or TDP-43, identified in Tasks 3.1 and 3.2. Therapeutic interventions will be carried out on adult 3D brain organoids (BrOs) derived from an ALS subject expressing HERV-K, a more relevant model to mimic the complexity of the human central nervous system (CNS). BrOs will be obtained using a free-floating method established by Xxxxxxxxx, Xxxxxxxxx et al. (30) in OU2 lab. Treatment will be performed starting at D45 and terminal molecular (RNA seq, qRT-PCR for xxXXX or target genes) and functional analysis (p62, DNA damage, neuronal integrity, caspase 3, TDP43 localization) (31, 32, 33) will be at D90. OU2 has already tested BrO treatment (30 Xxxxxxxxx, Xxxxxxxxx et al, submitted).

WP4. Communication and dissemination (OU1, OU2). Research will be presented at national and international conferences. Results will be published.

WP5. COORDINATION AND MANAGEMENT (OU1)

Every six-months, OU1 will monitor the progress of the work. Patient data will be handled in accordance with local data protection regulations, biological samples will be provided unique codes, databases will be password-protected, and information will be stored securely. OU1 will develop a data management plan with the goal of filling the final database to conduct statistical analysis to validate data quality and disseminate project information locally and internationally.

Picture to support preliminary data Fig_1_2_3_merge(nostra1).pdf Hypothesis and significance

ALS is a currently incurable disease for which timely diagnosis and effective treatment have yet to be defined. Given this

lack and the numerous scientific evidences documenting the involvement of the Human Endogenous Retrovirus-K (HERV- K) in ALS (22-24), we have decided to investigate in depth the mechanisms of its interaction with the proteins involved in the pathology. In the past few years, the expression of the virus has been documented in the spinal and cortical neurons of

patients, a characteristic that completely distinguishes ALS subjects from healthy individuals. The induced expression of HERV-K in neurons causes retraction and beading in neurites, and a transgenic mouse expressing the HERV-K envelope gene develops a syndrome similar to ALS (1). The research group belonging to OU1 has shown that the Human Endogenous Retrovirus HERV-K-env-su glycoprotein can modulate the immune system by inducing the expression of proinflammatory mediators such as IL-6, IFN-gamma, and TNF-alfa (2). Additionally, we have shown a specific humoral response

against defined epitopes of the HERV-K envelope. This humoral response was found to be positively correlated with the humoral response against the C-terminal portion of TDP-43, which is known to be involved in ALS (3). In relation to this, more recent scientific evidence documents how endogenous retrovirus expression and TDP-43 proteinopathy are mutually reinforcing (1). OU1 documented that ALS patients had higher levels of HERV-K and higher Abs levels against a specific envelope peptide compared to healthy donors (HDs) or individuals with multiple sclerosis (MS). The ALS individuals also had Abs that recognized more HERV-K-env peptides compared to HDs. The presence of HERV-K Abs in ALS individuals was significantly higher than in healthy donors or MS individuals. The levels of extracellular HERV-K DNA in serum and the number of HERV-K-env peptides recognized by ALS sera correlated with disease duration. Among ALS individuals, lower levels of HERV-K Abs were associated with a definite diagnosis per EL Escorial criteria, as well as a lower predicted and observed survival (4).

Based on this evidence, we propose to thoroughly investigate two fundamental aspects related to the activity of HERV-K in the context of ALS. Firstly, we aim to identify the proteins that may be correlated to the action of HERV-K, to clarify the network within which it operates. Additionally, we are interested in elucidating the mechanism underlying the expression of HERV-K. One of our hypotheses is that the expression of HERV-K may be regulated by the action of specific microRNAs, for which binding with the mRNA of the retrovirus is predicted through in silico analysis.

1) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/xxxxxxxxxxxx.xxx0000

2) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/xxxxxxxxxxxxxx0000000 3) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/x00000000

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19) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/x.xxxx.0000.00.000

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23) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/00000000.0000.0000000

24) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/xxx.00000

5.5 Methodologies and statistical analyses

Methods of data collection

To ensure rigorous data collection and minimize selection biases, comprehensive measures will be implemented throughout the study. All patients undergoing molecular analysis will be thoroughly screened to identify and enroll consecutive patients meeting the required criteria. Blinded researchers will perform cellular, molecular, and biochemical analyses as applicable to maintain objectivity. Both the preclinical and human specimen components of the project will generate new expression datasets. Stringent practices and standards will be followed to ensure the production of high quality data and accurate processing. Quantification of in vitro and in vivo data will be conducted by investigators adhering to established scientific standards. All data will be collected and securely stored in a cloud system, following standardized recording procedures. Data entry will be validated by the respective researchers responsible for their generation, and the principal investigators (PIs) will review the data for quality control. Metadata representation will adhere to controlled vocabularies and FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, and Reusable) guidelines to ensure data interoperability and accessibility. Experimental data will be collected using a standardized electronic report template by trained researchers.

The collected data will be anonymized and encrypted for secure storage. The Bioinformatic Unit of OU1 will utilize a High- Performance Computing cluster platform to store and manage the data. To promote transparency and resource availability, resulting datasets will be submitted to publicly accessible websites and databases, when suitable, serving as valuable resources for the wider scientific community. For cell quantification, various platforms will be utilized, including Cell Profiler (v3.1.9), Fiji (v2.3.0/1.53f), and Nis-Elements (v5.21). Image Studio Lite will be employed for Western blot quantification.

Fluorescent signals will be detected using advanced microscopy techniques such as fluorescence (Inverted Microscope DMi8), confocal laser scanning fluorescence microscopy (Leica, SP8 white laser inverted confocal microscope), and Nikon- Crest multimodal spinning-disk confocal microscopy. Automated image analysis algorithms will be applied to quantify specific cellular parameters, ensuring accurate and reliable data analysis. RNA Libraries will be constructed using the SMARTer-Stranded Total RNA Kit (Clontech) and sequencing will be performed on a NextS1eq 2000 (Illumina, paired-end 100-bp length). Comparative sequencing analysis will be performed, aligning reads with STAR algorithm using DESeq2.

Statistic plan

The statistical analyses for this study will be conducted using GraphPad Prism v.8, ensuring robust and reliable data analysis. Statistical significance will be determined based on the assumptions of the specific chosen statistical tests, with significance levels set at *p < 0.05, **p < 0.01, and ***p < 0.001. To ensure the reliability of the findings, all experiments will be performed in triplicate or more, providing sufficient replication for statistical analysis. Raw data will be assessed for normal distributions to ensure the appropriateness of the selected statistical tests. The determination of sample size for experiments involving iPSC-derived cell lines will be based on previous studies. Generally, a minimum of three different cell lines will be used, and each line will be subjected to at least three independent biological replicates. This approach ensures a robust dataset for comprehensive statistical analyses in the biological experiments. To ensure appropriate group allocation, samples will be categorized into different experimental groups based on their genotypes. This systematic grouping will allow for meaningful comparisons and analysis of the data.

Statistical analysis

Categorical variables will be presented as frequencies and percentages, while continuous variables will be described using the median and interquartile range (IQR). Baseline categorical variables, such as histological analysis, will be assessed using appropriate statistical tests, including the chi-squared test or Xxxxxx'x exact test. Pairwise comparisons among groups will be adjusted using the Bonferroni correction method to account for multiple comparisons. Baseline continuous variables will be compared using the Xxxxxxx-Wallis test for multiple group comparisons, and Dwass, Steel, Xxxxxxxxx-Fligner statistics will be employed for post hoc multiple comparisons. Statistical significance will be determined at a threshold of p <

0.05. For multiple comparisons on a single dataset, one-way analysis of variance (ANOVA) will be used. In cases where multiple variables need to be considered, two-way ANOVA will be employed, followed by appropriate post hoc analyses. Two-tailed, unpaired Student's t-test will be utilized for comparing two groups. Survival comparisons will be conducted using

Xxxxxx-Xxxxx survival analysis and assessed with the log-rank test. Molecular and cellular quantification data will be analyzed using Fiji/ImageJ PlugIns and GraphPad Prism v8 software, employing t-tests or ANOVA comparisons as appropriate. Omic analyses will be performed using dedicated packages as previously cited. By employing these statistical methods and software, we aim to ensure accurate and rigorous analysis of the data, facilitating the generation of meaningful results and conclusions for this study.

Timing of analysis data

The duration of this study is projected to be two years. The comprehensive data analysis will be conducted at the conclusion of the study, encompassing all the gathered information. However, it is important to note that molecular and cellular analyses will be performed at the conclusion of each specific aim as well. For a more detailed overview of the study's timeline, including a Gantt chart illustrating the relative milestones and activities, please refer to the Timeline 5.10 section.

5.6 Expected outcomes

Based on our research, we anticipate observing alterations in HERV-K expression in the biological samples of a specific subgroup of patients diagnosed with ALS and other neurological disorders. Through our investigations, we aim to identify the molecular targets that are influenced by the dysregulation of HERV-K. Furthermore, we will assess the impact of inhibiting HERV-K using ASO or other molecules on the phenotypes associated with ALS in various models. Successful validation of our proof-of-concept findings would provide compelling evidence supporting the role of HERV-K as a potential biomarker and therapeutic target for the treatment of ALS patients. By demonstrating the modulatory potential of HERV-K, we aim to contribute to the development of novel therapeutic strategies for ALS.

5.7 Risk analysis, possible problems and solutions

To ensure the smooth progress of the project and mitigate potential risks, a steering committee comprising representatives from each OU will be established. This committee will actively coordinate and manage the workflow, ensuring that both short-term and long-term goals are achieved. Effective communication channels will be established among all team members, facilitated by the committee, to xxxxxx collaboration and address any issues that may arise.

Considering the expertise of OU2 in iPSC and MN models, we anticipate no or minimal technical difficulties in generating 2D and 3D iPSC-derived cells, meeting the objectives of the task. The lab has well-established protocols that account for inherent line-to-line and experiment-to-experiment variability, which have been partially mitigated through optimized and adjusted procedures.

Additionally, the use of isogenic cell lines as control measures will further minimize this variability, enhancing the reliability of the results. OU2 might alternatively use a second protocol for BrO generation modified from (34) Xxxxxxxx et al. which offers some functional advantages (calcium response and electrophysiology).

While we do not anticipate major technical challenges concerning pharmacological and genetic modulation, we acknowledge the potential for detrimental effects resulting from the modulation of HERV-K and other proteins. To address this, we will employ a cautious approach. Differential and ascending doses of molecular modulation will be tested primarily in 2D model, along with varying exposure times, to carefully assess any adverse cellular effects. Markers of cell viability, such as metabolic alteration using CCK8, apoptosis, DNA damage, and response to stress, will be evaluated to ensure the safety and viability of the cells under modulation. As above mentioned, in case any of the OU2 available iPSC cell does not present HERV-K integration, OU2 will reprogram new iPSC line from subjects with confirmed integration.

Regarding human samples, we will utilize the resources available in the OU1 and OU2 biobank in addition to samples obtained from recruited patients. This approach will enhance the availability of suitable samples for analysis, ensuring an adequate sample size and diversity for robust research outcomes.

By proactively identifying potential risks, implementing appropriate measures, and utilizing existing resources effectively, we aim to overcome any challenges that may arise during the course of the project and achieve the desired research

outcomes.

5.8 Significance and Innovation

Our approach has the potential to herald a new era of innovation for ALS, presenting a transformative treatment option that revolutionizes patient care. With the advancement of ASO technology we target genetically driven diseases but also address more common seemingly sporadic conditions.

Development of Novel ASO and Other Strategies against HERV-K: This novel strategy holds immense potential for effectively modulating HERV-K activity and mitigating disease progression.

Utilization of Patient Avatars Based on iPSC Models: These avatars will serve as invaluable tools for testing the therapeutic consequences of the lead compound, enabling personalized medicine approaches and enhancing treatment efficacy.

Development of Innovative Biomarker Detection Systems associated with ALS and HERV-K dysregulation to enhance diagnostic accuracy, monitoring, and treatment response assessment, facilitating earlier detection and therapeutic interventions for improving the lives of ALS patients.

5.9 Bibliography

1) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/xxxxxxxxxxxx.xxx0000

2) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/xxxxxxxxxxxxxx0000000 3) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/x00000000

4) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/xxx.00000

5) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/xxx.00000

6) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/x00000-000-00000-x

7) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/xxxxxxx.xxxx.0000000 8) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/x00000-000-00000-x 9) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/xxxxx.0000.00000

10) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/x00000-000-00000-0

11) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/x00000-000-00000-0

12) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/x00000-000-0000-x

13) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/xxxx.00000

14) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/x00000-000-0000-0

15) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/x.xxxxxxxxx.0000.000000

16) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/x00000-000-00000-0

17) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/xxxx.0000000000

18) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/x00000-000-00000-0

19) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/x.xxxx.0000.00.000

20) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/xxxx00000000

21) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/xxxxx/xxx000 22) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/xxx.00000

23) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/00000000.0000.0000000

24) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/xxx.00000

25) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/x.xxxx.0000.00.000)

26) xxxxx://xxx: 10.3390/v15030710

27) xxxxx://xxx: 10.1371/journal.pone.0286814

28) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/xxx.xxxxxxx.000000 29) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/x.xxxx.0000.00.000

30) Xxxxxxxxx and Xxxxxxxxx et al, Targeted Antisense Oligonucleotide Treatment Rescues Developmental Alterations in Spinal Muscular Atrophy Organoids: Insights into Early Pathogenesis. SUBMITTED

31) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/x00000-000-00000-0

32) https://xxx.xxx/10.1667/0033-7587(2002)158[0486:qdoiid]0.0.xx;2

33) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/x00000-000-00000-0

34) xxxxx://xxx.xxx/00.0000/x.xxxx.0000.00.000

5.10 Timeline / Deliverables / Payable Milestones

Mo 0-1: Kick-off meeting; DELIVERABLE 1: Statistical Analysis Plan definition Mo 1-15: Recruitment, clinical assessment and biological samples processing Mo 1-20: Analysis of biological samples regarding HERV-K interactions

Mo 11-15: Interim analysis; DELIVERABLE 2: Interim analysis report

Mo 4-20: DNA-protein, RNA-protein, and Protein-Protein interactions in HERV-K context Mo 7-20: Investigation of ALS molecular mechanism in Drosophila model

Mo 2-22: Therapeutic modulation of identified genes/miRNAs involved in regulating HERV-K/TDP-43 Mo 2-23: Data collected through the project from all operative units and statistical analysis

Mo 1-24: Management and coordination

Mo 24: DELIVERABLE 3: Final report and dissemination of the results

Milestones 12 month

M1) Recruitment of 50% of patients M2) Interim analysis

Milestones 24 month

M3) Recruitment completed

M4) Statistical analysis completed M5) Final report

Gantt chart

Gantt PNRR.pdf

5.11 Equipment and resources available

Facilities Available

OU1: The laboratories of Microbiology of the Azienda Ospedaliera Universitaria of Sassari has the instruments necessary to perform the proposed research including automated ELISA washer and readers, Real Time PCR machines, Miseq illumina, freezers at -°80C, Flow cytometry, biological hoods, automated extractors, spectrophotometer, PCR systems.

OU1 collaborate with the Neurological Clinic of the AOU Sassari for diagnosis and clinical follow-up of different neurological diseases (more than 10000 visits per year).

OU2 offers a comprehensive array of facilities to provide robust support for the research project, encompassing a dedicated laboratory focused on biochemistry, cellular, and molecular biology. The well-equipped laboratory features essential instruments such as an ABI PRISM 3130 genetic analyzer, a DHPLC system, a real-time PCR system, eight thermal cyclers, a fluorimeter LS3B, a beta counter, and a Nanodrop spectrophotometer. For cell culture work, there are seven laminar flow biological hoods, CO2 incubators, ultra- and refrigerated centrifuges, a cryostat, Zeiss Axiophot and Axioscope

microscopes, and a Leica Laser confocal microscope SP8 equipped with digital imaging acquisition and analysis capabilities.

In addition to these laboratory facilities, OU2 benefits from access to a range of valuable support services. These encompass histopathological services, a bank comprising skeletal/cardiac muscle, peripheral nerve, DNA, and cell culture samples, a FACS sorter facility, an animal facility, and an imaging facility. Additionally, istitutional NGS (Next-Generation Sequencing) and proteomic/metabolomic facilities are available to enhance our research capabilities. Furthermore, a clinical neurology service is accessible for both inpatient and outpatient care, featuring specialized units dedicated to neuromuscular and rare diseases, as well as a motor neuron outpatient service.

Subcontract

none

5.12 Desc. of the complementarity and sinergy of secondary collab. researchers

The project will be conducted in the laboratories of AOU of Sassari under the supervision of Prof Xxxxx, who is also the coordinator of the project

The OU2 will be directed by Xxxx. Xxxxxxx Xxxx and will be in charge of the xxXXX analysis as well as of the 2D and 3D cell systems studies.

The study of the molecular mechanisms of interaction between TDP-43 and HERV-K will be carried out in synergy between the two groups that have complementary expertise, UO1 mainly having a molecular and biochemical expertise while UO2 a clinical expertise and expertise in iPSC cell culture and differentiation.

Therapeutic strategies have already been developed by OU2 in preclinical models such 2D and 3D model derived from iPSCs. Moreover, the group of Prof. Comi has consolidated expertise in preclinical therapeutic testing in motoneurons or complex cellular model.

The units have decided to centralize detection and quantification of xxXXX in OU2 because of the large amount of samples that have been already analyzed for this specific purpose.

5.13 Translational relevance and impact for the national health system (SSN)

What is already know about this topic?

Despite decades of research for therapy in ALS, still there are not identified drugs capable of significantly halting the disease or providing relief to ALS patients.

Different studies have shown that the human endogenous retrovirus K (HERV-K) and the humoral response against it is elevated in ALS serum and is associated with ALS TDP-43 pathology.

xxxxx://xxx.xxx/00.0000/x00000-000-00000-x xxxxx://xxx.xxx/00.0000/x00000000

Expression of either Drosophila mdg4-ERV (gypsy) or the human ERV, HERV-K (HML-2) are each sufficient to stimulate cytoplasmic aggregation of human TDP-43 whether cells are in contact or at distance.

xxxxx://xxx.xxx/00.0000/x00000-000-00000-x

A clinical trial is under way to evaluate HERV-K Suppression Using Antiretroviral Therapy in Volunteers With Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS).

XxxxxxxxXxxxxx.xxx Identifier: NCT02437110

xxxxx://xxx.xxx/00.0000/0000-0000(000000)00:0<527::aid-jmv17>0.0.xx;2-a xxxxx://xxx.xxx/00.0000/xxx.00000 xxxxx://xxx.xxx/00.0000/xxx.0

Details on what is already know about this topic

Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is a fatal neurodegenerative disorder (ND) characterized by progressive motor paralysis

that still lacks an efficacious therapy. ALS is largely sporadic (sALS), but mutations in several genes, including TARDBP (TDP-43) and C9ORF72, are inherited in subsets of familial forms of ALS (fALS). TDP-43 cytoplasmic mislocalization is the pathological hallmark of most ALS cases, both sALS, and fALS. Endogenous retrovirus (ERV) expression and TDP-43 proteinopathy are mutually reinforcing. Expression of either Drosophila mdg4-ERV (gypsy) or the human ERV, HERV-K (HML-2) are each sufficient to stimulate cytoplasmic aggregation of human TDP-43. Viral ERV transmission also triggers TDP-43 pathology in recipient cells that express physiological levels of TDP-43, whether they are in contact or at distance. A clinical trial is under way to evaluate HERV-K suppression using antiretroviral therapy in volunteers with amyotrophic lateral sclerosis (ALS).

What this reasearch adds?

The proteinopathy of TAR DNA-binding protein 43 (TDP-43), an RNA/DNA-binding protein involved in RNA transcription, splicing, stability, transport and translation is the neuropathological hallmark of ALS . TDP-43 is mainly located in the cell nucleus but in 97% of ALS patients it is aggregated in the cytoplasm of brain cells. In those cytoplasmic inclusions TDP-43 is misfolded, ubiquitinated and phosphorylated. Through the analysis go HERV-K integration in the genome we will identify specific proteins that are up or down regulated by the HERV-K activity. This will allow us to understand the molecular processes that lead to TDP-43 and other proteins misfolding and impaired degradation. xxxxx://xxx.xxx/00.0000/xxxxx.0000.00000

Moreover, if the role of an endogenous virus or viral proteins were proven, it would be conceivable to create a "vaccination" as a therapy for ALS/FTD in the near future given also the development of mRNA vaccination.

Details on what this reasearch adds

The hallmark for proteinopathy in ALS, TAR DNA-binding protein 43 (TDP-43), is characterized by mislocalization and aggregation in the cytoplasm of brain cells. By analyzing HERV-K integration in the genome, we aim to identify specific proteins regulated by HERV-K activity, shedding light on the molecular mechanisms underlying TDP-43 misfolding and impaired degradation. This understanding could pave the way for targeted therapies, including the development of a potential vaccination strategy leveraging mRNA technology. In the context of ALS, which lacks effective treatments, our focus is on RNA therapeutics, particularly ASOs, such as PMO or conjugated PMO, to modulate HERV-K safely and effectively. We will use cutting-edge in vitro models to bridge the gap between pre-clinical and clinical research. These platforms will provide insights into both familial and sporadic ALS pathologies, identify additional therapeutic targets, and facilitate the development of an effective lead compound

What are the implications for public health, clinical practice, patient care?

The restoration of the protein functions identified in the project through a modulation of HERV-K expression may be a new therapeutic approach in ALS and possibly in other disorders where similar TDP- pathology has been described, such as frontotemporal dementia, limbic-predominant age-related TDP-43 encephalopathy (LATE) and some cases of Alzheimer's disease.

xxxxx://xxx: 10.4103/1673-5374.330593

Details on what are the implications for public health, clinical practice, patient care

Modulating HERV-K expression to restore protein functions discovered in our project holds promise as a novel therapeutic approach not only for ALS but also for related disorders, including frontotemporal dementia, limbic-predominant age-related TDP-43 encephalopathy (LATE), and certain cases of Alzheimer's disease. This cost-effective paradigm we propose addresses the critical need for accelerated therapy discovery and development in neurological diseases. The ultimate goal is to provide a meaningful therapy for ALS patients, which would have significant and long-term implications for public health, clinical practice, and patient care. Given the incidence and burden of ALS, an effective treatment would alleviate the substantial social and economic costs associated with multidisciplinary medical care and management. It would reduce the

need for extensive rehabilitation, approved drugs, and specialized devices, ultimately improving the quality of life for patients.

6 - Budget

Total proposed budget ( Euro )
Costs	TOTAL BUDGET	Co-Funding	List of costs proposed for funding to the MOH	Percentage of total proposed to the MOH
1 Staff Salary	120.000,00	120.000,00	not permitted	0,00
2 Researchers' Contracts	430.000,00	0,00	430.000,00	43,09
3a.1 Equipment (Leasing -	110.000,00	0,00	110.000,00	11,02
3a.2 Equipment (buying)	0,00	0,00	0,00	0,00
3b Supplies	281.000,00	0,00	281.000,00	28,16
3c Model Costs	26.000,00	0,00	26.000,00	2,61
4 Subcontracts *	0,00	0,00	0,00	0,00
5 Patient Costs	5.000,00	0,00	5.000,00	0,50
6 IT Services and Data Bases	0,00	0,00	0,00	0,00
7 Travels	7.500,00	0,00	7.500,00	0,75
8 Publication Costs	5.000,00	0,00	5.000,00	0,50
9 Dissemination	4.000,00	0,00	4.000,00	0,40
10 Overheads *	69.500,00	0,00	69.500,00	6,96
11 Coordination Costs	60.000,00	0,00	60.000,00	6,01
Total	1.118.000,00	120.000,00	998.000,00	100,00

* percentage calculated as average value between all the Operating Units.

Report the Co-Funding Contributor:

None, except Salary staff

Budget Justification
1 Staff Salary	The staff salary is the sum of the months that: OU1: the PI, one associate professor, a clinician (RTI, 8 months) will dedicate to the project and for OU2:Co-funding contributor will be the IRCCS FONDAZIONE IRC Ca'Granda with a percentage of the staf
2 Researchers' Contracts	OU1: N.2 Researchers under 40, 1 researcher, 1 technician OU2: N. 1 Neurologist for 24 months € 40.000/year UNDER 40, TO BE HIRED; N.1 Post-Doc for 24 months € 40.000/year for cell culture; N.1 Post-Doc for 24 months € 40.000/year for molecular biology
3a.1 Equipment (Leasing - Rent)	OU1: Leasing of: Cytoflurimeter, RNA extractors,, refrigerated centrifuge, Components for automatized ELISA (Spectrometer, Washermachine, Workstation). Nanopore. Freezers at -80°C

3a.2 Equipment (buying)	OU2: n. 1 ELLA INSTRUMENT (2/5 costs instrument)
3b Supplies	All the materials necessary to carry out experiments described : reagents for qPCR, ELISA, Citofluorimetry (conjugated antibodies etc). Reagents for iPSC culture and differentiation , siRNA, antisense oligonucleotide, plasmid
3c Model Costs	Drosophila model
4 Subcontracts	NA
5 Patient Costs	N. 100 patients, €50/patient costs
6 IT Services and Data Bases	NA
7 Travels	Presentation of the results to international scientific meetings. travel to the other OUs
8 Publication Costs	Publishing costs in open science qualified open access international scientific journals
9 Dissemination	The results of the project will be disseminated at the local, regional, National and International Meetings and a t different levels through publications and social media
10 Overheads	Costs due to the Department for general costs (electricity etc.)
11 Coordination Costs	Additional costs are due to the enrollment of personnel units (one dedicated to each unit) / or integrative salary to administrative personnel nto coordinate the project, analyze and integrate the data. A final reports will be prepared and disseminated.

Proposed total budget UO1 Institution: Azienda Ospedaliera Universitaria di Sassari (Euro)

Costs	TOTAL BUDGET	Co-Funding	List of costs proposed for funding to the MOH	Percentage of total proposed to the MOH
1 Staff Salary	60.000,00	60.000,00	not permitted	0,00
2 Researchers' Contracts	190.000,00	0,00	190.000,00	34,67
3a.1 Equipment (Leasing - Rent)	110.000,00	0,00	110.000,00	20,07
3a.2 Equipment (buying)	0,00	0,00	0,00	0,00
3b Supplies	130.000,00	0,00	130.000,00	23,72
3c Model Costs	10.000,00	0,00	10.000,00	1,82
4 Subcontracts	0,00	0,00	0,00	0,00
5 Patient Costs	0,00	0,00	0,00	0,00
6 IT Services and Data Bases	0,00	0,00	0,00	0,00
7 Travels	5.000,00	0,00	5.000,00	0,91
8 Publication Costs	3.000,00	0,00	3.000,00	0,55
9 Dissemination	2.000,00	0,00	2.000,00	0,36
10 Overheads	38.000,00	0,00	38.000,00	6,93
11 Coordination Costs	60.000,00	0,00	60.000,00	10,95
Total	608.000,00	60.000,00	548.000,00	100,00

Budget Justification
1 Staff Salary	The staff salary is the sum of the months that the PI (a full professor, 2 months), one associate professor (6 months), a clinicians (RTI, 8 months) will dedicate to the project
2 Researchers' Contracts	Two young researchers (under 40), one post doc and one technician
3a.1 Equipment (Leasing - Rent)	Equipment needed for the length time of the project (e.g. Cytofluorimeter/cell sorting); nanopore sequencing
3a.2 Equipment (buying)	a -150° C freezer, RNA extractors, Real Time PCRs, refrigerated centrifuge, automatized ELISA (Spectrometer, Washermachine, Workstation). Freezers at -80°C and -20°C to stock plasma cells and plasma
3b Supplies	All the materials necessary to carry out experiments described : reagents for qPCR, ELISA, Citofluorimetry (conjugated antibodies etc)
3c Model Costs	constructing drosophila mutants and instruments to growth them
4 Subcontracts	Sequencing and bioinformatic analyses, external experiments that cannot be performed in the lab
5 Patient Costs	none
6 IT Services and Data Bases	none
7 Travels	Presentation of the results to international scientific meetings. travel to the other UO
8 Publication Costs	Publishing costs in open science qualified international scientific journals
9 Dissemination	The results of the project will be disseminated at the local, regional, National and International level through publications and social media
10 Overheads	Costs due to the Department for general costs (electricity etc.)
11 Coordination Costs	Additional costs are due to the enrollment of personnel units (one dedicated to each unit) / or integrative salary to administrative personnel nto coordinate the project, analyze and integrate the data. A final reports will be prepared and disseminated.

Costs	TOTAL BUDGET	Co-Funding	List of costs proposed for funding to the MOH	Percentage of total proposed to the MOH
1 Staff Salary	60.000,00	60.000,00	not permitted	0,00
2 Researchers' Contracts	240.000,00	0,00	240.000,00	53,33
3a.1 Equipment (Leasing - Rent)	0,00	0,00	0,00	0,00
3a.2 Equipment (buying)	0,00	0,00	0,00	0,00
3b Supplies	151.000,00	0,00	151.000,00	33,56
3c Model Costs	16.000,00	0,00	16.000,00	3,56
4 Subcontracts	0,00	0,00	0,00	0,00
5 Patient Costs	5.000,00	0,00	5.000,00	1,11
6 IT Services and Data Bases	0,00	0,00	0,00	0,00
7 Travels	2.500,00	0,00	2.500,00	0,56
8 Publication Costs	2.000,00	0,00	2.000,00	0,44
9 Dissemination	2.000,00	0,00	2.000,00	0,44
10 Overheads	31.500,00	0,00	31.500,00	7,00
11 Coordination Costs	not permitted	not permitted	not permitted	0,00
Total	510.000,00	60.000,00	450.000,00	100,00

Proposed total budget UO2 Institution: Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico (Euro)

Budget Justification
1 Staff Salary	Co-funding contributor will be the IRCCS FONDAZIONE IRCCS Ca'Granda with a percentage of the staff salary
2 Researchers' Contracts	N. 1 Neurologist for 24 months € 40.000/year UNDER 40, TO BE HIRED; N.1 Post-Doc for 24 months € 40.000/year for cell culture; N.1 Post-Doc for 24 months € 40.000/year for molecular biology
3a.1 Equipment (Leasing - Rent)	none
3a.2 Equipment (buying)	none
3b Supplies	reagents for iPSC culture and differentiation (MN and organoid) , siRNA, antisense oligonucleotide, lentivirus, sequencing cost , antibodies, reagents for molecular biology
3c Model Costs	plasticware, reagent for functional assay (calcium)
4 Subcontracts	none
5 Patient Costs	N. 50 patients and 50HD, € 50/patient costs
6 IT Services and Data Bases	none
7 Travels	N. 3 travel to conference or meeting of the project
8 Publication Costs	Open access costs
9 Dissemination	Conference fee
10 Overheads	Running expenses
11 Coordination Costs	none

Principal Investigator Data

Cognome: sechi

Nome: xxxxxxxx xxxxxxx Xxxxxx: M

Codice fiscale: XXXXXX00X00X000X Documento: Patente, Numero: U18791646C Data di nascita: 13/06/1965

Luogo di nascita: Ittiri Provincia di nascita: SS

Indirizzo lavorativo: Struttura Complessa di Microbiologia e Virologia, AOU sassari Città: Sassari

CAP: 07100

Provincia: SS

Email: XXXXXXX@XXXXX.XXX

Altra email: xxxxxxx@xxxxx.xx Telefono: x000000000000

Altro telefono: 0000000000

Qualifica: Professore Xxxxxxxxx, Dirigente Medico Struttura: dipartimento di scienze biomediche Istituzione: università di sassari

Datore/ente di lavoro? Yes Datore/ente di lavoro SSN? Yes Nome datore/ente di lavoro non SSN:

Nome istituzione SSN: Azienda Ospedaliera Universitaria di Sassari

Tipo contratto: Professore Ordinario convenzionato SSN con contratto art.6 comma 10 legge 240/2010 con obbligo di 16 ore

Con l'invio della presente proposta si dichiara che la stessa o parti significative di essa non sono oggetto di altri finanziamenti pubblici o privati e che di conseguenza vi è assenza del c.d. doppio finanziamento ai sensi dell'art. 9 del Regolamento (UE) 2021/241, ossia che non ci sia una duplicazione del finanziamento degli stessi costi da parte di altri programmi dell'Unione, nonché con risorse ordinarie da Bilancio statale.

By submitting this proposal, I declare that no significant part or parts of it are recipient of any other public or private funding and that consequently there isn't any so-called double financing pursuant to art. 9 of Regulation (EU) 2021/241, i.e. that there is no duplication in the financing of the same costs by other Euopean Union programs or any other ordinary resources from the State budget.

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