Beslutade miljökvalitetsnormer. Merparten av vattenförekomsterna i kommunen uppnår måttlig ekologisk status, och således inte miljökvalitetsnormerna. Kustvattnet i Stockholms skärgård uppnår måttlig ekologisk status och Dragfjärden, som omsluter kommunens västra kust, uppnår otillfredsställande ekologisk status. De flesta av kommunens vattenförekomster har fått förlängd tidsfrist för att uppnå MKN (Vatteninformationsystem Sverige, 2024). Orsaken är främst att det anses tekniskt omöjligt att hinna åtgärda övergödningsproblematiken före dess, bland annat för att stor påverkan sker från Östersjön i stort. När det gäller den kemiska ytvattenstatusen har många vatten fått tidsundantag för vissa ämnen eller mindre stränga krav. Övergödning utgör den största problematiken inom kommunens vattenförvaltning men yt- och grundvattenplanen behandlar även övriga utmaningar som är avgörande för kommunens möjligheter att uppfylla MKN. Bland dessa utmaningar finns miljögifter samt fysiska förändringar av naturliga vattenmiljöer (Nynäshamns kommun, 2019) vilket har negativ inverkan på marina och limniska organismer.
