Programma della ricerca. Il programma della ricerca, concordato tra le parti contraenti, è articolato in una serie di attività descritte nell’Allegato tecnico (ove dovranno essere indicate anche le sedi in cui si svolgeranno le singole attività), nel quale vengono riportati anche gli obiettivi finali. (Eventuale): L’attività oggetto del contratto si articolerà per obiettivi/fasi (descritti nell’Allegato tecnico) ed al raggiungimento di ciascun obiettivo l’Università redigerà una relazione/rapporto tecnico. Al termine della ricerca sarà redatta una relazione/rapporto tecnico finale sul programma di attività/ sui risultati raggiunti.
Programma della ricerca. Il progetto si focalizzerà nell’analisi di pazienti con fenotipo difficilmente correlabile a uno dei geni- epilessia conosciuti. Grazie all’analisi bioinformatica di dati di sequenziamento NGS dell’intera porzione codificante (esoma), il progetto mira ad identificare geni causativi l’epilessia in tempi più rapidi e con un migliore successo diagnostico e un conseguente notevole risparmio di costi e di tempo di analisi. Per identificare varianti rare a bassa frequenza, l’analisi bioinformatica dovrà inoltre essere accoppiata ad un sequenziamento ad alta copertura (>250X) che permetterà di ottenere un elevato numero di letture univoche delle regioni genomiche di interesse (Kou et al., 2016, Xxxx et al., 2018). A partire dai dati di sequenziamento esomico ottenuti, il Laboratorio di Genomica Funzionale eseguirà un’analisi bioinformatica primaria, mediante una pipeline messa a punto dal gruppo stesso. I dati grezzi prodotti dal sequenziatore verranno inizialmente filtrati (per qualità) ed allineati al genoma di riferimento mediante il software BWA-mem, ottenendo un file in formato BAM utilizzato nelle procedure di analisi successive. Le varianti a singolo nucleotide (SNVs) o piccole inserzioni/delezioni (InDels, <20bp) caratteristiche di ogni paziente verranno quindi identificate usando GATK che valuta le differenze rispetto al genoma di riferimento e Mutect2 specifico per la chiamata varianti somatiche/a bassa frequenza (Xxx et al., 2019). In questa fase cruciale dell’analisi, la pipeline bioinformatica implementata dal Laboratorio di Genomica Funzionale è stata ottimizzata per valutare la qualità dell’allineamento e la copertura di ogni base, al fine di individuare potenziali errori di sequenziamento o allineamento. Al termine di questo processo, le varianti verranno riportate in un file VCF sul quale possono essere effettuate le indagini secondarie. Il file VCF e il file BAM di ciascun trio paziente/genitori verranno restituiti al Laboratorio di Neurogenetica dell’Ospedale Meyer per le analisi secondarie. Inoltre, verrà fornito al Laboratorio, per ciascun trio, Sede Amministrativa Xxxxx Xxxxxxxxxx 00 - 00000 XXXXXXX xxx. 055/56621 - Fax 055/0000000 Sito Internet xxx.xxxxx.xx . Telefono segreteria Xxxx. Xxxxxxxx 055 5662573 un file excel per ciascun modello di ereditarietà (dominante, recessivo, X-inked) ottenuto mediante analisi con il software VarSeq (Golden Helix). L’analisi secondaria sui dati WES sarà effettuata dal Laboratorio di Neurogenetica che valut...
Programma della ricerca. INIZIO, LUOGO, DURATA ED ESECUZIONE
1. Il contratto di Ricerca avrà durata fino al 31.12.2021 a decorrere dalla data di sottoscrizione dalle Parti del presente Contratto.
2. La Ricerca verrà eseguita nei laboratori e strutture di Ricerca (“locali”) di volta in volta concordemente definiti dai Responsabili Scientifici delle Parti.
3. Il datore di lavoro della sede ospitante assolve, nei confronti del personale dello staff di Ricerca che si reca in questi locali, tutte le misure generali e specifiche di prevenzione e sicurezza.
4. Qualora la Ricerca in oggetto dovesse richiedere l’utilizzo di attrezzature di proprietà della Parte Committente, queste saranno concesse in uso al Dipartimento per la durata del presente Contratto nei limiti strettamente necessari allo svolgimento della Ricerca medesima.
Programma della ricerca. 1. Il Programma della Ricerca, ossia l’insieme delle attività volte alla realizzazione degli obiettivi del Progetto, corrisponde a quanto indicato nel documento inserito in fase di valutazione.
2. Il Coordinatore scientifico e i Responsabili scientifici delle Unità di ricerca potranno concordare per iscritto, con efficacia vincolante per le parti contraenti, eventuali modifiche in relazione all’evoluzione del Progetto.
Programma della ricerca. 1. Le attività di ricerca, con i rispettivi output e risultati come riportati nell’allegato n. 1, sono di seguito indicate con riferimento a ciascuna Linea di intervento:
L.1 Costruzione di un set di indicatori territoriali, settoriali e per livello di governo su rischio e contrasto della corruzione: - A.1.1 – Analisi delle banche dati amministrative e costruzione di un sistema di indicatori sul rischio di corruzione. La realizzazione di tale Attività consente di rilevare e analizzare a livello territoriale i rischi di corruzione, favorendo il rafforzamento della cooperazione e della capacità istituzionale. - A.1.2 – Rilevazione di indicatori di prevenzione e di contrasto della corruzione a livello territoriale e settoriale. L’Attività prevede la rilevazione a livello territoriale e settoriale di indicatori di prevenzione e di contrasto della corruzione, anche tramite la creazione di una banca dati nella quale devono confluire i dati elementari utili per il calcolo degli indicatori. L’Attività prevede inoltre la valorizzazione di misure ricavate dalle statistiche giudiziarie e dalla giurisprudenza contabile, nonché eventuali rilevazioni dirette, finalizzate alla raccolta di dati idonei per la misurazione del rischio di corruzione.
Programma della ricerca. Il programma della ricerca, concordato tra le parti contraenti, è articolato in una serie di attività descritte nel Progetto nel quale, fra l'altro, vengono riportati gli obiettivi che si intendono perseguire. Nel corso dello svolgimento dei lavori in relazione all’evoluzione degli stessi potranno essere concordati tra i responsabili scientifici del contratto, aggiornamenti alla pianificazione dettagliata delle attività, sempre nei limiti del programma di ricerca in argomento.
Programma della ricerca. INIZIO, LUOGO, DURATA ED ESECUZIONE
1. La Ricerca avrà inizio alla sottoscrizione da tutte le Parti del presente Contratto e terminerà in data 31 marzo 2018. Un eventuale differimento del termine potrebbe essere concordati dalle parti al verificarsi di eventi o condizioni non conosciute al momento della sottoscrizione.
2. La Ricerca verrà eseguita nei laboratori e strutture di Ricerca (“locali”) di volta in volta concordemente definiti dai Responsabili Scientifici delle Parti.
3. Il datore di lavoro della sede ospitante assolve, nei confronti del personale dello staff di Ricerca che si reca in questi locali, tutte le misure generali e specifiche di prevenzione e sicurezza, ivi compresa la sorveglianza sanitaria.
4. Qualora la Ricerca in oggetto dovesse richiedere l’utilizzo di attrezzature di proprietà della Parte Committente, queste saranno concesse in uso al Dipartimento per la durata del presente Contratto nei limiti strettamente necessari allo svolgimento della Ricerca medesima.
Programma della ricerca. 1. Il Programma della Ricerca, ossia l’insieme delle attività volte alla realizzazione degli obiettivi del Pro- getto, corrisponde a quanto indicato nel documento inserito in fase di valutazione e allegato al presente accordo (Allegato A).
2. Il Coordinatore scientifico e i Responsabili scientifici delle Unità di ricerca potranno concordare per iscritto, con efficacia vincolante per le parti contraenti, eventuali modifiche in relazione all’evoluzione del Progetto.
Programma della ricerca. Il programma della ricerca, concordato tra le parti contraenti, è articolato in una serie di attività descritte nell’Allegato tecnico.
Programma della ricerca. L’attività oggetto del contratto si articolerà nei seguenti obiettivi/nelle seguenti fasi (oppure negli obiettivi/fasi descritti nell’Allegato tecnico) ed al raggiungimento di ciascun obiettivo/fase l’ENEA redigerà una relazione/rapporto tecnico che trasmetterà al Committente entro …. giorni/entro i termini e con le modalità descritte nell’Allegato Tecnico. A completamento delle attività previste, l’ENEA trasmetterà al Committente una relazione finale sul programma di attività/sui risultati raggiunti, entro …. giorni/entro i termini e secondo le modalità descritte nell’Allegato Tecnico. L’accettazione da parte del Committente, entro 10 giorni dal suo inoltro, della relazione finale, consente il pagamento dell’ultima rata dell’importo contrattuale di cui al successivo articolo 6. Nel corso dello svolgimento dell’attività, i Responsabili delle stesse, così come individuati nel successivo articolo 7, potranno proporre per iscritto eventuali aggiornamenti e/o modifiche alla programmazione delle attività che si renderanno opportuni e necessari per il miglior esito delle attività stesse o che siano suggeriti dalla natura dei risultati nel frattempo conseguiti, da concordarsi successivamente 2 tra le Parti ai sensi dell’art. 17.