Odstavné koleje. Pro krátkodobé i dlouhodobé odstavení drážních vozidel jsou určeny především manipulační koleje ve stanicích. Odstavování drážních vozidel na dopravních kolejích je možné pouze výjimečně, není-li jiného zbytí. Odstavení vlaku, vozu nebo hnacího či speciálního vozidla na kolejích provozovatele dráhy JHMD ve vhodných stanicích je možné pouze na základě předchozího souhlasu provozovatele dráhy. Ve smyslu platných vnitřních předpisů provozovatele dráhy JHMD pro organizování drážní dopravy musí být o faktickém odstavení vždy ze strany provozovatele drážní dopravy informován dirigující dispečer.
Odstavné koleje. Provozovatel dráhy JHMD provozuje pro účely odstavování vozů v určených stanicích manipulační koleje, které je možné využívat jako odstavné koleje (dále jen „odstavné koleje“). Případné požadavky provozovatelů drážní dopravy na krátkodobé či dlouhodobé odstavení vlaků nebo drážních vozidel na odstavných kolejích musí tito předem projednat s provozovatelem dráhy JHMD, který musí dát k odstavení vlaku nebo drážních vozidel předem souhlas. Obdobně se postupuje i u operativních požadavků odstavení na dobu kratší než 7 dní. Provozovatel dráhy JH může pro případné požadované odstavení vlaku nebo vozů určit i jinou vhodnou stanici, než požaduje provozovatel drážní dopravy. Provozovatel drážní dopravy, který drážní vozidla (vlak) na úzkokolejných dráhách JH odstavil, odpovídá za splnění všech podmínek pro bezpečné odstavení drážních vozidel (vlaku) stanovených legislativou ČR a vnitřními předpisy provozovatele dráhy JHMD, a to po celou dobu odstavení těchto drážních vozidel (vlaku). Provozovatel dráhy JHMD neodpovídá za škody na odstavených drážních vozidlech, které nevznikly v přímé souvislosti s jeho činností. Provozovatel drážní dopravy, který drážní vozidla na úzkokolejných dráhách JH odstavil, je povinen na výzvu provozovatele dráhy JHMD drážní vozidla odvézt do 48 hodin v případě odstavení na dopravní koleji a do 72 hodin v případě ostatních kolejí, popř. neprodleně po uplynutí doby, na kterou byl souhlas provozovatele dráhy JHMD s odstavením drážních vozidel (vlaku) udělen. Pokud provozovatel drážní dopravy nesplní svou povinnost drážní vozidla včas odvézt, může provozovatel dráhy JHMD po něm požadovat náhradu škody vzniklé z důvodu včasného neuvolnění koleje. Provozovatel dráhy JHMD na jím provozovaných úzkokolejných dráhách JH umožňuje ve výjimečných případech a na základě předem ze strany provozovatele dráhy JHMD odsouhlasené žádosti dopravce krátkodobé odstavení drážních vozidel i na kolejích, které nejsou určeny k odstavování drážních vozidel, pokud to kapacita těchto kolejí umožňuje. Provozovatel, dráhy JHMD si v těchto případech vyhrazuje právo odmítnout žádost dopravce, popř. pro odstavení drážních vozidel určit jinou kolej popř. i jinou stanici. Seznam železničních stanic, ve kterých jsou provozovány odstavné koleje, a ceny za službu odstavení drážních vozidel na kolejích provozovaných provozovatelem dráhy JHMD zveřejňuje provozovatel dráhy na svém webovém portále.
Odstavné koleje. Na dráze regionální Čížkovice – Obrnice není tato služba poskytována.